MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Vibrio harveyi ATCC BAA-1116 plasmid pVIBHAR

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009777	GA	3	6	579	584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009777	GA	3	6	1229	1234	50 %	0 %	50 %	0 %	156936676
3	NC_009777	GT	3	6	1366	1371	0 %	50 %	50 %	0 %	156936676
4	NC_009777	TC	3	6	1540	1545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009777	AT	3	6	1704	1709	50 %	50 %	0 %	0 %	156936677
6	NC_009777	GT	3	6	1766	1771	0 %	50 %	50 %	0 %	156936677
7	NC_009777	TA	3	6	2869	2874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009777	GC	3	6	2881	2886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009777	CT	3	6	4242	4247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009777	TA	3	6	5035	5040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009777	GC	3	6	5047	5052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009777	CT	3	6	6057	6062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009777	CA	3	6	6844	6849	50 %	0 %	0 %	50 %	156936687
14	NC_009777	CA	3	6	6894	6899	50 %	0 %	0 %	50 %	156936687
15	NC_009777	TA	3	6	7632	7637	50 %	50 %	0 %	0 %	156936688
16	NC_009777	GA	3	6	10422	10427	50 %	0 %	50 %	0 %	156936690
17	NC_009777	AT	3	6	11060	11065	50 %	50 %	0 %	0 %	156936690
18	NC_009777	GT	3	6	13021	13026	0 %	50 %	50 %	0 %	156936694
19	NC_009777	CG	3	6	13505	13510	0 %	0 %	50 %	50 %	156936694
20	NC_009777	GA	3	6	14326	14331	50 %	0 %	50 %	0 %	156936694
21	NC_009777	GA	3	6	14976	14981	50 %	0 %	50 %	0 %	156936696
22	NC_009777	GT	3	6	15113	15118	0 %	50 %	50 %	0 %	156936696
23	NC_009777	TG	3	6	15308	15313	0 %	50 %	50 %	0 %	156936697
24	NC_009777	TG	3	6	15582	15587	0 %	50 %	50 %	0 %	156936697
25	NC_009777	AG	3	6	15781	15786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009777	TG	3	6	17575	17580	0 %	50 %	50 %	0 %	156936701
27	NC_009777	TG	3	6	17849	17854	0 %	50 %	50 %	0 %	156936701
28	NC_009777	AG	3	6	18048	18053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009777	GA	3	6	20127	20132	50 %	0 %	50 %	0 %	156936705
30	NC_009777	AC	3	6	20560	20565	50 %	0 %	0 %	50 %	156936705
31	NC_009777	GA	3	6	20683	20688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009777	GA	3	6	21814	21819	50 %	0 %	50 %	0 %	156936708
33	NC_009777	GC	3	6	22423	22428	0 %	0 %	50 %	50 %	156936708
34	NC_009777	AT	3	6	22719	22724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009777	AT	3	6	23341	23346	50 %	50 %	0 %	0 %	156936709
36	NC_009777	TA	3	6	24988	24993	50 %	50 %	0 %	0 %	156936710
37	NC_009777	GT	3	6	25256	25261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009777	AG	3	6	26356	26361	50 %	0 %	50 %	0 %	156936712
39	NC_009777	AG	3	6	26510	26515	50 %	0 %	50 %	0 %	156936712
40	NC_009777	TA	3	6	27396	27401	50 %	50 %	0 %	0 %	156936713
41	NC_009777	GA	3	6	27501	27506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009777	CT	3	6	31160	31165	0 %	50 %	0 %	50 %	156936717
43	NC_009777	TC	3	6	32829	32834	0 %	50 %	0 %	50 %	156936719
44	NC_009777	TG	3	6	33548	33553	0 %	50 %	50 %	0 %	156936719
45	NC_009777	CT	3	6	33779	33784	0 %	50 %	0 %	50 %	156936719
46	NC_009777	GT	3	6	34283	34288	0 %	50 %	50 %	0 %	156936720
47	NC_009777	AC	3	6	35603	35608	50 %	0 %	0 %	50 %	156936722
48	NC_009777	AG	3	6	36657	36662	50 %	0 %	50 %	0 %	156936722
49	NC_009777	GA	3	6	39148	39153	50 %	0 %	50 %	0 %	156936726
50	NC_009777	AT	3	6	40074	40079	50 %	50 %	0 %	0 %	156936728
51	NC_009777	CA	3	6	40460	40465	50 %	0 %	0 %	50 %	156936729
52	NC_009777	GT	3	6	41458	41463	0 %	50 %	50 %	0 %	156936729
53	NC_009777	TC	3	6	41860	41865	0 %	50 %	0 %	50 %	156936729
54	NC_009777	TG	3	6	42485	42490	0 %	50 %	50 %	0 %	156936729
55	NC_009777	AG	3	6	42642	42647	50 %	0 %	50 %	0 %	156936729
56	NC_009777	TC	3	6	43552	43557	0 %	50 %	0 %	50 %	156936732
57	NC_009777	GT	3	6	44828	44833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009777	TC	3	6	44846	44851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009777	CT	3	6	45075	45080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009777	CT	3	6	45166	45171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009777	TG	3	6	45199	45204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009777	TG	3	6	46891	46896	0 %	50 %	50 %	0 %	156936738
63	NC_009777	CT	3	6	47341	47346	0 %	50 %	0 %	50 %	156936739
64	NC_009777	TA	3	6	47832	47837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009777	CA	3	6	49184	49189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009777	TA	3	6	49295	49300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009777	AT	3	6	49501	49506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009777	GT	3	6	49611	49616	0 %	50 %	50 %	0 %	156936741
69	NC_009777	TG	3	6	49678	49683	0 %	50 %	50 %	0 %	156936741
70	NC_009777	GA	3	6	50052	50057	50 %	0 %	50 %	0 %	156936742
71	NC_009777	AG	3	6	51343	51348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009777	TC	3	6	51899	51904	0 %	50 %	0 %	50 %	156936747
73	NC_009777	TC	3	6	52035	52040	0 %	50 %	0 %	50 %	156936748
74	NC_009777	TG	3	6	52180	52185	0 %	50 %	50 %	0 %	156936748
75	NC_009777	TC	3	6	52264	52269	0 %	50 %	0 %	50 %	156936748
76	NC_009777	GT	3	6	52455	52460	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009777	TG	3	6	53623	53628	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009777	AG	3	6	54254	54259	50 %	0 %	50 %	0 %	156936750
79	NC_009777	CA	3	6	54823	54828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009777	GT	3	6	55608	55613	0 %	50 %	50 %	0 %	156936752
81	NC_009777	CG	3	6	56092	56097	0 %	0 %	50 %	50 %	156936752
82	NC_009777	GA	3	6	56913	56918	50 %	0 %	50 %	0 %	156936752
83	NC_009777	GA	3	6	57562	57567	50 %	0 %	50 %	0 %	156936754
84	NC_009777	GT	3	6	57699	57704	0 %	50 %	50 %	0 %	156936754
85	NC_009777	TA	3	6	57886	57891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009777	TG	3	6	58051	58056	0 %	50 %	50 %	0 %	156936755
87	NC_009777	TA	4	8	58543	58550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009777	AT	3	6	58766	58771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009777	CT	3	6	60822	60827	0 %	50 %	0 %	50 %	156936760
90	NC_009777	AG	3	6	60833	60838	50 %	0 %	50 %	0 %	156936760
91	NC_009777	GC	3	6	60913	60918	0 %	0 %	50 %	50 %	156936760
92	NC_009777	CT	3	6	61840	61845	0 %	50 %	0 %	50 %	156936760
93	NC_009777	AG	3	6	61943	61948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009777	GC	3	6	62351	62356	0 %	0 %	50 %	50 %	156936761
95	NC_009777	GC	3	6	62539	62544	0 %	0 %	50 %	50 %	156936761
96	NC_009777	CA	3	6	62945	62950	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009777	AG	3	6	64842	64847	50 %	0 %	50 %	0 %	156936766
98	NC_009777	TG	3	6	65666	65671	0 %	50 %	50 %	0 %	156936766
99	NC_009777	AG	3	6	65706	65711	50 %	0 %	50 %	0 %	156936766
100	NC_009777	GT	3	6	65897	65902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009777	CT	3	6	65949	65954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009777	CT	4	8	66051	66058	0 %	50 %	0 %	50 %	156936767
103	NC_009777	GA	3	6	66271	66276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009777	GC	3	6	66902	66907	0 %	0 %	50 %	50 %	156936768
105	NC_009777	AG	3	6	67053	67058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009777	AC	3	6	67079	67084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009777	TG	3	6	67378	67383	0 %	50 %	50 %	0 %	156936769
108	NC_009777	TG	3	6	68115	68120	0 %	50 %	50 %	0 %	156936770
109	NC_009777	AG	3	6	68999	69004	50 %	0 %	50 %	0 %	156936772
110	NC_009777	CT	3	6	69652	69657	0 %	50 %	0 %	50 %	156936774
111	NC_009777	GT	3	6	69986	69991	0 %	50 %	50 %	0 %	156936774
112	NC_009777	CT	3	6	71287	71292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009777	AT	3	6	72804	72809	50 %	50 %	0 %	0 %	156936778
114	NC_009777	TG	3	6	74203	74208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009777	AT	3	6	74772	74777	50 %	50 %	0 %	0 %	156936781
116	NC_009777	GA	3	6	74993	74998	50 %	0 %	50 %	0 %	156936781
117	NC_009777	AT	3	6	75191	75196	50 %	50 %	0 %	0 %	156936781
118	NC_009777	AT	3	6	76183	76188	50 %	50 %	0 %	0 %	156936781
119	NC_009777	AT	3	6	76744	76749	50 %	50 %	0 %	0 %	156936781
120	NC_009777	AG	3	6	76760	76765	50 %	0 %	50 %	0 %	156936781
121	NC_009777	AG	4	8	77817	77824	50 %	0 %	50 %	0 %	156936781
122	NC_009777	GA	3	6	77866	77871	50 %	0 %	50 %	0 %	156936781
123	NC_009777	TA	3	6	78313	78318	50 %	50 %	0 %	0 %	156936781
124	NC_009777	CA	3	6	79769	79774	50 %	0 %	0 %	50 %	156936783
125	NC_009777	AG	3	6	80488	80493	50 %	0 %	50 %	0 %	156936783
126	NC_009777	CA	3	6	82436	82441	50 %	0 %	0 %	50 %	156936785
127	NC_009777	AC	3	6	82500	82505	50 %	0 %	0 %	50 %	156936785
128	NC_009777	AG	3	6	82672	82677	50 %	0 %	50 %	0 %	156936785
129	NC_009777	CA	3	6	82879	82884	50 %	0 %	0 %	50 %	156936785
130	NC_009777	TA	4	8	83410	83417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009777	GT	3	6	84102	84107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009777	AG	3	6	85016	85021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009777	AC	3	6	86317	86322	50 %	0 %	0 %	50 %	156936790
134	NC_009777	AG	3	6	86651	86656	50 %	0 %	50 %	0 %	156936790
135	NC_009777	GT	3	6	87183	87188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009777	CA	3	6	87808	87813	50 %	0 %	0 %	50 %	156936793
137	NC_009777	AG	4	8	88104	88111	50 %	0 %	50 %	0 %	156936793
138	NC_009777	CG	3	6	88766	88771	0 %	0 %	50 %	50 %	156936794

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.