MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 6354

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009727	CAAA	2	8	247	254	75 %	0 %	0 %	25 %	154706441
2	NC_009727	CCAA	2	8	401	408	50 %	0 %	0 %	50 %	154706441
3	NC_009727	TTTA	2	8	596	603	25 %	75 %	0 %	0 %	154706441
4	NC_009727	GATC	2	8	821	828	25 %	25 %	25 %	25 %	154706441
5	NC_009727	TCAA	2	8	1144	1151	50 %	25 %	0 %	25 %	154706441
6	NC_009727	TTGC	2	8	1430	1437	0 %	50 %	25 %	25 %	154706441
7	NC_009727	CAAA	2	8	2194	2201	75 %	0 %	0 %	25 %	154706526
8	NC_009727	AATT	2	8	2348	2355	50 %	50 %	0 %	0 %	154706526
9	NC_009727	ATCG	2	8	2416	2423	25 %	25 %	25 %	25 %	154706526
10	NC_009727	AATC	2	8	2877	2884	50 %	25 %	0 %	25 %	154707128
11	NC_009727	CGAT	2	8	3028	3035	25 %	25 %	25 %	25 %	154707128
12	NC_009727	CCTT	2	8	3188	3195	0 %	50 %	0 %	50 %	154707128
13	NC_009727	GTGG	2	8	3420	3427	0 %	25 %	75 %	0 %	154707128
14	NC_009727	TTAC	2	8	3585	3592	25 %	50 %	0 %	25 %	154707128
15	NC_009727	ATTT	2	8	3647	3654	25 %	75 %	0 %	0 %	154707128
16	NC_009727	TGAT	2	8	3702	3709	25 %	50 %	25 %	0 %	154707128
17	NC_009727	TAGA	2	8	3919	3926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009727	GCTT	2	8	4715	4722	0 %	50 %	25 %	25 %	209363643
19	NC_009727	CCAT	2	8	4840	4847	25 %	25 %	0 %	50 %	209363643
20	NC_009727	CACT	2	8	4973	4980	25 %	25 %	0 %	50 %	209363643
21	NC_009727	CTTG	2	8	5216	5223	0 %	50 %	25 %	25 %	209363643
22	NC_009727	TGAG	2	8	5995	6002	25 %	25 %	50 %	0 %	209363643
23	NC_009727	ACCC	2	8	6711	6718	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_009727	GTAT	2	8	6891	6898	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009727	AGCG	2	8	7278	7285	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009727	TTGT	2	8	7326	7333	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009727	GGGT	2	8	7439	7446	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009727	GAAT	2	8	7705	7712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009727	CTTT	2	8	8023	8030	0 %	75 %	0 %	25 %	154707433
30	NC_009727	GGGT	2	8	8057	8064	0 %	25 %	75 %	0 %	154707433
31	NC_009727	TAGC	2	8	8151	8158	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009727	ACAT	2	8	8437	8444	50 %	25 %	0 %	25 %	154706378
33	NC_009727	ATTC	2	8	9151	9158	25 %	50 %	0 %	25 %	154706378
34	NC_009727	CTTG	2	8	9746	9753	0 %	50 %	25 %	25 %	154706378
35	NC_009727	CTCG	2	8	9785	9792	0 %	25 %	25 %	50 %	154706378
36	NC_009727	TCAA	2	8	10150	10157	50 %	25 %	0 %	25 %	154705767
37	NC_009727	TACC	2	8	10696	10703	25 %	25 %	0 %	50 %	154705767
38	NC_009727	AATT	2	8	10725	10732	50 %	50 %	0 %	0 %	154705767
39	NC_009727	TATT	2	8	11558	11565	25 %	75 %	0 %	0 %	154705767
40	NC_009727	AAAT	2	8	11972	11979	75 %	25 %	0 %	0 %	154705767
41	NC_009727	GGGC	2	8	12810	12817	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009727	TACA	2	8	12870	12877	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009727	ATTC	2	8	13118	13125	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009727	TCTA	2	8	13331	13338	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009727	TTCT	2	8	13649	13656	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009727	TCAA	2	8	14072	14079	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009727	AATT	2	8	14334	14341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009727	TTCG	2	8	14536	14543	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009727	GAAA	2	8	14967	14974	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009727	CATT	2	8	15124	15131	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009727	CACG	2	8	15766	15773	25 %	0 %	25 %	50 %	154706946
52	NC_009727	TTTA	2	8	16151	16158	25 %	75 %	0 %	0 %	154706946
53	NC_009727	TGCG	2	8	16438	16445	0 %	25 %	50 %	25 %	154706946
54	NC_009727	TTGG	2	8	16480	16487	0 %	50 %	50 %	0 %	154706946
55	NC_009727	AATT	2	8	16818	16825	50 %	50 %	0 %	0 %	154706946
56	NC_009727	TTGA	2	8	17117	17124	25 %	50 %	25 %	0 %	154706946
57	NC_009727	CCAC	2	8	17237	17244	25 %	0 %	0 %	75 %	154706946
58	NC_009727	AACT	2	8	17990	17997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009727	ATTG	2	8	18114	18121	25 %	50 %	25 %	0 %	209363645
60	NC_009727	AGCA	2	8	18188	18195	50 %	0 %	25 %	25 %	209363645
61	NC_009727	CGGT	2	8	18272	18279	0 %	25 %	50 %	25 %	209363645
62	NC_009727	ATTG	2	8	18389	18396	25 %	50 %	25 %	0 %	154705750
63	NC_009727	TCAA	2	8	19322	19329	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009727	TATT	2	8	19375	19382	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009727	TTTA	2	8	19921	19928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009727	CAAC	2	8	20316	20323	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009727	TTAT	2	8	20344	20351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009727	AATA	2	8	20652	20659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009727	ATAA	2	8	20865	20872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009727	GTTT	2	8	21097	21104	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009727	TCTT	2	8	21225	21232	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009727	CTTT	2	8	21259	21266	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009727	CTGA	2	8	21270	21277	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009727	ACCC	2	8	21443	21450	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
75	NC_009727	ATAA	2	8	21547	21554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009727	TCCA	2	8	21778	21785	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009727	GCTG	2	8	22132	22139	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009727	AAAC	2	8	22242	22249	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009727	AATA	3	12	23178	23189	75 %	25 %	0 %	0 %	209363646
80	NC_009727	TAAA	2	8	23778	23785	75 %	25 %	0 %	0 %	154707059
81	NC_009727	AAAT	2	8	23878	23885	75 %	25 %	0 %	0 %	154707059
82	NC_009727	AATT	2	8	23969	23976	50 %	50 %	0 %	0 %	154707059
83	NC_009727	TTAA	2	8	24079	24086	50 %	50 %	0 %	0 %	154707059
84	NC_009727	AATT	2	8	25347	25354	50 %	50 %	0 %	0 %	154707059
85	NC_009727	GTCA	2	8	25683	25690	25 %	25 %	25 %	25 %	154707059
86	NC_009727	TGGC	2	8	26049	26056	0 %	25 %	50 %	25 %	154707059
87	NC_009727	ATCA	2	8	26115	26122	50 %	25 %	0 %	25 %	154707059
88	NC_009727	GGTT	2	8	26291	26298	0 %	50 %	50 %	0 %	154707145
89	NC_009727	CGTT	2	8	26385	26392	0 %	50 %	25 %	25 %	154707145
90	NC_009727	CTTA	2	8	26498	26505	25 %	50 %	0 %	25 %	154707145
91	NC_009727	AAGC	2	8	26864	26871	50 %	0 %	25 %	25 %	154707145
92	NC_009727	CCTT	2	8	27312	27319	0 %	50 %	0 %	50 %	154707145
93	NC_009727	ATTC	2	8	27532	27539	25 %	50 %	0 %	25 %	154707145
94	NC_009727	CTTA	2	8	27606	27613	25 %	50 %	0 %	25 %	154707145
95	NC_009727	GCTC	2	8	27724	27731	0 %	25 %	25 %	50 %	154707145
96	NC_009727	TCAC	2	8	27786	27793	25 %	25 %	0 %	50 %	154707145
97	NC_009727	ATTA	2	8	28044	28051	50 %	50 %	0 %	0 %	209363647
98	NC_009727	CTTC	2	8	28307	28314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009727	TTAT	2	8	29087	29094	25 %	75 %	0 %	0 %	154705832
100	NC_009727	TACA	2	8	29119	29126	50 %	25 %	0 %	25 %	154705832
101	NC_009727	TTTA	2	8	29250	29257	25 %	75 %	0 %	0 %	154705832
102	NC_009727	ATTT	2	8	30227	30234	25 %	75 %	0 %	0 %	154705832
103	NC_009727	ACAT	2	8	30480	30487	50 %	25 %	0 %	25 %	154707346
104	NC_009727	AGAT	2	8	30649	30656	50 %	25 %	25 %	0 %	154707346
105	NC_009727	GTGA	2	8	30770	30777	25 %	25 %	50 %	0 %	154707346
106	NC_009727	AATG	2	8	31050	31057	50 %	25 %	25 %	0 %	154707463
107	NC_009727	TTAA	2	8	31197	31204	50 %	50 %	0 %	0 %	154707463
108	NC_009727	GAAT	2	8	31524	31531	50 %	25 %	25 %	0 %	209363648
109	NC_009727	TTAA	2	8	31807	31814	50 %	50 %	0 %	0 %	209363648
110	NC_009727	GTGA	2	8	32167	32174	25 %	25 %	50 %	0 %	154707564
111	NC_009727	GTTT	2	8	32689	32696	0 %	75 %	25 %	0 %	154706970
112	NC_009727	AATT	2	8	32763	32770	50 %	50 %	0 %	0 %	154706970
113	NC_009727	CTGT	2	8	32866	32873	0 %	50 %	25 %	25 %	154706970
114	NC_009727	TTGG	2	8	33049	33056	0 %	50 %	50 %	0 %	154706970
115	NC_009727	TTGA	2	8	34114	34121	25 %	50 %	25 %	0 %	154706089
116	NC_009727	AATT	2	8	34189	34196	50 %	50 %	0 %	0 %	154706089
117	NC_009727	AAAT	2	8	34650	34657	75 %	25 %	0 %	0 %	209363650
118	NC_009727	CTCA	2	8	34720	34727	25 %	25 %	0 %	50 %	154707024
119	NC_009727	TACT	2	8	34899	34906	25 %	50 %	0 %	25 %	154707024
120	NC_009727	CCAC	2	8	34909	34916	25 %	0 %	0 %	75 %	154707024
121	NC_009727	ACAA	2	8	35127	35134	75 %	0 %	0 %	25 %	154706190
122	NC_009727	AAGC	2	8	35767	35774	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009727	TTAA	2	8	35930	35937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009727	CTTC	2	8	36234	36241	0 %	50 %	0 %	50 %	154707121
125	NC_009727	TTTG	2	8	36302	36309	0 %	75 %	25 %	0 %	154707121
126	NC_009727	ATGT	2	8	36310	36317	25 %	50 %	25 %	0 %	154707121
127	NC_009727	CGAT	2	8	37473	37480	25 %	25 %	25 %	25 %	154706652
128	NC_009727	GTTT	2	8	37655	37662	0 %	75 %	25 %	0 %	154706652
129	NC_009727	CATC	2	8	37806	37813	25 %	25 %	0 %	50 %	154706652
130	NC_009727	CTAT	2	8	38005	38012	25 %	50 %	0 %	25 %	154707096
131	NC_009727	TGAA	2	8	39069	39076	50 %	25 %	25 %	0 %	154706910
132	NC_009727	GAAT	2	8	39565	39572	50 %	25 %	25 %	0 %	154706910
133	NC_009727	AAAC	2	8	39808	39815	75 %	0 %	0 %	25 %	154706910
134	NC_009727	TTGA	2	8	40100	40107	25 %	50 %	25 %	0 %	154706192
135	NC_009727	GTTT	2	8	41972	41979	0 %	75 %	25 %	0 %	209363651
136	NC_009727	AGCA	2	8	42224	42231	50 %	0 %	25 %	25 %	209363651
137	NC_009727	AGGA	2	8	42530	42537	50 %	0 %	50 %	0 %	209363651
138	NC_009727	TAAA	2	8	42556	42563	75 %	25 %	0 %	0 %	209363651
139	NC_009727	GGCG	2	8	43073	43080	0 %	0 %	75 %	25 %	154706317
140	NC_009727	ATTT	2	8	43643	43650	25 %	75 %	0 %	0 %	154705781
141	NC_009727	TGAG	2	8	44020	44027	25 %	25 %	50 %	0 %	154705781
142	NC_009727	CGAT	2	8	44224	44231	25 %	25 %	25 %	25 %	154705781
143	NC_009727	CTCA	2	8	44544	44551	25 %	25 %	0 %	50 %	154705781
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145	NC_009727	TTGA	2	8	45129	45136	25 %	50 %	25 %	0 %	154705781
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