MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica FTNF002-00 chromosome

Total Repeats: 207

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009749	AAGGTT	2	12	24392	24403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009749	ATAAGT	2	12	37606	37617	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009749	TTAATT	2	12	50272	50283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009749	CTTGAG	2	12	64188	64199	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_009749	CAGTTA	2	12	84901	84912	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_009749	AAAAAG	2	12	97985	97996	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009749	TTTATA	2	12	117276	117287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009749	AGAATA	2	12	125948	125959	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009749	TGAAAT	2	12	128254	128265	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009749	GATGGT	2	12	129834	129845	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009749	TTTTAT	2	12	136811	136822	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009749	TTATAA	2	12	142541	142552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009749	ATAAAT	2	12	149476	149487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009749	ATCAAT	2	12	165204	165215	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_009749	ATTTAA	2	12	172787	172798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009749	TAAAAA	2	12	178657	178668	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009749	ATTTTT	2	12	215751	215762	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009749	TTTTGT	2	12	216268	216279	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009749	TTATGG	2	12	221817	221828	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009749	ATTTTA	2	12	276741	276752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009749	GCAACA	2	12	326425	326436	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009749	ATTAAT	2	12	327253	327264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009749	TTAGAT	2	12	337437	337448	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009749	ATATTT	2	12	340067	340078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009749	ATTGAT	2	12	355217	355228	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009749	GTCTTG	2	12	360256	360267	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_009749	TTTAAA	2	12	377237	377248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009749	AGTAAC	2	12	409871	409882	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_009749	AGAATA	2	12	418935	418946	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009749	TGAAAT	2	12	421241	421252	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009749	TAAAAT	2	12	425958	425969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009749	ATTTTT	2	12	426537	426548	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009749	ATTTAT	2	12	445748	445759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009749	AAGTTA	2	12	447496	447507	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009749	AAAAGT	2	12	489332	489343	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009749	TAATGA	2	12	491520	491531	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009749	AGTTGG	2	12	491922	491933	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009749	TAGAAG	2	12	496920	496931	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009749	TAAATT	2	12	527366	527377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009749	ATTAAG	2	12	547783	547794	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009749	ACTTTA	2	12	560892	560903	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_009749	TTTGTA	2	12	607856	607867	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009749	TGGATT	2	12	610425	610436	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009749	TTAATG	2	12	614535	614546	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009749	TAAAAA	2	12	634902	634913	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009749	ATGTTA	2	12	643674	643685	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009749	TTGCCG	2	12	664357	664368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009749	TAGAAT	2	12	747482	747493	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009749	ATTTTG	2	12	750269	750280	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009749	TTAAAA	2	12	751621	751632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009749	ACAGGT	2	12	764154	764165	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_009749	TTGCAG	2	12	765932	765943	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_009749	TCCCAC	2	12	768316	768327	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_009749	ATGAAA	2	12	769073	769084	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009749	TAGTTT	2	12	773138	773149	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009749	AACAAA	2	12	781104	781115	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_009749	GATTAT	2	12	781127	781138	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009749	TAATTT	2	12	807006	807017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009749	TATAAT	2	12	824325	824336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009749	TTAGTT	2	12	825739	825750	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009749	TAAATA	2	12	838628	838639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009749	TATAGT	2	12	868444	868455	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009749	AAAATA	2	12	869767	869778	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009749	TAACAG	2	12	887480	887491	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_009749	ATATTT	2	12	891294	891305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009749	ATTTTT	2	12	899363	899374	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009749	TTATAT	2	12	908016	908027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009749	TTTACT	2	12	915635	915646	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_009749	TTAGTT	2	12	930721	930732	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009749	TAACAA	2	12	931445	931456	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_009749	TTTAAA	2	12	938783	938794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009749	ATTAGA	2	12	941469	941480	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009749	TAGATA	2	12	950737	950748	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009749	ATTTGA	2	12	950894	950905	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009749	TATAAT	4	24	960147	960170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009749	TTTGCT	2	12	966648	966659	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_009749	AAGAAA	2	12	992047	992058	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009749	TTGATT	2	12	993112	993123	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009749	ACAAAC	2	12	994475	994486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009749	CTATAA	2	12	994957	994968	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_009749	AAAATT	2	12	997594	997605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009749	AGTATT	2	12	1012653	1012664	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009749	CCAAAT	2	12	1013781	1013792	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009749	CAGGTT	2	12	1024184	1024195	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_009749	TAAACT	2	12	1035545	1035556	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_009749	TTTGGC	2	12	1037398	1037409	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_009749	TTGATA	2	12	1042800	1042811	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009749	AGATAT	2	12	1042977	1042988	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009749	ATTAAT	2	12	1043588	1043599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009749	ACATTA	2	12	1043766	1043777	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_009749	GTACTT	2	12	1044031	1044042	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_009749	TTTAGA	2	12	1048866	1048877	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009749	TCAAAT	2	12	1049049	1049060	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_009749	ATCAGT	2	12	1049601	1049612	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_009749	ATATCA	2	12	1059990	1060001	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_009749	TAAGAA	2	12	1068535	1068546	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009749	CTTTCA	2	12	1107679	1107690	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009749	TTTATA	2	12	1112582	1112593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009749	AGAATA	2	12	1121254	1121265	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009749	TGAAAT	2	12	1123560	1123571	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009749	ACAATT	2	12	1125688	1125699	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_009749	TTAGCT	2	12	1158825	1158836	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_009749	TATCTA	2	12	1158907	1158918	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_009749	AGATTA	2	12	1162839	1162850	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009749	CTAAAT	2	12	1165287	1165298	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_009749	ATAAAG	2	12	1166704	1166715	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009749	TAATTA	2	12	1183926	1183937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009749	AATTTA	2	12	1210242	1210253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009749	CTTATT	2	12	1210612	1210623	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_009749	TATAGG	2	12	1210824	1210835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009749	ATATTA	2	12	1221147	1221158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009749	CGGTGC	2	12	1231736	1231747	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009749	AATTCA	2	12	1234444	1234455	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_009749	CTTGAT	2	12	1235683	1235694	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_009749	AGAATC	2	12	1258861	1258872	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_009749	TATAGA	2	12	1259374	1259385	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009749	TAATTT	2	12	1259637	1259648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009749	TACGAT	2	12	1260024	1260035	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_009749	TTTATT	2	12	1260286	1260297	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009749	TATTTT	4	24	1261068	1261091	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009749	ATCAAA	2	12	1262507	1262518	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_009749	AAAATT	2	12	1262525	1262536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009749	CTATTG	2	12	1263292	1263303	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_009749	AAAATC	2	12	1263464	1263475	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_009749	TAAATC	2	12	1271471	1271482	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_009749	TAAAAA	2	12	1272198	1272209	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009749	AATCAA	2	12	1278585	1278596	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_009749	AGCTGA	2	12	1298466	1298477	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_009749	CTATTA	2	12	1299926	1299937	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.