MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Ignicoccus hospitalis KIN4/I chromosome

Total Repeats: 262

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009776	CCTC	2	8	26862	26869	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_009776	TAGA	2	8	26991	26998	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009776	GAGG	2	8	32469	32476	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009776	GCGT	2	8	35241	35248	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009776	GATC	2	8	55727	55734	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009776	GAGG	2	8	57302	57309	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009776	TCCT	2	8	61013	61020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009776	GCGG	2	8	76614	76621	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009776	TCGA	2	8	89051	89058	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009776	CCTC	2	8	89178	89185	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_009776	GGTG	2	8	89700	89707	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009776	ACAT	2	8	127929	127936	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009776	AGGG	2	8	135088	135095	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009776	TGGG	2	8	135131	135138	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009776	AATT	2	8	150067	150074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009776	GGAC	2	8	153099	153106	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009776	CGAA	2	8	157256	157263	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009776	CGCT	2	8	167947	167954	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009776	CCTT	2	8	169364	169371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009776	GGGC	2	8	169655	169662	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009776	GGCG	2	8	178616	178623	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009776	AGCA	2	8	180854	180861	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009776	CCCA	2	8	180997	181004	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_009776	GCGT	2	8	184208	184215	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009776	CTCC	2	8	184267	184274	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_009776	GAGG	3	12	202256	202267	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009776	GCTC	2	8	215710	215717	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009776	CTTT	2	8	223162	223169	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009776	TAAA	2	8	223175	223182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009776	GAAG	2	8	227369	227376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009776	CCTC	2	8	234933	234940	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_009776	GCCC	2	8	245667	245674	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_009776	AGGG	2	8	247045	247052	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009776	GAGG	2	8	247107	247114	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009776	TCTT	2	8	260374	260381	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009776	GGCG	2	8	260636	260643	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009776	ACGA	2	8	260869	260876	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009776	CCGG	2	8	261304	261311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009776	GAGG	2	8	277541	277548	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009776	TCCC	2	8	277570	277577	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_009776	CGAT	2	8	284290	284297	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009776	AACG	2	8	285329	285336	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009776	GCCC	2	8	289904	289911	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_009776	AGAA	2	8	290836	290843	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009776	CGGT	2	8	298639	298646	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009776	CCTA	2	8	308058	308065	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009776	GAAG	2	8	308094	308101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009776	ACGT	2	8	311966	311973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009776	CCTC	2	8	312855	312862	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_009776	GGCC	2	8	312934	312941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009776	GGGA	2	8	314271	314278	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009776	GCTA	2	8	330554	330561	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009776	GTCG	2	8	330577	330584	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009776	GAAG	2	8	335190	335197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009776	CCGG	2	8	352534	352541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009776	GAGG	2	8	352621	352628	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009776	CCTC	2	8	356911	356918	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_009776	CGTT	2	8	356962	356969	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009776	CCCT	2	8	363047	363054	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_009776	CGGG	2	8	374777	374784	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009776	GGGC	2	8	383051	383058	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009776	CTCG	2	8	384320	384327	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009776	CTTA	2	8	385065	385072	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009776	GGGA	2	8	386419	386426	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009776	GGAA	2	8	389298	389305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009776	CCGG	2	8	389357	389364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009776	CCCT	2	8	394812	394819	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_009776	AGGG	2	8	394820	394827	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009776	CGTT	2	8	405585	405592	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009776	TCAG	2	8	421235	421242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009776	TCAC	2	8	438123	438130	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009776	CGCC	2	8	438133	438140	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_009776	ATCA	2	8	451633	451640	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009776	CCTC	2	8	453430	453437	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
75	NC_009776	AGGA	2	8	454024	454031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009776	GACG	2	8	454115	454122	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009776	GAAG	2	8	454400	454407	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009776	ATAA	2	8	457009	457016	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009776	CTAC	2	8	457032	457039	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009776	GCCC	2	8	468151	468158	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
81	NC_009776	GCCG	2	8	473011	473018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009776	CGGG	2	8	500917	500924	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009776	GACT	2	8	503823	503830	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009776	TAAA	2	8	505486	505493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009776	CCTC	2	8	507272	507279	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_009776	GGTC	2	8	508253	508260	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009776	GCCC	2	8	509254	509261	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
88	NC_009776	AGGA	2	8	535891	535898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009776	TTTA	2	8	544927	544934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009776	GGGC	2	8	553831	553838	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009776	CTTC	2	8	556682	556689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009776	AACT	2	8	556776	556783	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009776	AGAA	2	8	557175	557182	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009776	AAGC	2	8	557708	557715	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009776	GCTT	2	8	560784	560791	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009776	CTCC	2	8	586354	586361	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_009776	TTAG	2	8	597777	597784	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009776	TTCG	2	8	599468	599475	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009776	AGTT	2	8	599755	599762	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009776	AGGA	2	8	599841	599848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009776	CTTT	2	8	606525	606532	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009776	TAAA	2	8	608803	608810	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009776	TTTA	2	8	619224	619231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009776	TTAG	2	8	632505	632512	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009776	ATTT	2	8	651075	651082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009776	GGGC	2	8	672409	672416	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009776	CGTT	2	8	677420	677427	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009776	TTCG	2	8	682342	682349	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009776	CGAA	2	8	682353	682360	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009776	GGTA	2	8	693753	693760	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009776	CCGT	2	8	705446	705453	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009776	CGGT	2	8	711920	711927	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009776	AATT	2	8	711928	711935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009776	TCTA	2	8	713706	713713	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009776	AACA	2	8	715925	715932	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009776	GTCG	2	8	716032	716039	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009776	TCTT	2	8	717620	717627	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_009776	AGTT	2	8	718125	718132	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009776	TTTC	2	8	719362	719369	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009776	AGGA	2	8	719654	719661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009776	GCCC	2	8	720203	720210	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_009776	TATG	2	8	720286	720293	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009776	TCCG	2	8	728009	728016	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_009776	CCCG	2	8	728304	728311	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125	NC_009776	CGCC	2	8	728424	728431	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_009776	GGGC	2	8	729154	729161	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009776	GCCC	2	8	729167	729174	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128	NC_009776	CGAG	2	8	729420	729427	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_009776	CCTA	2	8	729918	729925	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009776	CGCT	2	8	729961	729968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_009776	CTCG	2	8	730997	731004	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_009776	CGGC	2	8	731262	731269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009776	GGAA	2	8	731926	731933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009776	GCCG	2	8	732613	732620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009776	GGCG	2	8	732663	732670	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009776	CCGG	2	8	733831	733838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009776	GCCC	2	8	734016	734023	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
138	NC_009776	CGGG	2	8	734357	734364	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009776	GGCC	2	8	734447	734454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009776	CAAC	2	8	735917	735924	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_009776	ATTT	2	8	760896	760903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009776	CAAG	2	8	760906	760913	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009776	TGGG	2	8	761448	761455	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009776	AGAA	2	8	785176	785183	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009776	CCCT	2	8	790798	790805	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
146	NC_009776	GCTG	2	8	793272	793279	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009776	GAGG	2	8	793463	793470	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009776	CTCC	2	8	794503	794510	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
149	NC_009776	TGTT	2	8	795774	795781	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_009776	CTCC	2	8	797795	797802	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.