MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Vibrio harveyi ATCC BAA-1116 plasmid pVIBHAR

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009777	GAAA	2	8	1696	1703	75 %	0 %	25 %	0 %	156936677
2	NC_009777	GTTC	2	8	2632	2639	0 %	50 %	25 %	25 %	156936680
3	NC_009777	TGAC	2	8	2970	2977	25 %	25 %	25 %	25 %	156936681
4	NC_009777	GATG	2	8	3172	3179	25 %	25 %	50 %	0 %	156936681
5	NC_009777	GTTC	2	8	4798	4805	0 %	50 %	25 %	25 %	156936683
6	NC_009777	TGAC	2	8	5136	5143	25 %	25 %	25 %	25 %	156936684
7	NC_009777	ATAG	2	8	6190	6197	50 %	25 %	25 %	0 %	156936686
8	NC_009777	TGAG	2	8	6355	6362	25 %	25 %	50 %	0 %	156936686
9	NC_009777	CTCG	2	8	6479	6486	0 %	25 %	25 %	50 %	156936686
10	NC_009777	TAAA	2	8	7048	7055	75 %	25 %	0 %	0 %	156936687
11	NC_009777	ACTA	2	8	7746	7753	50 %	25 %	0 %	25 %	156936688
12	NC_009777	AAAG	2	8	8096	8103	75 %	0 %	25 %	0 %	156936689
13	NC_009777	ATGA	2	8	8387	8394	50 %	25 %	25 %	0 %	156936689
14	NC_009777	CAAA	2	8	9699	9706	75 %	0 %	0 %	25 %	156936690
15	NC_009777	GAAG	2	8	10743	10750	50 %	0 %	50 %	0 %	156936690
16	NC_009777	AAAG	2	8	11268	11275	75 %	0 %	25 %	0 %	156936690
17	NC_009777	TTAA	2	8	12129	12136	50 %	50 %	0 %	0 %	156936691
18	NC_009777	AAAG	2	8	12288	12295	75 %	0 %	25 %	0 %	156936691
19	NC_009777	GATA	2	8	13094	13101	50 %	25 %	25 %	0 %	156936694
20	NC_009777	CCAT	2	8	15269	15276	25 %	25 %	0 %	50 %	156936697
21	NC_009777	ACTG	2	8	15330	15337	25 %	25 %	25 %	25 %	156936697
22	NC_009777	CCAT	2	8	17536	17543	25 %	25 %	0 %	50 %	156936701
23	NC_009777	ACTG	2	8	17597	17604	25 %	25 %	25 %	25 %	156936701
24	NC_009777	ATAG	2	8	20165	20172	50 %	25 %	25 %	0 %	156936705
25	NC_009777	AAGC	2	8	21312	21319	50 %	0 %	25 %	25 %	156936707
26	NC_009777	TTTG	2	8	21669	21676	0 %	75 %	25 %	0 %	156936708
27	NC_009777	CGCT	2	8	21870	21877	0 %	25 %	25 %	50 %	156936708
28	NC_009777	GATT	2	8	21927	21934	25 %	50 %	25 %	0 %	156936708
29	NC_009777	TGGT	2	8	22902	22909	0 %	50 %	50 %	0 %	156936709
30	NC_009777	ACTT	2	8	23015	23022	25 %	50 %	0 %	25 %	156936709
31	NC_009777	AGTG	2	8	23238	23245	25 %	25 %	50 %	0 %	156936709
32	NC_009777	TGAT	2	8	23845	23852	25 %	50 %	25 %	0 %	156936709
33	NC_009777	AACC	2	8	24690	24697	50 %	0 %	0 %	50 %	156936710
34	NC_009777	AGTG	2	8	25097	25104	25 %	25 %	50 %	0 %	156936710
35	NC_009777	AATG	2	8	25435	25442	50 %	25 %	25 %	0 %	156936711
36	NC_009777	GAAA	2	8	25473	25480	75 %	0 %	25 %	0 %	156936711
37	NC_009777	TCTA	2	8	26032	26039	25 %	50 %	0 %	25 %	156936712
38	NC_009777	ATGA	2	8	26081	26088	50 %	25 %	25 %	0 %	156936712
39	NC_009777	ATCT	2	8	26157	26164	25 %	50 %	0 %	25 %	156936712
40	NC_009777	ACTT	2	8	26256	26263	25 %	50 %	0 %	25 %	156936712
41	NC_009777	TAGA	2	8	26436	26443	50 %	25 %	25 %	0 %	156936712
42	NC_009777	TGAT	2	8	27758	27765	25 %	50 %	25 %	0 %	156936714
43	NC_009777	CAAT	2	8	28309	28316	50 %	25 %	0 %	25 %	156936716
44	NC_009777	GTTT	2	8	28493	28500	0 %	75 %	25 %	0 %	156936716
45	NC_009777	AATC	2	8	29111	29118	50 %	25 %	0 %	25 %	156936716
46	NC_009777	CTTT	2	8	29673	29680	0 %	75 %	0 %	25 %	156936717
47	NC_009777	ACCA	2	8	29934	29941	50 %	0 %	0 %	50 %	156936717
48	NC_009777	GCTT	2	8	30107	30114	0 %	50 %	25 %	25 %	156936717
49	NC_009777	CTTG	2	8	30183	30190	0 %	50 %	25 %	25 %	156936717
50	NC_009777	AAAC	2	8	30646	30653	75 %	0 %	0 %	25 %	156936717
51	NC_009777	GGCT	2	8	30705	30712	0 %	25 %	50 %	25 %	156936717
52	NC_009777	GTGC	2	8	31035	31042	0 %	25 %	50 %	25 %	156936717
53	NC_009777	TGAA	2	8	31103	31110	50 %	25 %	25 %	0 %	156936717
54	NC_009777	TAGG	2	8	31680	31687	25 %	25 %	50 %	0 %	156936717
55	NC_009777	AGGG	2	8	31853	31860	25 %	0 %	75 %	0 %	156936717
56	NC_009777	AAAC	2	8	32223	32230	75 %	0 %	0 %	25 %	156936718
57	NC_009777	GACT	2	8	32703	32710	25 %	25 %	25 %	25 %	156936719
58	NC_009777	GCTG	2	8	33077	33084	0 %	25 %	50 %	25 %	156936719
59	NC_009777	GTCG	2	8	33898	33905	0 %	25 %	50 %	25 %	156936719
60	NC_009777	TGGC	2	8	33941	33948	0 %	25 %	50 %	25 %	156936719
61	NC_009777	TTTG	2	8	34773	34780	0 %	75 %	25 %	0 %	156936720
62	NC_009777	ATTG	2	8	35202	35209	25 %	50 %	25 %	0 %	156936720
63	NC_009777	AGGA	2	8	35803	35810	50 %	0 %	50 %	0 %	156936722
64	NC_009777	TTGC	2	8	36159	36166	0 %	50 %	25 %	25 %	156936722
65	NC_009777	TTGC	2	8	36413	36420	0 %	50 %	25 %	25 %	156936722
66	NC_009777	GCTT	2	8	36427	36434	0 %	50 %	25 %	25 %	156936722
67	NC_009777	CACG	2	8	37293	37300	25 %	0 %	25 %	50 %	156936723
68	NC_009777	GGTA	2	8	37663	37670	25 %	25 %	50 %	0 %	156936724
69	NC_009777	GCTT	2	8	38212	38219	0 %	50 %	25 %	25 %	156936724
70	NC_009777	GGTT	2	8	38232	38239	0 %	50 %	50 %	0 %	156936724
71	NC_009777	GAAA	2	8	38916	38923	75 %	0 %	25 %	0 %	156936726
72	NC_009777	CAAT	2	8	39024	39031	50 %	25 %	0 %	25 %	156936726
73	NC_009777	TTCG	2	8	39945	39952	0 %	50 %	25 %	25 %	156936728
74	NC_009777	TTGA	2	8	40213	40220	25 %	50 %	25 %	0 %	156936728
75	NC_009777	TGTT	2	8	40683	40690	0 %	75 %	25 %	0 %	156936729
76	NC_009777	TCAT	2	8	40759	40766	25 %	50 %	0 %	25 %	156936729
77	NC_009777	AACA	2	8	40894	40901	75 %	0 %	0 %	25 %	156936729
78	NC_009777	TTGC	2	8	40988	40995	0 %	50 %	25 %	25 %	156936729
79	NC_009777	CAAG	2	8	41029	41036	50 %	0 %	25 %	25 %	156936729
80	NC_009777	TATC	2	8	41150	41157	25 %	50 %	0 %	25 %	156936729
81	NC_009777	CCTT	2	8	41296	41303	0 %	50 %	0 %	50 %	156936729
82	NC_009777	CTAT	2	8	41770	41777	25 %	50 %	0 %	25 %	156936729
83	NC_009777	ATCA	2	8	41931	41938	50 %	25 %	0 %	25 %	156936729
84	NC_009777	GTTG	2	8	41995	42002	0 %	50 %	50 %	0 %	156936729
85	NC_009777	AAGA	2	8	42206	42213	75 %	0 %	25 %	0 %	156936729
86	NC_009777	AAGG	2	8	42556	42563	50 %	0 %	50 %	0 %	156936729
87	NC_009777	GTCA	2	8	42684	42691	25 %	25 %	25 %	25 %	156936730
88	NC_009777	TGAA	2	8	42759	42766	50 %	25 %	25 %	0 %	156936730
89	NC_009777	CAGT	2	8	42939	42946	25 %	25 %	25 %	25 %	156936730
90	NC_009777	ACAA	2	8	43296	43303	75 %	0 %	0 %	25 %	156936731
91	NC_009777	GCTT	2	8	43428	43435	0 %	50 %	25 %	25 %	156936732
92	NC_009777	GTTG	2	8	44422	44429	0 %	50 %	50 %	0 %	156936734
93	NC_009777	GTTC	2	8	44636	44643	0 %	50 %	25 %	25 %	156936735
94	NC_009777	TTGA	2	8	44691	44698	25 %	50 %	25 %	0 %	156936735
95	NC_009777	AGCG	2	8	45646	45653	25 %	0 %	50 %	25 %	156936736
96	NC_009777	AAGT	2	8	45708	45715	50 %	25 %	25 %	0 %	156936736
97	NC_009777	AACG	2	8	45991	45998	50 %	0 %	25 %	25 %	156936737
98	NC_009777	AAGT	2	8	46049	46056	50 %	25 %	25 %	0 %	156936737
99	NC_009777	CAAA	2	8	46119	46126	75 %	0 %	0 %	25 %	156936737
100	NC_009777	CAAA	2	8	46212	46219	75 %	0 %	0 %	25 %	156936737
101	NC_009777	TTGA	2	8	46278	46285	25 %	50 %	25 %	0 %	156936737
102	NC_009777	GTAA	2	8	47252	47259	50 %	25 %	25 %	0 %	156936739
103	NC_009777	GACT	2	8	47382	47389	25 %	25 %	25 %	25 %	156936739
104	NC_009777	CAGA	2	8	48915	48922	50 %	0 %	25 %	25 %	156936740
105	NC_009777	GGTA	2	8	50988	50995	25 %	25 %	50 %	0 %	156936743
106	NC_009777	GGGT	2	8	51178	51185	0 %	25 %	75 %	0 %	156936744
107	NC_009777	TGAT	2	8	51290	51297	25 %	50 %	25 %	0 %	156936744
108	NC_009777	TTTC	2	8	53581	53588	0 %	75 %	0 %	25 %	156936749
109	NC_009777	CCGT	2	8	53891	53898	0 %	25 %	25 %	50 %	156936750
110	NC_009777	CGAA	2	8	54121	54128	50 %	0 %	25 %	25 %	156936750
111	NC_009777	AGTG	2	8	54905	54912	25 %	25 %	50 %	0 %	156936751
112	NC_009777	TTTG	2	8	55052	55059	0 %	75 %	25 %	0 %	156936751
113	NC_009777	GATA	2	8	55681	55688	50 %	25 %	25 %	0 %	156936752
114	NC_009777	CCAT	2	8	57993	58000	25 %	25 %	0 %	50 %	156936755
115	NC_009777	GGCT	2	8	58057	58064	0 %	25 %	50 %	25 %	156936755
116	NC_009777	CTTG	2	8	58402	58409	0 %	50 %	25 %	25 %	156936755
117	NC_009777	TGGC	2	8	60094	60101	0 %	25 %	50 %	25 %	156936757
118	NC_009777	AAAC	2	8	60485	60492	75 %	0 %	0 %	25 %	156936758
119	NC_009777	TTTC	2	8	62390	62397	0 %	75 %	0 %	25 %	156936761
120	NC_009777	CAAT	2	8	63325	63332	50 %	25 %	0 %	25 %	156936763
121	NC_009777	TTGC	2	8	63791	63798	0 %	50 %	25 %	25 %	156936765
122	NC_009777	CATA	2	8	63855	63862	50 %	25 %	0 %	25 %	156936765
123	NC_009777	TCTT	2	8	65212	65219	0 %	75 %	0 %	25 %	156936766
124	NC_009777	CTTT	2	8	65741	65748	0 %	75 %	0 %	25 %	156936766
125	NC_009777	GGGA	2	8	66098	66105	25 %	0 %	75 %	0 %	156936767
126	NC_009777	GCTT	2	8	66111	66118	0 %	50 %	25 %	25 %	156936767
127	NC_009777	CGGA	2	8	67440	67447	25 %	0 %	50 %	25 %	156936769
128	NC_009777	GAAC	2	8	68014	68021	50 %	0 %	25 %	25 %	156936770
129	NC_009777	TGGA	2	8	68302	68309	25 %	25 %	50 %	0 %	156936771
130	NC_009777	ATTT	2	8	68522	68529	25 %	75 %	0 %	0 %	156936771
131	NC_009777	GGCA	2	8	68652	68659	25 %	0 %	50 %	25 %	156936771
132	NC_009777	GATT	2	8	68711	68718	25 %	50 %	25 %	0 %	156936771
133	NC_009777	TGGC	2	8	69169	69176	0 %	25 %	50 %	25 %	156936772
134	NC_009777	ATTG	2	8	70712	70719	25 %	50 %	25 %	0 %	156936774
135	NC_009777	GAGT	2	8	70831	70838	25 %	25 %	50 %	0 %	156936774
136	NC_009777	CAAT	2	8	72336	72343	50 %	25 %	0 %	25 %	156936777
137	NC_009777	TGAA	2	8	72352	72359	50 %	25 %	25 %	0 %	156936778
138	NC_009777	GGTT	2	8	73030	73037	0 %	50 %	50 %	0 %	156936778
139	NC_009777	GGCT	2	8	73410	73417	0 %	25 %	50 %	25 %	156936779
140	NC_009777	ACGC	2	8	73749	73756	25 %	0 %	25 %	50 %	156936779
141	NC_009777	ACTT	2	8	73921	73928	25 %	50 %	0 %	25 %	156936779
142	NC_009777	CATA	2	8	74695	74702	50 %	25 %	0 %	25 %	156936781
143	NC_009777	AGTG	2	8	74762	74769	25 %	25 %	50 %	0 %	156936781
144	NC_009777	AAGT	2	8	75054	75061	50 %	25 %	25 %	0 %	156936781
145	NC_009777	ATTG	2	8	75727	75734	25 %	50 %	25 %	0 %	156936781
146	NC_009777	TAAG	2	8	76167	76174	50 %	25 %	25 %	0 %	156936781
147	NC_009777	GAAG	2	8	76651	76658	50 %	0 %	50 %	0 %	156936781
148	NC_009777	TCAC	2	8	77250	77257	25 %	25 %	0 %	50 %	156936781
149	NC_009777	ACAG	2	8	77419	77426	50 %	0 %	25 %	25 %	156936781
150	NC_009777	GTTC	2	8	77461	77468	0 %	50 %	25 %	25 %	156936781
151	NC_009777	GAAT	2	8	77568	77575	50 %	25 %	25 %	0 %	156936781
152	NC_009777	AATT	2	8	77622	77629	50 %	50 %	0 %	0 %	156936781
153	NC_009777	AGTT	2	8	78064	78071	25 %	50 %	25 %	0 %	156936781
154	NC_009777	CCTG	2	8	79107	79114	0 %	25 %	25 %	50 %	156936782
155	NC_009777	TGCT	2	8	79750	79757	0 %	50 %	25 %	25 %	156936783
156	NC_009777	ACTT	2	8	79842	79849	25 %	50 %	0 %	25 %	156936783
157	NC_009777	TGGT	2	8	80006	80013	0 %	50 %	50 %	0 %	156936783
158	NC_009777	TGCT	2	8	80386	80393	0 %	50 %	25 %	25 %	156936783
159	NC_009777	CCAT	2	8	80504	80511	25 %	25 %	0 %	50 %	156936783
160	NC_009777	TAAG	2	8	80803	80810	50 %	25 %	25 %	0 %	156936783
161	NC_009777	GTTA	2	8	81249	81256	25 %	50 %	25 %	0 %	156936784
162	NC_009777	AGCT	2	8	81419	81426	25 %	25 %	25 %	25 %	156936784
163	NC_009777	CTTT	2	8	81526	81533	0 %	75 %	0 %	25 %	156936784
164	NC_009777	TAAA	2	8	81912	81919	75 %	25 %	0 %	0 %	156936785
165	NC_009777	TCAC	2	8	82442	82449	25 %	25 %	0 %	50 %	156936785
166	NC_009777	GCAC	2	8	82494	82501	25 %	0 %	25 %	50 %	156936785
167	NC_009777	ATCA	2	8	83130	83137	50 %	25 %	0 %	25 %	156936786
168	NC_009777	CGAG	2	8	83315	83322	25 %	0 %	50 %	25 %	156936786
169	NC_009777	TCAT	2	8	84493	84500	25 %	50 %	0 %	25 %	156936788
170	NC_009777	ACTC	2	8	85470	85477	25 %	25 %	0 %	50 %	156936790
171	NC_009777	TCAA	2	8	85588	85595	50 %	25 %	0 %	25 %	156936790
172	NC_009777	CCAA	2	8	86517	86524	50 %	0 %	0 %	50 %	156936790
173	NC_009777	TTCT	2	8	87586	87593	0 %	75 %	0 %	25 %	156936793
174	NC_009777	AAGC	2	8	87626	87633	50 %	0 %	25 %	25 %	156936793
175	NC_009777	AATG	2	8	88268	88275	50 %	25 %	25 %	0 %	156936793
176	NC_009777	CAAC	2	8	88665	88672	50 %	0 %	0 %	50 %	156936794

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.