MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 11266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009767	GGCA	2	8	649	656	25 %	0 %	50 %	25 %	156740029
2	NC_009767	TGAT	2	8	1358	1365	25 %	50 %	25 %	0 %	156740029
3	NC_009767	CTCC	2	8	1575	1582	0 %	25 %	0 %	75 %	156740029
4	NC_009767	AGGC	2	8	2198	2205	25 %	0 %	50 %	25 %	156740030
5	NC_009767	CTGG	2	8	2405	2412	0 %	25 %	50 %	25 %	156740030
6	NC_009767	TGGA	2	8	2658	2665	25 %	25 %	50 %	0 %	156740030
7	NC_009767	CAGA	2	8	3076	3083	50 %	0 %	25 %	25 %	156740030
8	NC_009767	AATC	2	8	3266	3273	50 %	25 %	0 %	25 %	156740031
9	NC_009767	CGGG	2	8	3593	3600	0 %	0 %	75 %	25 %	156740032
10	NC_009767	TTTC	2	8	3810	3817	0 %	75 %	0 %	25 %	156740032
11	NC_009767	CAGG	2	8	3967	3974	25 %	0 %	50 %	25 %	156740033
12	NC_009767	CGTC	2	8	5397	5404	0 %	25 %	25 %	50 %	156740035
13	NC_009767	ATCG	2	8	5960	5967	25 %	25 %	25 %	25 %	156740035
14	NC_009767	CACG	2	8	6175	6182	25 %	0 %	25 %	50 %	156740035
15	NC_009767	CGCA	2	8	7871	7878	25 %	0 %	25 %	50 %	156740037
16	NC_009767	GCCC	2	8	8141	8148	0 %	0 %	25 %	75 %	156740037
17	NC_009767	CAAC	2	8	8164	8171	50 %	0 %	0 %	50 %	156740037
18	NC_009767	TCTA	2	8	8184	8191	25 %	50 %	0 %	25 %	156740037
19	NC_009767	CGCA	2	8	8288	8295	25 %	0 %	25 %	50 %	156740037
20	NC_009767	CGAT	2	8	8433	8440	25 %	25 %	25 %	25 %	156740037
21	NC_009767	GATG	2	8	8848	8855	25 %	25 %	50 %	0 %	156740037
22	NC_009767	GGCT	2	8	9119	9126	0 %	25 %	50 %	25 %	156740038
23	NC_009767	CTGG	2	8	9788	9795	0 %	25 %	50 %	25 %	156740039
24	NC_009767	TTCG	2	8	10679	10686	0 %	50 %	25 %	25 %	156740040
25	NC_009767	ATGC	2	8	10727	10734	25 %	25 %	25 %	25 %	156740040
26	NC_009767	GCAG	2	8	15204	15211	25 %	0 %	50 %	25 %	156740043
27	NC_009767	TTTC	2	8	15843	15850	0 %	75 %	0 %	25 %	156740043
28	NC_009767	AGCG	2	8	16865	16872	25 %	0 %	50 %	25 %	156740044
29	NC_009767	CCAT	2	8	17877	17884	25 %	25 %	0 %	50 %	156740045
30	NC_009767	TCGC	2	8	18491	18498	0 %	25 %	25 %	50 %	156740046
31	NC_009767	TGGC	2	8	18914	18921	0 %	25 %	50 %	25 %	156740046
32	NC_009767	GCCC	2	8	21696	21703	0 %	0 %	25 %	75 %	156740047
33	NC_009767	AGCG	2	8	22171	22178	25 %	0 %	50 %	25 %	156740047
34	NC_009767	GGTC	2	8	22417	22424	0 %	25 %	50 %	25 %	156740047
35	NC_009767	CGGG	2	8	22724	22731	0 %	0 %	75 %	25 %	156740048
36	NC_009767	CAGG	2	8	22733	22740	25 %	0 %	50 %	25 %	156740048
37	NC_009767	CCTC	2	8	23184	23191	0 %	25 %	0 %	75 %	156740048
38	NC_009767	TTCC	2	8	23282	23289	0 %	50 %	0 %	50 %	156740048
39	NC_009767	CACC	2	8	25875	25882	25 %	0 %	0 %	75 %	156740049
40	NC_009767	CAGT	2	8	26710	26717	25 %	25 %	25 %	25 %	156740049
41	NC_009767	GCGT	2	8	26844	26851	0 %	25 %	50 %	25 %	156740049
42	NC_009767	CCAA	2	8	27624	27631	50 %	0 %	0 %	50 %	156740050
43	NC_009767	CGGT	2	8	28207	28214	0 %	25 %	50 %	25 %	156740050
44	NC_009767	CCAT	2	8	28535	28542	25 %	25 %	0 %	50 %	156740051
45	NC_009767	ATCG	2	8	28900	28907	25 %	25 %	25 %	25 %	156740051
46	NC_009767	GATC	2	8	29661	29668	25 %	25 %	25 %	25 %	156740051
47	NC_009767	CGAT	2	8	29694	29701	25 %	25 %	25 %	25 %	156740051
48	NC_009767	GCCA	2	8	30198	30205	25 %	0 %	25 %	50 %	156740051
49	NC_009767	TGCC	2	8	30261	30268	0 %	25 %	25 %	50 %	156740051
50	NC_009767	GGTC	2	8	31958	31965	0 %	25 %	50 %	25 %	156740053
51	NC_009767	TGGC	2	8	32007	32014	0 %	25 %	50 %	25 %	156740053
52	NC_009767	CCGT	2	8	32423	32430	0 %	25 %	25 %	50 %	156740054
53	NC_009767	TCCG	2	8	32455	32462	0 %	25 %	25 %	50 %	156740054
54	NC_009767	CCGC	2	8	32486	32493	0 %	0 %	25 %	75 %	156740054
55	NC_009767	CACG	2	8	32522	32529	25 %	0 %	25 %	50 %	156740054
56	NC_009767	GGAG	2	8	33706	33713	25 %	0 %	75 %	0 %	156740055
57	NC_009767	GCCA	2	8	35155	35162	25 %	0 %	25 %	50 %	156740056
58	NC_009767	CCTT	2	8	35191	35198	0 %	50 %	0 %	50 %	156740056
59	NC_009767	CCGG	2	8	35463	35470	0 %	0 %	50 %	50 %	156740056
60	NC_009767	TTGG	2	8	35528	35535	0 %	50 %	50 %	0 %	156740056
61	NC_009767	CGTT	2	8	36813	36820	0 %	50 %	25 %	25 %	156740057
62	NC_009767	TGGC	2	8	37007	37014	0 %	25 %	50 %	25 %	156740057
63	NC_009767	CATT	2	8	37459	37466	25 %	50 %	0 %	25 %	156740057
64	NC_009767	GCTG	2	8	37686	37693	0 %	25 %	50 %	25 %	156740057
65	NC_009767	CTGC	2	8	38125	38132	0 %	25 %	25 %	50 %	156740057
66	NC_009767	GACC	2	8	38455	38462	25 %	0 %	25 %	50 %	156740057
67	NC_009767	GACG	2	8	38486	38493	25 %	0 %	50 %	25 %	156740057
68	NC_009767	AACG	2	8	39074	39081	50 %	0 %	25 %	25 %	156740058
69	NC_009767	CCAT	2	8	39436	39443	25 %	25 %	0 %	50 %	156740059
70	NC_009767	ATCA	2	8	39912	39919	50 %	25 %	0 %	25 %	156740059
71	NC_009767	TCGA	2	8	40251	40258	25 %	25 %	25 %	25 %	156740059
72	NC_009767	CGAT	2	8	42526	42533	25 %	25 %	25 %	25 %	156740060
73	NC_009767	CCGA	2	8	42558	42565	25 %	0 %	25 %	50 %	156740060
74	NC_009767	TCGA	2	8	43422	43429	25 %	25 %	25 %	25 %	156740060
75	NC_009767	CGAC	2	8	43914	43921	25 %	0 %	25 %	50 %	156740060
76	NC_009767	GACA	2	8	43960	43967	50 %	0 %	25 %	25 %	156740060
77	NC_009767	TTCA	2	8	44297	44304	25 %	50 %	0 %	25 %	156740060
78	NC_009767	TTTC	2	8	44380	44387	0 %	75 %	0 %	25 %	156740060
79	NC_009767	AGGA	2	8	44623	44630	50 %	0 %	50 %	0 %	156740060
80	NC_009767	TGAG	2	8	44725	44732	25 %	25 %	50 %	0 %	156740060
81	NC_009767	AACC	2	8	45665	45672	50 %	0 %	0 %	50 %	156740060
82	NC_009767	GATG	2	8	46086	46093	25 %	25 %	50 %	0 %	156740061
83	NC_009767	GGAA	2	8	46814	46821	50 %	0 %	50 %	0 %	156740062
84	NC_009767	GCAG	2	8	47034	47041	25 %	0 %	50 %	25 %	156740063
85	NC_009767	GCGA	2	8	47063	47070	25 %	0 %	50 %	25 %	156740063
86	NC_009767	CGAC	2	8	47086	47093	25 %	0 %	25 %	50 %	156740063
87	NC_009767	ATCA	2	8	47114	47121	50 %	25 %	0 %	25 %	156740063
88	NC_009767	GCCA	2	8	47199	47206	25 %	0 %	25 %	50 %	156740063
89	NC_009767	CAGT	2	8	47401	47408	25 %	25 %	25 %	25 %	156740063
90	NC_009767	CAGA	2	8	47564	47571	50 %	0 %	25 %	25 %	156740063
91	NC_009767	GTGC	2	8	47989	47996	0 %	25 %	50 %	25 %	156740063
92	NC_009767	ATCC	2	8	48389	48396	25 %	25 %	0 %	50 %	156740064
93	NC_009767	CGGT	2	8	48408	48415	0 %	25 %	50 %	25 %	156740064
94	NC_009767	TGCG	2	8	49083	49090	0 %	25 %	50 %	25 %	156740064
95	NC_009767	TCCA	2	8	50797	50804	25 %	25 %	0 %	50 %	156740065
96	NC_009767	ATCC	2	8	51847	51854	25 %	25 %	0 %	50 %	156740066
97	NC_009767	TTGG	2	8	52008	52015	0 %	50 %	50 %	0 %	156740066
98	NC_009767	ACCG	2	8	52657	52664	25 %	0 %	25 %	50 %	156740066
99	NC_009767	TGGA	2	8	54379	54386	25 %	25 %	50 %	0 %	156740068
100	NC_009767	GATC	2	8	54984	54991	25 %	25 %	25 %	25 %	156740068
101	NC_009767	TGAG	2	8	55082	55089	25 %	25 %	50 %	0 %	156740068
102	NC_009767	GATG	2	8	55092	55099	25 %	25 %	50 %	0 %	156740068
103	NC_009767	GGCG	2	8	55909	55916	0 %	0 %	75 %	25 %	156740069
104	NC_009767	CGAA	2	8	57097	57104	50 %	0 %	25 %	25 %	156740070
105	NC_009767	ATGA	2	8	57887	57894	50 %	25 %	25 %	0 %	156740070
106	NC_009767	GCCG	2	8	58302	58309	0 %	0 %	50 %	50 %	156740071
107	NC_009767	GCAC	2	8	58577	58584	25 %	0 %	25 %	50 %	156740071
108	NC_009767	TGCC	2	8	59670	59677	0 %	25 %	25 %	50 %	156740072
109	NC_009767	TGAG	2	8	60140	60147	25 %	25 %	50 %	0 %	156740072
110	NC_009767	CGCA	2	8	60235	60242	25 %	0 %	25 %	50 %	156740072
111	NC_009767	GAAA	2	8	60625	60632	75 %	0 %	25 %	0 %	156740073
112	NC_009767	CCAG	2	8	61384	61391	25 %	0 %	25 %	50 %	156740073
113	NC_009767	CACG	2	8	61456	61463	25 %	0 %	25 %	50 %	156740073
114	NC_009767	GATC	2	8	63028	63035	25 %	25 %	25 %	25 %	156740074
115	NC_009767	GTTC	2	8	63196	63203	0 %	50 %	25 %	25 %	156740074
116	NC_009767	CAGC	2	8	63904	63911	25 %	0 %	25 %	50 %	156740075
117	NC_009767	GTCG	2	8	64918	64925	0 %	25 %	50 %	25 %	156740077
118	NC_009767	CGTT	2	8	65315	65322	0 %	50 %	25 %	25 %	156740077
119	NC_009767	CATT	2	8	65561	65568	25 %	50 %	0 %	25 %	156740077
120	NC_009767	CAGC	2	8	66673	66680	25 %	0 %	25 %	50 %	156740078
121	NC_009767	GATC	2	8	66858	66865	25 %	25 %	25 %	25 %	156740078
122	NC_009767	ATCC	2	8	66941	66948	25 %	25 %	0 %	50 %	156740078
123	NC_009767	CATC	2	8	67068	67075	25 %	25 %	0 %	50 %	156740078
124	NC_009767	GCAT	2	8	67218	67225	25 %	25 %	25 %	25 %	156740079
125	NC_009767	AGGA	2	8	68522	68529	50 %	0 %	50 %	0 %	156740081
126	NC_009767	CGAC	2	8	69036	69043	25 %	0 %	25 %	50 %	156740081
127	NC_009767	CAAC	2	8	69441	69448	50 %	0 %	0 %	50 %	156740082
128	NC_009767	GGCA	2	8	70706	70713	25 %	0 %	50 %	25 %	156740084
129	NC_009767	GCTG	2	8	71091	71098	0 %	25 %	50 %	25 %	156740084
130	NC_009767	CTGG	2	8	71570	71577	0 %	25 %	50 %	25 %	156740084
131	NC_009767	AAGA	2	8	71744	71751	75 %	0 %	25 %	0 %	156740085
132	NC_009767	CATT	2	8	72186	72193	25 %	50 %	0 %	25 %	156740086
133	NC_009767	ATTC	2	8	72343	72350	25 %	50 %	0 %	25 %	156740087
134	NC_009767	GATC	2	8	72454	72461	25 %	25 %	25 %	25 %	156740087
135	NC_009767	CGCA	2	8	73187	73194	25 %	0 %	25 %	50 %	156740087
136	NC_009767	GGCA	2	8	73334	73341	25 %	0 %	50 %	25 %	156740087
137	NC_009767	AGGC	2	8	73452	73459	25 %	0 %	50 %	25 %	156740087
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