MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ignicoccus hospitalis KIN4/I chromosome

Total Repeats: 20553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009776	GCA	2	6	160	165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936796
2	NC_009776	TAT	2	6	203	208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936796
3	NC_009776	TCG	3	9	228	236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936796
4	NC_009776	CCG	2	6	280	285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936796
5	NC_009776	ACA	2	6	298	303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936796
6	NC_009776	TTG	2	6	362	367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936796
7	NC_009776	TGC	2	6	418	423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936796
8	NC_009776	TCC	2	6	438	443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936796
9	NC_009776	TCA	2	6	445	450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936796
10	NC_009776	CTA	2	6	493	498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936796
11	NC_009776	TCT	2	6	580	585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936796
12	NC_009776	CCT	2	6	586	591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936796
13	NC_009776	CTC	2	6	611	616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936796
14	NC_009776	CCT	2	6	667	672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936796
15	NC_009776	CTA	2	6	766	771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936796
16	NC_009776	TTC	2	6	825	830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936796
17	NC_009776	ACG	2	6	969	974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936796
18	NC_009776	GCG	2	6	1035	1040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936796
19	NC_009776	CCT	2	6	1045	1050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936796
20	NC_009776	CCG	2	6	1143	1148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936796
21	NC_009776	TTA	2	6	1171	1176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936796
22	NC_009776	CAT	2	6	1180	1185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936796
23	NC_009776	CTC	2	6	1220	1225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936796
24	NC_009776	ATA	2	6	1236	1241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156936796
25	NC_009776	TTG	2	6	1452	1457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936796
26	NC_009776	CCT	2	6	1474	1479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936796
27	NC_009776	CGC	2	6	1556	1561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936796
28	NC_009776	ACG	2	6	1641	1646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936796
29	NC_009776	CGC	2	6	1669	1674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936796
30	NC_009776	CAG	2	6	1724	1729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936796
31	NC_009776	TCT	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936796
32	NC_009776	CTA	2	6	1855	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936796
33	NC_009776	TCT	2	6	2141	2146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936797
34	NC_009776	CTT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936797
35	NC_009776	TCG	2	6	2215	2220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936797
36	NC_009776	GAG	2	6	2247	2252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936797
37	NC_009776	CGC	2	6	2267	2272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936797
38	NC_009776	GAT	2	6	2307	2312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936797
39	NC_009776	CTC	2	6	2346	2351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936797
40	NC_009776	TCG	2	6	2623	2628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936797
41	NC_009776	CAA	2	6	2790	2795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936797
42	NC_009776	CTC	2	6	2806	2811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936797
43	NC_009776	CCA	2	6	2873	2878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936797
44	NC_009776	TGG	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936797
45	NC_009776	TGC	2	6	2903	2908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936797
46	NC_009776	TCT	2	6	2909	2914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936797
47	NC_009776	CCG	2	6	3013	3018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936797
48	NC_009776	TGG	2	6	3023	3028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936797
49	NC_009776	CTA	2	6	3029	3034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936797
50	NC_009776	CGC	2	6	3035	3040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936797
51	NC_009776	TCT	2	6	3093	3098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936797
52	NC_009776	GCG	2	6	3353	3358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936797
53	NC_009776	CAA	2	6	3381	3386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936797
54	NC_009776	TCG	2	6	3391	3396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936797
55	NC_009776	TTA	2	6	3531	3536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936798
56	NC_009776	CTG	2	6	3583	3588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936798
57	NC_009776	GAA	2	6	4053	4058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936799
58	NC_009776	CGT	2	6	4079	4084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936799
59	NC_009776	TCC	2	6	4126	4131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936799
60	NC_009776	GAC	2	6	4185	4190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936799
61	NC_009776	AAT	2	6	4226	4231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156936799
62	NC_009776	GTG	2	6	4247	4252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936799
63	NC_009776	TAC	2	6	4311	4316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936799
64	NC_009776	GGA	2	6	4333	4338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936799
65	NC_009776	GAG	2	6	4355	4360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936799
66	NC_009776	GAA	2	6	4385	4390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936799
67	NC_009776	GTG	2	6	4394	4399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936799
68	NC_009776	CTC	2	6	4449	4454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936799
69	NC_009776	AGG	2	6	4465	4470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936799
70	NC_009776	ATA	2	6	4494	4499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156936799
71	NC_009776	AGG	2	6	4580	4585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936799
72	NC_009776	ACC	2	6	4721	4726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936800
73	NC_009776	CTC	2	6	4756	4761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936800
74	NC_009776	CCT	2	6	4800	4805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936800
75	NC_009776	CAA	2	6	5135	5140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936800
76	NC_009776	CAG	2	6	5172	5177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936800
77	NC_009776	GCC	2	6	5185	5190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936800
78	NC_009776	TAG	2	6	5216	5221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936800
79	NC_009776	CTC	2	6	5227	5232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936800
80	NC_009776	CTT	2	6	5257	5262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936800
81	NC_009776	TCT	2	6	5392	5397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936801
82	NC_009776	CTC	2	6	5458	5463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936801
83	NC_009776	CTT	2	6	5478	5483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936801
84	NC_009776	GTC	2	6	5498	5503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936801
85	NC_009776	AGA	2	6	5542	5547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936801
86	NC_009776	ACC	2	6	5557	5562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936801
87	NC_009776	AAC	2	6	5568	5573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936801
88	NC_009776	CGC	2	6	5611	5616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936801
89	NC_009776	TCC	2	6	5628	5633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936801
90	NC_009776	ATT	2	6	5705	5710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936802
91	NC_009776	CCT	2	6	5751	5756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936802
92	NC_009776	GCC	2	6	5759	5764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936802
93	NC_009776	CTT	2	6	5791	5796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936802
94	NC_009776	CCT	3	9	5824	5832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936802
95	NC_009776	ACG	2	6	5879	5884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936802
96	NC_009776	TCC	2	6	5894	5899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936802
97	NC_009776	CAA	2	6	5912	5917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936802
98	NC_009776	CTT	2	6	6022	6027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936802
99	NC_009776	CCT	2	6	6030	6035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936802
100	NC_009776	CAT	2	6	6064	6069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936802
101	NC_009776	TCT	2	6	6083	6088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936802
102	NC_009776	CCT	2	6	6094	6099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936802
103	NC_009776	CCT	2	6	6328	6333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936802
104	NC_009776	GAG	2	6	6390	6395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936802
105	NC_009776	CCT	2	6	6436	6441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936802
106	NC_009776	CAC	2	6	6478	6483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936802
107	NC_009776	CCT	2	6	6529	6534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936802
108	NC_009776	TTC	2	6	6575	6580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936802
109	NC_009776	GTC	2	6	6619	6624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936802
110	NC_009776	GTT	2	6	6634	6639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936802
111	NC_009776	ACT	2	6	6923	6928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936802
112	NC_009776	CCA	2	6	7071	7076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936802
113	NC_009776	CCT	2	6	7077	7082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936802
114	NC_009776	ATC	2	6	7220	7225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936802
115	NC_009776	TGC	2	6	7302	7307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936802
116	NC_009776	TAT	3	9	7330	7338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936802
117	NC_009776	GCT	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936802
118	NC_009776	TTC	2	6	7430	7435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936802
119	NC_009776	GCC	2	6	7535	7540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936802
120	NC_009776	TCT	2	6	7554	7559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936802
121	NC_009776	GCC	2	6	7640	7645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936802
122	NC_009776	TTG	2	6	7807	7812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936803
123	NC_009776	CGA	3	9	7839	7847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936803
124	NC_009776	AAG	2	6	7897	7902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936803
125	NC_009776	ATT	2	6	7945	7950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936803
126	NC_009776	ACA	2	6	7955	7960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936803
127	NC_009776	TGC	2	6	8038	8043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936803
128	NC_009776	TGG	2	6	8119	8124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936803
129	NC_009776	TAG	2	6	8246	8251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936803
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131	NC_009776	TGG	2	6	8342	8347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936803
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