MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 2924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009727	CG	3	6	1300	1305	0 %	0 %	50 %	50 %	154706441
2	NC_009727	CT	3	6	1741	1746	0 %	50 %	0 %	50 %	154706526
3	NC_009727	CA	3	6	2986	2991	50 %	0 %	0 %	50 %	154707128
4	NC_009727	AC	3	6	3492	3497	50 %	0 %	0 %	50 %	154707128
5	NC_009727	CA	3	6	5647	5652	50 %	0 %	0 %	50 %	209363643
6	NC_009727	TA	3	6	5737	5742	50 %	50 %	0 %	0 %	209363643
7	NC_009727	TA	3	6	5946	5951	50 %	50 %	0 %	0 %	209363643
8	NC_009727	TA	3	6	6217	6222	50 %	50 %	0 %	0 %	209363643
9	NC_009727	TG	3	6	6834	6839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009727	TG	3	6	7719	7724	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009727	AC	3	6	7838	7843	50 %	0 %	0 %	50 %	154707433
12	NC_009727	CG	3	6	9566	9571	0 %	0 %	50 %	50 %	154706378
13	NC_009727	GA	3	6	11474	11479	50 %	0 %	50 %	0 %	154705767
14	NC_009727	GC	3	6	14699	14704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009727	CG	3	6	16032	16037	0 %	0 %	50 %	50 %	154706946
16	NC_009727	GC	3	6	16688	16693	0 %	0 %	50 %	50 %	154706946
17	NC_009727	GC	3	6	17156	17161	0 %	0 %	50 %	50 %	154706946
18	NC_009727	CA	3	6	18594	18599	50 %	0 %	0 %	50 %	154705750
19	NC_009727	TA	3	6	19629	19634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009727	AT	3	6	20377	20382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009727	CA	3	6	20608	20613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009727	CT	3	6	20876	20881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009727	GA	3	6	23049	23054	50 %	0 %	50 %	0 %	209363646
24	NC_009727	CG	3	6	23982	23987	0 %	0 %	50 %	50 %	154707059
25	NC_009727	CG	3	6	24045	24050	0 %	0 %	50 %	50 %	154707059
26	NC_009727	CG	3	6	24177	24182	0 %	0 %	50 %	50 %	154707059
27	NC_009727	GC	3	6	25076	25081	0 %	0 %	50 %	50 %	154707059
28	NC_009727	AC	3	6	26202	26207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009727	CG	3	6	26902	26907	0 %	0 %	50 %	50 %	154707145
30	NC_009727	AT	3	6	27902	27907	50 %	50 %	0 %	0 %	209363647
31	NC_009727	AG	3	6	28334	28339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009727	TC	3	6	28543	28548	0 %	50 %	0 %	50 %	154705832
33	NC_009727	AC	3	6	28598	28603	50 %	0 %	0 %	50 %	154705832
34	NC_009727	TA	3	6	29577	29582	50 %	50 %	0 %	0 %	154705832
35	NC_009727	CT	3	6	32022	32027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009727	AG	3	6	32892	32897	50 %	0 %	50 %	0 %	154706970
37	NC_009727	CG	3	6	33142	33147	0 %	0 %	50 %	50 %	154706970
38	NC_009727	AT	3	6	35617	35622	50 %	50 %	0 %	0 %	154705743
39	NC_009727	GC	5	10	38209	38218	0 %	0 %	50 %	50 %	154707096
40	NC_009727	GC	3	6	38308	38313	0 %	0 %	50 %	50 %	154707096
41	NC_009727	CG	3	6	38441	38446	0 %	0 %	50 %	50 %	154707096
42	NC_009727	CG	3	6	40182	40187	0 %	0 %	50 %	50 %	154706192
43	NC_009727	GC	4	8	41908	41915	0 %	0 %	50 %	50 %	209363651
44	NC_009727	AC	3	6	41980	41985	50 %	0 %	0 %	50 %	209363651
45	NC_009727	CG	3	6	42862	42867	0 %	0 %	50 %	50 %	154706317
46	NC_009727	TC	3	6	45419	45424	0 %	50 %	0 %	50 %	154705781
47	NC_009727	AC	3	6	46753	46758	50 %	0 %	0 %	50 %	209363652
48	NC_009727	AT	3	6	47582	47587	50 %	50 %	0 %	0 %	154706010
49	NC_009727	AT	3	6	48231	48236	50 %	50 %	0 %	0 %	154706010
50	NC_009727	TA	3	6	48486	48491	50 %	50 %	0 %	0 %	154706010
51	NC_009727	AT	3	6	48983	48988	50 %	50 %	0 %	0 %	209363653
52	NC_009727	CT	3	6	49471	49476	0 %	50 %	0 %	50 %	209363653
53	NC_009727	GA	3	6	49856	49861	50 %	0 %	50 %	0 %	209363653
54	NC_009727	TC	3	6	50693	50698	0 %	50 %	0 %	50 %	154706619
55	NC_009727	TG	3	6	50835	50840	0 %	50 %	50 %	0 %	154706619
56	NC_009727	AG	3	6	52093	52098	50 %	0 %	50 %	0 %	154707221
57	NC_009727	AT	3	6	52460	52465	50 %	50 %	0 %	0 %	154707221
58	NC_009727	GC	3	6	52920	52925	0 %	0 %	50 %	50 %	209363656
59	NC_009727	GC	3	6	52931	52936	0 %	0 %	50 %	50 %	209363656
60	NC_009727	GC	3	6	53850	53855	0 %	0 %	50 %	50 %	154706090
61	NC_009727	GC	3	6	55236	55241	0 %	0 %	50 %	50 %	209363657
62	NC_009727	AT	3	6	56003	56008	50 %	50 %	0 %	0 %	209363658
63	NC_009727	AG	4	8	56507	56514	50 %	0 %	50 %	0 %	209363658
64	NC_009727	AT	3	6	56611	56616	50 %	50 %	0 %	0 %	209363658
65	NC_009727	TG	3	6	56681	56686	0 %	50 %	50 %	0 %	209363658
66	NC_009727	TG	3	6	56795	56800	0 %	50 %	50 %	0 %	209363658
67	NC_009727	TC	3	6	57678	57683	0 %	50 %	0 %	50 %	154706735
68	NC_009727	GC	3	6	57872	57877	0 %	0 %	50 %	50 %	154706735
69	NC_009727	GC	4	8	58166	58173	0 %	0 %	50 %	50 %	154706735
70	NC_009727	CA	3	6	58502	58507	50 %	0 %	0 %	50 %	154706735
71	NC_009727	TC	3	6	58693	58698	0 %	50 %	0 %	50 %	154706083
72	NC_009727	TC	3	6	59871	59876	0 %	50 %	0 %	50 %	154706083
73	NC_009727	GC	3	6	60061	60066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009727	CG	3	6	61982	61987	0 %	0 %	50 %	50 %	154706011
75	NC_009727	TC	3	6	63266	63271	0 %	50 %	0 %	50 %	154707003
76	NC_009727	CA	3	6	63370	63375	50 %	0 %	0 %	50 %	154707003
77	NC_009727	CT	3	6	63434	63439	0 %	50 %	0 %	50 %	154707003
78	NC_009727	TC	3	6	63849	63854	0 %	50 %	0 %	50 %	154707003
79	NC_009727	CT	3	6	64497	64502	0 %	50 %	0 %	50 %	154707185
80	NC_009727	TC	3	6	65315	65320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009727	AT	3	6	66110	66115	50 %	50 %	0 %	0 %	209363660
82	NC_009727	AT	3	6	66319	66324	50 %	50 %	0 %	0 %	209363660
83	NC_009727	TC	3	6	66491	66496	0 %	50 %	0 %	50 %	154707208
84	NC_009727	TA	3	6	66526	66531	50 %	50 %	0 %	0 %	154707208
85	NC_009727	TC	3	6	67303	67308	0 %	50 %	0 %	50 %	209363661
86	NC_009727	CG	3	6	70533	70538	0 %	0 %	50 %	50 %	209363662
87	NC_009727	CT	3	6	71468	71473	0 %	50 %	0 %	50 %	209363664
88	NC_009727	CT	3	6	71805	71810	0 %	50 %	0 %	50 %	154706598
89	NC_009727	GC	3	6	75699	75704	0 %	0 %	50 %	50 %	209363668
90	NC_009727	TC	3	6	76231	76236	0 %	50 %	0 %	50 %	209363669
91	NC_009727	GC	3	6	77115	77120	0 %	0 %	50 %	50 %	154707050
92	NC_009727	AG	3	6	80210	80215	50 %	0 %	50 %	0 %	154706078
93	NC_009727	CA	3	6	80563	80568	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009727	AT	3	6	80921	80926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009727	GC	3	6	81075	81080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009727	CG	3	6	81631	81636	0 %	0 %	50 %	50 %	209363671
97	NC_009727	CG	4	8	81724	81731	0 %	0 %	50 %	50 %	209363671
98	NC_009727	CA	3	6	84531	84536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009727	GC	3	6	84649	84654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009727	CG	3	6	84747	84752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009727	GT	3	6	84899	84904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009727	TA	3	6	84976	84981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009727	CA	3	6	85373	85378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009727	AT	3	6	86307	86312	50 %	50 %	0 %	0 %	154707740
105	NC_009727	AT	3	6	88482	88487	50 %	50 %	0 %	0 %	154707212
106	NC_009727	AG	3	6	89164	89169	50 %	0 %	50 %	0 %	154706630
107	NC_009727	AG	3	6	91167	91172	50 %	0 %	50 %	0 %	154707257
108	NC_009727	CG	3	6	92438	92443	0 %	0 %	50 %	50 %	209363673
109	NC_009727	AG	3	6	94651	94656	50 %	0 %	50 %	0 %	209363674
110	NC_009727	GA	3	6	95243	95248	50 %	0 %	50 %	0 %	209363675
111	NC_009727	AG	3	6	95359	95364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009727	CT	3	6	95670	95675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009727	TG	3	6	95903	95908	0 %	50 %	50 %	0 %	154707300
114	NC_009727	TA	3	6	96423	96428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009727	AT	3	6	97178	97183	50 %	50 %	0 %	0 %	154706892
116	NC_009727	CG	3	6	99208	99213	0 %	0 %	50 %	50 %	209363678
117	NC_009727	GC	3	6	100625	100630	0 %	0 %	50 %	50 %	154706140
118	NC_009727	GC	3	6	101464	101469	0 %	0 %	50 %	50 %	154707771
119	NC_009727	CG	3	6	102536	102541	0 %	0 %	50 %	50 %	154706977
120	NC_009727	TA	3	6	103096	103101	50 %	50 %	0 %	0 %	154707531
121	NC_009727	AG	3	6	104730	104735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009727	TA	3	6	104855	104860	50 %	50 %	0 %	0 %	209363680
123	NC_009727	CT	3	6	105205	105210	0 %	50 %	0 %	50 %	209363680
124	NC_009727	CG	3	6	107085	107090	0 %	0 %	50 %	50 %	154705873
125	NC_009727	GC	3	6	108095	108100	0 %	0 %	50 %	50 %	154705930
126	NC_009727	GC	3	6	108503	108508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009727	GC	3	6	108514	108519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009727	AG	3	6	108624	108629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009727	CG	3	6	108907	108912	0 %	0 %	50 %	50 %	154705953
130	NC_009727	GC	3	6	110034	110039	0 %	0 %	50 %	50 %	154705953
131	NC_009727	TG	4	8	111781	111788	0 %	50 %	50 %	0 %	154707089
132	NC_009727	CG	4	8	112508	112515	0 %	0 %	50 %	50 %	209363681
133	NC_009727	GC	3	6	113297	113302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009727	GC	3	6	115158	115163	0 %	0 %	50 %	50 %	154706757
135	NC_009727	AT	3	6	116828	116833	50 %	50 %	0 %	0 %	209363685
136	NC_009727	TC	3	6	117191	117196	0 %	50 %	0 %	50 %	209363685
137	NC_009727	CT	3	6	118175	118180	0 %	50 %	0 %	50 %	154705785
138	NC_009727	CA	3	6	119516	119521	50 %	0 %	0 %	50 %	154707193
139	NC_009727	CG	3	6	120033	120038	0 %	0 %	50 %	50 %	154707193
140	NC_009727	CG	3	6	121130	121135	0 %	0 %	50 %	50 %	154706614
141	NC_009727	GA	4	8	121817	121824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009727	TC	3	6	121927	121932	0 %	50 %	0 %	50 %	209363688
143	NC_009727	GC	3	6	122870	122875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009727	GC	3	6	123304	123309	0 %	0 %	50 %	50 %	154706571
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