MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Vibrio harveyi ATCC BAA-1116 plasmid pVIBHAR

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009777	T	6	6	1242	1247	0 %	100 %	0 %	0 %	156936676
2	NC_009777	T	6	6	3720	3725	0 %	100 %	0 %	0 %	156936681
3	NC_009777	T	7	7	3910	3916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009777	T	6	6	4026	4031	0 %	100 %	0 %	0 %	156936682
5	NC_009777	T	8	8	6072	6079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009777	T	6	6	6084	6089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009777	A	6	6	6153	6158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009777	T	6	6	6454	6459	0 %	100 %	0 %	0 %	156936686
9	NC_009777	T	6	6	6643	6648	0 %	100 %	0 %	0 %	156936687
10	NC_009777	T	6	6	7620	7625	0 %	100 %	0 %	0 %	156936688
11	NC_009777	A	6	6	7977	7982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009777	T	6	6	7994	7999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009777	A	6	6	8182	8187	100 %	0 %	0 %	0 %	156936689
14	NC_009777	T	6	6	11217	11222	0 %	100 %	0 %	0 %	156936690
15	NC_009777	A	6	6	12077	12082	100 %	0 %	0 %	0 %	156936691
16	NC_009777	A	6	6	12228	12233	100 %	0 %	0 %	0 %	156936691
17	NC_009777	T	6	6	13041	13046	0 %	100 %	0 %	0 %	156936694
18	NC_009777	T	6	6	14989	14994	0 %	100 %	0 %	0 %	156936696
19	NC_009777	T	6	6	15685	15690	0 %	100 %	0 %	0 %	156936697
20	NC_009777	A	6	6	15919	15924	100 %	0 %	0 %	0 %	156936698
21	NC_009777	T	6	6	16041	16046	0 %	100 %	0 %	0 %	156936698
22	NC_009777	T	7	7	16257	16263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009777	A	6	6	16306	16311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009777	A	6	6	16329	16334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009777	A	6	6	16340	16345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009777	T	6	6	16497	16502	0 %	100 %	0 %	0 %	156936699
27	NC_009777	A	7	7	16736	16742	100 %	0 %	0 %	0 %	156936699
28	NC_009777	T	6	6	17114	17119	0 %	100 %	0 %	0 %	156936700
29	NC_009777	T	6	6	17952	17957	0 %	100 %	0 %	0 %	156936701
30	NC_009777	A	6	6	18186	18191	100 %	0 %	0 %	0 %	156936702
31	NC_009777	T	6	6	18308	18313	0 %	100 %	0 %	0 %	156936702
32	NC_009777	A	7	7	21205	21211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009777	T	6	6	21849	21854	0 %	100 %	0 %	0 %	156936708
34	NC_009777	C	6	6	23134	23139	0 %	0 %	0 %	100 %	156936709
35	NC_009777	T	6	6	23817	23822	0 %	100 %	0 %	0 %	156936709
36	NC_009777	T	6	6	23872	23877	0 %	100 %	0 %	0 %	156936709
37	NC_009777	T	6	6	25160	25165	0 %	100 %	0 %	0 %	156936710
38	NC_009777	C	6	6	26223	26228	0 %	0 %	0 %	100 %	156936712
39	NC_009777	A	6	6	27105	27110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009777	T	6	6	28095	28100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009777	A	6	6	28684	28689	100 %	0 %	0 %	0 %	156936716
42	NC_009777	T	7	7	30966	30972	0 %	100 %	0 %	0 %	156936717
43	NC_009777	A	6	6	32386	32391	100 %	0 %	0 %	0 %	156936718
44	NC_009777	T	6	6	32716	32721	0 %	100 %	0 %	0 %	156936719
45	NC_009777	T	6	6	32819	32824	0 %	100 %	0 %	0 %	156936719
46	NC_009777	A	8	8	34165	34172	100 %	0 %	0 %	0 %	156936719
47	NC_009777	T	6	6	34195	34200	0 %	100 %	0 %	0 %	156936719
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49	NC_009777	G	7	7	35339	35345	0 %	0 %	100 %	0 %	156936721
50	NC_009777	T	6	6	38238	38243	0 %	100 %	0 %	0 %	156936724
51	NC_009777	T	6	6	38453	38458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009777	A	7	7	38465	38471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009777	C	6	6	39099	39104	0 %	0 %	0 %	100 %	156936726
54	NC_009777	T	6	6	39511	39516	0 %	100 %	0 %	0 %	156936727
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60	NC_009777	T	7	7	44327	44333	0 %	100 %	0 %	0 %	156936733
61	NC_009777	A	8	8	44385	44392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009777	A	6	6	45391	45396	100 %	0 %	0 %	0 %	156936736
63	NC_009777	T	6	6	45613	45618	0 %	100 %	0 %	0 %	156936736
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69	NC_009777	T	6	6	47877	47882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009777	A	6	6	49316	49321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009777	T	7	7	51542	51548	0 %	100 %	0 %	0 %	156936745
72	NC_009777	T	6	6	52224	52229	0 %	100 %	0 %	0 %	156936748
73	NC_009777	T	6	6	52627	52632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009777	T	6	6	53684	53689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009777	A	6	6	55343	55348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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91	NC_009777	A	6	6	62935	62940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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98	NC_009777	A	7	7	66969	66975	100 %	0 %	0 %	0 %	156936768
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103	NC_009777	T	6	6	74800	74805	0 %	100 %	0 %	0 %	156936781
104	NC_009777	A	7	7	76716	76722	100 %	0 %	0 %	0 %	156936781
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108	NC_009777	T	6	6	81026	81031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009777	A	6	6	81069	81074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009777	A	6	6	82245	82250	100 %	0 %	0 %	0 %	156936785
111	NC_009777	A	6	6	83272	83277	100 %	0 %	0 %	0 %	156936786
112	NC_009777	A	6	6	84176	84181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009777	T	6	6	84633	84638	0 %	100 %	0 %	0 %	156936788
114	NC_009777	T	6	6	87203	87208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009777	T	6	6	88338	88343	0 %	100 %	0 %	0 %	156936793

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.