MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Xanthobacter autotrophicus Py2 chromosome

Total Repeats: 102812

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009720	TCG	2	6	41	46	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009720	CTC	2	6	83	88	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009720	CCG	2	6	322	327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009720	CGA	2	6	340	345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243959
5	NC_009720	ACC	2	6	351	356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243959
6	NC_009720	GAG	2	6	399	404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243959
7	NC_009720	CCG	2	6	448	453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243959
8	NC_009720	GAG	2	6	540	545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243959
9	NC_009720	GCG	2	6	547	552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243959
10	NC_009720	GCG	2	6	557	562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243959
11	NC_009720	GGT	2	6	629	634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243959
12	NC_009720	CAG	2	6	672	677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243959
13	NC_009720	CGG	2	6	766	771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243959
14	NC_009720	GTG	2	6	849	854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243959
15	NC_009720	CGC	3	9	878	886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243959
16	NC_009720	CAC	2	6	1019	1024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243959
17	NC_009720	CCG	2	6	1033	1038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243959
18	NC_009720	GCC	2	6	1062	1067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243959
19	NC_009720	CGA	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243959
20	NC_009720	CAA	2	6	1154	1159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154243959
21	NC_009720	CAG	2	6	1164	1169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243959
22	NC_009720	CTG	2	6	1194	1199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243959
23	NC_009720	CGG	2	6	1202	1207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243959
24	NC_009720	GGT	3	9	1214	1222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243959
25	NC_009720	GGC	2	6	1223	1228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243959
26	NC_009720	CGA	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243959
27	NC_009720	CGG	2	6	1286	1291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243959
28	NC_009720	TGG	3	9	1294	1302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243959
29	NC_009720	GGA	3	9	1316	1324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243959
30	NC_009720	AGC	2	6	1369	1374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243959
31	NC_009720	GCT	2	6	1466	1471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243959
32	NC_009720	GAC	2	6	1572	1577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243959
33	NC_009720	GTG	2	6	1587	1592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243959
34	NC_009720	CTG	2	6	1623	1628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243959
35	NC_009720	GTG	2	6	1650	1655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243959
36	NC_009720	GCC	2	6	1720	1725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243959
37	NC_009720	TGC	2	6	1753	1758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243959
38	NC_009720	GTC	2	6	1855	1860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009720	GCG	3	9	1997	2005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009720	GGC	2	6	2052	2057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009720	TCC	2	6	2080	2085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_009720	CGG	2	6	2086	2091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009720	ACG	2	6	2193	2198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009720	CGG	2	6	2211	2216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009720	CGT	2	6	2329	2334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243960
46	NC_009720	GCG	2	6	2338	2343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243960
47	NC_009720	GGT	2	6	2428	2433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243960
48	NC_009720	CCA	2	6	2469	2474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243960
49	NC_009720	CGG	2	6	2634	2639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243960
50	NC_009720	TGG	2	6	2688	2693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243960
51	NC_009720	GAG	2	6	2720	2725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243960
52	NC_009720	CGG	2	6	2773	2778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243960
53	NC_009720	TGC	2	6	2787	2792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243960
54	NC_009720	CGG	2	6	2844	2849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243960
55	NC_009720	GCT	2	6	2908	2913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243960
56	NC_009720	GGA	2	6	2914	2919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243960
57	NC_009720	AGG	2	6	2922	2927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243960
58	NC_009720	CCA	3	9	2949	2957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243960
59	NC_009720	CGC	3	9	3082	3090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243960
60	NC_009720	CCG	2	6	3225	3230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243960
61	NC_009720	CTG	2	6	3263	3268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243960
62	NC_009720	CCA	2	6	3348	3353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243960
63	NC_009720	CTG	2	6	3450	3455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009720	CGC	2	6	3588	3593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243961
65	NC_009720	GGT	2	6	3663	3668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243961
66	NC_009720	GCG	2	6	3744	3749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243961
67	NC_009720	GCC	2	6	3787	3792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243961
68	NC_009720	GCG	2	6	3888	3893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243961
69	NC_009720	GCC	2	6	3993	3998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243961
70	NC_009720	CGG	2	6	4006	4011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243961
71	NC_009720	GGA	2	6	4107	4112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243961
72	NC_009720	GCG	3	9	4177	4185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243961
73	NC_009720	CGC	2	6	4221	4226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243961
74	NC_009720	CGA	2	6	4233	4238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243961
75	NC_009720	CCT	2	6	4338	4343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154243961
76	NC_009720	GCG	2	6	4369	4374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243961
77	NC_009720	CGC	2	6	4440	4445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243961
78	NC_009720	TGG	2	6	4508	4513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243961
79	NC_009720	GAC	2	6	4549	4554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243961
80	NC_009720	GTG	2	6	4555	4560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243961
81	NC_009720	CGC	2	6	4572	4577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243961
82	NC_009720	CTC	2	6	4725	4730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_009720	AAC	2	6	4789	4794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009720	CAT	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009720	TAA	2	6	4839	4844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009720	GAC	2	6	4845	4850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009720	TGA	2	6	4863	4868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154243962
88	NC_009720	CGG	3	9	4902	4910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243962
89	NC_009720	TGC	2	6	4968	4973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243962
90	NC_009720	CGG	2	6	4981	4986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243962
91	NC_009720	CCA	2	6	4992	4997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243962
92	NC_009720	GGC	2	6	5029	5034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243962
93	NC_009720	CGG	2	6	5049	5054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243962
94	NC_009720	CTG	2	6	5171	5176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243962
95	NC_009720	ACA	2	6	5187	5192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154243962
96	NC_009720	CAA	3	9	5308	5316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154243962
97	NC_009720	ACG	2	6	5325	5330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243962
98	NC_009720	AGC	2	6	5337	5342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243962
99	NC_009720	TCT	2	6	5356	5361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154243962
100	NC_009720	GAA	2	6	5362	5367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154243962
101	NC_009720	CGC	2	6	5434	5439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243962
102	NC_009720	AAG	2	6	5447	5452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154243962
103	NC_009720	CGA	2	6	5485	5490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243962
104	NC_009720	GTG	2	6	5567	5572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243962
105	NC_009720	ACC	2	6	5586	5591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243962
106	NC_009720	GCG	2	6	5655	5660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243962
107	NC_009720	TGG	2	6	5772	5777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243962
108	NC_009720	CGC	2	6	5917	5922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243962
109	NC_009720	TCG	2	6	5952	5957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243962
110	NC_009720	CGG	2	6	6028	6033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243962
111	NC_009720	GCA	2	6	6140	6145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009720	GCA	2	6	6147	6152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009720	TCA	2	6	6286	6291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154243963
114	NC_009720	CGG	2	6	6305	6310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243963
115	NC_009720	TCA	2	6	6364	6369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154243963
116	NC_009720	TCT	2	6	6416	6421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154243963
117	NC_009720	TGG	3	9	6544	6552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243963
118	NC_009720	CTG	2	6	6567	6572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243963
119	NC_009720	CCG	2	6	6577	6582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243963
120	NC_009720	TGG	3	9	6592	6600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243963
121	NC_009720	ACA	2	6	6601	6606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154243963
122	NC_009720	ACC	2	6	6645	6650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243963
123	NC_009720	TCG	2	6	6673	6678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243963
124	NC_009720	GCC	2	6	6717	6722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243963
125	NC_009720	GCG	2	6	6810	6815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243963
126	NC_009720	GCT	2	6	6896	6901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243963
127	NC_009720	TTC	2	6	6909	6914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154243963
128	NC_009720	CCA	2	6	6925	6930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243963
129	NC_009720	TGG	3	9	6961	6969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243963
130	NC_009720	GGC	2	6	6975	6980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243963
131	NC_009720	CGG	2	6	7007	7012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243963
132	NC_009720	GCT	3	9	7013	7021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243963
133	NC_009720	GCC	2	6	7041	7046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243963
134	NC_009720	CGG	2	6	7066	7071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243963
135	NC_009720	TCT	2	6	7075	7080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154243963
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137	NC_009720	CGG	2	6	7254	7259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243964
138	NC_009720	TCG	2	6	7289	7294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243964
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141	NC_009720	CGG	2	6	7423	7428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243964
142	NC_009720	CTG	2	6	7430	7435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243964
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