MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 plasmid pQpDG

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009726	CAGG	2	8	1219	1226	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009726	ATTG	2	8	1294	1301	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009726	TTTA	2	8	2843	2850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009726	CGAG	2	8	4683	4690	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009726	ATTA	2	8	4786	4793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009726	CCAA	2	8	4852	4859	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009726	TAAC	2	8	5434	5441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009726	TAAA	2	8	8399	8406	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009726	TGAT	2	8	10394	10401	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009726	TCCT	2	8	10766	10773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009726	GGCT	2	8	10819	10826	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009726	TTGA	2	8	10885	10892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009726	TCTT	2	8	11243	11250	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009726	TAAA	2	8	11347	11354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009726	GCTT	2	8	11432	11439	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009726	GCAC	2	8	11808	11815	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009726	TTAT	2	8	12184	12191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009726	TTAC	2	8	14901	14908	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009726	GCAA	2	8	16320	16327	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009726	ACCA	2	8	17801	17808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009726	TTTC	2	8	17940	17947	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009726	TTGG	2	8	18296	18303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009726	CCTG	2	8	18692	18699	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009726	ATTT	2	8	24048	24055	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009726	ACCA	2	8	24993	25000	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009726	TGGG	2	8	25919	25926	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009726	ATGA	2	8	26010	26017	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009726	GCGA	2	8	26266	26273	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009726	CCGT	2	8	26808	26815	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009726	AATA	2	8	27533	27540	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009726	GAAA	2	8	27624	27631	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009726	AGGT	2	8	28128	28135	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009726	GGCG	2	8	28625	28632	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009726	CCAT	2	8	29346	29353	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009726	GAAA	2	8	29500	29507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009726	GGAT	2	8	30356	30363	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009726	TCTA	2	8	30505	30512	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009726	GCTC	2	8	30630	30637	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009726	CGAG	2	8	32868	32875	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009726	AAAT	2	8	33964	33971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009726	TTAA	2	8	34024	34031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009726	ATCA	2	8	35139	35146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009726	CGAC	2	8	35415	35422	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009726	TCGT	2	8	35536	35543	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009726	ATGG	2	8	35577	35584	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009726	TGAA	2	8	35656	35663	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009726	CTTT	2	8	35745	35752	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009726	AATT	2	8	35862	35869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009726	GCTG	2	8	35995	36002	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009726	AGAT	2	8	36045	36052	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009726	AAAG	2	8	36259	36266	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009726	AAGG	2	8	38500	38507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009726	TCCT	2	8	40342	40349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009726	AGAT	2	8	40647	40654	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009726	AACT	2	8	46439	46446	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009726	TTCT	2	8	46623	46630	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009726	TGTT	2	8	54030	54037	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009726	TTTA	2	8	54041	54048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009726	TAGT	2	8	54059	54066	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009726	TTTA	2	8	54071	54078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.