MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica FTNF002-00 chromosome

Total Repeats: 1176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009749	AAGAA	2	10	1181	1190	80 %	0 %	20 %	0 %	169656467
2	NC_009749	CATCT	2	10	3512	3521	20 %	40 %	0 %	40 %	169656468
3	NC_009749	TTCTT	2	10	3584	3593	0 %	80 %	0 %	20 %	169656468
4	NC_009749	CCTTG	2	10	3782	3791	0 %	40 %	20 %	40 %	169656468
5	NC_009749	ATTAT	2	10	6832	6841	40 %	60 %	0 %	0 %	156501378
6	NC_009749	CAACA	2	10	6924	6933	60 %	0 %	0 %	40 %	169656469
7	NC_009749	TGTTT	2	10	8632	8641	0 %	80 %	20 %	0 %	156501381
8	NC_009749	CAAGA	2	10	11612	11621	60 %	0 %	20 %	20 %	156501385
9	NC_009749	TTGAT	2	10	13940	13949	20 %	60 %	20 %	0 %	169656470
10	NC_009749	CATCT	2	10	16410	16419	20 %	40 %	0 %	40 %	169656471
11	NC_009749	TTCTT	2	10	16482	16491	0 %	80 %	0 %	20 %	169656471
12	NC_009749	CCTTG	2	10	16680	16689	0 %	40 %	20 %	40 %	169656471
13	NC_009749	ACGCA	2	10	19774	19783	40 %	0 %	20 %	40 %	156501394
14	NC_009749	TTGAA	2	10	19863	19872	40 %	40 %	20 %	0 %	156501394
15	NC_009749	GCAAA	2	10	20378	20387	60 %	0 %	20 %	20 %	156501394
16	NC_009749	CAAGG	2	10	21255	21264	40 %	0 %	40 %	20 %	169656472
17	NC_009749	AAAGA	2	10	21452	21461	80 %	0 %	20 %	0 %	169656472
18	NC_009749	ATTTT	2	10	23023	23032	20 %	80 %	0 %	0 %	156501400
19	NC_009749	ATATC	2	10	23095	23104	40 %	40 %	0 %	20 %	156501400
20	NC_009749	ATTTT	2	10	23190	23199	20 %	80 %	0 %	0 %	156501400
21	NC_009749	AGATA	2	10	23334	23343	60 %	20 %	20 %	0 %	156501400
22	NC_009749	ATTTG	2	10	26147	26156	20 %	60 %	20 %	0 %	156501404
23	NC_009749	AAAGA	2	10	26865	26874	80 %	0 %	20 %	0 %	156501404
24	NC_009749	CATTT	2	10	28509	28518	20 %	60 %	0 %	20 %	156501405
25	NC_009749	ATAGT	2	10	30839	30848	40 %	40 %	20 %	0 %	156501406
26	NC_009749	AAAAT	2	10	33080	33089	80 %	20 %	0 %	0 %	156501407
27	NC_009749	GTTTA	2	10	33771	33780	20 %	60 %	20 %	0 %	156501408
28	NC_009749	TCAAA	2	10	34025	34034	60 %	20 %	0 %	20 %	156501409
29	NC_009749	GAAAA	2	10	35856	35865	80 %	0 %	20 %	0 %	156501410
30	NC_009749	CTTGT	2	10	35929	35938	0 %	60 %	20 %	20 %	156501410
31	NC_009749	AAACA	2	10	36034	36043	80 %	0 %	0 %	20 %	156501410
32	NC_009749	AAATA	2	10	36142	36151	80 %	20 %	0 %	0 %	156501410
33	NC_009749	TTGAT	2	10	38118	38127	20 %	60 %	20 %	0 %	156501412
34	NC_009749	TACAA	2	10	38958	38967	60 %	20 %	0 %	20 %	156501413
35	NC_009749	CTAAC	2	10	39432	39441	40 %	20 %	0 %	40 %	156501414
36	NC_009749	TTTTA	2	10	40006	40015	20 %	80 %	0 %	0 %	156501414
37	NC_009749	TAATA	2	10	40687	40696	60 %	40 %	0 %	0 %	156501415
38	NC_009749	AGAAA	2	10	42599	42608	80 %	0 %	20 %	0 %	156501418
39	NC_009749	AGTTT	2	10	45948	45957	20 %	60 %	20 %	0 %	156501421
40	NC_009749	GATAA	2	10	52893	52902	60 %	20 %	20 %	0 %	169656474
41	NC_009749	TAAAC	2	10	53747	53756	60 %	20 %	0 %	20 %	169656474
42	NC_009749	CATCT	2	10	54592	54601	20 %	40 %	0 %	40 %	169656475
43	NC_009749	TTCTT	2	10	54664	54673	0 %	80 %	0 %	20 %	169656475
44	NC_009749	CCTTG	2	10	54862	54871	0 %	40 %	20 %	40 %	169656475
45	NC_009749	TAATA	2	10	56282	56291	60 %	40 %	0 %	0 %	156501433
46	NC_009749	TTATT	2	10	56962	56971	20 %	80 %	0 %	0 %	156501435
47	NC_009749	TACTT	2	10	57247	57256	20 %	60 %	0 %	20 %	156501435
48	NC_009749	TTCAA	2	10	59801	59810	40 %	40 %	0 %	20 %	156501438
49	NC_009749	AATTT	2	10	62827	62836	40 %	60 %	0 %	0 %	156501441
50	NC_009749	TTTGT	2	10	63106	63115	0 %	80 %	20 %	0 %	156501441
51	NC_009749	GTTTA	2	10	66597	66606	20 %	60 %	20 %	0 %	156501446
52	NC_009749	TGAAA	2	10	67626	67635	60 %	20 %	20 %	0 %	156501448
53	NC_009749	TTTTA	2	10	74692	74701	20 %	80 %	0 %	0 %	156501455
54	NC_009749	TATTT	2	10	74923	74932	20 %	80 %	0 %	0 %	156501455
55	NC_009749	CATCT	2	10	76909	76918	20 %	40 %	0 %	40 %	169656477
56	NC_009749	TTCTT	2	10	76981	76990	0 %	80 %	0 %	20 %	169656477
57	NC_009749	CCTTG	2	10	77179	77188	0 %	40 %	20 %	40 %	169656477
58	NC_009749	TTTGT	2	10	81711	81720	0 %	80 %	20 %	0 %	156501464
59	NC_009749	AACTC	2	10	85795	85804	40 %	20 %	0 %	40 %	156501470
60	NC_009749	ATTAC	2	10	90832	90841	40 %	40 %	0 %	20 %	156501472
61	NC_009749	ATGTA	2	10	91374	91383	40 %	40 %	20 %	0 %	156501472
62	NC_009749	AAACT	2	10	92833	92842	60 %	20 %	0 %	20 %	169656481
63	NC_009749	TTTCT	2	10	93769	93778	0 %	80 %	0 %	20 %	156501475
64	NC_009749	CTTTT	2	10	93827	93836	0 %	80 %	0 %	20 %	156501476
65	NC_009749	TAGTA	2	10	95743	95752	40 %	40 %	20 %	0 %	169656482
66	NC_009749	CAAGG	2	10	100198	100207	40 %	0 %	40 %	20 %	169656484
67	NC_009749	AAAGA	2	10	100395	100404	80 %	0 %	20 %	0 %	169656484
68	NC_009749	TGAAA	2	10	102935	102944	60 %	20 %	20 %	0 %	156501488
69	NC_009749	GTCGA	2	10	104422	104431	20 %	20 %	40 %	20 %	156501489
70	NC_009749	TAAGT	2	10	105609	105618	40 %	40 %	20 %	0 %	156501491
71	NC_009749	TAAAT	2	10	106101	106110	60 %	40 %	0 %	0 %	156501491
72	NC_009749	TTATA	2	10	106546	106555	40 %	60 %	0 %	0 %	156501492
73	NC_009749	TTTTC	2	10	106560	106569	0 %	80 %	0 %	20 %	156501492
74	NC_009749	TAATA	2	10	107936	107945	60 %	40 %	0 %	0 %	156501493
75	NC_009749	TTTTA	2	10	108273	108282	20 %	80 %	0 %	0 %	156501493
76	NC_009749	GCTTG	2	10	109449	109458	0 %	40 %	40 %	20 %	156501493
77	NC_009749	ATTTT	2	10	110530	110539	20 %	80 %	0 %	0 %	156501493
78	NC_009749	TATAA	2	10	111336	111345	60 %	40 %	0 %	0 %	156501494
79	NC_009749	TATTT	2	10	111940	111949	20 %	80 %	0 %	0 %	156501495
80	NC_009749	ATTAA	2	10	114410	114419	60 %	40 %	0 %	0 %	156501497
81	NC_009749	TCTTT	2	10	115124	115133	0 %	80 %	0 %	20 %	156501497
82	NC_009749	TATTC	2	10	120394	120403	20 %	60 %	0 %	20 %	156501502
83	NC_009749	TTGTT	2	10	123571	123580	0 %	80 %	20 %	0 %	156501503
84	NC_009749	CAAGG	2	10	130531	130540	40 %	0 %	40 %	20 %	169656486
85	NC_009749	AAAGA	2	10	130728	130737	80 %	0 %	20 %	0 %	169656486
86	NC_009749	CGTAT	2	10	133405	133414	20 %	40 %	20 %	20 %	156501510
87	NC_009749	CTAGC	2	10	134149	134158	20 %	20 %	20 %	40 %	156501511
88	NC_009749	TTTTC	2	10	135118	135127	0 %	80 %	0 %	20 %	156501511
89	NC_009749	CATCT	2	10	140610	140619	20 %	40 %	0 %	40 %	169656488
90	NC_009749	TTCTT	2	10	140682	140691	0 %	80 %	0 %	20 %	169656488
91	NC_009749	CCTTG	2	10	140880	140889	0 %	40 %	20 %	40 %	169656488
92	NC_009749	ATAAA	2	10	141720	141729	80 %	20 %	0 %	0 %	156501516
93	NC_009749	AATAA	2	10	141870	141879	80 %	20 %	0 %	0 %	156501516
94	NC_009749	GGGAT	2	10	145390	145399	20 %	20 %	60 %	0 %	156501518
95	NC_009749	TTGAT	2	10	145442	145451	20 %	60 %	20 %	0 %	156501518
96	NC_009749	AAATT	2	10	147447	147456	60 %	40 %	0 %	0 %	156501520
97	NC_009749	TTATT	2	10	149191	149200	20 %	80 %	0 %	0 %	156501525
98	NC_009749	TATTT	2	10	150941	150950	20 %	80 %	0 %	0 %	169656490
99	NC_009749	AGATG	2	10	152207	152216	40 %	20 %	40 %	0 %	156501527
100	NC_009749	CAAGG	2	10	158889	158898	40 %	0 %	40 %	20 %	169656492
101	NC_009749	AAAGA	2	10	159086	159095	80 %	0 %	20 %	0 %	169656492
102	NC_009749	ATTGT	2	10	164112	164121	20 %	60 %	20 %	0 %	156501541
103	NC_009749	CATCT	2	10	167574	167583	20 %	40 %	0 %	40 %	169656494
104	NC_009749	TTCTT	2	10	167646	167655	0 %	80 %	0 %	20 %	169656494
105	NC_009749	CCTTG	2	10	167844	167853	0 %	40 %	20 %	40 %	169656494
106	NC_009749	AGTTT	2	10	168584	168593	20 %	60 %	20 %	0 %	156501549
107	NC_009749	ATCAC	2	10	168893	168902	40 %	20 %	0 %	40 %	156501549
108	NC_009749	ATTTT	2	10	169280	169289	20 %	80 %	0 %	0 %	156501550
109	NC_009749	AACTA	2	10	169957	169966	60 %	20 %	0 %	20 %	156501550
110	NC_009749	AGATA	2	10	170164	170173	60 %	20 %	20 %	0 %	156501550
111	NC_009749	CTTGA	2	10	170682	170691	20 %	40 %	20 %	20 %	156501550
112	NC_009749	CTGTA	2	10	171172	171181	20 %	40 %	20 %	20 %	156501550
113	NC_009749	AATAT	2	10	177023	177032	60 %	40 %	0 %	0 %	156501557
114	NC_009749	CTTTG	2	10	177457	177466	0 %	60 %	20 %	20 %	156501558
115	NC_009749	TCTAG	2	10	177526	177535	20 %	40 %	20 %	20 %	156501558
116	NC_009749	AAAAT	2	10	177966	177975	80 %	20 %	0 %	0 %	156501559
117	NC_009749	GGTTG	2	10	179473	179482	0 %	40 %	60 %	0 %	156501560
118	NC_009749	AAAAG	2	10	180904	180913	80 %	0 %	20 %	0 %	156501561
119	NC_009749	CAAGG	2	10	184201	184210	40 %	0 %	40 %	20 %	169656497
120	NC_009749	AAAGA	2	10	184398	184407	80 %	0 %	20 %	0 %	169656497
121	NC_009749	AGCAA	2	10	185185	185194	60 %	0 %	20 %	20 %	156501568
122	NC_009749	TTTAT	2	10	185443	185452	20 %	80 %	0 %	0 %	156501568
123	NC_009749	ATACG	2	10	186007	186016	40 %	20 %	20 %	20 %	156501568
124	NC_009749	TAAAG	2	10	187249	187258	60 %	20 %	20 %	0 %	156501571
125	NC_009749	AGCTA	2	10	187480	187489	40 %	20 %	20 %	20 %	156501571
126	NC_009749	CAAAC	2	10	188031	188040	60 %	0 %	0 %	40 %	156501571
127	NC_009749	TTTGG	2	10	195367	195376	0 %	60 %	40 %	0 %	156501576
128	NC_009749	TTTAT	2	10	201573	201582	20 %	80 %	0 %	0 %	156501585
129	NC_009749	TTGGT	2	10	202330	202339	0 %	60 %	40 %	0 %	156501586
130	NC_009749	AAGCA	2	10	204307	204316	60 %	0 %	20 %	20 %	169656499
131	NC_009749	TTTAT	2	10	207688	207697	20 %	80 %	0 %	0 %	156501592
132	NC_009749	ATCAC	2	10	209115	209124	40 %	20 %	0 %	40 %	156501594
133	NC_009749	AGATA	2	10	209735	209744	60 %	20 %	20 %	0 %	156501594
134	NC_009749	GAAGA	2	10	211891	211900	60 %	0 %	40 %	0 %	156501595
135	NC_009749	TTGGA	2	10	212329	212338	20 %	40 %	40 %	0 %	156501595
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