MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Ignicoccus hospitalis KIN4/I chromosome

Total Repeats: 683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009776	CTCTTG	2	12	7118	7129	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	156936802
2	NC_009776	GCACGA	2	12	10986	10997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936806
3	NC_009776	TTCGAA	2	12	13028	13039	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156936808
4	NC_009776	TTCACT	2	12	13559	13570	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	156936809
5	NC_009776	GTAAGT	2	12	15966	15977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936811
6	NC_009776	CTAAAG	2	12	18816	18827	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	156936812
7	NC_009776	CCTCTT	2	12	21046	21057	0 %	50 %	0 %	50 %	156936814
8	NC_009776	ACGAAC	2	12	21755	21766	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	156936815
9	NC_009776	TTGGAG	2	12	23849	23860	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	156936818
10	NC_009776	ACGAAG	2	12	27412	27423	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	156936821
11	NC_009776	ACTTGT	2	12	28006	28017	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156936822
12	NC_009776	TACTTC	2	12	29271	29282	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	156936825
13	NC_009776	ACTCGT	2	12	29962	29973	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156936826
14	NC_009776	CAAGGC	2	12	31607	31618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936829
15	NC_009776	CGTTGC	2	12	34922	34933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936831
16	NC_009776	TTGAGG	2	12	43198	43209	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	156936840
17	NC_009776	CGAAGG	2	12	48302	48313	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	156936846
18	NC_009776	AGGACG	2	12	54530	54541	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	156936852
19	NC_009776	GAAATA	2	12	55220	55231	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	156936853
20	NC_009776	TGACAC	2	12	57160	57171	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156936855
21	NC_009776	GATAGC	2	12	57937	57948	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156936856
22	NC_009776	ACGGCG	2	12	58271	58282	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	156936856
23	NC_009776	GCTGTT	2	12	60285	60296	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	156936857
24	NC_009776	TTAAAG	2	12	65714	65725	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	156936863
25	NC_009776	GAACTT	2	12	70848	70859	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156936868
26	NC_009776	CGTTGG	2	12	70913	70924	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	156936869
27	NC_009776	AGCCCC	2	12	71418	71429	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	156936869
28	NC_009776	CGTTTA	2	12	71776	71787	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156936870
29	NC_009776	TCATAC	2	12	81639	81650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936879
30	NC_009776	TTACCT	2	12	83315	83326	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	156936881
31	NC_009776	CTCCCT	2	12	83544	83555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936881
32	NC_009776	GCAAGG	2	12	84566	84577	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	156936882
33	NC_009776	GGGTGA	2	12	86551	86562	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	156936886
34	NC_009776	CAAGGA	2	12	90151	90162	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	156936891
35	NC_009776	GGTGAG	2	12	91216	91227	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	156936891
36	NC_009776	CTTACC	2	12	98921	98932	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	156936900
37	NC_009776	ACCTCT	2	12	100611	100622	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	156936902
38	NC_009776	CCAACT	2	12	104657	104668	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	156936908
39	NC_009776	CAAGAG	2	12	107541	107552	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	156936913
40	NC_009776	CAAGCC	2	12	110895	110906	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	156936918
41	NC_009776	AAGGTG	2	12	114190	114201	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	156936922
42	NC_009776	CGCGGT	2	12	114447	114458	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	156936922
43	NC_009776	CCACTA	2	12	114856	114867	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	156936923
44	NC_009776	TGCCGG	2	12	119951	119962	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	156936927
45	NC_009776	ATTATC	2	12	124593	124604	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	156936933
46	NC_009776	ATTTTA	2	12	126566	126577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936935
47	NC_009776	GGCGTC	2	12	126782	126793	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	156936935
48	NC_009776	GAGATA	2	12	129255	129266	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	156936937
49	NC_009776	AAGATG	2	12	133742	133753	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	156936943
50	NC_009776	TCACGC	2	12	134544	134555	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	156936944
51	NC_009776	AGAAAG	2	12	138633	138644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936946
52	NC_009776	CGTTCC	2	12	139986	139997	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	156936948
53	NC_009776	TTACGT	2	12	141869	141880	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156936951
54	NC_009776	CGTAAC	2	12	142604	142615	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156936953
55	NC_009776	AGAGGT	2	12	147028	147039	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	156936957
56	NC_009776	TGGAGG	2	12	147123	147134	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	156936957
57	NC_009776	GCCTTA	2	12	147726	147737	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156936958
58	NC_009776	GTACCG	2	12	151946	151957	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	156936963
59	NC_009776	GACCCT	2	12	157030	157041	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	156936969
60	NC_009776	GCTTCG	2	12	159689	159700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936974
61	NC_009776	AGGGCG	2	12	159778	159789	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	156936974
62	NC_009776	CGAGGA	2	12	161795	161806	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	156936978
63	NC_009776	GACGCG	2	12	163004	163015	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	156936980
64	NC_009776	TAGACT	2	12	165510	165521	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156936986
65	NC_009776	CGGGCT	2	12	168206	168217	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	156936987
66	NC_009776	CAGGGG	2	12	170755	170766	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	156936989
67	NC_009776	AAGAGG	2	12	171391	171402	50 %	0 %	50 %	0 %	156936991
68	NC_009776	CGAAGC	2	12	173355	173366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936991
69	NC_009776	GCTAAG	2	12	176390	176401	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156936993
70	NC_009776	TCCCCT	2	12	177183	177194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936994
71	NC_009776	GTAGCC	2	12	184413	184424	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	156937002
72	NC_009776	CGAGCG	2	12	192808	192819	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	156937014
73	NC_009776	AAGTTG	2	12	197746	197757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156937018
74	NC_009776	CCTCAC	2	12	198194	198205	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	156937019
75	NC_009776	CCGACG	2	12	199528	199539	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	156937022
76	NC_009776	AGCGAG	2	12	200525	200536	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	156937023
77	NC_009776	CCCTCG	2	12	201293	201304	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	156937024
78	NC_009776	GGCCTT	2	12	201849	201860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156937025
79	NC_009776	CTCATC	2	12	202222	202233	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	156937025
80	NC_009776	CCTCGG	2	12	203125	203136	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	156937026
81	NC_009776	AAGCCG	2	12	207888	207899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156937034
82	NC_009776	TGACCG	2	12	214019	214030	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	156937039
83	NC_009776	GTGTAC	2	12	214204	214215	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156937040
84	NC_009776	AGATAG	2	12	214542	214553	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	156937041
85	NC_009776	GGGTAT	2	12	218909	218920	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	156937047
86	NC_009776	GGCAAG	2	12	222353	222364	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	156937051
87	NC_009776	AGGACG	2	12	222701	222712	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	156937052
88	NC_009776	CCTCGG	2	12	223221	223232	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	156937053
89	NC_009776	GCTCTA	2	12	224422	224433	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156937054
90	NC_009776	CAACTT	2	12	225116	225127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156937055
91	NC_009776	GTAGGA	2	12	228066	228077	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	156937060
92	NC_009776	CCACGT	2	12	228203	228214	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	156937060
93	NC_009776	GCCCTG	2	12	233373	233384	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	156937066
94	NC_009776	TCGGGC	2	12	234449	234460	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	156937068
95	NC_009776	AGCTCC	2	12	234875	234886	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	156937068
96	NC_009776	CTTCCT	2	12	239765	239776	0 %	50 %	0 %	50 %	156937073
97	NC_009776	CTCCGC	2	12	239904	239915	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	156937073
98	NC_009776	GTCCTT	2	12	240949	240960	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	156937074
99	NC_009776	CCTCCC	2	12	241409	241420	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	156937075
100	NC_009776	CGTGGA	2	12	246558	246569	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	156937083
101	NC_009776	CCTCCC	2	12	248751	248762	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	156937086
102	NC_009776	AAGGGC	2	12	251607	251618	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	156937089
103	NC_009776	GTTTAT	2	12	253969	253980	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	156937090
104	NC_009776	GAAGAG	2	12	254230	254241	50 %	0 %	50 %	0 %	156937091
105	NC_009776	GGGCGG	2	12	255045	255056	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	156937092
106	NC_009776	GAGAAG	2	12	255412	255423	50 %	0 %	50 %	0 %	156937092
107	NC_009776	GCCTAC	2	12	255905	255916	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	156937093
108	NC_009776	CGCCAG	2	12	256795	256806	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	156937094
109	NC_009776	TCCCCC	2	12	257533	257544	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	156937095
110	NC_009776	GCAAGG	2	12	258211	258222	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	156937096
111	NC_009776	CTTCGG	2	12	261890	261901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156937100
112	NC_009776	GAGATA	2	12	262026	262037	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	156937100
113	NC_009776	TCTTCC	2	12	267429	267440	0 %	50 %	0 %	50 %	156937107
114	NC_009776	CCCTAG	2	12	270667	270678	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	156937108
115	NC_009776	TTATCT	2	12	271330	271341	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	156937109
116	NC_009776	CCTCGA	2	12	273105	273116	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	156937110
117	NC_009776	CACCGC	2	12	276549	276560	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	156937113
118	NC_009776	TACTTG	2	12	278402	278413	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156937115
119	NC_009776	AAGCTG	2	12	278825	278836	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156937115
120	NC_009776	GTACAA	2	12	278947	278958	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	156937116
121	NC_009776	GAACGA	2	12	282949	282960	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	156937120
122	NC_009776	CAAGTC	2	12	292390	292401	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156937125
123	NC_009776	CTCCCC	2	12	293340	293351	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	156937126
124	NC_009776	ACCTTG	2	12	294907	294918	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156937129
125	NC_009776	GTCTAC	2	12	295215	295226	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156937130
126	NC_009776	CCCAAG	2	12	297797	297808	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	156937134
127	NC_009776	GGACGT	2	12	300965	300976	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	156937136
128	NC_009776	GCTCCA	2	12	303660	303671	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	156937139
129	NC_009776	CCCTCA	2	12	310276	310287	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	156937147
130	NC_009776	TCGAAG	2	12	310919	310930	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156937148
131	NC_009776	GGTGTT	2	12	311155	311166	0 %	50 %	50 %	0 %	156937148
132	NC_009776	CAACTC	2	12	319071	319082	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	156937158
133	NC_009776	CGTCTT	2	12	319209	319220	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	156937158
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136	NC_009776	GAGGTG	2	12	320819	320830	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	156937160
137	NC_009776	TCCAAG	2	12	326186	326197	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156937164
138	NC_009776	TCTCCC	2	12	327364	327375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156937164
139	NC_009776	GGGGAA	2	12	331062	331073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156937169
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141	NC_009776	AACTCC	2	12	332847	332858	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	156937171
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143	NC_009776	TATAGG	2	12	333399	333410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156937172
144	NC_009776	CGGAGG	2	12	334752	334763	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	156937173
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146	NC_009776	CCAGGG	2	12	335654	335665	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	156937175
147	NC_009776	AGGCCA	2	12	335729	335740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156937175
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153	NC_009776	GTAATG	2	12	346795	346806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156937187
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155	NC_009776	AGCTGG	2	12	349262	349273	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	156937189
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216	NC_009776	AAGCTC	2	12	450524	450535	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156937304
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218	NC_009776	CACTAG	2	12	455632	455643	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156937307
219	NC_009776	TTCGTC	2	12	457758	457769	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	156937309
220	NC_009776	GTTCAA	2	12	458408	458419	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156937309
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222	NC_009776	CCCCAC	2	12	463848	463859	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	156937311
223	NC_009776	AAGGGG	2	12	467868	467879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156937317
224	NC_009776	GAGGTG	2	12	474775	474786	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	156937324
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227	NC_009776	TGAAGA	2	12	486039	486050	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	156937334
228	NC_009776	TCTCGT	2	12	487587	487598	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	156937335
229	NC_009776	GAAGGC	2	12	488343	488354	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	156937336
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231	NC_009776	CCGCGC	2	12	491277	491288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156937339
232	NC_009776	CTATTA	2	12	496618	496629	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	156937345
233	NC_009776	GACCTC	2	12	497650	497661	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	156937346
234	NC_009776	AGCGGA	2	12	499541	499552	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	156937348
235	NC_009776	GACCTC	2	12	501890	501901	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	156937350
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243	NC_009776	TTCAAG	2	12	514443	514454	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156937363
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342	NC_009776	GAACGA	2	12	688711	688722	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	156937563
343	NC_009776	CCGTAG	2	12	691615	691626	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	156937568
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