MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 plasmid pQpDG

Total Repeats: 668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009726	TTG	2	6	9	14	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009726	GGT	2	6	246	251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154688252
3	NC_009726	AGA	2	6	363	368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154688252
4	NC_009726	GAA	2	6	529	534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154688252
5	NC_009726	GTC	2	6	675	680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209363623
6	NC_009726	CCG	2	6	733	738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209363623
7	NC_009726	CAT	2	6	905	910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209363623
8	NC_009726	TGA	2	6	963	968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209363623
9	NC_009726	AGA	2	6	1021	1026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363623
10	NC_009726	TTC	2	6	1253	1258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009726	GCC	2	6	1272	1277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_009726	TGC	2	6	1322	1327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009726	GCC	2	6	1369	1374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_009726	TAT	2	6	1563	1568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009726	GAG	2	6	1588	1593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009726	ATT	2	6	1599	1604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009726	CTA	2	6	1747	1752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688289
18	NC_009726	TGG	2	6	1762	1767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154688289
19	NC_009726	TGC	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154688289
20	NC_009726	CAA	2	6	1867	1872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154688289
21	NC_009726	TTA	2	6	1933	1938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154688289
22	NC_009726	TGT	2	6	2149	2154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154688289
23	NC_009726	TCG	2	6	2177	2182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154688289
24	NC_009726	TCG	2	6	2381	2386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154688289
25	NC_009726	GGC	2	6	2620	2625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154688289
26	NC_009726	TAA	2	6	2833	2838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009726	ATG	2	6	3284	3289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688312
28	NC_009726	TGA	2	6	3393	3398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688312
29	NC_009726	ATT	2	6	3477	3482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154688312
30	NC_009726	GTG	2	6	3629	3634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154688312
31	NC_009726	ATG	2	6	3643	3648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688308
32	NC_009726	AAT	2	6	3721	3726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154688308
33	NC_009726	ATG	2	6	3731	3736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688308
34	NC_009726	TGA	2	6	3884	3889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688308
35	NC_009726	CTT	2	6	3932	3937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688308
36	NC_009726	TTG	2	6	4190	4195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154688308
37	NC_009726	GAT	2	6	4209	4214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688308
38	NC_009726	CAT	2	6	4327	4332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688308
39	NC_009726	TAA	2	6	4337	4342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154688308
40	NC_009726	TGA	2	6	4398	4403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688308
41	NC_009726	CTT	2	6	4411	4416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688308
42	NC_009726	GGA	2	6	4471	4476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154688308
43	NC_009726	GTT	3	9	4488	4496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154688308
44	NC_009726	CTT	2	6	4616	4621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009726	TAG	2	6	4704	4709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009726	AAT	2	6	4733	4738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009726	ACC	2	6	4770	4775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_009726	GAA	2	6	4863	4868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009726	TAT	2	6	4979	4984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154688260
50	NC_009726	TCT	2	6	5073	5078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688260
51	NC_009726	ATG	2	6	5098	5103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688260
52	NC_009726	TGA	2	6	5283	5288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009726	AAT	2	6	5322	5327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009726	CAA	2	6	5442	5447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009726	TGA	2	6	5477	5482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009726	GCA	2	6	5488	5493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009726	CAA	2	6	5666	5671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363624
58	NC_009726	AGG	2	6	5679	5684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209363624
59	NC_009726	GAA	2	6	5750	5755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363624
60	NC_009726	CAA	2	6	5838	5843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363624
61	NC_009726	CAT	2	6	5998	6003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209363624
62	NC_009726	ATT	3	9	6009	6017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209363624
63	NC_009726	CTT	2	6	6168	6173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209363624
64	NC_009726	TGA	2	6	6178	6183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209363624
65	NC_009726	GCA	2	6	6273	6278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209363624
66	NC_009726	AGA	2	6	6427	6432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363624
67	NC_009726	AGT	2	6	6467	6472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209363624
68	NC_009726	CAA	2	6	6779	6784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363624
69	NC_009726	ATT	2	6	6813	6818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209363624
70	NC_009726	TTG	2	6	6869	6874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209363624
71	NC_009726	AAC	2	6	7012	7017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363624
72	NC_009726	GAA	2	6	7052	7057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363624
73	NC_009726	ATT	2	6	7066	7071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209363624
74	NC_009726	GTT	2	6	7235	7240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209363624
75	NC_009726	CAA	2	6	7259	7264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363624
76	NC_009726	CGA	2	6	7270	7275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209363624
77	NC_009726	CTA	2	6	7276	7281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209363624
78	NC_009726	GAA	2	6	7295	7300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363624
79	NC_009726	AAT	2	6	7462	7467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154688294
80	NC_009726	TGG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154688294
81	NC_009726	GAT	2	6	7670	7675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688294
82	NC_009726	TTA	2	6	7745	7750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009726	TAA	2	6	7761	7766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009726	TAA	2	6	7772	7777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009726	GTA	2	6	7782	7787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009726	GTT	2	6	7813	7818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009726	TTA	2	6	7964	7969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154688257
88	NC_009726	GAT	2	6	7996	8001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688257
89	NC_009726	GCA	2	6	8049	8054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154688257
90	NC_009726	ATT	2	6	8148	8153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154688257
91	NC_009726	GTT	2	6	8215	8220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154688257
92	NC_009726	AGC	2	6	8418	8423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009726	TTC	2	6	8525	8530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688273
94	NC_009726	AAC	2	6	8558	8563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154688273
95	NC_009726	GAA	2	6	8579	8584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154688273
96	NC_009726	TAC	2	6	8756	8761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688273
97	NC_009726	TCG	2	6	8799	8804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154688273
98	NC_009726	CTC	2	6	8858	8863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154688273
99	NC_009726	TCT	2	6	9030	9035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688273
100	NC_009726	TTG	2	6	9047	9052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154688273
101	NC_009726	CTT	2	6	9074	9079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688273
102	NC_009726	CGC	2	6	9146	9151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154688273
103	NC_009726	ATC	2	6	9191	9196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688273
104	NC_009726	CAT	2	6	9208	9213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688273
105	NC_009726	AGC	2	6	9257	9262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154688273
106	NC_009726	TCA	2	6	9264	9269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688273
107	NC_009726	AGA	2	6	9317	9322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154688273
108	NC_009726	AAT	2	6	9346	9351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154688273
109	NC_009726	TTC	3	9	9386	9394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688273
110	NC_009726	CGA	2	6	9441	9446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154688273
111	NC_009726	TCA	2	6	9495	9500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688273
112	NC_009726	TCT	2	6	9540	9545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688273
113	NC_009726	TCT	2	6	9666	9671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688273
114	NC_009726	TTC	3	9	9689	9697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688273
115	NC_009726	GGT	2	6	9698	9703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154688273
116	NC_009726	GCC	2	6	9706	9711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154688273
117	NC_009726	CAT	2	6	9760	9765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688273
118	NC_009726	GAT	2	6	9814	9819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688273
119	NC_009726	CTT	2	6	9898	9903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688273
120	NC_009726	ATA	2	6	10037	10042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154688273
121	NC_009726	TCA	2	6	10131	10136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009726	CAT	2	6	10156	10161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009726	CCA	2	6	10282	10287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_009726	GCT	2	6	10359	10364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009726	GTT	2	6	10444	10449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009726	TTC	2	6	10466	10471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009726	CCA	2	6	10543	10548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_009726	TTC	2	6	10562	10567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009726	TAA	2	6	10667	10672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009726	GCC	2	6	10719	10724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_009726	TCC	2	6	10776	10781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_009726	TTG	2	6	10917	10922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009726	AGG	2	6	11037	11042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009726	AAG	2	6	11046	11051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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