MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens FZB42

Total Repeats: 1229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009725	AAAAGA	2	12	4191	4202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	154684522
2	NC_009725	TCCGGA	2	12	5386	5397	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	154684524
3	NC_009725	TGAAGA	2	12	8487	8498	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	154684525
4	NC_009725	ACTGGC	2	12	17360	17371	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	154684528
5	NC_009725	TTCGGC	2	12	24441	24452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154684534
6	NC_009725	GAAGGT	2	12	28775	28786	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	154684538
7	NC_009725	TTAAAT	2	12	29281	29292	50 %	50 %	0 %	0 %	154684538
8	NC_009725	CAGGCG	2	12	37452	37463	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	154684545
9	NC_009725	AATGTG	2	12	42355	42366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154684550
10	NC_009725	GAAAAA	2	12	47735	47746	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	154684557
11	NC_009725	GTTTCT	2	12	49582	49593	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	154684559
12	NC_009725	AGCGGA	2	12	54998	55009	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	154684565
13	NC_009725	TTGCCA	2	12	58409	58420	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	154684569
14	NC_009725	GAATCG	2	12	60614	60625	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	154684572
15	NC_009725	TACCGG	2	12	73683	73694	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	154684583
16	NC_009725	ATGATC	2	12	75118	75129	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	154684585
17	NC_009725	AGCTGC	2	12	76615	76626	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	154684586
18	NC_009725	TGTCGG	2	12	78356	78367	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	154684588
19	NC_009725	AACACC	2	12	79747	79758	50 %	0 %	0 %	50 %	154684589
20	NC_009725	TCAAAT	2	12	89623	89634	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	154684600
21	NC_009725	GTATCG	2	12	90765	90776	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	154684600
22	NC_009725	TGGCAC	2	12	104335	104346	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	154684604
23	NC_009725	ACTCGG	2	12	104450	104461	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	154684604
24	NC_009725	TGCCGA	2	12	109112	109123	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	154684606
25	NC_009725	GTCATT	2	12	109974	109985	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	154684607
26	NC_009725	CCAAGC	2	12	110470	110481	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	154684607
27	NC_009725	GCATGG	2	12	118940	118951	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	154684619
28	NC_009725	CATTTA	2	12	119500	119511	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	154684620
29	NC_009725	TCTGGT	2	12	119565	119576	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	154684620
30	NC_009725	GAAGCT	2	12	120082	120093	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	154684621
31	NC_009725	CTTGCA	2	12	121227	121238	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	154684622
32	NC_009725	CTGTAG	2	12	121434	121445	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	154684623
33	NC_009725	CCGGTA	2	12	129796	129807	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	154684626
34	NC_009725	AGTTGA	2	12	131656	131667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154684630
35	NC_009725	TAAAGG	2	12	136785	136796	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	154684634
36	NC_009725	GTCGGT	2	12	143404	143415	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	154684649
37	NC_009725	ATCGAA	2	12	143497	143508	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	154684649
38	NC_009725	AATAAA	2	12	144784	144795	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	154684652
39	NC_009725	CATTAA	2	12	146937	146948	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	154684655
40	NC_009725	GAAAAG	2	12	148636	148647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154684658
41	NC_009725	AAACAA	2	12	148677	148688	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	154684658
42	NC_009725	AAAAAG	2	12	150405	150416	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	154684661
43	NC_009725	TTAACT	2	12	155202	155213	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	154684668
44	NC_009725	CGGTTG	2	12	155646	155657	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	154684669
45	NC_009725	ACGGAT	2	12	182544	182555	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	154684681
46	NC_009725	TCCGGC	2	12	185792	185803	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	154684684
47	NC_009725	ATAAAT	2	12	187447	187458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154684686
48	NC_009725	TCTGAT	2	12	187468	187479	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	154684686
49	NC_009725	ATCGTC	2	12	190411	190422	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	154684688
50	NC_009725	TTCTTT	2	12	195912	195923	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	154684692
51	NC_009725	TGTTGA	2	12	201532	201543	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	154684698
52	NC_009725	AGACAA	2	12	202198	202209	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	154684698
53	NC_009725	TGGCCG	2	12	204949	204960	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	154684701
54	NC_009725	GAAATG	2	12	205461	205472	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	154684701
55	NC_009725	GGAATA	2	12	205916	205927	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	154684701
56	NC_009725	TAAATA	2	12	209681	209692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154684707
57	NC_009725	ATTGAG	2	12	210378	210389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154684708
58	NC_009725	GGATTT	2	12	213398	213409	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	154684710
59	NC_009725	ATCTTG	2	12	213429	213440	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	154684710
60	NC_009725	TGCGGA	2	12	216511	216522	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	154684713
61	NC_009725	TATCTT	2	12	218612	218623	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154684715
62	NC_009725	CGGAAT	2	12	218954	218965	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	154684715
63	NC_009725	TTCGGT	2	12	218973	218984	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	154684715
64	NC_009725	AAACCG	2	12	221926	221937	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	154684718
65	NC_009725	GTGAAC	2	12	224054	224065	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	154684720
66	NC_009725	CTTTTC	2	12	224813	224824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154684721
67	NC_009725	CGTCTG	2	12	226221	226232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154684723
68	NC_009725	GGCTGC	2	12	227254	227265	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	154684725
69	NC_009725	AAGCGA	2	12	229586	229597	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	154684727
70	NC_009725	GAAAAG	2	12	230521	230532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154684728
71	NC_009725	AGATAA	2	12	231006	231017	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	154684728
72	NC_009725	ACAATA	2	12	237239	237250	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	154684734
73	NC_009725	TTTTAT	2	12	244700	244711	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	154684740
74	NC_009725	ACCATT	2	12	247668	247679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154684744
75	NC_009725	CTGCCG	2	12	248049	248060	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	154684744
76	NC_009725	GAGACG	2	12	250009	250020	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	154684746
77	NC_009725	ATGCCG	2	12	253846	253857	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	154684749
78	NC_009725	CGAGGA	2	12	256332	256343	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	154684751
79	NC_009725	GCGGAA	2	12	263069	263080	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	154684761
80	NC_009725	AGCGGG	2	12	264944	264955	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	154684762
81	NC_009725	CAGGAT	2	12	270136	270147	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	154684768
82	NC_009725	TGAGAT	2	12	279763	279774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154684777
83	NC_009725	ATGAGC	2	12	282423	282434	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	154684779
84	NC_009725	TTTTCA	2	12	282445	282456	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154684779
85	NC_009725	TCATTG	2	12	283499	283510	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	154684780
86	NC_009725	GAAGAG	2	12	283864	283875	50 %	0 %	50 %	0 %	154684780
87	NC_009725	TTCTGC	2	12	285904	285915	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	154684782
88	NC_009725	TGATTT	2	12	288032	288043	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	154684785
89	NC_009725	GAAGCG	2	12	288258	288269	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	154684785
90	NC_009725	GGGCGA	2	12	288778	288789	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	154684786
91	NC_009725	TTTATC	2	12	289384	289395	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154684787
92	NC_009725	AAAATC	2	12	291632	291643	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	154684789
93	NC_009725	AAACAG	2	12	295362	295373	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	154684791
94	NC_009725	TTTCGG	2	12	297779	297790	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	154684794
95	NC_009725	AGAGTG	2	12	300255	300266	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	154684796
96	NC_009725	GAAAGA	2	12	300268	300279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154684796
97	NC_009725	ACGCTG	2	12	302757	302768	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	154684797
98	NC_009725	ATACGG	2	12	302776	302787	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	154684797
99	NC_009725	GGAAAA	2	12	306645	306656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154684801
100	NC_009725	AGGATG	2	12	310245	310256	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	154684805
101	NC_009725	AGAATG	2	12	310400	310411	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	154684805
102	NC_009725	CGGATG	2	12	311043	311054	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	154684806
103	NC_009725	TATTGA	2	12	314529	314540	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	154684810
104	NC_009725	AGCGAC	2	12	316241	316252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154684812
105	NC_009725	GATCTC	2	12	317421	317432	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	154684813
106	NC_009725	ATGGGG	2	12	321881	321892	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	154684816
107	NC_009725	ATCAAT	2	12	333517	333528	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	154684823
108	NC_009725	TTTGAG	2	12	334880	334891	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	154684824
109	NC_009725	GAGCAG	2	12	335183	335194	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	154684824
110	NC_009725	GCCTGA	2	12	340534	340545	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	154684831
111	NC_009725	AAATGC	2	12	349934	349945	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	154684834
112	NC_009725	CGGCGA	2	12	351206	351217	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	154684834
113	NC_009725	GATGAC	2	12	353174	353185	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	154684834
114	NC_009725	ATGAAA	2	12	356080	356091	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	154684835
115	NC_009725	GATACG	2	12	357234	357245	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	154684835
116	NC_009725	ACTGGA	2	12	360719	360730	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	154684835
117	NC_009725	CGGCGA	2	12	361973	361984	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	154684835
118	NC_009725	TCTGGA	2	12	363071	363082	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	154684835
119	NC_009725	AATGTC	2	12	366277	366288	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	154684837
120	NC_009725	TCAGGC	2	12	367062	367073	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	154684837
121	NC_009725	ATGAAA	2	12	378954	378965	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	154684850
122	NC_009725	ATCAAA	2	12	379478	379489	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	154684850
123	NC_009725	ATCCAG	2	12	381208	381219	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	154684853
124	NC_009725	TGCTCG	2	12	388420	388431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154684858
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142	NC_009725	GAAAAA	2	12	439021	439032	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	154684909
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213	NC_009725	CTAAAG	2	12	637797	637808	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	154685117
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221	NC_009725	CAAAAG	2	12	658396	658407	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	154685135
222	NC_009725	CCGGCT	2	12	658429	658440	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	154685135
223	NC_009725	GCCGGA	2	12	660760	660771	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	154685139
224	NC_009725	CTGTAC	2	12	662063	662074	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	154685140
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227	NC_009725	AGGCGG	2	12	667666	667677	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	154685146
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229	NC_009725	TTTGAT	2	12	685866	685877	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	154685159
230	NC_009725	TGAAAA	2	12	689136	689147	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	154685162
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