MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 plasmid pQpDG

Total Repeats: 453

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009726	GGT	2	6	246	251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154688252
2	NC_009726	AGA	2	6	363	368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154688252
3	NC_009726	GAA	2	6	529	534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154688252
4	NC_009726	GTC	2	6	675	680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209363623
5	NC_009726	CCG	2	6	733	738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209363623
6	NC_009726	CAT	2	6	905	910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209363623
7	NC_009726	TGA	2	6	963	968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209363623
8	NC_009726	AGA	2	6	1021	1026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363623
9	NC_009726	CTA	2	6	1747	1752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688289
10	NC_009726	TGG	2	6	1762	1767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154688289
11	NC_009726	TGC	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154688289
12	NC_009726	CAA	2	6	1867	1872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154688289
13	NC_009726	TTA	2	6	1933	1938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154688289
14	NC_009726	TGT	2	6	2149	2154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154688289
15	NC_009726	TCG	2	6	2177	2182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154688289
16	NC_009726	TCG	2	6	2381	2386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154688289
17	NC_009726	GGC	2	6	2620	2625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154688289
18	NC_009726	ATG	2	6	3284	3289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688312
19	NC_009726	TGA	2	6	3393	3398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688312
20	NC_009726	ATT	2	6	3477	3482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154688312
21	NC_009726	GTG	2	6	3629	3634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154688312
22	NC_009726	ATG	2	6	3643	3648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688308
23	NC_009726	AAT	2	6	3721	3726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154688308
24	NC_009726	ATG	2	6	3731	3736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688308
25	NC_009726	TGA	2	6	3884	3889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688308
26	NC_009726	CTT	2	6	3932	3937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688308
27	NC_009726	TTG	2	6	4190	4195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154688308
28	NC_009726	GAT	2	6	4209	4214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688308
29	NC_009726	CAT	2	6	4327	4332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688308
30	NC_009726	TAA	2	6	4337	4342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154688308
31	NC_009726	TGA	2	6	4398	4403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688308
32	NC_009726	CTT	2	6	4411	4416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688308
33	NC_009726	GGA	2	6	4471	4476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154688308
34	NC_009726	GTT	3	9	4488	4496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154688308
35	NC_009726	TAT	2	6	4979	4984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154688260
36	NC_009726	TCT	2	6	5073	5078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688260
37	NC_009726	ATG	2	6	5098	5103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688260
38	NC_009726	CAA	2	6	5666	5671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363624
39	NC_009726	AGG	2	6	5679	5684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209363624
40	NC_009726	GAA	2	6	5750	5755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363624
41	NC_009726	CAA	2	6	5838	5843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363624
42	NC_009726	CAT	2	6	5998	6003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209363624
43	NC_009726	ATT	3	9	6009	6017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209363624
44	NC_009726	CTT	2	6	6168	6173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209363624
45	NC_009726	TGA	2	6	6178	6183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209363624
46	NC_009726	GCA	2	6	6273	6278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209363624
47	NC_009726	AGA	2	6	6427	6432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363624
48	NC_009726	AGT	2	6	6467	6472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209363624
49	NC_009726	CAA	2	6	6779	6784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363624
50	NC_009726	ATT	2	6	6813	6818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209363624
51	NC_009726	TTG	2	6	6869	6874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209363624
52	NC_009726	AAC	2	6	7012	7017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363624
53	NC_009726	GAA	2	6	7052	7057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363624
54	NC_009726	ATT	2	6	7066	7071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209363624
55	NC_009726	GTT	2	6	7235	7240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209363624
56	NC_009726	CAA	2	6	7259	7264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363624
57	NC_009726	CGA	2	6	7270	7275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209363624
58	NC_009726	CTA	2	6	7276	7281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209363624
59	NC_009726	GAA	2	6	7295	7300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363624
60	NC_009726	AAT	2	6	7462	7467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154688294
61	NC_009726	TGG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154688294
62	NC_009726	GAT	2	6	7670	7675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688294
63	NC_009726	TTA	2	6	7964	7969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154688257
64	NC_009726	GAT	2	6	7996	8001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688257
65	NC_009726	GCA	2	6	8049	8054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154688257
66	NC_009726	ATT	2	6	8148	8153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154688257
67	NC_009726	GTT	2	6	8215	8220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154688257
68	NC_009726	TTC	2	6	8525	8530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688273
69	NC_009726	AAC	2	6	8558	8563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154688273
70	NC_009726	GAA	2	6	8579	8584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154688273
71	NC_009726	TAC	2	6	8756	8761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688273
72	NC_009726	TCG	2	6	8799	8804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154688273
73	NC_009726	CTC	2	6	8858	8863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154688273
74	NC_009726	TCT	2	6	9030	9035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688273
75	NC_009726	TTG	2	6	9047	9052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154688273
76	NC_009726	CTT	2	6	9074	9079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688273
77	NC_009726	CGC	2	6	9146	9151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154688273
78	NC_009726	ATC	2	6	9191	9196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688273
79	NC_009726	CAT	2	6	9208	9213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688273
80	NC_009726	AGC	2	6	9257	9262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154688273
81	NC_009726	TCA	2	6	9264	9269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688273
82	NC_009726	AGA	2	6	9317	9322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154688273
83	NC_009726	AAT	2	6	9346	9351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154688273
84	NC_009726	TTC	3	9	9386	9394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688273
85	NC_009726	CGA	2	6	9441	9446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154688273
86	NC_009726	TCA	2	6	9495	9500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688273
87	NC_009726	TCT	2	6	9540	9545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688273
88	NC_009726	TCT	2	6	9666	9671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688273
89	NC_009726	TTC	3	9	9689	9697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688273
90	NC_009726	GGT	2	6	9698	9703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154688273
91	NC_009726	GCC	2	6	9706	9711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154688273
92	NC_009726	CAT	2	6	9760	9765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688273
93	NC_009726	GAT	2	6	9814	9819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688273
94	NC_009726	CTT	2	6	9898	9903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688273
95	NC_009726	ATA	2	6	10037	10042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154688273
96	NC_009726	ACC	2	6	12267	12272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154688265
97	NC_009726	CAG	2	6	12356	12361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154688265
98	NC_009726	GCC	2	6	12600	12605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154688265
99	NC_009726	ATC	2	6	12619	12624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688265
100	NC_009726	AAG	2	6	12646	12651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154688265
101	NC_009726	ATT	2	6	12738	12743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154688265
102	NC_009726	TCA	2	6	12781	12786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688265
103	NC_009726	AGT	2	6	12835	12840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688265
104	NC_009726	GCT	2	6	12862	12867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154688265
105	NC_009726	CTA	2	6	12943	12948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688265
106	NC_009726	ACT	2	6	12985	12990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688265
107	NC_009726	AAT	2	6	13004	13009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154688265
108	NC_009726	TAT	2	6	13053	13058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154688249
109	NC_009726	CAG	2	6	13065	13070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154688249
110	NC_009726	TCA	2	6	13076	13081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688249
111	NC_009726	GCC	2	6	13114	13119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154688249
112	NC_009726	GTG	2	6	13193	13198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154688249
113	NC_009726	TCA	2	6	13307	13312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688249
114	NC_009726	ATT	2	6	13369	13374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154688249
115	NC_009726	GCC	2	6	13407	13412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154688249
116	NC_009726	ATC	2	6	13513	13518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209363625
117	NC_009726	TTC	2	6	13524	13529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209363625
118	NC_009726	ATC	2	6	13589	13594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209363625
119	NC_009726	GCC	2	6	13619	13624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209363625
120	NC_009726	TCG	2	6	13638	13643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209363625
121	NC_009726	GTC	2	6	13671	13676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209363625
122	NC_009726	GTA	2	6	13694	13699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209363625
123	NC_009726	TGC	2	6	13738	13743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209363625
124	NC_009726	TTC	2	6	13793	13798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209363625
125	NC_009726	AAT	2	6	14022	14027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209363626
126	NC_009726	ATT	2	6	15146	15151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209363627
127	NC_009726	ATG	2	6	15248	15253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209363627
128	NC_009726	TTA	2	6	15298	15303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209363627
129	NC_009726	GCG	2	6	15395	15400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154688310
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