MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Vibrio harveyi ATCC BAA-1116 plasmid pVIBHAR

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009777	GATTG	2	10	1858	1867	20 %	40 %	40 %	0 %	156936678
2	NC_009777	GAGCC	2	10	3752	3761	20 %	0 %	40 %	40 %	156936681
3	NC_009777	GAATT	2	10	3942	3951	40 %	40 %	20 %	0 %	156936682
4	NC_009777	GGGCA	2	10	5829	5838	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009777	AGTAA	2	10	7389	7398	60 %	20 %	20 %	0 %	156936688
6	NC_009777	ACAAG	2	10	7848	7857	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009777	ACAAA	2	10	8876	8885	80 %	0 %	0 %	20 %	156936690
8	NC_009777	CCAAC	2	10	9370	9379	40 %	0 %	0 %	60 %	156936690
9	NC_009777	TTCGA	2	10	11405	11414	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009777	TGTCT	2	10	11828	11837	0 %	60 %	20 %	20 %	156936691
11	NC_009777	ATTAC	4	20	16360	16379	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009777	TTTGG	2	10	19657	19666	0 %	60 %	40 %	0 %	156936704
13	NC_009777	AGAGC	2	10	25107	25116	40 %	0 %	40 %	20 %	156936710
14	NC_009777	CAATG	2	10	25996	26005	40 %	20 %	20 %	20 %	156936712
15	NC_009777	TTGCG	2	10	30574	30583	0 %	40 %	40 %	20 %	156936717
16	NC_009777	GCTTG	2	10	37260	37269	0 %	40 %	40 %	20 %	156936723
17	NC_009777	ATCAC	2	10	37415	37424	40 %	20 %	0 %	40 %	156936723
18	NC_009777	GAACA	2	10	38696	38705	60 %	0 %	20 %	20 %	156936726
19	NC_009777	TTTTC	2	10	39576	39585	0 %	80 %	0 %	20 %	156936727
20	NC_009777	CATTT	2	10	42815	42824	20 %	60 %	0 %	20 %	156936730
21	NC_009777	ACTCA	2	10	43976	43985	40 %	20 %	0 %	40 %	156936732
22	NC_009777	CATTT	2	10	44576	44585	20 %	60 %	0 %	20 %	156936734
23	NC_009777	TGAGT	2	10	45323	45332	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009777	TGCAT	2	10	47752	47761	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009777	TTTAA	2	10	48003	48012	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009777	TCGCT	2	10	49322	49331	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_009777	TTGAT	2	10	50445	50454	20 %	60 %	20 %	0 %	156936743
28	NC_009777	AATGA	2	10	51516	51525	60 %	20 %	20 %	0 %	156936746
29	NC_009777	TAATG	2	10	52883	52892	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009777	TAAGG	2	10	53086	53095	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009777	CGAAA	2	10	54296	54305	60 %	0 %	20 %	20 %	156936750
32	NC_009777	CACTG	2	10	60929	60938	20 %	20 %	20 %	40 %	156936760
33	NC_009777	AGCGC	2	10	61450	61459	20 %	0 %	40 %	40 %	156936760
34	NC_009777	TCCAT	2	10	63940	63949	20 %	40 %	0 %	40 %	156936765
35	NC_009777	TCTTG	2	10	64937	64946	0 %	60 %	20 %	20 %	156936766
36	NC_009777	CCGCG	2	10	66568	66577	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_009777	CGTTA	2	10	66799	66808	20 %	40 %	20 %	20 %	156936768
38	NC_009777	ACGAC	2	10	67337	67346	40 %	0 %	20 %	40 %	156936769
39	NC_009777	TGGTT	2	10	67355	67364	0 %	60 %	40 %	0 %	156936769
40	NC_009777	CTCTA	2	10	67826	67835	20 %	40 %	0 %	40 %	156936770
41	NC_009777	TTTGG	2	10	68400	68409	0 %	60 %	40 %	0 %	156936771
42	NC_009777	TTTGT	2	10	70785	70794	0 %	80 %	20 %	0 %	156936774
43	NC_009777	AAGGA	2	10	73615	73624	60 %	0 %	40 %	0 %	156936779
44	NC_009777	GTCCA	2	10	75291	75300	20 %	20 %	20 %	40 %	156936781
45	NC_009777	ATTCA	2	10	78282	78291	40 %	40 %	0 %	20 %	156936781
46	NC_009777	AAGAA	2	10	81594	81603	80 %	0 %	20 %	0 %	156936784
47	NC_009777	AGAGG	2	10	82774	82783	40 %	0 %	60 %	0 %	156936785
48	NC_009777	TTGGC	2	10	82856	82865	0 %	40 %	40 %	20 %	156936785
49	NC_009777	TAAAA	2	10	84597	84606	80 %	20 %	0 %	0 %	156936788

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.