MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica FTNF002-00 chromosome

Total Repeats: 432

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009749	AGCTA	2	10	19244	19253	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009749	TTAAT	2	10	20485	20494	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009749	TGATT	2	10	20672	20681	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009749	CAAAG	2	10	25307	25316	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009749	ATATT	2	10	25683	25692	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009749	ATTTT	2	10	26087	26096	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009749	CTGTA	2	10	36464	36473	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009749	TTATC	2	10	36751	36760	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009749	CTTGT	2	10	49874	49883	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009749	AGTTT	2	10	51776	51785	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009749	TATTT	2	10	55673	55682	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009749	ATTAT	2	10	55703	55712	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009749	AATTT	2	10	56707	56716	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009749	GATAA	2	10	61259	61268	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009749	ATTTT	2	10	64172	64181	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009749	CTAAA	2	10	65820	65829	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009749	AAAGT	2	10	71461	71470	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009749	GCCCT	2	10	75590	75599	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_009749	AGAAA	2	10	75801	75810	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009749	TTTGG	2	10	77460	77469	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009749	ACTTT	2	10	77501	77510	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009749	ATTTT	2	10	84695	84704	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009749	AGTTA	2	10	84819	84828	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009749	TAAAA	2	10	92562	92571	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009749	TTCTA	2	10	117038	117047	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009749	TATAA	2	10	117349	117358	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009749	GAATA	2	10	126019	126028	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009749	GATTT	2	10	133646	133655	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009749	TTTTA	2	10	136664	136673	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009749	TATAG	2	10	139650	139659	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009749	AAAAT	2	10	141142	141151	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009749	ATTTT	2	10	158378	158387	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009749	AAAGC	2	10	166257	166266	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009749	TAAAC	2	10	166638	166647	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_009749	AAATA	2	10	172828	172837	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009749	TATAG	2	10	173442	173451	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009749	CTAGC	2	10	176459	176468	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_009749	CTTGA	2	10	177355	177364	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009749	TTAAG	2	10	190317	190326	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009749	AGATT	2	10	190411	190420	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009749	AAAAC	2	10	196968	196977	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009749	AAAAT	2	10	215677	215686	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009749	AGAAA	2	10	220377	220386	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009749	ATCTT	2	10	222527	222536	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_009749	TAATA	2	10	234021	234030	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009749	ATTTT	2	10	238695	238704	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009749	ATTTC	2	10	247411	247420	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_009749	ATTGA	2	10	249704	249713	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009749	TTTCT	2	10	250338	250347	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009749	CTTTT	2	10	253333	253342	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009749	TAATT	2	10	256179	256188	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009749	AGTTT	2	10	257155	257164	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009749	TTTGA	2	10	265680	265689	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009749	ATGAT	2	10	269057	269066	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009749	TAAAA	2	10	269185	269194	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009749	TGATC	2	10	307628	307637	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_009749	TAATT	2	10	308342	308351	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009749	ATTTA	2	10	314432	314441	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009749	AATCT	2	10	318833	318842	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_009749	ATATA	2	10	322021	322030	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009749	AAGCA	2	10	322952	322961	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009749	AAATG	2	10	326283	326292	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009749	GATTT	2	10	326542	326551	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009749	ATTTT	2	10	326771	326780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009749	GCGAT	2	10	327699	327708	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_009749	TATCT	2	10	340084	340093	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009749	TTTCT	2	10	340969	340978	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009749	AGATA	2	10	342177	342186	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009749	AATCT	2	10	350738	350747	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_009749	ATTTA	2	10	356637	356646	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009749	AATAA	2	10	360732	360741	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009749	TAGTT	2	10	362571	362580	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009749	TTAGA	2	10	362800	362809	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009749	GATTT	2	10	364649	364658	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009749	TTTAG	2	10	373886	373895	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009749	AGTTA	2	10	377735	377744	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009749	CATCT	2	10	385688	385697	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_009749	TTCTT	2	10	385760	385769	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009749	CCTTG	2	10	385958	385967	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_009749	CTGTC	2	10	386438	386447	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_009749	TTTAT	2	10	388985	388994	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009749	AATAA	2	10	395195	395204	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009749	TTTCT	2	10	411473	411482	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_009749	TGTTA	2	10	416914	416923	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009749	TTTTA	2	10	416928	416937	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009749	TAAAT	2	10	416974	416983	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009749	GAATA	2	10	419006	419015	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009749	TAATT	2	10	423605	423614	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009749	TGAAA	2	10	437337	437346	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009749	TAATT	2	10	442100	442109	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009749	AGAAA	2	10	444635	444644	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009749	TTGTA	2	10	445425	445434	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009749	TTTTA	2	10	452032	452041	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009749	AGTTA	2	10	452051	452060	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009749	TTAAC	2	10	479370	479379	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_009749	TTTAA	2	10	486459	486468	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009749	GTTTG	2	10	504149	504158	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009749	CAATT	2	10	504160	504169	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009749	AATGA	2	10	506873	506882	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009749	TAGAT	2	10	506885	506894	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009749	ACTAT	2	10	508793	508802	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_009749	AAATT	2	10	508838	508847	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009749	GATAA	2	10	514428	514437	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009749	GATAA	2	10	515607	515616	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009749	TTCTT	2	10	521918	521927	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009749	ATTTA	2	10	541614	541623	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009749	TAATG	2	10	547461	547470	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009749	ATTTG	2	10	548171	548180	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009749	AACTT	2	10	548752	548761	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009749	ATTTT	2	10	548883	548892	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009749	ACTAA	2	10	550771	550780	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_009749	AGTTA	2	10	560564	560573	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009749	ATTTA	2	10	560949	560958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009749	TTTAG	2	10	562741	562750	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009749	AATTT	2	10	597491	597500	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009749	TAAGT	2	10	598634	598643	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009749	TGAGA	2	10	605415	605424	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009749	AATTA	2	10	607883	607892	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009749	TTTTA	2	10	613307	613316	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009749	AATAT	2	10	623216	623225	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009749	GCTAT	2	10	624280	624289	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_009749	ACTAG	2	10	624500	624509	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_009749	AATCA	2	10	627395	627404	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_009749	AACTA	2	10	629926	629935	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_009749	TATTT	2	10	635407	635416	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009749	AAAGT	2	10	636402	636411	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009749	AGATA	2	10	643804	643813	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009749	TTAAA	2	10	664580	664589	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009749	ATTTA	2	10	682765	682774	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009749	GCTTA	2	10	691984	691993	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009749	ATAAA	2	10	695438	695447	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009749	TTATA	2	10	695469	695478	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009749	TAATA	2	10	697490	697499	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009749	TAGTT	2	10	700955	700964	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009749	TGGCA	2	10	703729	703738	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_009749	CTATG	2	10	703878	703887	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009749	TGTTT	2	10	704465	704474	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009749	TAAAT	2	10	713936	713945	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009749	AAAAT	2	10	716541	716550	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009749	GATTT	2	10	722621	722630	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009749	TATAA	2	10	723518	723527	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009749	TGTTT	2	10	725418	725427	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009749	ATATA	2	10	727110	727119	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009749	CAAAA	2	10	734614	734623	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_009749	TGCTG	2	10	748048	748057	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_009749	AAATT	2	10	750154	750163	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009749	ACTAA	2	10	750186	750195	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_009749	CATTG	2	10	751528	751537	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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430	NC_009749	TAGCA	2	10	1880510	1880519	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
431	NC_009749	TTTTA	2	10	1890438	1890447	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_009749	TACTT	2	10	1890503	1890512	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.