MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 plasmid pQpDG

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009726	CAATGG	2	12	937	948	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	209363623
2	NC_009726	GGGGAA	2	12	2274	2285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154688289
3	NC_009726	GCCGCG	2	12	2460	2471	0 %	0 %	50 %	50 %	154688289
4	NC_009726	ATGCTT	2	12	15060	15071	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	209363627
5	NC_009726	GAAGCG	2	12	16770	16781	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	209363628
6	NC_009726	TTGAAA	2	12	16819	16830	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	209363628
7	NC_009726	CATCAA	2	12	22356	22367	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	154688279
8	NC_009726	CCATCA	2	12	31518	31529	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	209363633
9	NC_009726	ATTTAA	2	12	36349	36360	50 %	50 %	0 %	0 %	154688280
10	NC_009726	TCTTCA	2	12	37898	37909	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	209363635
11	NC_009726	TAACGA	2	12	37941	37952	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	209363635
12	NC_009726	GAATTC	2	12	38786	38797	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	154688275
13	NC_009726	TTTCTT	2	12	40111	40122	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	209363636
14	NC_009726	AAAAAT	2	12	40160	40171	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	209363636
15	NC_009726	TGAGTC	2	12	41109	41120	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	154688270
16	NC_009726	TTTAGA	2	12	42861	42872	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	209363638
17	NC_009726	TGGCAT	2	12	43220	43231	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	209363638
18	NC_009726	TATTGC	2	12	51579	51590	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	154688253

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.