MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Xanthobacter autotrophicus Py2 chromosome

Total Repeats: 228

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009720	TCCCCG	2	12	6197	6208	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009720	GGCCGG	2	12	80260	80271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009720	GGGGAT	2	12	122621	122632	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009720	GAGGCG	2	12	122983	122994	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_009720	TGCGGG	2	12	124012	124023	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_009720	GCGGGA	2	12	127271	127282	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_009720	CCATCG	2	12	188523	188534	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009720	CCGTGC	2	12	196291	196302	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009720	CAGAAG	2	12	221359	221370	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009720	TGCGCG	2	12	230810	230821	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009720	CGGTCC	2	12	306592	306603	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009720	GGAGAG	2	12	315097	315108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009720	CGTTTG	2	12	342135	342146	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_009720	AAGGCG	2	12	365812	365823	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_009720	CCCCCG	2	12	372211	372222	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
16	NC_009720	CGGGTC	2	12	393658	393669	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009720	GCGCCG	2	12	438713	438724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009720	TCCCGG	2	12	448198	448209	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009720	GCCGGA	2	12	563804	563815	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009720	AAGGGG	2	12	565260	565271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009720	TAGCGG	2	12	588215	588226	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_009720	TGCCGC	2	12	601388	601399	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009720	GTTCCT	2	12	620114	620125	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009720	CAGAAG	2	12	664189	664200	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_009720	GGAGAG	2	12	683327	683338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009720	GGAGTG	2	12	683339	683350	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009720	CGCAGG	2	12	691511	691522	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009720	ACACTG	2	12	705695	705706	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009720	TTCTCC	2	12	743984	743995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009720	CTTGTT	2	12	760924	760935	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_009720	CGGGAA	2	12	810194	810205	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_009720	CACTCT	2	12	857492	857503	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009720	ACCGAG	2	12	939663	939674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009720	CTTCGA	2	12	955778	955789	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009720	GGGATG	2	12	971223	971234	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009720	ATCGGC	2	12	992428	992439	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009720	TAGGCG	2	12	1016921	1016932	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_009720	TCCGGG	2	12	1018388	1018399	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009720	CGGCGC	2	12	1020657	1020668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009720	CGCCGG	2	12	1024704	1024715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009720	CGATGC	2	12	1027678	1027689	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009720	TGCTTT	2	12	1051065	1051076	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_009720	CGGCGC	2	12	1064742	1064753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009720	GCTGCG	2	12	1088421	1088432	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009720	AAATGC	2	12	1096614	1096625	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_009720	GCCTGC	2	12	1099304	1099315	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009720	GCGCCG	2	12	1108749	1108760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009720	CGCTCC	2	12	1118032	1118043	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_009720	TGCGGC	2	12	1212639	1212650	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009720	TAGGTG	2	12	1248774	1248785	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009720	TGTCCC	2	12	1318146	1318157	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009720	CTTGGC	2	12	1329185	1329196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009720	CAGCGA	2	12	1375608	1375619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009720	TTTCGG	2	12	1383654	1383665	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_009720	GGGGGC	2	12	1384988	1384999	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_009720	CCCGCT	2	12	1391230	1391241	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_009720	TCGGCG	2	12	1396231	1396242	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009720	CGGGTG	2	12	1396832	1396843	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_009720	CACCGG	2	12	1400432	1400443	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009720	TGGCCA	2	12	1403441	1403452	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009720	CCCGGC	2	12	1439023	1439034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_009720	GCGGTC	2	12	1473264	1473275	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009720	GGTTTT	2	12	1509720	1509731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009720	GGGGGC	2	12	1519402	1519413	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_009720	CCGCAC	2	12	1527929	1527940	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_009720	CTTGGA	2	12	1545995	1546006	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_009720	TCCCCA	2	12	1561954	1561965	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_009720	CTTCCT	2	12	1606842	1606853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009720	CGTGCG	2	12	1608503	1608514	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009720	GCGGGA	2	12	1653519	1653530	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_009720	CACCGG	2	12	1656007	1656018	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009720	CGGCTG	2	12	1720138	1720149	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009720	CGAGGG	2	12	1780449	1780460	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_009720	AACGCC	2	12	1792018	1792029	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009720	ACGTTG	2	12	1847129	1847140	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_009720	TTGCGT	2	12	1984375	1984386	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_009720	GCATGC	2	12	1999001	1999012	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009720	GCCGGG	2	12	2000499	2000510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009720	CATCTC	2	12	2034366	2034377	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009720	AACGGC	2	12	2094547	2094558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009720	TAGGCG	2	12	2153363	2153374	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_009720	TCCGGG	2	12	2154830	2154841	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009720	GTGCCT	2	12	2158944	2158955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009720	GGGGAA	2	12	2165577	2165588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009720	GCGCCC	2	12	2175512	2175523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_009720	CGGGCG	2	12	2224874	2224885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009720	TTCGCC	2	12	2241541	2241552	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009720	GCTGTC	2	12	2342874	2342885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009720	CATTCC	2	12	2405377	2405388	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009720	GCCCAT	2	12	2442327	2442338	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009720	CCCGGC	2	12	2451261	2451272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_009720	GCCGGC	2	12	2452820	2452831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009720	GATCCC	2	12	2491176	2491187	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009720	TCGGGA	2	12	2491191	2491202	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_009720	AACGAT	2	12	2496946	2496957	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_009720	GACAAC	2	12	2497925	2497936	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009720	GGCGTT	2	12	2513473	2513484	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_009720	CGAGAT	2	12	2513533	2513544	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_009720	TCCCAT	2	12	2526691	2526702	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009720	GCGACC	2	12	2559535	2559546	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009720	TGATCA	2	12	2574658	2574669	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_009720	CCCGAT	2	12	2591711	2591722	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009720	GGATCG	2	12	2591732	2591743	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_009720	GTCGCC	2	12	2599988	2599999	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009720	CCGCTT	2	12	2623054	2623065	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009720	GAGAGG	2	12	2627692	2627703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009720	TGCGCC	2	12	2631616	2631627	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009720	CAGGCG	2	12	2638778	2638789	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009720	AGCTCA	2	12	2692165	2692176	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009720	GCCTTC	2	12	2694515	2694526	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009720	ATGGGG	2	12	2722961	2722972	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009720	TCCGGC	2	12	2762003	2762014	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009720	CGGGGC	2	12	2767919	2767930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009720	CCGCGT	2	12	2778896	2778907	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_009720	GCCGTC	2	12	2787032	2787043	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009720	CGAGGG	2	12	2812399	2812410	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_009720	ACCGTG	2	12	2851552	2851563	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009720	GGCGCG	2	12	2874567	2874578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009720	TGCGGT	2	12	2943673	2943684	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_009720	CCGGTA	2	12	2966967	2966978	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009720	GTCCCG	2	12	2998747	2998758	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009720	GACCCC	2	12	3009695	3009706	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_009720	CAAGAC	2	12	3041100	3041111	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_009720	CGTCGG	2	12	3068194	3068205	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009720	CTGAAG	2	12	3100614	3100625	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_009720	TTGATC	2	12	3116470	3116481	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_009720	CGCCGG	2	12	3139902	3139913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009720	GAGCTG	2	12	3152179	3152190	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_009720	TGATCG	2	12	3153880	3153891	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_009720	CGGAAG	2	12	3190468	3190479	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_009720	CCCATT	2	12	3196554	3196565	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_009720	TCCCGT	2	12	3213508	3213519	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009720	GCACCG	2	12	3223910	3223921	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009720	ACCATT	2	12	3231061	3231072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009720	CACCGG	2	12	3232486	3232497	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009720	GGCAGG	2	12	3235844	3235855	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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138	NC_009720	CGTTTC	2	12	3266060	3266071	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009720	CGAGAT	2	12	3286461	3286472	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_009720	AGAGAA	2	12	3291076	3291087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009720	TGGGAC	2	12	3299860	3299871	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_009720	GACCGT	2	12	3358710	3358721	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_009720	CTCTCA	2	12	3368100	3368111	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009720	TCCTCT	2	12	3370380	3370391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009720	CACTCT	2	12	3376983	3376994	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009720	CCGGCC	2	12	3400506	3400517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_009720	GGGGGA	2	12	3420557	3420568	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009720	AGGGGG	2	12	3441029	3441040	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009720	TTGACC	2	12	3443589	3443600	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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153	NC_009720	TCGCTT	2	12	3518608	3518619	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_009720	GCGATG	2	12	3521174	3521185	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_009720	GAAGCC	2	12	3521500	3521511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_009720	GGCGTG	2	12	3724519	3724530	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_009720	GTGCGC	2	12	3724578	3724589	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_009720	GCCATC	2	12	3736360	3736371	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
160	NC_009720	GCCGGC	2	12	3739248	3739259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
161	NC_009720	GCGACC	2	12	3741737	3741748	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
162	NC_009720	GCGGAT	2	12	3785399	3785410	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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164	NC_009720	GAGGTA	2	12	3818193	3818204	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.