MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica FTNF002-00 chromosome

Total Repeats: 1608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009749	AAGAA	2	10	1181	1190	80 %	0 %	20 %	0 %	169656467
2	NC_009749	CATCT	2	10	3512	3521	20 %	40 %	0 %	40 %	169656468
3	NC_009749	TTCTT	2	10	3584	3593	0 %	80 %	0 %	20 %	169656468
4	NC_009749	CCTTG	2	10	3782	3791	0 %	40 %	20 %	40 %	169656468
5	NC_009749	ATTAT	2	10	6832	6841	40 %	60 %	0 %	0 %	156501378
6	NC_009749	CAACA	2	10	6924	6933	60 %	0 %	0 %	40 %	169656469
7	NC_009749	TGTTT	2	10	8632	8641	0 %	80 %	20 %	0 %	156501381
8	NC_009749	CAAGA	2	10	11612	11621	60 %	0 %	20 %	20 %	156501385
9	NC_009749	TTGAT	2	10	13940	13949	20 %	60 %	20 %	0 %	169656470
10	NC_009749	CATCT	2	10	16410	16419	20 %	40 %	0 %	40 %	169656471
11	NC_009749	TTCTT	2	10	16482	16491	0 %	80 %	0 %	20 %	169656471
12	NC_009749	CCTTG	2	10	16680	16689	0 %	40 %	20 %	40 %	169656471
13	NC_009749	AGCTA	2	10	19244	19253	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009749	ACGCA	2	10	19774	19783	40 %	0 %	20 %	40 %	156501394
15	NC_009749	TTGAA	2	10	19863	19872	40 %	40 %	20 %	0 %	156501394
16	NC_009749	GCAAA	2	10	20378	20387	60 %	0 %	20 %	20 %	156501394
17	NC_009749	TTAAT	2	10	20485	20494	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009749	TGATT	2	10	20672	20681	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009749	CAAGG	2	10	21255	21264	40 %	0 %	40 %	20 %	169656472
20	NC_009749	AAAGA	2	10	21452	21461	80 %	0 %	20 %	0 %	169656472
21	NC_009749	ATTTT	2	10	23023	23032	20 %	80 %	0 %	0 %	156501400
22	NC_009749	ATATC	2	10	23095	23104	40 %	40 %	0 %	20 %	156501400
23	NC_009749	ATTTT	2	10	23190	23199	20 %	80 %	0 %	0 %	156501400
24	NC_009749	AGATA	2	10	23334	23343	60 %	20 %	20 %	0 %	156501400
25	NC_009749	CAAAG	2	10	25307	25316	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009749	ATATT	2	10	25683	25692	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009749	ATTTT	2	10	26087	26096	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009749	ATTTG	2	10	26147	26156	20 %	60 %	20 %	0 %	156501404
29	NC_009749	AAAGA	2	10	26865	26874	80 %	0 %	20 %	0 %	156501404
30	NC_009749	CATTT	2	10	28509	28518	20 %	60 %	0 %	20 %	156501405
31	NC_009749	ATAGT	2	10	30839	30848	40 %	40 %	20 %	0 %	156501406
32	NC_009749	AAAAT	2	10	33080	33089	80 %	20 %	0 %	0 %	156501407
33	NC_009749	GTTTA	2	10	33771	33780	20 %	60 %	20 %	0 %	156501408
34	NC_009749	TCAAA	2	10	34025	34034	60 %	20 %	0 %	20 %	156501409
35	NC_009749	GAAAA	2	10	35856	35865	80 %	0 %	20 %	0 %	156501410
36	NC_009749	CTTGT	2	10	35929	35938	0 %	60 %	20 %	20 %	156501410
37	NC_009749	AAACA	2	10	36034	36043	80 %	0 %	0 %	20 %	156501410
38	NC_009749	AAATA	2	10	36142	36151	80 %	20 %	0 %	0 %	156501410
39	NC_009749	CTGTA	2	10	36464	36473	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_009749	TTATC	2	10	36751	36760	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009749	TTGAT	2	10	38118	38127	20 %	60 %	20 %	0 %	156501412
42	NC_009749	TACAA	2	10	38958	38967	60 %	20 %	0 %	20 %	156501413
43	NC_009749	CTAAC	2	10	39432	39441	40 %	20 %	0 %	40 %	156501414
44	NC_009749	TTTTA	2	10	40006	40015	20 %	80 %	0 %	0 %	156501414
45	NC_009749	TAATA	2	10	40687	40696	60 %	40 %	0 %	0 %	156501415
46	NC_009749	AGAAA	2	10	42599	42608	80 %	0 %	20 %	0 %	156501418
47	NC_009749	AGTTT	2	10	45948	45957	20 %	60 %	20 %	0 %	156501421
48	NC_009749	CTTGT	2	10	49874	49883	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_009749	AGTTT	2	10	51776	51785	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009749	GATAA	2	10	52893	52902	60 %	20 %	20 %	0 %	169656474
51	NC_009749	TAAAC	2	10	53747	53756	60 %	20 %	0 %	20 %	169656474
52	NC_009749	CATCT	2	10	54592	54601	20 %	40 %	0 %	40 %	169656475
53	NC_009749	TTCTT	2	10	54664	54673	0 %	80 %	0 %	20 %	169656475
54	NC_009749	CCTTG	2	10	54862	54871	0 %	40 %	20 %	40 %	169656475
55	NC_009749	TATTT	2	10	55673	55682	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009749	ATTAT	2	10	55703	55712	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009749	TAATA	2	10	56282	56291	60 %	40 %	0 %	0 %	156501433
58	NC_009749	AATTT	2	10	56707	56716	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009749	TTATT	2	10	56962	56971	20 %	80 %	0 %	0 %	156501435
60	NC_009749	TACTT	2	10	57247	57256	20 %	60 %	0 %	20 %	156501435
61	NC_009749	TTCAA	2	10	59801	59810	40 %	40 %	0 %	20 %	156501438
62	NC_009749	GATAA	2	10	61259	61268	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009749	AATTT	2	10	62827	62836	40 %	60 %	0 %	0 %	156501441
64	NC_009749	TTTGT	2	10	63106	63115	0 %	80 %	20 %	0 %	156501441
65	NC_009749	ATTTT	2	10	64172	64181	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009749	CTAAA	2	10	65820	65829	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009749	GTTTA	2	10	66597	66606	20 %	60 %	20 %	0 %	156501446
68	NC_009749	TGAAA	2	10	67626	67635	60 %	20 %	20 %	0 %	156501448
69	NC_009749	AAAGT	2	10	71461	71470	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009749	TTTTA	2	10	74692	74701	20 %	80 %	0 %	0 %	156501455
71	NC_009749	TATTT	2	10	74923	74932	20 %	80 %	0 %	0 %	156501455
72	NC_009749	GCCCT	2	10	75590	75599	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_009749	AGAAA	2	10	75801	75810	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009749	CATCT	2	10	76909	76918	20 %	40 %	0 %	40 %	169656477
75	NC_009749	TTCTT	2	10	76981	76990	0 %	80 %	0 %	20 %	169656477
76	NC_009749	CCTTG	2	10	77179	77188	0 %	40 %	20 %	40 %	169656477
77	NC_009749	TTTGG	2	10	77460	77469	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009749	ACTTT	2	10	77501	77510	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009749	TTTGT	2	10	81711	81720	0 %	80 %	20 %	0 %	156501464
80	NC_009749	ATTTT	2	10	84695	84704	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009749	AGTTA	2	10	84819	84828	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009749	AACTC	2	10	85795	85804	40 %	20 %	0 %	40 %	156501470
83	NC_009749	ATTAC	2	10	90832	90841	40 %	40 %	0 %	20 %	156501472
84	NC_009749	ATGTA	2	10	91374	91383	40 %	40 %	20 %	0 %	156501472
85	NC_009749	TAAAA	2	10	92562	92571	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009749	AAACT	2	10	92833	92842	60 %	20 %	0 %	20 %	169656481
87	NC_009749	TTTCT	2	10	93769	93778	0 %	80 %	0 %	20 %	156501475
88	NC_009749	CTTTT	2	10	93827	93836	0 %	80 %	0 %	20 %	156501476
89	NC_009749	TAGTA	2	10	95743	95752	40 %	40 %	20 %	0 %	169656482
90	NC_009749	CAAGG	2	10	100198	100207	40 %	0 %	40 %	20 %	169656484
91	NC_009749	AAAGA	2	10	100395	100404	80 %	0 %	20 %	0 %	169656484
92	NC_009749	TGAAA	2	10	102935	102944	60 %	20 %	20 %	0 %	156501488
93	NC_009749	GTCGA	2	10	104422	104431	20 %	20 %	40 %	20 %	156501489
94	NC_009749	TAAGT	2	10	105609	105618	40 %	40 %	20 %	0 %	156501491
95	NC_009749	TAAAT	2	10	106101	106110	60 %	40 %	0 %	0 %	156501491
96	NC_009749	TTATA	2	10	106546	106555	40 %	60 %	0 %	0 %	156501492
97	NC_009749	TTTTC	2	10	106560	106569	0 %	80 %	0 %	20 %	156501492
98	NC_009749	TAATA	2	10	107936	107945	60 %	40 %	0 %	0 %	156501493
99	NC_009749	TTTTA	2	10	108273	108282	20 %	80 %	0 %	0 %	156501493
100	NC_009749	GCTTG	2	10	109449	109458	0 %	40 %	40 %	20 %	156501493
101	NC_009749	ATTTT	2	10	110530	110539	20 %	80 %	0 %	0 %	156501493
102	NC_009749	TATAA	2	10	111336	111345	60 %	40 %	0 %	0 %	156501494
103	NC_009749	TATTT	2	10	111940	111949	20 %	80 %	0 %	0 %	156501495
104	NC_009749	ATTAA	2	10	114410	114419	60 %	40 %	0 %	0 %	156501497
105	NC_009749	TCTTT	2	10	115124	115133	0 %	80 %	0 %	20 %	156501497
106	NC_009749	TTCTA	2	10	117038	117047	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009749	TATAA	2	10	117349	117358	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009749	TATTC	2	10	120394	120403	20 %	60 %	0 %	20 %	156501502
109	NC_009749	TTGTT	2	10	123571	123580	0 %	80 %	20 %	0 %	156501503
110	NC_009749	GAATA	2	10	126019	126028	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009749	CAAGG	2	10	130531	130540	40 %	0 %	40 %	20 %	169656486
112	NC_009749	AAAGA	2	10	130728	130737	80 %	0 %	20 %	0 %	169656486
113	NC_009749	CGTAT	2	10	133405	133414	20 %	40 %	20 %	20 %	156501510
114	NC_009749	GATTT	2	10	133646	133655	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009749	CTAGC	2	10	134149	134158	20 %	20 %	20 %	40 %	156501511
116	NC_009749	TTTTC	2	10	135118	135127	0 %	80 %	0 %	20 %	156501511
117	NC_009749	TTTTA	2	10	136664	136673	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009749	TATAG	2	10	139650	139659	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009749	CATCT	2	10	140610	140619	20 %	40 %	0 %	40 %	169656488
120	NC_009749	TTCTT	2	10	140682	140691	0 %	80 %	0 %	20 %	169656488
121	NC_009749	CCTTG	2	10	140880	140889	0 %	40 %	20 %	40 %	169656488
122	NC_009749	AAAAT	2	10	141142	141151	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009749	ATAAA	2	10	141720	141729	80 %	20 %	0 %	0 %	156501516
124	NC_009749	AATAA	2	10	141870	141879	80 %	20 %	0 %	0 %	156501516
125	NC_009749	GGGAT	2	10	145390	145399	20 %	20 %	60 %	0 %	156501518
126	NC_009749	TTGAT	2	10	145442	145451	20 %	60 %	20 %	0 %	156501518
127	NC_009749	AAATT	2	10	147447	147456	60 %	40 %	0 %	0 %	156501520
128	NC_009749	TTATT	2	10	149191	149200	20 %	80 %	0 %	0 %	156501525
129	NC_009749	TATTT	2	10	150941	150950	20 %	80 %	0 %	0 %	169656490
130	NC_009749	AGATG	2	10	152207	152216	40 %	20 %	40 %	0 %	156501527
131	NC_009749	ATTTT	2	10	158378	158387	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009749	CAAGG	2	10	158889	158898	40 %	0 %	40 %	20 %	169656492
133	NC_009749	AAAGA	2	10	159086	159095	80 %	0 %	20 %	0 %	169656492
134	NC_009749	ATTGT	2	10	164112	164121	20 %	60 %	20 %	0 %	156501541
135	NC_009749	AAAGC	2	10	166257	166266	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_009749	TAAAC	2	10	166638	166647	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009749	CATCT	2	10	167574	167583	20 %	40 %	0 %	40 %	169656494
138	NC_009749	TTCTT	2	10	167646	167655	0 %	80 %	0 %	20 %	169656494
139	NC_009749	CCTTG	2	10	167844	167853	0 %	40 %	20 %	40 %	169656494
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