MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Xanthobacter autotrophicus Py2 plasmid pXAUT01

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009717	GCGCC	2	10	6963	6972	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_009717	CGGGA	2	10	22925	22934	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009717	TGGGG	2	10	44546	44555	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009717	TCGGC	2	10	51986	51995	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009717	TCAGG	2	10	54043	54052	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009717	CATCA	2	10	54915	54924	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_009717	TAGGA	2	10	67417	67426	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009717	CAAGA	2	10	67542	67551	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009717	GATCG	2	10	73653	73662	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009717	CCGGC	2	10	85719	85728	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_009717	CGCTG	2	10	94883	94892	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_009717	ACAAG	2	10	95105	95114	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009717	GGCTC	2	10	99299	99308	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_009717	TGTCG	2	10	99490	99499	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009717	GAAGA	2	10	104222	104231	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009717	GGGGC	2	10	114792	114801	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009717	CGTCC	2	10	131061	131070	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_009717	TGAGG	2	10	131348	131357	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009717	TCGCC	2	10	144132	144141	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_009717	GCGAC	2	10	146919	146928	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009717	GCCGG	2	10	153879	153888	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_009717	AGCGG	2	10	169137	169146	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009717	TCGCC	2	10	169234	169243	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_009717	TGGAA	2	10	172411	172420	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009717	GACGA	2	10	177364	177373	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009717	CTTCA	2	10	178744	178753	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_009717	TCCCT	2	10	181532	181541	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_009717	TCACG	2	10	186740	186749	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_009717	GGAAG	2	10	186955	186964	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009717	CCGCG	2	10	201315	201324	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31	NC_009717	AAGGA	2	10	201520	201529	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009717	GACAA	2	10	208930	208939	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009717	TCGGC	2	10	210023	210032	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009717	TCGCT	2	10	210903	210912	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_009717	CGCGG	2	10	216446	216455	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_009717	GGCGC	2	10	228629	228638	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_009717	GAAGG	2	10	230008	230017	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009717	CGGGC	2	10	230029	230038	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
39	NC_009717	AACAA	2	10	234860	234869	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_009717	ATCGG	2	10	234976	234985	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009717	CCGAG	2	10	244569	244578	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_009717	CGGTC	2	10	244853	244862	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_009717	GTTCA	2	10	247571	247580	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_009717	CGCGC	2	10	251776	251785	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
45	NC_009717	CCGCC	2	10	268022	268031	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
46	NC_009717	GCGCA	2	10	280478	280487	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_009717	GCCGA	2	10	281725	281734	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_009717	GGTGC	2	10	285289	285298	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_009717	AAATT	2	10	299364	299373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009717	CCCCT	2	10	302057	302066	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
51	NC_009717	CCTCT	7	35	311771	311805	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
52	NC_009717	GCCAC	2	10	313544	313553	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.