MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Xanthobacter autotrophicus Py2 chromosome

Total Repeats: 2145

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009720	GCCG	2	8	269	276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009720	GCCG	2	8	1921	1928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009720	AGCC	2	8	2022	2029	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009720	CTCC	2	8	4804	4811	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_009720	CATA	2	8	4830	4837	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009720	GGGA	2	8	4855	4862	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009720	CTGG	2	8	6155	6162	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009720	GGTG	2	8	10568	10575	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009720	GGCA	2	8	12628	12635	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009720	GCCT	2	8	14336	14343	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009720	GCGG	2	8	18551	18558	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009720	CCGG	2	8	23402	23409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009720	GACG	2	8	23428	23435	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009720	CGGC	2	8	23506	23513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009720	CGGC	2	8	26574	26581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009720	GGCC	2	8	26699	26706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009720	ACTT	2	8	31554	31561	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009720	CCCT	2	8	32162	32169	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_009720	GCCG	2	8	32316	32323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009720	CGGC	2	8	32949	32956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009720	CCGC	2	8	34106	34113	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_009720	GCCC	2	8	36999	37006	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_009720	GGCG	2	8	37152	37159	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009720	GCCG	2	8	44987	44994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009720	GCCA	2	8	49611	49618	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009720	GCCC	2	8	51663	51670	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_009720	CGGG	2	8	51677	51684	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009720	GCCG	2	8	54646	54653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009720	CACC	2	8	55427	55434	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_009720	TCTG	2	8	55450	55457	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009720	CGCC	2	8	55521	55528	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_009720	CACC	2	8	56426	56433	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_009720	GACC	2	8	56503	56510	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009720	GCCC	2	8	58550	58557	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_009720	CCGA	2	8	61252	61259	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009720	GCCG	2	8	61438	61445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009720	TTTC	2	8	61515	61522	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009720	GCTG	2	8	61678	61685	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009720	CCGT	2	8	66465	66472	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009720	GCGT	2	8	66487	66494	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009720	TCGA	2	8	68487	68494	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009720	GCCG	2	8	73835	73842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009720	CCGG	2	8	73899	73906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009720	CAAA	2	8	75240	75247	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009720	CGGG	2	8	90067	90074	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009720	TGCC	2	8	90277	90284	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009720	GGCG	2	8	90637	90644	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009720	GCCG	2	8	90706	90713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009720	CGGC	2	8	95889	95896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009720	CGTC	2	8	95954	95961	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009720	CGCC	3	12	95989	96000	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_009720	GGCC	2	8	97313	97320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009720	ACCC	2	8	98947	98954	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_009720	CCCG	2	8	100565	100572	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_009720	GTTG	2	8	105539	105546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009720	CGGC	2	8	106304	106311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009720	GCAA	2	8	112112	112119	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009720	TGGA	2	8	112305	112312	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009720	ACGC	2	8	114368	114375	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009720	GCCG	2	8	114416	114423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009720	ACCA	2	8	117511	117518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009720	CCGT	2	8	118226	118233	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009720	GGGC	2	8	123174	123181	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009720	CCGG	2	8	123994	124001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009720	GGCC	2	8	126036	126043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009720	CAGG	2	8	127263	127270	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009720	GGGC	2	8	129218	129225	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009720	GCCC	2	8	129232	129239	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_009720	GTCC	2	8	130483	130490	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009720	GTGC	2	8	130999	131006	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009720	GCTC	2	8	131925	131932	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009720	GCGG	2	8	137065	137072	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009720	GACG	2	8	137138	137145	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009720	GGGA	2	8	137232	137239	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009720	GGCC	2	8	137472	137479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009720	TCGG	2	8	138451	138458	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009720	GGGC	2	8	138616	138623	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009720	CTTG	2	8	138864	138871	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009720	GCGG	2	8	138908	138915	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009720	CGAG	2	8	138947	138954	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009720	CCCG	2	8	142374	142381	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_009720	GGAC	2	8	143604	143611	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009720	TTCA	2	8	143962	143969	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009720	TTGT	2	8	146539	146546	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009720	GTTT	2	8	146559	146566	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009720	CAGC	2	8	146710	146717	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009720	CGGC	2	8	147287	147294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009720	GTCC	2	8	148542	148549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009720	CTCC	2	8	150719	150726	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_009720	CGGC	2	8	150834	150841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009720	GCCG	2	8	159432	159439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009720	TGTA	2	8	169950	169957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009720	GAGG	2	8	170033	170040	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009720	GTCG	2	8	174245	174252	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009720	AGCG	2	8	182698	182705	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009720	GACG	2	8	182750	182757	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009720	CCCG	2	8	184031	184038	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_009720	GCCC	2	8	184050	184057	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_009720	GCTC	2	8	184124	184131	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009720	GCCG	2	8	186195	186202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009720	CCGT	2	8	186363	186370	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009720	TGCC	2	8	188487	188494	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009720	GGCG	2	8	188551	188558	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_009720	CCGG	2	8	189330	189337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009720	TCTT	2	8	189339	189346	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009720	GCCG	2	8	192817	192824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009720	TCAT	2	8	193951	193958	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009720	TTCG	2	8	194450	194457	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009720	TGCC	2	8	194534	194541	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009720	GCCC	2	8	196260	196267	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_009720	GCGG	2	8	199331	199338	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009720	GAGG	2	8	204012	204019	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009720	GCCT	2	8	204066	204073	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009720	GGGA	2	8	207961	207968	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009720	GAGG	2	8	208057	208064	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009720	CCGA	2	8	215936	215943	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009720	GCCG	3	12	219234	219245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009720	CGGG	2	8	221345	221352	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_009720	AGCG	2	8	221508	221515	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009720	CTAC	2	8	221516	221523	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009720	CGTT	2	8	224067	224074	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009720	CTCG	2	8	225150	225157	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_009720	CGGC	2	8	225433	225440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_009720	GCTG	2	8	225763	225770	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009720	GTTC	2	8	225817	225824	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009720	GGCT	2	8	230928	230935	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009720	CCGG	2	8	232257	232264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009720	CGAC	2	8	233525	233532	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009720	GACT	2	8	237166	237173	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009720	GACC	2	8	241933	241940	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_009720	GAGC	2	8	242138	242145	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009720	TGAG	2	8	243985	243992	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009720	CGCC	2	8	244039	244046	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_009720	CAGC	2	8	245899	245906	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009720	CGGC	2	8	253408	253415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009720	GGAC	2	8	257945	257952	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009720	ACGA	2	8	257987	257994	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_009720	CGGC	2	8	258166	258173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009720	GATG	2	8	264396	264403	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009720	CGCC	2	8	272107	272114	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
141	NC_009720	TCGC	2	8	272631	272638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009720	GTCT	2	8	276734	276741	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009720	GAAG	2	8	279744	279751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009720	TCAG	2	8	279811	279818	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009720	CCGC	2	8	279923	279930	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
146	NC_009720	GCGG	2	8	279983	279990	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009720	CGGG	2	8	286139	286146	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009720	GGGC	2	8	286163	286170	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
149	NC_009720	AGGA	2	8	286173	286180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009720	GCTT	2	8	291485	291492	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_009720	TTCT	2	8	293706	293713	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_009720	CGGG	2	8	293960	293967	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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450	NC_009720	TGGA	2	8	1077973	1077980	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_009720	TCGG	2	8	1111631	1111638	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
467	NC_009720	CCTC	2	8	1112365	1112372	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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475	NC_009720	CGGA	2	8	1208408	1208415	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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484	NC_009720	CCGA	2	8	1226279	1226286	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
485	NC_009720	TCGC	2	8	1226412	1226419	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
486	NC_009720	TTCC	2	8	1226490	1226497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
487	NC_009720	ATAG	2	8	1226578	1226585	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
488	NC_009720	ATTG	2	8	1228350	1228357	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_009720	GAAT	2	8	1248713	1248720	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
492	NC_009720	AGGG	2	8	1250729	1250736	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
493	NC_009720	GCCG	2	8	1250984	1250991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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497	NC_009720	TATC	2	8	1253219	1253226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
498	NC_009720	CCGC	2	8	1258326	1258333	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
499	NC_009720	ACCG	2	8	1260654	1260661	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
500	NC_009720	CCGT	2	8	1261237	1261244	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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