MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica FTNF002-00 chromosome

Total Repeats: 1484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009749	TGTT	2	8	4324	4331	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009749	GGTA	2	8	4334	4341	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009749	ATTT	2	8	4974	4981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009749	TTGA	2	8	5124	5131	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009749	TTTC	2	8	5261	5268	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009749	TTTA	2	8	5424	5431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009749	ATTA	2	8	5490	5497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009749	TAGC	2	8	6169	6176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009749	ATTA	2	8	6419	6426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009749	ATGA	2	8	6570	6577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009749	ATTA	2	8	8572	8579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009749	ATTT	2	8	11127	11134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009749	CAAA	2	8	19218	19225	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009749	TAAA	2	8	20473	20480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009749	TAAC	2	8	20495	20502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009749	ACCA	2	8	20633	20640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009749	TTAA	2	8	20956	20963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009749	AGTT	2	8	22193	22200	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009749	AAGA	2	8	22660	22667	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009749	TAAA	2	8	24165	24172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009749	TAAT	2	8	24227	24234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009749	TTAA	2	8	24289	24296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009749	TTTA	2	8	24791	24798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009749	ATTA	2	8	24899	24906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009749	TCAG	2	8	25026	25033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009749	TATT	2	8	27038	27045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009749	ATTA	2	8	32001	32008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009749	TTGT	2	8	33892	33899	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009749	ACTA	2	8	33915	33922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009749	ATTT	2	8	36533	36540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009749	TATT	2	8	36931	36938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009749	TTAT	2	8	40329	40336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009749	AATA	2	8	43133	43140	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009749	GTAT	2	8	43164	43171	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009749	ACCT	2	8	47412	47419	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009749	AGTT	2	8	47503	47510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009749	CTTT	2	8	49432	49439	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009749	CCAT	2	8	49489	49496	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009749	GTTT	2	8	49527	49534	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009749	CCTA	2	8	49658	49665	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009749	CTAG	2	8	49845	49852	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009749	ATTT	2	8	50483	50490	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009749	ATCT	2	8	50509	50516	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009749	TAAT	2	8	51175	51182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009749	CTTG	2	8	51300	51307	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009749	AAAT	2	8	51333	51340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009749	AATA	2	8	51898	51905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009749	ACTC	2	8	52002	52009	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009749	GTAT	2	8	52031	52038	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009749	TAAC	2	8	52043	52050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009749	ACCA	2	8	52116	52123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009749	AATT	2	8	52165	52172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009749	AAGT	2	8	53896	53903	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009749	TAGT	2	8	61152	61159	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009749	TAAG	2	8	62025	62032	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009749	TTCT	2	8	62044	62051	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009749	ATTT	2	8	63567	63574	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009749	TTTA	2	8	64297	64304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009749	ACTG	2	8	64673	64680	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009749	TTGG	2	8	64861	64868	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009749	ATAA	3	12	65019	65030	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009749	AGAA	2	8	65248	65255	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009749	TTTG	2	8	65636	65643	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009749	ATTT	2	8	65783	65790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009749	TAAA	2	8	67481	67488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009749	TTAC	2	8	75354	75361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009749	AAAT	2	8	75637	75644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009749	TTTA	2	8	75665	75672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009749	TCTT	2	8	75825	75832	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009749	AATA	2	8	76335	76342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009749	GTAT	2	8	76366	76373	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009749	TAGT	2	8	77559	77566	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009749	TTTG	2	8	79104	79111	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009749	TTGG	2	8	79485	79492	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009749	TAAT	2	8	79839	79846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009749	TCAT	2	8	83890	83897	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009749	TATG	2	8	92006	92013	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009749	GTTT	2	8	92961	92968	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009749	ATTA	2	8	99380	99387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009749	TTGG	2	8	99611	99618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009749	TTTA	2	8	99705	99712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009749	TTGG	2	8	99788	99795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009749	AGCA	2	8	99924	99931	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009749	TGAA	2	8	101894	101901	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009749	GTCA	2	8	102042	102049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009749	GCTT	2	8	115701	115708	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009749	ATAA	2	8	116216	116223	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009749	TATT	2	8	116289	116296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009749	TTTA	2	8	116696	116703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009749	GCTA	2	8	116735	116742	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009749	ACTA	2	8	116831	116838	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009749	CTTA	2	8	117320	117327	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009749	TAAA	2	8	117370	117377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009749	GATG	2	8	124617	124624	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009749	AGAT	2	8	125411	125418	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009749	TTTA	2	8	126201	126208	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009749	ACTC	2	8	126397	126404	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009749	GCGA	2	8	126490	126497	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009749	AAAG	2	8	127332	127339	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009749	TAGG	2	8	127680	127687	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009749	GTAG	2	8	127718	127725	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009749	GTAG	2	8	127870	127877	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009749	GAAC	2	8	128909	128916	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_009749	ATCT	2	8	129471	129478	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009749	TTGA	2	8	129864	129871	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009749	TTTA	2	8	129907	129914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009749	AGAA	2	8	129920	129927	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009749	TGGA	2	8	131624	131631	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009749	CTAG	2	8	132216	132223	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009749	CTTG	2	8	132282	132289	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009749	AATT	2	8	136588	136595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009749	GATA	2	8	136646	136653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009749	TCTT	2	8	136761	136768	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009749	ATTA	2	8	137190	137197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009749	ATAA	2	8	137224	137231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009749	AAAG	2	8	139667	139674	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009749	AATA	2	8	142503	142510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009749	TAAT	2	8	143928	143935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009749	TAAA	2	8	145905	145912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009749	AAAC	2	8	145986	145993	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009749	TATT	2	8	154377	154384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009749	TTAT	2	8	160360	160367	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009749	TTTG	2	8	160369	160376	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009749	CTAA	2	8	162142	162149	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009749	TATT	2	8	166088	166095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009749	CATA	2	8	166396	166403	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009749	CTTG	2	8	166549	166556	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009749	TACT	2	8	169213	169220	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_009749	AACA	2	8	169242	169249	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009749	TTAA	2	8	169265	169272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009749	TGAT	2	8	177399	177406	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009749	TAAA	2	8	177939	177946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009749	AGAT	2	8	186041	186048	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009749	TGAT	2	8	186919	186926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009749	ATTT	2	8	189986	189993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009749	ATTA	2	8	190122	190129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009749	ATTT	2	8	190344	190351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009749	TAAT	2	8	191841	191848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009749	TTAG	2	8	192000	192007	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009749	TAGA	2	8	197079	197086	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009749	AGTT	2	8	197668	197675	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009749	ATAC	2	8	197697	197704	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009749	ATTA	2	8	198075	198082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009749	CTAA	2	8	213403	213410	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009749	TTTA	2	8	213457	213464	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009749	GAAA	2	8	217825	217832	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009749	GCTG	2	8	219376	219383	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009749	TCTT	2	8	220401	220408	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_009749	AATA	2	8	220911	220918	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009749	GTAT	2	8	220942	220949	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009749	GTTG	2	8	221284	221291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009749	GGTT	2	8	221305	221312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_009749	TAAT	2	8	221666	221673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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