MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 77274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009767	ACA	2	6	437	442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740029
2	NC_009767	TCA	2	6	512	517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740029
3	NC_009767	AAG	2	6	518	523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740029
4	NC_009767	GTC	2	6	571	576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740029
5	NC_009767	TCA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740029
6	NC_009767	GGC	2	6	910	915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740029
7	NC_009767	CAG	2	6	1045	1050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740029
8	NC_009767	GAG	2	6	1054	1059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156740029
9	NC_009767	CTG	2	6	1090	1095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740029
10	NC_009767	TGA	2	6	1098	1103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740029
11	NC_009767	GAA	2	6	1138	1143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740029
12	NC_009767	ATC	2	6	1186	1191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740029
13	NC_009767	GAA	2	6	1231	1236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740029
14	NC_009767	TCG	2	6	1268	1273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740029
15	NC_009767	GCG	2	6	1549	1554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740029
16	NC_009767	GAG	2	6	1645	1650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156740029
17	NC_009767	GGT	2	6	1687	1692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740029
18	NC_009767	ACG	2	6	1702	1707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740029
19	NC_009767	TGA	2	6	1793	1798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740029
20	NC_009767	GAT	2	6	1922	1927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740030
21	NC_009767	GCT	2	6	1942	1947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740030
22	NC_009767	GCT	2	6	1994	1999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740030
23	NC_009767	CGG	2	6	2069	2074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740030
24	NC_009767	CCG	2	6	2080	2085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740030
25	NC_009767	GTG	2	6	2162	2167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740030
26	NC_009767	TAC	2	6	2169	2174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740030
27	NC_009767	CGG	2	6	2324	2329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740030
28	NC_009767	CGC	2	6	2465	2470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740030
29	NC_009767	GGC	2	6	2501	2506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740030
30	NC_009767	CCG	2	6	2514	2519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740030
31	NC_009767	AGA	2	6	2548	2553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740030
32	NC_009767	CGT	2	6	2572	2577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740030
33	NC_009767	ACT	3	9	2578	2586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740030
34	NC_009767	GCG	2	6	2826	2831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740030
35	NC_009767	GAT	2	6	2847	2852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740030
36	NC_009767	GCG	2	6	2893	2898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740030
37	NC_009767	CGC	2	6	2959	2964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740030
38	NC_009767	CTA	2	6	3151	3156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740031
39	NC_009767	CGT	2	6	3178	3183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740031
40	NC_009767	TAC	2	6	3278	3283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740031
41	NC_009767	TCG	2	6	3285	3290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740031
42	NC_009767	GTT	2	6	3347	3352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156740031
43	NC_009767	GTT	2	6	3385	3390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156740031
44	NC_009767	AGC	2	6	3393	3398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740031
45	NC_009767	CAC	2	6	3564	3569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740032
46	NC_009767	CGG	2	6	3609	3614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740032
47	NC_009767	GTA	2	6	3674	3679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740032
48	NC_009767	GAG	2	6	3705	3710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156740032
49	NC_009767	CCT	2	6	3871	3876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156740032
50	NC_009767	GCG	2	6	3892	3897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740032
51	NC_009767	CGG	2	6	3935	3940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740032
52	NC_009767	CGT	3	9	3953	3961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740032
53	NC_009767	CAG	5	15	4047	4061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740033
54	NC_009767	AGC	3	9	4066	4074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740033
55	NC_009767	GCC	2	6	4287	4292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740034
56	NC_009767	GCG	2	6	4339	4344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740034
57	NC_009767	ACC	2	6	4407	4412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740034
58	NC_009767	CGG	3	9	4417	4425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740034
59	NC_009767	GTT	2	6	4430	4435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156740034
60	NC_009767	GAC	2	6	4439	4444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740034
61	NC_009767	CCG	2	6	4510	4515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740034
62	NC_009767	GTG	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740034
63	NC_009767	TCG	2	6	4620	4625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740034
64	NC_009767	CAC	2	6	4654	4659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740034
65	NC_009767	TCA	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740035
66	NC_009767	GAC	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
67	NC_009767	GCG	2	6	4899	4904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740035
68	NC_009767	CAG	2	6	4943	4948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
69	NC_009767	GAT	2	6	5039	5044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740035
70	NC_009767	GCT	2	6	5088	5093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740035
71	NC_009767	ACA	2	6	5130	5135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740035
72	NC_009767	TCG	2	6	5157	5162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740035
73	NC_009767	TGC	2	6	5255	5260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740035
74	NC_009767	CAG	2	6	5573	5578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
75	NC_009767	ACG	2	6	5591	5596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
76	NC_009767	TGC	2	6	5679	5684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740035
77	NC_009767	CGG	2	6	5705	5710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740035
78	NC_009767	GCA	2	6	5797	5802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
79	NC_009767	ACA	2	6	5817	5822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740035
80	NC_009767	CAT	2	6	5830	5835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740035
81	NC_009767	GCC	2	6	5841	5846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740035
82	NC_009767	GGC	2	6	5872	5877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740035
83	NC_009767	CGC	2	6	5900	5905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740035
84	NC_009767	GCG	2	6	5925	5930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740035
85	NC_009767	CAG	2	6	5975	5980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
86	NC_009767	CCG	2	6	6001	6006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740035
87	NC_009767	GCC	2	6	6060	6065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740035
88	NC_009767	GCA	2	6	6081	6086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
89	NC_009767	GCA	2	6	6166	6171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740035
90	NC_009767	GGA	2	6	6186	6191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156740035
91	NC_009767	GTA	2	6	6212	6217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740035
92	NC_009767	GAG	2	6	6236	6241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156740035
93	NC_009767	GCG	2	6	6319	6324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740035
94	NC_009767	GCG	2	6	7061	7066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740036
95	NC_009767	CAG	2	6	7087	7092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740036
96	NC_009767	ATC	2	6	7147	7152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740036
97	NC_009767	GCA	2	6	7166	7171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740036
98	NC_009767	GAA	3	9	7225	7233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740036
99	NC_009767	TCG	2	6	7244	7249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740036
100	NC_009767	GCA	2	6	7250	7255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740036
101	NC_009767	GCT	2	6	7311	7316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740036
102	NC_009767	CAG	2	6	7333	7338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740036
103	NC_009767	CGA	2	6	7798	7803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740037
104	NC_009767	CGA	2	6	7822	7827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740037
105	NC_009767	GAG	2	6	7973	7978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156740037
106	NC_009767	CGG	2	6	8128	8133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740037
107	NC_009767	TCA	2	6	8151	8156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740037
108	NC_009767	ATG	2	6	8312	8317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740037
109	NC_009767	ATG	2	6	8351	8356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740037
110	NC_009767	TGG	2	6	8361	8366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740037
111	NC_009767	GGC	2	6	8454	8459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740037
112	NC_009767	AGG	2	6	8535	8540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156740037
113	NC_009767	CGC	2	6	8548	8553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740037
114	NC_009767	ATC	2	6	8655	8660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740037
115	NC_009767	CGC	2	6	8673	8678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740037
116	NC_009767	ACG	2	6	8686	8691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740037
117	NC_009767	AAC	2	6	8790	8795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740037
118	NC_009767	ATG	2	6	8820	8825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740037
119	NC_009767	CGA	2	6	8830	8835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740037
120	NC_009767	GCC	2	6	8887	8892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740037
121	NC_009767	CGG	2	6	8896	8901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740037
122	NC_009767	GGA	2	6	9058	9063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156740038
123	NC_009767	CGA	2	6	9145	9150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740038
124	NC_009767	TGC	2	6	9189	9194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740038
125	NC_009767	GTG	2	6	9231	9236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740038
126	NC_009767	ACA	2	6	9495	9500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740039
127	NC_009767	GGT	2	6	9584	9589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740039
128	NC_009767	GCG	2	6	9651	9656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740039
129	NC_009767	TGA	2	6	9667	9672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740039
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252	NC_009767	GCA	2	6	22052	22057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740047
253	NC_009767	CGA	2	6	22128	22133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740047
254	NC_009767	TCC	2	6	22193	22198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156740047
255	NC_009767	TCG	2	6	22338	22343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740047
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257	NC_009767	TCG	2	6	22373	22378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740047
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375	NC_009767	GCG	2	6	32401	32406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740054
376	NC_009767	TGC	2	6	32594	32599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740054
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498	NC_009767	CCG	2	6	41127	41132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740059
499	NC_009767	GAA	2	6	41769	41774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740060
500	NC_009767	TGC	2	6	41941	41946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740060

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