MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 11577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009767	TCT	2	6	198	203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009767	CTC	2	6	264	269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009767	AGG	2	6	334	339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009767	GCC	2	6	1837	1842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_009767	TCA	2	6	1874	1879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009767	CTC	2	6	1907	1912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_009767	GGT	2	6	6503	6508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009767	TGC	2	6	6514	6519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009767	GCG	2	6	6698	6703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009767	ACG	2	6	6856	6861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009767	GCG	2	6	6862	6867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009767	CAG	2	6	6888	6893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009767	GAA	2	6	6906	6911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009767	CGG	2	6	7409	7414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009767	AAG	2	6	9016	9021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009767	AGG	2	6	9029	9034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009767	GGA	2	6	9375	9380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009767	TGT	2	6	9471	9476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009767	CCG	2	6	10832	10837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_009767	TTG	2	6	10850	10855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009767	AAC	2	6	10879	10884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009767	CAC	2	6	10904	10909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_009767	CAA	2	6	10934	10939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009767	CCG	2	6	10946	10951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_009767	CTT	2	6	10985	10990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009767	AAC	2	6	11018	11023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009767	GTT	2	6	11041	11046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009767	AGG	2	6	11051	11056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009767	AGC	2	6	12536	12541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009767	AGC	2	6	12676	12681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009767	AGC	2	6	12816	12821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009767	AGC	2	6	12956	12961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009767	AGC	2	6	13096	13101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009767	AAT	2	6	13168	13173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009767	AGC	2	6	13237	13242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009767	AGC	2	6	13377	13382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009767	AGC	2	6	13517	13522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009767	AAT	2	6	13589	13594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009767	GAT	2	6	14854	14859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009767	GTG	2	6	14863	14868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009767	GAG	2	6	16553	16558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009767	GAG	2	6	17128	17133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009767	CGC	2	6	17207	17212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_009767	GAG	2	6	18421	18426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009767	AGC	2	6	19119	19124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009767	GCT	2	6	19185	19190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009767	CGC	2	6	19215	19220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_009767	CGC	2	6	19222	19227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_009767	ATC	2	6	20015	20020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009767	GCT	2	6	20267	20272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009767	CAC	2	6	20318	20323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_009767	GCG	2	6	21253	21258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009767	AGC	2	6	21265	21270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009767	AGT	2	6	21340	21345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009767	ACT	2	6	23654	23659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009767	AGC	2	6	23925	23930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009767	AGC	2	6	24212	24217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009767	GCA	2	6	25350	25355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009767	CTT	2	6	25505	25510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009767	CAG	2	6	25668	25673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009767	TCT	2	6	25717	25722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009767	CGC	3	9	25726	25734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_009767	CGG	3	9	27076	27084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009767	AGT	2	6	27085	27090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009767	GTT	2	6	27091	27096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009767	CTC	2	6	27202	27207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_009767	CCG	2	6	27247	27252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_009767	GCA	2	6	27262	27267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009767	GGT	2	6	27284	27289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009767	GTG	2	6	27290	27295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009767	CGG	2	6	27296	27301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009767	TGC	2	6	27305	27310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009767	AGA	2	6	27327	27332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009767	AGG	2	6	28415	28420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009767	CGT	2	6	28425	28430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009767	CTT	2	6	28448	28453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009767	TGC	2	6	28468	28473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009767	CGG	2	6	28478	28483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009767	CCT	2	6	30531	30536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_009767	GTT	2	6	30759	30764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009767	ACG	2	6	32164	32169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009767	TCT	2	6	32207	32212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009767	CAC	2	6	32647	32652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_009767	CCG	2	6	32677	32682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_009767	GCC	2	6	32778	32783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_009767	GCC	3	9	32801	32809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_009767	GCC	2	6	32896	32901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_009767	GCC	2	6	33007	33012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_009767	CGC	2	6	33049	33054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_009767	CGC	2	6	33104	33109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_009767	ACG	2	6	33287	33292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009767	ACG	2	6	33386	33391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009767	AGG	2	6	33551	33556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009767	CCT	2	6	34140	34145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_009767	GTC	2	6	34164	34169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009767	CCA	2	6	34170	34175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_009767	GGC	2	6	34400	34405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009767	ATG	2	6	39354	39359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009767	ATG	2	6	39392	39397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009767	AGG	2	6	41343	41348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009767	ACA	2	6	41388	41393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_009767	CTG	2	6	41405	41410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009767	CGT	2	6	41424	41429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009767	TGC	3	9	41507	41515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009767	CGC	2	6	41571	41576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_009767	GGA	2	6	41590	41595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009767	TCG	2	6	51071	51076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009767	GCG	2	6	51153	51158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009767	AGC	2	6	51166	51171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009767	CCT	2	6	51224	51229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_009767	GCA	2	6	51317	51322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009767	ACA	2	6	53223	53228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009767	CCG	2	6	53235	53240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_009767	TCG	2	6	53279	53284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009767	AGC	2	6	53368	53373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009767	CAT	2	6	53432	53437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009767	GAT	2	6	53642	53647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009767	GGC	2	6	53669	53674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009767	GCA	2	6	53685	53690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009767	GCA	2	6	53752	53757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009767	GTC	2	6	54099	54104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009767	TGA	2	6	56671	56676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009767	TCA	2	6	56763	56768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_009767	CCT	2	6	56792	56797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_009767	TGC	2	6	56859	56864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009767	ACA	2	6	56934	56939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009767	GCT	2	6	56968	56973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009767	ATG	2	6	59016	59021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009767	GAC	2	6	62027	62032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009767	CAA	2	6	62040	62045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_009767	TCG	2	6	62062	62067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009767	CTT	2	6	62170	62175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009767	TGC	2	6	62181	62186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009767	CTC	2	6	62236	62241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_009767	CGC	2	6	62250	62255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_009767	TCC	2	6	67079	67084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_009767	ACG	2	6	67113	67118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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139	NC_009767	TGC	2	6	68165	68170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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