MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica FTNF002-00 chromosome

Total Repeats: 704

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009749	CAAGAT	2	12	721	732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	169656467
2	NC_009749	TATTTC	2	12	2819	2830	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	156501371
3	NC_009749	TAAGAG	2	12	6969	6980	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	169656469
4	NC_009749	TGGTTT	2	12	7401	7412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169656469
5	NC_009749	TAAAGG	2	12	8744	8755	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	156501381
6	NC_009749	GTTGAT	2	12	9833	9844	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	156501383
7	NC_009749	ATTAAG	2	12	14494	14505	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	169656470
8	NC_009749	GTTTTA	2	12	21417	21428	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	169656472
9	NC_009749	TCTAGT	2	12	26844	26855	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156501404
10	NC_009749	CTAAAA	2	12	30404	30415	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	156501405
11	NC_009749	TGGTGA	2	12	32390	32401	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	156501407
12	NC_009749	ACCAAT	2	12	32426	32437	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	156501407
13	NC_009749	TAAATT	2	12	41552	41563	50 %	50 %	0 %	0 %	156501416
14	NC_009749	TACCAG	2	12	45306	45317	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156501421
15	NC_009749	TAAAAA	2	12	56134	56145	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	156501433
16	NC_009749	TTATGT	2	12	57896	57907	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	156501434
17	NC_009749	AAGGAT	2	12	58438	58449	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	156501434
18	NC_009749	TAAATA	2	12	61370	61381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501439
19	NC_009749	GTTATT	2	12	62932	62943	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	156501441
20	NC_009749	ATCTTT	2	12	80395	80406	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	156501463
21	NC_009749	TATGAA	2	12	81510	81521	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	156501464
22	NC_009749	TGCAAA	2	12	86193	86204	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	156501470
23	NC_009749	TCAAAA	2	12	87234	87245	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	156501471
24	NC_009749	CAGCTT	2	12	87847	87858	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156501471
25	NC_009749	GGACTA	2	12	88572	88583	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156501471
26	NC_009749	CTTTCT	2	12	90353	90364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156501472
27	NC_009749	ATATAG	2	12	91505	91516	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	156501472
28	NC_009749	AATATC	2	12	95467	95478	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	169656482
29	NC_009749	GTGATT	2	12	95703	95714	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	169656482
30	NC_009749	TCCAGC	2	12	97427	97438	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	169656483
31	NC_009749	GTTTTA	2	12	100360	100371	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	169656484
32	NC_009749	AGCTTT	2	12	101778	101789	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156501485
33	NC_009749	TTTTGA	2	12	102803	102814	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	156501488
34	NC_009749	TTTATC	2	12	103275	103286	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	156501489
35	NC_009749	TAGTAT	2	12	105154	105165	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	156501490
36	NC_009749	TCATTA	2	12	105697	105708	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	156501491
37	NC_009749	GATAAG	2	12	107545	107556	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	156501493
38	NC_009749	ATTAAA	2	12	107710	107721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501493
39	NC_009749	CATTTG	2	12	109379	109390	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156501493
40	NC_009749	CTATTT	2	12	110201	110212	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	156501493
41	NC_009749	CTTTCA	2	12	112373	112384	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	156501495
42	NC_009749	TCATTA	3	18	113615	113632	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	156501496
43	NC_009749	TTTATA	2	12	123477	123488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156501503
44	NC_009749	GTTTTA	2	12	130693	130704	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	169656486
45	NC_009749	ATCAAT	2	12	134351	134362	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	156501511
46	NC_009749	AATACC	2	12	139176	139187	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	156501512
47	NC_009749	CTGATA	2	12	139442	139453	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156501512
48	NC_009749	TTGAGA	2	12	144023	144034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501518
49	NC_009749	TTAGGC	2	12	144880	144891	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	156501518
50	NC_009749	TATTTT	2	12	148118	148129	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	156501522
51	NC_009749	TAAGTA	2	12	149062	149073	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	156501525
52	NC_009749	GATCTA	2	12	153030	153041	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156501528
53	NC_009749	AAATAT	2	12	155906	155917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501529
54	NC_009749	ACAGGT	2	12	158083	158094	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156501532
55	NC_009749	ACTTTT	2	12	158426	158437	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	169656491
56	NC_009749	GTTTTA	2	12	159051	159062	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	169656492
57	NC_009749	ACCTTA	2	12	159877	159888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156501537
58	NC_009749	GCCATT	2	12	160542	160553	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156501538
59	NC_009749	ACTGTT	2	12	161945	161956	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156501539
60	NC_009749	TAATTA	2	12	163568	163579	50 %	50 %	0 %	0 %	156501540
61	NC_009749	AAACTT	2	12	165609	165620	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	169656493
62	NC_009749	TATCAA	2	12	172312	172323	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	156501551
63	NC_009749	AATTAT	2	12	172576	172587	50 %	50 %	0 %	0 %	156501551
64	NC_009749	GCTTTG	2	12	176816	176827	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	156501557
65	NC_009749	TAGCTT	2	12	179331	179342	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156501560
66	NC_009749	CCAGCT	2	12	180163	180174	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	156501560
67	NC_009749	GACAAA	2	12	180694	180705	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	156501561
68	NC_009749	GTTTTA	2	12	184363	184374	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	169656497
69	NC_009749	CAAATT	2	12	189745	189756	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	169656498
70	NC_009749	TTTTAT	2	12	190430	190441	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	156501573
71	NC_009749	TTAAGT	2	12	191171	191182	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	156501573
72	NC_009749	ATTATA	2	12	196442	196453	50 %	50 %	0 %	0 %	156501578
73	NC_009749	CACCAA	2	12	198208	198219	50 %	0 %	0 %	50 %	156501581
74	NC_009749	ACTAGT	2	12	205542	205553	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156501590
75	NC_009749	AAGATG	2	12	210076	210087	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	156501594
76	NC_009749	TACTGC	2	12	210692	210703	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156501594
77	NC_009749	TTTAGC	2	12	210890	210901	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156501594
78	NC_009749	ATTAGT	2	12	211493	211504	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	156501594
79	NC_009749	ATAAGT	2	12	212578	212589	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	156501596
80	NC_009749	TAGCTT	2	12	215498	215509	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156501599
81	NC_009749	CATCAC	2	12	218757	218768	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	156501602
82	NC_009749	TTTTGA	2	12	218770	218781	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	156501602
83	NC_009749	ATTTTT	2	12	224108	224119	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	156501607
84	NC_009749	TGAAGC	2	12	225070	225081	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	394894374
85	NC_009749	AAAGAA	2	12	226175	226186	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	156501609
86	NC_009749	AAAAGA	2	12	227658	227669	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	156501611
87	NC_009749	TGGTGT	2	12	228687	228698	0 %	50 %	50 %	0 %	156501613
88	NC_009749	GTTTTT	2	12	229387	229398	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	156501613
89	NC_009749	TGAAGT	2	12	231178	231189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501617
90	NC_009749	GCAAGA	2	12	231654	231665	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	156501618
91	NC_009749	CTGTTG	2	12	232736	232747	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	156501618
92	NC_009749	AGGTTG	2	12	233345	233356	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	156501618
93	NC_009749	GTAAAG	2	12	238059	238070	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	156501627
94	NC_009749	TGGGTG	2	12	239609	239620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156501631
95	NC_009749	TTGGTG	2	12	240738	240749	0 %	50 %	50 %	0 %	169656502
96	NC_009749	GTTTTA	2	12	247858	247869	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	169656503
97	NC_009749	ATCTTT	2	12	248852	248863	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	169656504
98	NC_009749	GGTATG	2	12	253135	253146	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	156501651
99	NC_009749	TGATAA	2	12	260069	260080	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	156501658
100	NC_009749	AAATGC	2	12	260766	260777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	156501659
101	NC_009749	CATTAG	2	12	261203	261214	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156501660
102	NC_009749	CTAAAG	2	12	262032	262043	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	156501661
103	NC_009749	ATAACA	2	12	262604	262615	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	156501662
104	NC_009749	TTTATG	2	12	264364	264375	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	156501663
105	NC_009749	TGGTGA	2	12	266521	266532	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	156501667
106	NC_009749	GCTTTA	2	12	268576	268587	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	156501668
107	NC_009749	AAAGCC	2	12	271378	271389	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	156501671
108	NC_009749	TTGCCT	2	12	274809	274820	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	156501676
109	NC_009749	TACTAT	2	12	276523	276534	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	169656507
110	NC_009749	TCTTGT	2	12	280248	280259	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	156501680
111	NC_009749	ATCTAA	2	12	284976	284987	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	156501684
112	NC_009749	GCTAAA	2	12	285532	285543	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	156501684
113	NC_009749	TGGTAA	2	12	294028	294039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501695
114	NC_009749	GATTTT	2	12	294851	294862	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	156501695
115	NC_009749	ATGGTA	2	12	296008	296019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501696
116	NC_009749	TGCTGG	2	12	296048	296059	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	156501696
117	NC_009749	GTTGAG	2	12	298118	298129	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	156501697
118	NC_009749	AGTGGT	2	12	298739	298750	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	156501697
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232	NC_009749	AGCTAT	2	12	618493	618504	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	169656555
233	NC_009749	ATACTT	3	18	624770	624787	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	156502038
234	NC_009749	GATTTG	2	12	627643	627654	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	156502042
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342	NC_009749	ACAGCC	3	18	952414	952431	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	156502400
343	NC_009749	CCTAGA	2	12	957833	957844	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	156502406
344	NC_009749	TTGAAA	2	12	960856	960867	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	156502409
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346	NC_009749	GTTCTT	2	12	963980	963991	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	156502415
347	NC_009749	ATCAAT	2	12	965029	965040	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	156502415
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452	NC_009749	ACAGCA	2	12	1233322	1233333	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	156502733
453	NC_009749	GTTTTA	2	12	1237321	1237332	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	169656649
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455	NC_009749	CTTGCT	2	12	1246065	1246076	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	169656651
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