MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Vibrio harveyi ATCC BAA-1116 plasmid pVIBHAR

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009777	GAACAG	2	12	937	948	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	156936675
2	NC_009777	ATTCTG	2	12	3420	3431	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156936681
3	NC_009777	TATTCA	2	12	8110	8121	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	156936689
4	NC_009777	AGTTCG	2	12	8442	8453	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156936689
5	NC_009777	TCATGT	2	12	8808	8819	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156936690
6	NC_009777	ACCGGA	2	12	9466	9477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936690
7	NC_009777	TTACCT	2	12	13347	13358	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	156936694
8	NC_009777	GCTTTG	2	12	21530	21541	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	156936708
9	NC_009777	TTGCTC	2	12	28380	28391	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	156936716
10	NC_009777	CCTTTT	2	12	29777	29788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936717
11	NC_009777	ATTGGT	2	12	30802	30813	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	156936717
12	NC_009777	TGGTTT	2	12	31244	31255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936717
13	NC_009777	AAAATC	2	12	33127	33138	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	156936719
14	NC_009777	TCTAAG	2	12	35162	35173	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156936720
15	NC_009777	TAGTTT	2	12	39639	39650	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	156936727
16	NC_009777	AGCGTT	2	12	51240	51251	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156936744
17	NC_009777	TTCATT	2	12	52270	52281	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	156936748
18	NC_009777	ATATGG	2	12	55060	55071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936751
19	NC_009777	TTACCT	2	12	55934	55945	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	156936752
20	NC_009777	GAACAG	2	12	57270	57281	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	156936753
21	NC_009777	GAATTT	2	12	59674	59685	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	156936756
22	NC_009777	TCTTTA	2	12	61332	61343	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	156936760
23	NC_009777	TAGCTC	2	12	64956	64967	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156936766
24	NC_009777	GTTGAA	2	12	73096	73107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936778
25	NC_009777	TACCTG	2	12	76117	76128	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156936781
26	NC_009777	TCATCC	2	12	80402	80413	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	156936783
27	NC_009777	GATACA	2	12	85207	85218	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	156936789
28	NC_009777	TTACCT	2	12	88608	88619	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	156936794

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.