MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 3897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009767	ATCGG	2	10	1197	1206	20 %	20 %	40 %	20 %	156740029
2	NC_009767	CAGCG	2	10	4463	4472	20 %	0 %	40 %	40 %	156740034
3	NC_009767	GCGGT	2	10	4919	4928	0 %	20 %	60 %	20 %	156740035
4	NC_009767	GCGCC	2	10	9594	9603	0 %	0 %	40 %	60 %	156740039
5	NC_009767	GGCGT	2	10	11260	11269	0 %	20 %	60 %	20 %	156740041
6	NC_009767	TGCGC	2	10	12039	12048	0 %	20 %	40 %	40 %	156740041
7	NC_009767	GCGTC	2	10	13864	13873	0 %	20 %	40 %	40 %	156740042
8	NC_009767	CCGAT	2	10	13877	13886	20 %	20 %	20 %	40 %	156740042
9	NC_009767	CGCTG	2	10	15029	15038	0 %	20 %	40 %	40 %	156740043
10	NC_009767	GCAAC	2	10	15072	15081	40 %	0 %	20 %	40 %	156740043
11	NC_009767	ACCGC	2	10	16924	16933	20 %	0 %	20 %	60 %	156740044
12	NC_009767	GGGTT	2	10	18899	18908	0 %	40 %	60 %	0 %	156740046
13	NC_009767	GCGCC	2	10	21781	21790	0 %	0 %	40 %	60 %	156740047
14	NC_009767	GCGCC	2	10	23197	23206	0 %	0 %	40 %	60 %	156740048
15	NC_009767	CCGCC	2	10	23488	23497	0 %	0 %	20 %	80 %	156740048
16	NC_009767	CGCCC	2	10	26374	26383	0 %	0 %	20 %	80 %	156740049
17	NC_009767	CCGCA	2	10	28333	28342	20 %	0 %	20 %	60 %	156740050
18	NC_009767	GCGCA	2	10	28816	28825	20 %	0 %	40 %	40 %	156740051
19	NC_009767	GCCGC	2	10	29382	29391	0 %	0 %	40 %	60 %	156740051
20	NC_009767	CAGCG	2	10	29965	29974	20 %	0 %	40 %	40 %	156740051
21	NC_009767	CTGCG	2	10	31684	31693	0 %	20 %	40 %	40 %	156740053
22	NC_009767	TCTCA	2	10	31833	31842	20 %	40 %	0 %	40 %	156740053
23	NC_009767	TCCCA	2	10	32390	32399	20 %	20 %	0 %	60 %	156740054
24	NC_009767	CGAGA	2	10	34548	34557	40 %	0 %	40 %	20 %	156740056
25	NC_009767	TGCGC	2	10	36038	36047	0 %	20 %	40 %	40 %	156740056
26	NC_009767	ATTTC	2	10	37447	37456	20 %	60 %	0 %	20 %	156740057
27	NC_009767	GCGCC	2	10	37694	37703	0 %	0 %	40 %	60 %	156740057
28	NC_009767	CGCGC	2	10	38277	38286	0 %	0 %	40 %	60 %	156740057
29	NC_009767	GCGCG	2	10	39224	39233	0 %	0 %	60 %	40 %	156740058
30	NC_009767	CGGAT	2	10	39505	39514	20 %	20 %	40 %	20 %	156740059
31	NC_009767	TGTGC	2	10	40136	40145	0 %	40 %	40 %	20 %	156740059
32	NC_009767	GCTTG	2	10	44078	44087	0 %	40 %	40 %	20 %	156740060
33	NC_009767	CGCGA	2	10	45894	45903	20 %	0 %	40 %	40 %	156740060
34	NC_009767	TGGTC	2	10	46062	46071	0 %	40 %	40 %	20 %	156740061
35	NC_009767	TCGAT	2	10	46184	46193	20 %	40 %	20 %	20 %	156740061
36	NC_009767	TGGTC	2	10	46278	46287	0 %	40 %	40 %	20 %	156740061
37	NC_009767	CCGCG	2	10	48118	48127	0 %	0 %	40 %	60 %	156740063
38	NC_009767	AACGC	2	10	49182	49191	40 %	0 %	20 %	40 %	156740064
39	NC_009767	CGCCA	2	10	49988	49997	20 %	0 %	20 %	60 %	156740064
40	NC_009767	GATCG	2	10	52228	52237	20 %	20 %	40 %	20 %	156740066
41	NC_009767	CGATC	2	10	55556	55565	20 %	20 %	20 %	40 %	156740068
42	NC_009767	CACGC	2	10	57465	57474	20 %	0 %	20 %	60 %	156740070
43	NC_009767	ATGGC	2	10	58162	58171	20 %	20 %	40 %	20 %	156740071
44	NC_009767	CTGCG	2	10	58242	58251	0 %	20 %	40 %	40 %	156740071
45	NC_009767	AGGGT	2	10	61254	61263	20 %	20 %	60 %	0 %	156740073
46	NC_009767	TCAAC	2	10	64747	64756	40 %	20 %	0 %	40 %	156740077
47	NC_009767	ACTGG	2	10	66682	66691	20 %	20 %	40 %	20 %	156740078
48	NC_009767	CGCGG	2	10	68704	68713	0 %	0 %	60 %	40 %	156740081
49	NC_009767	GACCT	2	10	69874	69883	20 %	20 %	20 %	40 %	156740082
50	NC_009767	GCTGC	2	10	69991	70000	0 %	20 %	40 %	40 %	156740082
51	NC_009767	CGCGC	2	10	70503	70512	0 %	0 %	40 %	60 %	156740084
52	NC_009767	AATGG	2	10	71949	71958	40 %	20 %	40 %	0 %	156740085
53	NC_009767	GGCGT	2	10	72683	72692	0 %	20 %	60 %	20 %	156740087
54	NC_009767	GCCGT	2	10	73827	73836	0 %	20 %	40 %	40 %	156740087
55	NC_009767	CGGCG	2	10	74469	74478	0 %	0 %	60 %	40 %	156740087
56	NC_009767	GGCGC	2	10	77129	77138	0 %	0 %	60 %	40 %	156740089
57	NC_009767	GGCGC	2	10	78665	78674	0 %	0 %	60 %	40 %	156740089
58	NC_009767	AGCAG	2	10	79061	79070	40 %	0 %	40 %	20 %	156740089
59	NC_009767	CTGGT	2	10	80232	80241	0 %	40 %	40 %	20 %	156740091
60	NC_009767	GGCGC	2	10	81073	81082	0 %	0 %	60 %	40 %	156740092
61	NC_009767	TGAAC	2	10	81267	81276	40 %	20 %	20 %	20 %	156740092
62	NC_009767	GCGCG	2	10	81498	81507	0 %	0 %	60 %	40 %	156740092
63	NC_009767	GCTGC	2	10	83032	83041	0 %	20 %	40 %	40 %	156740093
64	NC_009767	TTCCT	2	10	84166	84175	0 %	60 %	0 %	40 %	156740095
65	NC_009767	GTCCG	2	10	87562	87571	0 %	20 %	40 %	40 %	156740096
66	NC_009767	GCGTG	2	10	87616	87625	0 %	20 %	60 %	20 %	156740096
67	NC_009767	CGGGA	2	10	89276	89285	20 %	0 %	60 %	20 %	156740098
68	NC_009767	TCGTC	2	10	89313	89322	0 %	40 %	20 %	40 %	156740098
69	NC_009767	TATCA	2	10	90707	90716	40 %	40 %	0 %	20 %	156740099
70	NC_009767	TTTCG	2	10	90756	90765	0 %	60 %	20 %	20 %	156740099
71	NC_009767	CAGCG	2	10	92204	92213	20 %	0 %	40 %	40 %	156740100
72	NC_009767	GCTGC	2	10	93293	93302	0 %	20 %	40 %	40 %	156740101
73	NC_009767	CACGC	2	10	93445	93454	20 %	0 %	20 %	60 %	156740101
74	NC_009767	CAGCA	2	10	95049	95058	40 %	0 %	20 %	40 %	156740102
75	NC_009767	TCCAG	2	10	95669	95678	20 %	20 %	20 %	40 %	156740102
76	NC_009767	ACCCG	2	10	97221	97230	20 %	0 %	20 %	60 %	156740103
77	NC_009767	TCCAT	2	10	97486	97495	20 %	40 %	0 %	40 %	156740103
78	NC_009767	GACCG	2	10	97607	97616	20 %	0 %	40 %	40 %	156740103
79	NC_009767	CGCGC	2	10	98050	98059	0 %	0 %	40 %	60 %	156740103
80	NC_009767	TTCCC	2	10	98281	98290	0 %	40 %	0 %	60 %	156740103
81	NC_009767	CGGCG	2	10	98701	98710	0 %	0 %	60 %	40 %	156740103
82	NC_009767	GCCCC	2	10	99851	99860	0 %	0 %	20 %	80 %	156740104
83	NC_009767	ATCGC	2	10	100059	100068	20 %	20 %	20 %	40 %	156740104
84	NC_009767	CTGAT	2	10	100545	100554	20 %	40 %	20 %	20 %	156740105
85	NC_009767	CAGGG	2	10	104069	104078	20 %	0 %	60 %	20 %	156740109
86	NC_009767	TCGGG	2	10	107041	107050	0 %	20 %	60 %	20 %	156740112
87	NC_009767	CGATC	2	10	107944	107953	20 %	20 %	20 %	40 %	156740112
88	NC_009767	AGCGC	2	10	110023	110032	20 %	0 %	40 %	40 %	156740113
89	NC_009767	ACGCC	2	10	114179	114188	20 %	0 %	20 %	60 %	156740118
90	NC_009767	TGCCG	2	10	115533	115542	0 %	20 %	40 %	40 %	156740119
91	NC_009767	GCCCC	2	10	117619	117628	0 %	0 %	20 %	80 %	156740122
92	NC_009767	GCGCG	2	10	119045	119054	0 %	0 %	60 %	40 %	156740124
93	NC_009767	TGCTC	2	10	119329	119338	0 %	40 %	20 %	40 %	156740124
94	NC_009767	GGATG	2	10	121494	121503	20 %	20 %	60 %	0 %	156740125
95	NC_009767	TCGCC	2	10	122299	122308	0 %	20 %	20 %	60 %	156740126
96	NC_009767	GTGCA	2	10	122978	122987	20 %	20 %	40 %	20 %	156740127
97	NC_009767	GCGCG	2	10	123491	123500	0 %	0 %	60 %	40 %	156740128
98	NC_009767	TCGAG	2	10	123833	123842	20 %	20 %	40 %	20 %	156740128
99	NC_009767	TGCGC	2	10	128971	128980	0 %	20 %	40 %	40 %	156740133
100	NC_009767	GTCGT	2	10	131071	131080	0 %	40 %	40 %	20 %	156740134
101	NC_009767	GACCG	2	10	131537	131546	20 %	0 %	40 %	40 %	156740135
102	NC_009767	TGATC	2	10	131681	131690	20 %	40 %	20 %	20 %	156740135
103	NC_009767	GGAGA	2	10	132873	132882	40 %	0 %	60 %	0 %	156740136
104	NC_009767	GCGCC	2	10	134660	134669	0 %	0 %	40 %	60 %	156740137
105	NC_009767	CGACT	2	10	135349	135358	20 %	20 %	20 %	40 %	156740138
106	NC_009767	ACCCT	2	10	136888	136897	20 %	20 %	0 %	60 %	156740139
107	NC_009767	CGGCA	2	10	137158	137167	20 %	0 %	40 %	40 %	156740139
108	NC_009767	CAGCG	2	10	138598	138607	20 %	0 %	40 %	40 %	156740140
109	NC_009767	ACACG	2	10	138692	138701	40 %	0 %	20 %	40 %	156740140
110	NC_009767	TGCGG	2	10	142764	142773	0 %	20 %	60 %	20 %	156740145
111	NC_009767	TGCGC	2	10	142776	142785	0 %	20 %	40 %	40 %	156740145
112	NC_009767	AGCGC	2	10	144551	144560	20 %	0 %	40 %	40 %	156740146
113	NC_009767	TCGCC	2	10	144639	144648	0 %	20 %	20 %	60 %	156740147
114	NC_009767	ACCGC	2	10	145022	145031	20 %	0 %	20 %	60 %	156740147
115	NC_009767	AGATC	2	10	145122	145131	40 %	20 %	20 %	20 %	156740147
116	NC_009767	AGCGC	2	10	148232	148241	20 %	0 %	40 %	40 %	156740149
117	NC_009767	GCGCC	2	10	148449	148458	0 %	0 %	40 %	60 %	156740149
118	NC_009767	GTGAG	2	10	150578	150587	20 %	20 %	60 %	0 %	156740150
119	NC_009767	CGGCG	2	10	150588	150597	0 %	0 %	60 %	40 %	156740150
120	NC_009767	CGCGC	2	10	150850	150859	0 %	0 %	40 %	60 %	156740150
121	NC_009767	GCGCA	2	10	151618	151627	20 %	0 %	40 %	40 %	156740150
122	NC_009767	TGATC	2	10	152061	152070	20 %	40 %	20 %	20 %	156740150
123	NC_009767	TCAAC	2	10	152222	152231	40 %	20 %	0 %	40 %	156740150
124	NC_009767	GCGCG	2	10	153399	153408	0 %	0 %	60 %	40 %	156740151
125	NC_009767	AATGC	2	10	155470	155479	40 %	20 %	20 %	20 %	156740153
126	NC_009767	ACCAT	2	10	156163	156172	40 %	20 %	0 %	40 %	156740153
127	NC_009767	ACCAG	2	10	158068	158077	40 %	0 %	20 %	40 %	156740154
128	NC_009767	GTCGA	2	10	158356	158365	20 %	20 %	40 %	20 %	156740155
129	NC_009767	AGCGC	2	10	158687	158696	20 %	0 %	40 %	40 %	156740155
130	NC_009767	CCGCA	2	10	158942	158951	20 %	0 %	20 %	60 %	156740156
131	NC_009767	CGGCA	2	10	162075	162084	20 %	0 %	40 %	40 %	156740158
132	NC_009767	TCAGG	2	10	162305	162314	20 %	20 %	40 %	20 %	156740158
133	NC_009767	TCCGC	2	10	162993	163002	0 %	20 %	20 %	60 %	156740159
134	NC_009767	ATCAT	2	10	163850	163859	40 %	40 %	0 %	20 %	156740159
135	NC_009767	ATCCC	2	10	164170	164179	20 %	20 %	0 %	60 %	156740159
136	NC_009767	GCCGA	2	10	165463	165472	20 %	0 %	40 %	40 %	156740160
137	NC_009767	GGGCG	2	10	169462	169471	0 %	0 %	80 %	20 %	156740164
138	NC_009767	GGCAT	2	10	170433	170442	20 %	20 %	40 %	20 %	156740165
139	NC_009767	TCGAT	2	10	173816	173825	20 %	40 %	20 %	20 %	156740168
140	NC_009767	TGGTA	2	10	174010	174019	20 %	40 %	40 %	0 %	156740168
141	NC_009767	TGTGG	2	10	174989	174998	0 %	40 %	60 %	0 %	156740169
142	NC_009767	CCGCA	2	10	175267	175276	20 %	0 %	20 %	60 %	156740169
143	NC_009767	CGCCA	2	10	178112	178121	20 %	0 %	20 %	60 %	156740171
144	NC_009767	CGAAG	2	10	179596	179605	40 %	0 %	40 %	20 %	156740171
145	NC_009767	TGAGA	2	10	179699	179708	40 %	20 %	40 %	0 %	156740171
146	NC_009767	ACCAG	2	10	179883	179892	40 %	0 %	20 %	40 %	156740171
147	NC_009767	GCGCT	2	10	181986	181995	0 %	20 %	40 %	40 %	156740174
148	NC_009767	AGCGC	2	10	182461	182470	20 %	0 %	40 %	40 %	156740174
149	NC_009767	AGCGC	2	10	183185	183194	20 %	0 %	40 %	40 %	156740175
150	NC_009767	TGCGC	2	10	185427	185436	0 %	20 %	40 %	40 %	156740178
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152	NC_009767	GTCCT	2	10	189169	189178	0 %	40 %	20 %	40 %	156740179
153	NC_009767	GCTGC	2	10	189740	189749	0 %	20 %	40 %	40 %	156740180
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155	NC_009767	TGCTA	2	10	190003	190012	20 %	40 %	20 %	20 %	156740180
156	NC_009767	GCGCG	2	10	190272	190281	0 %	0 %	60 %	40 %	156740180
157	NC_009767	CTGGT	2	10	190826	190835	0 %	40 %	40 %	20 %	156740181
158	NC_009767	TGGCA	2	10	191132	191141	20 %	20 %	40 %	20 %	156740181
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164	NC_009767	CAATC	2	10	193545	193554	40 %	20 %	0 %	40 %	156740183
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166	NC_009767	ATCCG	2	10	200351	200360	20 %	20 %	20 %	40 %	156740187
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168	NC_009767	TGCGC	2	10	203575	203584	0 %	20 %	40 %	40 %	156740189
169	NC_009767	ATCCG	2	10	205190	205199	20 %	20 %	20 %	40 %	156740190
170	NC_009767	GGGCA	2	10	206062	206071	20 %	0 %	60 %	20 %	156740191
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172	NC_009767	GTGTG	2	10	207219	207228	0 %	40 %	60 %	0 %	156740192
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174	NC_009767	CACCC	2	10	209393	209402	20 %	0 %	0 %	80 %	156740193
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177	NC_009767	CATGG	2	10	216250	216259	20 %	20 %	40 %	20 %	156740202
178	NC_009767	ACGCC	2	10	218533	218542	20 %	0 %	20 %	60 %	156740204
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187	NC_009767	CCCGC	2	10	224958	224967	0 %	0 %	20 %	80 %	156740210
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199	NC_009767	TGCGC	2	10	242377	242386	0 %	20 %	40 %	40 %	156740220
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247	NC_009767	GAGCG	2	10	303311	303320	20 %	0 %	60 %	20 %	156740268
248	NC_009767	CCAGA	2	10	303972	303981	40 %	0 %	20 %	40 %	156740269
249	NC_009767	TGGAT	2	10	304129	304138	20 %	40 %	40 %	0 %	156740269
250	NC_009767	GCATT	2	10	305143	305152	20 %	40 %	20 %	20 %	156740269
251	NC_009767	CGCTG	2	10	305590	305599	0 %	20 %	40 %	40 %	156740270
252	NC_009767	TGACC	2	10	305935	305944	20 %	20 %	20 %	40 %	156740271
253	NC_009767	CGCGA	2	10	306917	306926	20 %	0 %	40 %	40 %	156740271
254	NC_009767	CTCTC	2	10	307393	307402	0 %	40 %	0 %	60 %	156740272
255	NC_009767	CGGCG	2	10	307882	307891	0 %	0 %	60 %	40 %	156740272
256	NC_009767	GCCGC	2	10	309294	309303	0 %	0 %	40 %	60 %	156740273
257	NC_009767	GCGCG	2	10	312100	312109	0 %	0 %	60 %	40 %	156740276
258	NC_009767	CGCTG	2	10	312312	312321	0 %	20 %	40 %	40 %	156740276
259	NC_009767	GGAAC	2	10	312924	312933	40 %	0 %	40 %	20 %	156740277
260	NC_009767	GGAAC	2	10	313443	313452	40 %	0 %	40 %	20 %	156740277
261	NC_009767	GATCA	2	10	313603	313612	40 %	20 %	20 %	20 %	156740278
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384	NC_009767	TGACA	2	10	503314	503323	40 %	20 %	20 %	20 %	156740418
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390	NC_009767	GGTTT	2	10	514188	514197	0 %	60 %	40 %	0 %	156740427
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