MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 1163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009727	TAGA	2	8	3919	3926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009727	ACCC	2	8	6711	6718	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_009727	GTAT	2	8	6891	6898	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009727	AGCG	2	8	7278	7285	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009727	TTGT	2	8	7326	7333	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009727	GGGT	2	8	7439	7446	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009727	GAAT	2	8	7705	7712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009727	TAGC	2	8	8151	8158	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009727	GGGC	2	8	12810	12817	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009727	TACA	2	8	12870	12877	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009727	ATTC	2	8	13118	13125	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009727	TCTA	2	8	13331	13338	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009727	TTCT	2	8	13649	13656	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009727	TCAA	2	8	14072	14079	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009727	AATT	2	8	14334	14341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009727	TTCG	2	8	14536	14543	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009727	GAAA	2	8	14967	14974	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009727	CATT	2	8	15124	15131	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009727	AACT	2	8	17990	17997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009727	TCAA	2	8	19322	19329	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009727	TATT	2	8	19375	19382	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009727	TTTA	2	8	19921	19928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009727	CAAC	2	8	20316	20323	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009727	TTAT	2	8	20344	20351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009727	AATA	2	8	20652	20659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009727	ATAA	2	8	20865	20872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009727	GTTT	2	8	21097	21104	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009727	TCTT	2	8	21225	21232	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009727	CTTT	2	8	21259	21266	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009727	CTGA	2	8	21270	21277	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009727	ACCC	2	8	21443	21450	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_009727	ATAA	2	8	21547	21554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009727	TCCA	2	8	21778	21785	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009727	GCTG	2	8	22132	22139	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009727	AAAC	2	8	22242	22249	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009727	CTTC	2	8	28307	28314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009727	AAGC	2	8	35767	35774	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009727	TTAA	2	8	35930	35937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009727	TAAA	2	8	47260	47267	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009727	TAAA	2	8	47276	47283	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009727	TTAT	2	8	47287	47294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009727	TTTA	2	8	47305	47312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009727	TTAA	2	8	47316	47323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009727	AAAT	2	8	47365	47372	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009727	GCAA	2	8	51079	51086	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009727	AATG	2	8	51266	51273	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009727	CCGC	2	8	51426	51433	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_009727	TAAA	2	8	57613	57620	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009727	TTTG	2	8	60423	60430	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009727	AAAT	3	12	60695	60706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009727	AGGT	2	8	61148	61155	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009727	TGTC	2	8	62530	62537	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009727	TAAT	2	8	71306	71313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009727	TATT	2	8	71930	71937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009727	AGCA	2	8	75595	75602	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009727	AGTA	2	8	76557	76564	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009727	CAAG	2	8	80391	80398	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009727	TCTT	2	8	80515	80522	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009727	ACGA	2	8	80771	80778	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009727	TCTT	2	8	82670	82677	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009727	AAAT	2	8	84470	84477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009727	TAAT	2	8	85157	85164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009727	ACCC	2	8	85181	85188	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_009727	ATTA	2	8	92056	92063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009727	TTAA	2	8	92132	92139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009727	AATT	2	8	92171	92178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009727	GATA	2	8	95434	95441	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009727	CAAA	2	8	96434	96441	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009727	TTGG	2	8	96497	96504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009727	AAAT	2	8	96535	96542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009727	CTAA	2	8	96614	96621	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009727	CTTC	2	8	101812	101819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009727	CAAG	2	8	101959	101966	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009727	CAAT	2	8	101968	101975	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009727	AAAC	2	8	108414	108421	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009727	TTTG	2	8	112089	112096	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009727	CTAA	2	8	112205	112212	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009727	CTTA	2	8	113007	113014	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009727	ATTA	2	8	113088	113095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009727	TTAA	2	8	113288	113295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009727	AGGC	2	8	113846	113853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009727	TAGC	2	8	117918	117925	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009727	TTTC	2	8	127191	127198	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009727	ATTG	2	8	127930	127937	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009727	AAGA	2	8	130681	130688	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009727	GAGC	2	8	132668	132675	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009727	TAAA	2	8	133464	133471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009727	CCGC	2	8	134798	134805	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
89	NC_009727	ATAA	2	8	135379	135386	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009727	ACCG	3	12	135510	135521	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009727	GGAC	2	8	136335	136342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009727	GATA	2	8	136483	136490	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009727	CCGC	2	8	136758	136765	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
94	NC_009727	CTTT	2	8	139147	139154	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009727	ACCC	2	8	146269	146276	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
96	NC_009727	GTAT	2	8	146449	146456	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009727	AGCG	2	8	146836	146843	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009727	TTGT	2	8	146884	146891	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009727	GGGT	2	8	146997	147004	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009727	GAAT	2	8	147263	147270	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009727	TTTA	2	8	147853	147860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009727	CTTC	2	8	148492	148499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009727	ATCC	2	8	148535	148542	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009727	TTCG	2	8	148873	148880	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009727	AATA	2	8	148892	148899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009727	GCCT	2	8	148986	148993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009727	TGTC	2	8	151100	151107	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009727	GTTT	2	8	153480	153487	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009727	AATA	2	8	155685	155692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009727	TTGA	2	8	160231	160238	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009727	CACT	2	8	168372	168379	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009727	GGGT	2	8	170229	170236	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009727	TGAT	2	8	170320	170327	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009727	AATT	2	8	170600	170607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009727	TTCC	2	8	171625	171632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009727	TCCA	2	8	171905	171912	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009727	AAGG	2	8	172539	172546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009727	ACTA	2	8	187731	187738	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_009727	TTAA	2	8	187743	187750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009727	TAAA	2	8	187918	187925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009727	ACCC	2	8	193013	193020	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
122	NC_009727	TTTA	2	8	196073	196080	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009727	ACCC	2	8	203095	203102	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_009727	AAAG	2	8	203129	203136	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009727	ATAC	2	8	205353	205360	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009727	GGGT	2	8	205534	205541	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009727	GCTA	2	8	205597	205604	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009727	GTTA	2	8	208749	208756	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009727	CGAT	2	8	221648	221655	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009727	TGAC	2	8	221658	221665	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009727	GACT	2	8	233468	233475	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009727	AGCG	2	8	233544	233551	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009727	AAAG	2	8	233604	233611	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009727	CCCG	2	8	233956	233963	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
135	NC_009727	TAAA	2	8	235528	235535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009727	GTTT	2	8	241921	241928	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009727	TGCA	2	8	256531	256538	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_009727	TCTT	2	8	260537	260544	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009727	TATT	2	8	261406	261413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009727	TCCT	2	8	261834	261841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_009727	ATTT	2	8	262035	262042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009727	ATTT	2	8	262378	262385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009727	AGCA	2	8	262770	262777	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_009727	TGCT	2	8	264797	264804	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009727	AAGA	2	8	265143	265150	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009727	TTCC	2	8	265486	265493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_009727	ATTT	2	8	265685	265692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009727	GTTT	2	8	266338	266345	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009727	GCTG	2	8	266639	266646	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_009727	AAAG	2	8	266763	266770	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009727	GCGG	2	8	266853	266860	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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