MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 23350

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009727	CCG	2	6	197	202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154706441
2	NC_009727	CAA	2	6	203	208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154706441
3	NC_009727	TAC	2	6	261	266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706441
4	NC_009727	CCT	2	6	356	361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154706441
5	NC_009727	AGC	2	6	436	441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154706441
6	NC_009727	TCG	2	6	513	518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706441
7	NC_009727	GCC	3	9	545	553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154706441
8	NC_009727	TGG	2	6	604	609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154706441
9	NC_009727	TTG	2	6	708	713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154706441
10	NC_009727	GTT	2	6	784	789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154706441
11	NC_009727	TTC	2	6	839	844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706441
12	NC_009727	AGA	2	6	925	930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154706441
13	NC_009727	CTT	2	6	1057	1062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706441
14	NC_009727	CGT	2	6	1440	1445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706441
15	NC_009727	AGA	2	6	1456	1461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154706441
16	NC_009727	ATT	2	6	1665	1670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154706526
17	NC_009727	TCT	2	6	1834	1839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706526
18	NC_009727	CCG	2	6	1991	1996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154706526
19	NC_009727	TAT	2	6	2098	2103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154706526
20	NC_009727	ATC	2	6	2224	2229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706526
21	NC_009727	ATT	2	6	2242	2247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154706526
22	NC_009727	GAG	2	6	2266	2271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154706526
23	NC_009727	AAT	2	6	2302	2307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706526
24	NC_009727	CTA	2	6	2321	2326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706526
25	NC_009727	GTG	2	6	2396	2401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154706526
26	NC_009727	ATT	2	6	2508	2513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154706526
27	NC_009727	CCA	2	6	2525	2530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154706526
28	NC_009727	AAG	2	6	2540	2545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154706526
29	NC_009727	GAA	3	9	2551	2559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154706526
30	NC_009727	AGC	2	6	2677	2682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154706526
31	NC_009727	ATA	2	6	2943	2948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154707128
32	NC_009727	TTA	2	6	2967	2972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154707128
33	NC_009727	TCA	2	6	3319	3324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154707128
34	NC_009727	CAA	2	6	3572	3577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154707128
35	NC_009727	CGA	2	6	3658	3663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154707128
36	NC_009727	CCG	2	6	3669	3674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154707128
37	NC_009727	CGC	2	6	3814	3819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154707128
38	NC_009727	CAC	2	6	4141	4146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209363643
39	NC_009727	TTC	2	6	4157	4162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209363643
40	NC_009727	CGA	2	6	4229	4234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209363643
41	NC_009727	CAC	2	6	4248	4253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209363643
42	NC_009727	CGA	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209363643
43	NC_009727	AGA	2	6	4391	4396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363643
44	NC_009727	GCC	2	6	4407	4412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209363643
45	NC_009727	TTA	2	6	4417	4422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209363643
46	NC_009727	CGG	2	6	4439	4444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209363643
47	NC_009727	CGG	2	6	4475	4480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209363643
48	NC_009727	GTG	2	6	4503	4508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209363643
49	NC_009727	AGA	2	6	4520	4525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363643
50	NC_009727	AAT	2	6	4947	4952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209363643
51	NC_009727	CGG	2	6	4967	4972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209363643
52	NC_009727	AGT	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209363643
53	NC_009727	TGC	2	6	5267	5272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209363643
54	NC_009727	ACG	2	6	5312	5317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209363643
55	NC_009727	TGG	2	6	5401	5406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209363643
56	NC_009727	TCT	2	6	5523	5528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209363643
57	NC_009727	AGA	2	6	5576	5581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363643
58	NC_009727	ATC	2	6	5605	5610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209363643
59	NC_009727	TCT	2	6	5674	5679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209363643
60	NC_009727	GTT	2	6	5798	5803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209363643
61	NC_009727	GCG	2	6	5886	5891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209363643
62	NC_009727	GCT	2	6	5960	5965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209363643
63	NC_009727	GGA	2	6	6035	6040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209363643
64	NC_009727	ATT	2	6	6135	6140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209363643
65	NC_009727	TTG	2	6	6208	6213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209363643
66	NC_009727	TAT	2	6	6424	6429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209363643
67	NC_009727	ACC	2	6	6471	6476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209363643
68	NC_009727	CGC	2	6	6501	6506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209363643
69	NC_009727	CCG	2	6	7803	7808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154707433
70	NC_009727	TGA	2	6	7869	7874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154707433
71	NC_009727	TCA	2	6	7963	7968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154707433
72	NC_009727	TGG	2	6	7978	7983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154707433
73	NC_009727	TCA	2	6	8031	8036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154707433
74	NC_009727	TTG	2	6	8044	8049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154707433
75	NC_009727	ACA	2	6	8050	8055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154707433
76	NC_009727	GAA	2	6	8234	8239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154706378
77	NC_009727	TCT	2	6	8267	8272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706378
78	NC_009727	CTC	2	6	8281	8286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154706378
79	NC_009727	TTC	2	6	8308	8313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706378
80	NC_009727	TAA	2	6	8322	8327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706378
81	NC_009727	TGA	2	6	8356	8361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154706378
82	NC_009727	TAA	2	6	8385	8390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706378
83	NC_009727	ATC	2	6	8413	8418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706378
84	NC_009727	GGA	2	6	8575	8580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154706378
85	NC_009727	AAT	2	6	8592	8597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706378
86	NC_009727	TTC	2	6	8818	8823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706378
87	NC_009727	TCC	2	6	8828	8833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154706378
88	NC_009727	TAT	2	6	8860	8865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154706378
89	NC_009727	TAC	2	6	8943	8948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706378
90	NC_009727	CAA	2	6	9043	9048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154706378
91	NC_009727	GCT	2	6	9125	9130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706378
92	NC_009727	GAA	2	6	9192	9197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154706378
93	NC_009727	GGA	2	6	9227	9232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154706378
94	NC_009727	GCT	2	6	9287	9292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706378
95	NC_009727	GAA	2	6	9351	9356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154706378
96	NC_009727	AGG	2	6	9385	9390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154706378
97	NC_009727	CAA	2	6	9421	9426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154706378
98	NC_009727	TTC	2	6	9538	9543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706378
99	NC_009727	TCT	3	9	9686	9694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706378
100	NC_009727	TCT	2	6	10069	10074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154705767
101	NC_009727	CAA	2	6	10169	10174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154705767
102	NC_009727	ATG	2	6	10284	10289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154705767
103	NC_009727	CTT	2	6	10306	10311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154705767
104	NC_009727	GGA	2	6	10365	10370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154705767
105	NC_009727	AAT	2	6	10382	10387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154705767
106	NC_009727	ATT	2	6	10432	10437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154705767
107	NC_009727	TCT	2	6	10609	10614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154705767
108	NC_009727	ACA	2	6	10737	10742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154705767
109	NC_009727	GCT	2	6	10915	10920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154705767
110	NC_009727	GAA	2	6	10979	10984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154705767
111	NC_009727	GCA	2	6	10988	10993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154705767
112	NC_009727	GGA	2	6	11014	11019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154705767
113	NC_009727	CTG	2	6	11072	11077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154705767
114	NC_009727	GAA	2	6	11138	11143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154705767
115	NC_009727	CTG	2	6	11219	11224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154705767
116	NC_009727	CAA	2	6	11295	11300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154705767
117	NC_009727	CAA	2	6	11343	11348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154705767
118	NC_009727	CTG	2	6	11366	11371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154705767
119	NC_009727	GAA	2	6	11438	11443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154705767
120	NC_009727	TCT	2	6	11480	11485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154705767
121	NC_009727	CTG	2	6	11531	11536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154705767
122	NC_009727	AGC	2	6	11608	11613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154705767
123	NC_009727	GCT	3	9	11689	11697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154705767
124	NC_009727	CGG	2	6	11731	11736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154705767
125	NC_009727	AAT	2	6	11804	11809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154705767
126	NC_009727	TAC	2	6	11841	11846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154705767
127	NC_009727	CTT	3	9	11924	11932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154705767
128	NC_009727	CTC	2	6	12004	12009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154705767
129	NC_009727	CTT	2	6	12010	12015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154705767
130	NC_009727	CTC	2	6	12018	12023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154705767
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