MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Fervidobacterium nodosum Rt17-B1 chromosome

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009718	TTCAAA	2	12	8	19	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009718	TCATTC	2	12	32693	32704	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009718	TTTTAG	2	12	41690	41701	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009718	ACCAGA	2	12	64570	64581	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009718	ACCTCC	2	12	199664	199675	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_009718	TAATTG	2	12	235901	235912	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009718	CACTAA	2	12	263517	263528	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009718	GAAAAA	2	12	336242	336253	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009718	AACAAA	2	12	345480	345491	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009718	CGTATT	2	12	367751	367762	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009718	GATTAA	2	12	367766	367777	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009718	TTATAT	2	12	419139	419150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009718	TAAACT	2	12	424417	424428	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_009718	AATAAA	2	12	568379	568390	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009718	AAAAAT	2	12	608807	608818	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009718	ATTATA	2	12	616988	616999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009718	CTTTTT	2	12	623089	623100	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009718	GTTATT	2	12	630960	630971	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009718	TTAAAA	2	12	631293	631304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009718	ATTTTT	2	12	631400	631411	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009718	AATGAA	2	12	640945	640956	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009718	ATTGAT	2	12	725445	725456	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009718	ATTTTA	2	12	799415	799426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009718	GCTCCG	2	12	811968	811979	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009718	TCTGCC	2	12	813729	813740	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009718	TTTTTC	2	12	814608	814619	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_009718	TAATTA	2	12	821167	821178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009718	TTAGAA	2	12	825490	825501	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009718	AGTCTG	2	12	829536	829547	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_009718	AAGAAA	2	12	833042	833053	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009718	GATTTT	2	12	843672	843683	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009718	TATAAT	2	12	913797	913808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009718	TATTTT	2	12	931419	931430	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009718	TGAAAA	2	12	935217	935228	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009718	TCATTT	2	12	935229	935240	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_009718	ATTACA	2	12	936420	936431	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_009718	ATTAAA	2	12	957735	957746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009718	ATAGAA	2	12	979582	979593	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009718	AGCGAA	2	12	980635	980646	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_009718	GGGGAG	2	12	984335	984346	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009718	GAAGAC	2	12	1020108	1020119	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_009718	CTTTTG	2	12	1025861	1025872	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_009718	GTGAAT	2	12	1027945	1027956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009718	CGGTGA	2	12	1031045	1031056	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_009718	ATTTTT	2	12	1075402	1075413	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009718	AGATAA	2	12	1120577	1120588	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009718	AATTTG	2	12	1141847	1141858	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009718	TTCAAA	2	12	1207346	1207357	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_009718	GCTCCG	2	12	1282984	1282995	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009718	TCTGCC	2	12	1284745	1284756	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009718	TTTTTC	2	12	1285624	1285635	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_009718	TTTTGT	2	12	1299391	1299402	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009718	AAGAAT	2	12	1341402	1341413	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009718	AGAATT	2	12	1342031	1342042	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009718	TTAAAT	2	12	1376985	1376996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009718	TTGTTT	2	12	1388972	1388983	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009718	AAAAGA	2	12	1404445	1404456	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009718	TGATAA	2	12	1429498	1429509	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009718	TTGGTT	2	12	1435760	1435771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009718	TAAAAG	2	12	1442778	1442789	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009718	AAATAT	2	12	1446357	1446368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009718	AATAAA	2	12	1452553	1452564	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009718	AATTTT	2	12	1458426	1458437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009718	TATTTT	2	12	1469527	1469538	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009718	AAAAGC	2	12	1469712	1469723	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009718	ATTTGA	2	12	1475591	1475602	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009718	AATTTG	2	12	1485716	1485727	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009718	TCATTC	2	12	1492715	1492726	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009718	CATATT	2	12	1493348	1493359	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_009718	TTATAA	2	12	1524675	1524686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009718	AAAAAT	2	12	1551501	1551512	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009718	AAAAAC	2	12	1603638	1603649	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_009718	ATTCTC	2	12	1637836	1637847	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009718	TAAATT	2	12	1708848	1708859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009718	AATATA	2	12	1725994	1726005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009718	TAATCT	2	12	1730867	1730878	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_009718	GTTTTT	2	12	1765571	1765582	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009718	AATTTT	2	12	1780808	1780819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009718	TAAAAA	2	12	1817483	1817494	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009718	AAAATT	2	12	1835097	1835108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009718	TTATCT	2	12	1850800	1850811	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_009718	ATTATA	2	12	1852524	1852535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009718	TTTTGA	2	12	1887228	1887239	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009718	CTTTTA	2	12	1903509	1903520	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_009718	AAAAAT	2	12	1945652	1945663	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.