MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica FTNF002-00 chromosome

Total Repeats: 21809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009749	CAA	2	6	176	181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169656467
2	NC_009749	ATT	2	6	208	213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169656467
3	NC_009749	TAA	2	6	222	227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169656467
4	NC_009749	CAA	2	6	293	298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169656467
5	NC_009749	AGA	2	6	321	326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169656467
6	NC_009749	AGT	2	6	333	338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656467
7	NC_009749	AAG	2	6	358	363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169656467
8	NC_009749	TCA	2	6	385	390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169656467
9	NC_009749	AGA	2	6	435	440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169656467
10	NC_009749	TGT	2	6	495	500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169656467
11	NC_009749	AGC	2	6	525	530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169656467
12	NC_009749	TGG	2	6	585	590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169656467
13	NC_009749	ATT	2	6	664	669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169656467
14	NC_009749	TTA	2	6	689	694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169656467
15	NC_009749	GAA	2	6	907	912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169656467
16	NC_009749	CAG	2	6	1034	1039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169656467
17	NC_009749	TAC	2	6	1104	1109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169656467
18	NC_009749	CTA	2	6	1133	1138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169656467
19	NC_009749	ATA	2	6	1202	1207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169656467
20	NC_009749	GTT	2	6	1216	1221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169656467
21	NC_009749	AAG	2	6	1266	1271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169656467
22	NC_009749	TGG	2	6	1359	1364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169656467
23	NC_009749	GAT	2	6	1438	1443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656467
24	NC_009749	TAT	2	6	1598	1603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156501372
25	NC_009749	ATA	3	9	1625	1633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501372
26	NC_009749	TAA	2	6	1812	1817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501372
27	NC_009749	CAA	2	6	1906	1911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156501372
28	NC_009749	TCA	2	6	1917	1922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156501372
29	NC_009749	TAT	2	6	1923	1928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156501372
30	NC_009749	ATG	2	6	1955	1960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501372
31	NC_009749	CTA	2	6	2008	2013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156501372
32	NC_009749	AGA	2	6	2148	2153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156501372
33	NC_009749	ATA	2	6	2270	2275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501372
34	NC_009749	ATT	2	6	2316	2321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156501372
35	NC_009749	TAA	2	6	2400	2405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501372
36	NC_009749	GAA	2	6	2515	2520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156501372
37	NC_009749	ATA	2	6	2579	2584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501372
38	NC_009749	ATT	2	6	2593	2598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156501372
39	NC_009749	TAA	2	6	2618	2623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501371
40	NC_009749	AGT	3	9	2733	2741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501371
41	NC_009749	TAA	2	6	2745	2750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501371
42	NC_009749	CAC	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156501371
43	NC_009749	TGA	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501371
44	NC_009749	ATA	2	6	2935	2940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501371
45	NC_009749	ACC	2	6	3003	3008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156501371
46	NC_009749	GAA	2	6	3040	3045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156501371
47	NC_009749	TAT	2	6	3121	3126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169656468
48	NC_009749	ATA	2	6	3205	3210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169656468
49	NC_009749	TAG	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656468
50	NC_009749	ATG	2	6	3301	3306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656468
51	NC_009749	CAA	2	6	3409	3414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169656468
52	NC_009749	CTT	3	9	3417	3425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169656468
53	NC_009749	CTT	2	6	3659	3664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169656468
54	NC_009749	CTT	2	6	3684	3689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169656468
55	NC_009749	GAT	2	6	3714	3719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656468
56	NC_009749	AAC	2	6	3832	3837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169656468
57	NC_009749	CTT	2	6	3888	3893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169656468
58	NC_009749	ATG	2	6	3933	3938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656468
59	NC_009749	AGT	2	6	6636	6641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501378
60	NC_009749	TTG	2	6	6803	6808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156501378
61	NC_009749	TAA	2	6	7004	7009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169656469
62	NC_009749	TAA	2	6	7085	7090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169656469
63	NC_009749	TGA	2	6	7110	7115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656469
64	NC_009749	TGA	2	6	7152	7157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656469
65	NC_009749	TTG	2	6	7190	7195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169656469
66	NC_009749	AGG	2	6	7209	7214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169656469
67	NC_009749	TGA	2	6	7230	7235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656469
68	NC_009749	TTA	2	6	7323	7328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169656469
69	NC_009749	GCT	2	6	7333	7338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169656469
70	NC_009749	TCA	2	6	7545	7550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169656469
71	NC_009749	ACA	2	6	7612	7617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169656469
72	NC_009749	TAA	2	6	7710	7715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169656469
73	NC_009749	TTG	2	6	7724	7729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169656469
74	NC_009749	CAG	2	6	7757	7762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169656469
75	NC_009749	TAT	2	6	7789	7794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169656469
76	NC_009749	TAT	2	6	7880	7885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156501380
77	NC_009749	CAA	2	6	7898	7903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156501380
78	NC_009749	GAA	2	6	7909	7914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156501380
79	NC_009749	TGG	2	6	7952	7957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156501380
80	NC_009749	TGG	2	6	7988	7993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156501380
81	NC_009749	TGA	2	6	8060	8065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501380
82	NC_009749	GAT	2	6	8151	8156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501380
83	NC_009749	GAT	2	6	8166	8171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501380
84	NC_009749	CAG	2	6	8200	8205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156501380
85	NC_009749	CAA	2	6	8229	8234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156501380
86	NC_009749	CTG	2	6	8389	8394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156501380
87	NC_009749	AAT	2	6	8455	8460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501380
88	NC_009749	CTA	2	6	8655	8660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156501381
89	NC_009749	ATT	2	6	8802	8807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156501381
90	NC_009749	ATG	2	6	8827	8832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501381
91	NC_009749	AAC	2	6	8837	8842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156501381
92	NC_009749	CAA	2	6	8916	8921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156501381
93	NC_009749	AAG	2	6	8929	8934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156501381
94	NC_009749	AGC	2	6	8969	8974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156501381
95	NC_009749	CTA	2	6	9180	9185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156501382
96	NC_009749	AGA	2	6	9193	9198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156501382
97	NC_009749	ATG	2	6	9243	9248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501382
98	NC_009749	AAG	2	6	9309	9314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156501382
99	NC_009749	GTG	2	6	9399	9404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156501382
100	NC_009749	CAG	2	6	9471	9476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156501382
101	NC_009749	AAG	2	6	9600	9605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156501383
102	NC_009749	TAT	2	6	9637	9642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156501383
103	NC_009749	AGG	2	6	9667	9672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156501383
104	NC_009749	ATT	2	6	9689	9694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156501383
105	NC_009749	ATC	2	6	9712	9717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156501383
106	NC_009749	ACA	2	6	9725	9730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156501383
107	NC_009749	GCA	2	6	9776	9781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156501383
108	NC_009749	TTG	2	6	9783	9788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156501383
109	NC_009749	GGA	2	6	9914	9919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156501383
110	NC_009749	GTA	2	6	9929	9934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501383
111	NC_009749	TGC	2	6	9946	9951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156501383
112	NC_009749	TGG	2	6	10138	10143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156501383
113	NC_009749	GGT	2	6	10190	10195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156501383
114	NC_009749	ATT	2	6	10355	10360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156501383
115	NC_009749	CTG	2	6	10446	10451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156501383
116	NC_009749	TGA	2	6	10456	10461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501383
117	NC_009749	TAA	2	6	10507	10512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501383
118	NC_009749	AAG	2	6	10533	10538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156501383
119	NC_009749	CAG	2	6	10566	10571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156501383
120	NC_009749	TCT	2	6	10607	10612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156501384
121	NC_009749	ATT	2	6	10633	10638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156501384
122	NC_009749	AAC	2	6	10645	10650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156501384
123	NC_009749	ATA	2	6	10675	10680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501384
124	NC_009749	TGA	2	6	10739	10744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501384
125	NC_009749	TAT	2	6	10802	10807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156501384
126	NC_009749	CAG	2	6	10813	10818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156501384
127	NC_009749	TGA	2	6	11000	11005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501384
128	NC_009749	ATG	2	6	11318	11323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501385
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130	NC_009749	CTG	2	6	11378	11383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156501385
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