MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ignicoccus hospitalis KIN4/I chromosome

Total Repeats: 760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009776	CCCTT	2	10	337	346	0 %	40 %	0 %	60 %	156936796
2	NC_009776	CCTCG	2	10	374	383	0 %	20 %	20 %	60 %	156936796
3	NC_009776	GGTAA	2	10	3366	3375	40 %	20 %	40 %	0 %	156936797
4	NC_009776	GAGGG	2	10	3414	3423	20 %	0 %	80 %	0 %	156936797
5	NC_009776	TCGAG	2	10	5403	5412	20 %	20 %	40 %	20 %	156936801
6	NC_009776	TCGCA	2	10	5695	5704	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_009776	ACGCC	2	10	6147	6156	20 %	0 %	20 %	60 %	156936802
8	NC_009776	ACTTG	2	10	6339	6348	20 %	40 %	20 %	20 %	156936802
9	NC_009776	TCCAG	2	10	7185	7194	20 %	20 %	20 %	40 %	156936802
10	NC_009776	GCACC	2	10	9187	9196	20 %	0 %	20 %	60 %	156936804
11	NC_009776	TTGTT	2	10	9310	9319	0 %	80 %	20 %	0 %	156936804
12	NC_009776	TTATC	2	10	10471	10480	20 %	60 %	0 %	20 %	156936804
13	NC_009776	GGAAG	2	10	11764	11773	40 %	0 %	60 %	0 %	156936807
14	NC_009776	AGGAG	2	10	12272	12281	40 %	0 %	60 %	0 %	156936808
15	NC_009776	CTCCG	2	10	12637	12646	0 %	20 %	20 %	60 %	156936808
16	NC_009776	AGGGA	2	10	14688	14697	40 %	0 %	60 %	0 %	156936811
17	NC_009776	AACGA	2	10	17016	17025	60 %	0 %	20 %	20 %	156936812
18	NC_009776	GGAGG	2	10	17380	17389	20 %	0 %	80 %	0 %	156936812
19	NC_009776	GGAAA	2	10	24981	24990	60 %	0 %	40 %	0 %	156936820
20	NC_009776	CGGGG	2	10	25514	25523	0 %	0 %	80 %	20 %	156936820
21	NC_009776	GCCCC	2	10	26304	26313	0 %	0 %	20 %	80 %	156936820
22	NC_009776	CCCGC	2	10	26568	26577	0 %	0 %	20 %	80 %	156936820
23	NC_009776	GCCTC	2	10	29906	29915	0 %	20 %	20 %	60 %	156936826
24	NC_009776	GGCCG	3	15	30213	30227	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_009776	GCGTG	2	10	31634	31643	0 %	20 %	60 %	20 %	156936829
26	NC_009776	CGCAC	2	10	32264	32273	20 %	0 %	20 %	60 %	156936829
27	NC_009776	CCTTT	2	10	35426	35435	0 %	60 %	0 %	40 %	156936832
28	NC_009776	AAGGA	2	10	37847	37856	60 %	0 %	40 %	0 %	156936834
29	NC_009776	GAGGG	2	10	39331	39340	20 %	0 %	80 %	0 %	156936836
30	NC_009776	TGGGA	2	10	40212	40221	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009776	TGTTT	2	10	42438	42447	0 %	80 %	20 %	0 %	156936839
32	NC_009776	TGGGA	2	10	42582	42591	20 %	20 %	60 %	0 %	156936840
33	NC_009776	GGAAG	2	10	42986	42995	40 %	0 %	60 %	0 %	156936840
34	NC_009776	GCTTT	2	10	43879	43888	0 %	60 %	20 %	20 %	156936840
35	NC_009776	TGCTC	2	10	44888	44897	0 %	40 %	20 %	40 %	156936841
36	NC_009776	CAAGA	2	10	45352	45361	60 %	0 %	20 %	20 %	156936842
37	NC_009776	TCCCT	2	10	49393	49402	0 %	40 %	0 %	60 %	156936847
38	NC_009776	AAAGA	2	10	49742	49751	80 %	0 %	20 %	0 %	156936847
39	NC_009776	GAAGT	2	10	55640	55649	40 %	20 %	40 %	0 %	156936853
40	NC_009776	ATTTT	2	10	56334	56343	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009776	AAGAG	2	10	57687	57696	60 %	0 %	40 %	0 %	156936856
42	NC_009776	GAGGG	2	10	57824	57833	20 %	0 %	80 %	0 %	156936856
43	NC_009776	AGCCT	2	10	58693	58702	20 %	20 %	20 %	40 %	156936857
44	NC_009776	CTCCC	2	10	64289	64298	0 %	20 %	0 %	80 %	156936862
45	NC_009776	AGGGG	2	10	64906	64915	20 %	0 %	80 %	0 %	156936862
46	NC_009776	CGAGC	2	10	65773	65782	20 %	0 %	40 %	40 %	156936863
47	NC_009776	GAAGA	2	10	67931	67940	60 %	0 %	40 %	0 %	156936865
48	NC_009776	ACGCC	2	10	72040	72049	20 %	0 %	20 %	60 %	156936870
49	NC_009776	AGGGG	2	10	74535	74544	20 %	0 %	80 %	0 %	156936873
50	NC_009776	TCCTT	2	10	78457	78466	0 %	60 %	0 %	40 %	156936876
51	NC_009776	GAGAA	2	10	84419	84428	60 %	0 %	40 %	0 %	156936882
52	NC_009776	AAGGC	2	10	84921	84930	40 %	0 %	40 %	20 %	156936883
53	NC_009776	GCCGG	2	10	85121	85130	0 %	0 %	60 %	40 %	156936884
54	NC_009776	GAAGG	2	10	85325	85334	40 %	0 %	60 %	0 %	156936884
55	NC_009776	CGAGG	2	10	86076	86085	20 %	0 %	60 %	20 %	156936885
56	NC_009776	TAGTA	2	10	87768	87777	40 %	40 %	20 %	0 %	156936888
57	NC_009776	AAGGA	2	10	88042	88051	60 %	0 %	40 %	0 %	156936888
58	NC_009776	CCCTT	2	10	89479	89488	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_009776	CTGGG	2	10	91984	91993	0 %	20 %	60 %	20 %	156936892
60	NC_009776	AGCTG	2	10	94144	94153	20 %	20 %	40 %	20 %	156936895
61	NC_009776	CCCTA	2	10	96726	96735	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
62	NC_009776	GGGCC	2	10	97581	97590	0 %	0 %	60 %	40 %	156936899
63	NC_009776	GGCCC	2	10	98361	98370	0 %	0 %	40 %	60 %	156936900
64	NC_009776	AAGTC	2	10	98620	98629	40 %	20 %	20 %	20 %	156936900
65	NC_009776	TCCTT	2	10	101693	101702	0 %	60 %	0 %	40 %	156936903
66	NC_009776	CTTCT	2	10	105966	105975	0 %	60 %	0 %	40 %	156936910
67	NC_009776	CGAGC	2	10	109982	109991	20 %	0 %	40 %	40 %	156936917
68	NC_009776	CCACC	2	10	113726	113735	20 %	0 %	0 %	80 %	156936921
69	NC_009776	CAGCC	2	10	114740	114749	20 %	0 %	20 %	60 %	156936923
70	NC_009776	TCCCT	2	10	115354	115363	0 %	40 %	0 %	60 %	156936924
71	NC_009776	CCCTT	2	10	116009	116018	0 %	40 %	0 %	60 %	156936924
72	NC_009776	CGGGA	2	10	116653	116662	20 %	0 %	60 %	20 %	156936924
73	NC_009776	CGTGG	2	10	117225	117234	0 %	20 %	60 %	20 %	156936924
74	NC_009776	GGGCG	2	10	120024	120033	0 %	0 %	80 %	20 %	156936927
75	NC_009776	CCCTC	2	10	120544	120553	0 %	20 %	0 %	80 %	156936928
76	NC_009776	GCCCA	2	10	120792	120801	20 %	0 %	20 %	60 %	156936928
77	NC_009776	GCGGG	2	10	127675	127684	0 %	0 %	80 %	20 %	156936935
78	NC_009776	TTCGC	2	10	128117	128126	0 %	40 %	20 %	40 %	156936936
79	NC_009776	CGTCC	2	10	128352	128361	0 %	20 %	20 %	60 %	156936936
80	NC_009776	AGGCG	2	10	128810	128819	20 %	0 %	60 %	20 %	156936937
81	NC_009776	CAAGG	2	10	129321	129330	40 %	0 %	40 %	20 %	156936938
82	NC_009776	TGGTG	2	10	131280	131289	0 %	40 %	60 %	0 %	156936940
83	NC_009776	GTGGG	2	10	132809	132818	0 %	20 %	80 %	0 %	156936942
84	NC_009776	GGAGG	2	10	133824	133833	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009776	AGAGG	2	10	134101	134110	40 %	0 %	60 %	0 %	156936944
86	NC_009776	GGGAG	2	10	134406	134415	20 %	0 %	80 %	0 %	156936944
87	NC_009776	TCTAT	2	10	134690	134699	20 %	60 %	0 %	20 %	156936944
88	NC_009776	GGAAG	2	10	136602	136611	40 %	0 %	60 %	0 %	156936945
89	NC_009776	ACGTG	2	10	138985	138994	20 %	20 %	40 %	20 %	156936947
90	NC_009776	CCAGC	2	10	143894	143903	20 %	0 %	20 %	60 %	156936954
91	NC_009776	GATAT	2	10	144832	144841	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009776	GAGCT	2	10	145319	145328	20 %	20 %	40 %	20 %	156936956
93	NC_009776	GGGGA	2	10	147055	147064	20 %	0 %	80 %	0 %	156936957
94	NC_009776	CTTCC	2	10	148344	148353	0 %	40 %	0 %	60 %	156936959
95	NC_009776	GTGTT	2	10	152909	152918	0 %	60 %	40 %	0 %	156936964
96	NC_009776	TCCCG	2	10	153080	153089	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
97	NC_009776	CGAGG	2	10	154107	154116	20 %	0 %	60 %	20 %	156936966
98	NC_009776	GGGCC	2	10	154913	154922	0 %	0 %	60 %	40 %	156936966
99	NC_009776	GGGAG	2	10	156316	156325	20 %	0 %	80 %	0 %	156936968
100	NC_009776	GAAGT	2	10	157503	157512	40 %	20 %	40 %	0 %	156936970
101	NC_009776	AGGAG	2	10	159240	159249	40 %	0 %	60 %	0 %	156936973
102	NC_009776	AGACA	2	10	160350	160359	60 %	0 %	20 %	20 %	156936975
103	NC_009776	AGGTG	2	10	160485	160494	20 %	20 %	60 %	0 %	156936975
104	NC_009776	GGATG	2	10	163062	163071	20 %	20 %	60 %	0 %	156936980
105	NC_009776	AAGGG	2	10	163201	163210	40 %	0 %	60 %	0 %	156936981
106	NC_009776	TCAGC	2	10	165610	165619	20 %	20 %	20 %	40 %	156936986
107	NC_009776	AAGAG	2	10	166311	166320	60 %	0 %	40 %	0 %	156936986
108	NC_009776	CAGCT	2	10	167192	167201	20 %	20 %	20 %	40 %	156936986
109	NC_009776	CGTTG	2	10	168179	168188	0 %	40 %	40 %	20 %	156936987
110	NC_009776	CGGCG	2	10	170818	170827	0 %	0 %	60 %	40 %	156936989
111	NC_009776	ACGCT	2	10	179345	179354	20 %	20 %	20 %	40 %	156936996
112	NC_009776	CGACC	2	10	180392	180401	20 %	0 %	20 %	60 %	156936997
113	NC_009776	ACTCG	2	10	182400	182409	20 %	20 %	20 %	40 %	156937000
114	NC_009776	TGCAT	2	10	186441	186450	20 %	40 %	20 %	20 %	156937005
115	NC_009776	ATAGT	2	10	187763	187772	40 %	40 %	20 %	0 %	156937006
116	NC_009776	TGGGA	2	10	188471	188480	20 %	20 %	60 %	0 %	156937007
117	NC_009776	TTCTC	2	10	188752	188761	0 %	60 %	0 %	40 %	156937008
118	NC_009776	GGGGT	2	10	190349	190358	0 %	20 %	80 %	0 %	156937011
119	NC_009776	TCCTC	2	10	190588	190597	0 %	40 %	0 %	60 %	156937012
120	NC_009776	CCACG	2	10	192019	192028	20 %	0 %	20 %	60 %	156937013
121	NC_009776	GACGC	2	10	194633	194642	20 %	0 %	40 %	40 %	156937015
122	NC_009776	TTCTC	2	10	194915	194924	0 %	60 %	0 %	40 %	156937015
123	NC_009776	GACGA	2	10	197680	197689	40 %	0 %	40 %	20 %	156937018
124	NC_009776	TACCT	2	10	199337	199346	20 %	40 %	0 %	40 %	156937022
125	NC_009776	TCGCC	2	10	210101	210110	0 %	20 %	20 %	60 %	156937038
126	NC_009776	AGGCC	2	10	210715	210724	20 %	0 %	40 %	40 %	156937038
127	NC_009776	GTTCC	2	10	211037	211046	0 %	40 %	20 %	40 %	156937038
128	NC_009776	CAAGG	2	10	212228	212237	40 %	0 %	40 %	20 %	156937038
129	NC_009776	AAGGG	2	10	213359	213368	40 %	0 %	60 %	0 %	156937039
130	NC_009776	GACGC	2	10	218511	218520	20 %	0 %	40 %	40 %	156937047
131	NC_009776	CTTGC	2	10	218758	218767	0 %	40 %	20 %	40 %	156937047
132	NC_009776	TCCTC	2	10	219745	219754	0 %	40 %	0 %	60 %	156937048
133	NC_009776	CTACG	2	10	222001	222010	20 %	20 %	20 %	40 %	156937051
134	NC_009776	GCCCC	2	10	222455	222464	0 %	0 %	20 %	80 %	156937052
135	NC_009776	CCAGC	2	10	222897	222906	20 %	0 %	20 %	60 %	156937052
136	NC_009776	GGAGA	2	10	226695	226704	40 %	0 %	60 %	0 %	156937056
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