MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 plasmid pQpDG

Total Repeats: 201

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009726	A	8	8	455	462	100 %	0 %	0 %	0 %	154688252
2	NC_009726	A	6	6	722	727	100 %	0 %	0 %	0 %	209363623
3	NC_009726	A	6	6	862	867	100 %	0 %	0 %	0 %	209363623
4	NC_009726	A	6	6	996	1001	100 %	0 %	0 %	0 %	209363623
5	NC_009726	A	7	7	1051	1057	100 %	0 %	0 %	0 %	209363623
6	NC_009726	T	6	6	1400	1405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009726	T	7	7	1469	1475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009726	A	6	6	1638	1643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009726	A	6	6	1698	1703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009726	T	6	6	1716	1721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009726	A	6	6	2126	2131	100 %	0 %	0 %	0 %	154688289
12	NC_009726	T	6	6	2163	2168	0 %	100 %	0 %	0 %	154688289
13	NC_009726	A	6	6	2837	2842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009726	A	7	7	2943	2949	100 %	0 %	0 %	0 %	154688312
15	NC_009726	A	6	6	3468	3473	100 %	0 %	0 %	0 %	154688312
16	NC_009726	T	6	6	3544	3549	0 %	100 %	0 %	0 %	154688312
17	NC_009726	A	6	6	3686	3691	100 %	0 %	0 %	0 %	154688308
18	NC_009726	A	7	7	3842	3848	100 %	0 %	0 %	0 %	154688308
19	NC_009726	A	6	6	3924	3929	100 %	0 %	0 %	0 %	154688308
20	NC_009726	A	6	6	4997	5002	100 %	0 %	0 %	0 %	154688260
21	NC_009726	T	6	6	5332	5337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009726	T	6	6	5549	5554	0 %	100 %	0 %	0 %	209363624
23	NC_009726	A	6	6	5972	5977	100 %	0 %	0 %	0 %	209363624
24	NC_009726	A	6	6	6569	6574	100 %	0 %	0 %	0 %	209363624
25	NC_009726	T	6	6	7495	7500	0 %	100 %	0 %	0 %	154688294
26	NC_009726	G	6	6	7617	7622	0 %	0 %	100 %	0 %	154688294
27	NC_009726	A	6	6	7843	7848	100 %	0 %	0 %	0 %	154688257
28	NC_009726	A	6	6	7985	7990	100 %	0 %	0 %	0 %	154688257
29	NC_009726	T	7	7	8515	8521	0 %	100 %	0 %	0 %	154688273
30	NC_009726	T	7	7	8706	8712	0 %	100 %	0 %	0 %	154688273
31	NC_009726	T	7	7	8881	8887	0 %	100 %	0 %	0 %	154688273
32	NC_009726	T	6	6	8933	8938	0 %	100 %	0 %	0 %	154688273
33	NC_009726	A	7	7	9021	9027	100 %	0 %	0 %	0 %	154688273
34	NC_009726	T	7	7	9078	9084	0 %	100 %	0 %	0 %	154688273
35	NC_009726	T	6	6	9658	9663	0 %	100 %	0 %	0 %	154688273
36	NC_009726	A	6	6	9683	9688	100 %	0 %	0 %	0 %	154688273
37	NC_009726	G	6	6	9924	9929	0 %	0 %	100 %	0 %	154688273
38	NC_009726	T	6	6	9932	9937	0 %	100 %	0 %	0 %	154688273
39	NC_009726	T	6	6	10061	10066	0 %	100 %	0 %	0 %	154688273
40	NC_009726	T	6	6	10111	10116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009726	T	8	8	10907	10914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009726	T	9	9	10963	10971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009726	T	6	6	11061	11066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009726	T	7	7	11208	11214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009726	A	6	6	11719	11724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009726	A	6	6	11841	11846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009726	A	6	6	11875	11880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009726	T	6	6	13715	13720	0 %	100 %	0 %	0 %	209363625
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50	NC_009726	T	6	6	14103	14108	0 %	100 %	0 %	0 %	209363626
51	NC_009726	A	7	7	14681	14687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.