MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Xanthobacter autotrophicus Py2 plasmid pXAUT01

Total Repeats: 216

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009717	TGATC	2	10	1109	1118	20 %	40 %	20 %	20 %	154243669
2	NC_009717	CCTTG	2	10	4494	4503	0 %	40 %	20 %	40 %	154243672
3	NC_009717	CGGGG	2	10	4856	4865	0 %	0 %	80 %	20 %	154243672
4	NC_009717	CCGCG	2	10	4929	4938	0 %	0 %	40 %	60 %	154243672
5	NC_009717	AGGGG	2	10	5215	5224	20 %	0 %	80 %	0 %	154243672
6	NC_009717	GTCGC	2	10	6485	6494	0 %	20 %	40 %	40 %	154243674
7	NC_009717	GGGAG	2	10	8611	8620	20 %	0 %	80 %	0 %	154243675
8	NC_009717	CCTGG	2	10	10206	10215	0 %	20 %	40 %	40 %	154243678
9	NC_009717	GGGCG	2	10	10380	10389	0 %	0 %	80 %	20 %	154243678
10	NC_009717	TCGGC	2	10	10933	10942	0 %	20 %	40 %	40 %	154243679
11	NC_009717	TGACC	2	10	11515	11524	20 %	20 %	20 %	40 %	154243680
12	NC_009717	CCGTT	2	10	14115	14124	0 %	40 %	20 %	40 %	154243682
13	NC_009717	CACGG	2	10	15608	15617	20 %	0 %	40 %	40 %	154243683
14	NC_009717	ACGAC	2	10	16284	16293	40 %	0 %	20 %	40 %	154243683
15	NC_009717	TGTCC	2	10	16324	16333	0 %	40 %	20 %	40 %	154243683
16	NC_009717	TCGCC	2	10	20624	20633	0 %	20 %	20 %	60 %	154243686
17	NC_009717	GAACG	2	10	20634	20643	40 %	0 %	40 %	20 %	154243686
18	NC_009717	TTTCG	2	10	20661	20670	0 %	60 %	20 %	20 %	154243686
19	NC_009717	CGGGA	2	10	20926	20935	20 %	0 %	60 %	20 %	154243687
20	NC_009717	CGGCG	2	10	21879	21888	0 %	0 %	60 %	40 %	154243688
21	NC_009717	CTCCA	2	10	27133	27142	20 %	20 %	0 %	60 %	154243693
22	NC_009717	GACGA	2	10	27189	27198	40 %	0 %	40 %	20 %	154243693
23	NC_009717	CCGGA	2	10	27274	27283	20 %	0 %	40 %	40 %	154243693
24	NC_009717	TGTTC	2	10	30727	30736	0 %	60 %	20 %	20 %	154243699
25	NC_009717	TGGTG	2	10	31676	31685	0 %	40 %	60 %	0 %	154243700
26	NC_009717	CAGGC	2	10	31778	31787	20 %	0 %	40 %	40 %	154243700
27	NC_009717	GGATG	2	10	31850	31859	20 %	20 %	60 %	0 %	154243700
28	NC_009717	CGTGC	2	10	33378	33387	0 %	20 %	40 %	40 %	154243701
29	NC_009717	TCGGC	2	10	36340	36349	0 %	20 %	40 %	40 %	154243702
30	NC_009717	CGAGG	2	10	38413	38422	20 %	0 %	60 %	20 %	154243704
31	NC_009717	CATGC	2	10	39173	39182	20 %	20 %	20 %	40 %	154243705
32	NC_009717	CGCGG	2	10	39590	39599	0 %	0 %	60 %	40 %	154243706
33	NC_009717	GCCGT	2	10	39915	39924	0 %	20 %	40 %	40 %	154243706
34	NC_009717	CAGCG	2	10	40388	40397	20 %	0 %	40 %	40 %	154243707
35	NC_009717	GGCGG	2	10	43128	43137	0 %	0 %	80 %	20 %	154243708
36	NC_009717	GTTCC	2	10	46138	46147	0 %	40 %	20 %	40 %	154243709
37	NC_009717	GCGCC	2	10	47505	47514	0 %	0 %	40 %	60 %	154243709
38	NC_009717	CGCGG	2	10	47840	47849	0 %	0 %	60 %	40 %	154243710
39	NC_009717	CCGGC	2	10	49573	49582	0 %	0 %	40 %	60 %	154243713
40	NC_009717	CGCCC	2	10	50594	50603	0 %	0 %	20 %	80 %	154243713
41	NC_009717	TCCAT	2	10	51700	51709	20 %	40 %	0 %	40 %	154243714
42	NC_009717	AGTGG	2	10	52522	52531	20 %	20 %	60 %	0 %	154243715
43	NC_009717	TGGCA	2	10	53360	53369	20 %	20 %	40 %	20 %	154243715
44	NC_009717	GCGCG	2	10	53819	53828	0 %	0 %	60 %	40 %	154243715
45	NC_009717	GCCGC	2	10	55661	55670	0 %	0 %	40 %	60 %	154243718
46	NC_009717	TGCGC	2	10	56021	56030	0 %	20 %	40 %	40 %	154243718
47	NC_009717	CGTCG	2	10	57690	57699	0 %	20 %	40 %	40 %	154243719
48	NC_009717	AAATA	2	10	58033	58042	80 %	20 %	0 %	0 %	154243719
49	NC_009717	GCGTG	2	10	64329	64338	0 %	20 %	60 %	20 %	154243722
50	NC_009717	AGCGA	2	10	64374	64383	40 %	0 %	40 %	20 %	154243722
51	NC_009717	TGCTC	2	10	65327	65336	0 %	40 %	20 %	40 %	154243723
52	NC_009717	GCCGC	2	10	65563	65572	0 %	0 %	40 %	60 %	154243723
53	NC_009717	GCCGT	2	10	65817	65826	0 %	20 %	40 %	40 %	154243723
54	NC_009717	GGACG	2	10	66467	66476	20 %	0 %	60 %	20 %	154243724
55	NC_009717	AGCGC	2	10	66896	66905	20 %	0 %	40 %	40 %	154243724
56	NC_009717	CGGAT	2	10	68697	68706	20 %	20 %	40 %	20 %	154243726
57	NC_009717	AGGCG	2	10	69780	69789	20 %	0 %	60 %	20 %	154243727
58	NC_009717	CACGC	2	10	70576	70585	20 %	0 %	20 %	60 %	154243727
59	NC_009717	GGTGG	2	10	71065	71074	0 %	20 %	80 %	0 %	154243728
60	NC_009717	GCCTC	2	10	71634	71643	0 %	20 %	20 %	60 %	154243728
61	NC_009717	GCGCG	2	10	77998	78007	0 %	0 %	60 %	40 %	154243736
62	NC_009717	TCCTG	2	10	78782	78791	0 %	40 %	20 %	40 %	154243737
63	NC_009717	CCGCC	2	10	82475	82484	0 %	0 %	20 %	80 %	154243740
64	NC_009717	TCGGC	2	10	82771	82780	0 %	20 %	40 %	40 %	154243741
65	NC_009717	CCTCG	2	10	85310	85319	0 %	20 %	20 %	60 %	154243743
66	NC_009717	GCCCG	2	10	87876	87885	0 %	0 %	40 %	60 %	154243745
67	NC_009717	CGGCT	2	10	88346	88355	0 %	20 %	40 %	40 %	154243745
68	NC_009717	CGGCG	2	10	89124	89133	0 %	0 %	60 %	40 %	154243745
69	NC_009717	TCGCC	2	10	91350	91359	0 %	20 %	20 %	60 %	154243747
70	NC_009717	TCGAA	2	10	93195	93204	40 %	20 %	20 %	20 %	154243749
71	NC_009717	ATCGC	2	10	95966	95975	20 %	20 %	20 %	40 %	154243751
72	NC_009717	TGACC	2	10	96626	96635	20 %	20 %	20 %	40 %	154243751
73	NC_009717	GCCAA	2	10	98437	98446	40 %	0 %	20 %	40 %	154243755
74	NC_009717	GTGCC	2	10	98919	98928	0 %	20 %	40 %	40 %	154243756
75	NC_009717	CGGAC	2	10	104598	104607	20 %	0 %	40 %	40 %	154243762
76	NC_009717	CCGGG	2	10	105597	105606	0 %	0 %	60 %	40 %	154243764
77	NC_009717	GCCCG	2	10	107213	107222	0 %	0 %	40 %	60 %	154243764
78	NC_009717	CGGCG	2	10	111326	111335	0 %	0 %	60 %	40 %	154243765
79	NC_009717	GCCGG	2	10	113258	113267	0 %	0 %	60 %	40 %	154243766
80	NC_009717	TCGCG	2	10	114893	114902	0 %	20 %	40 %	40 %	154243768
81	NC_009717	GCCGA	2	10	116664	116673	20 %	0 %	40 %	40 %	154243768
82	NC_009717	GCGCC	2	10	117563	117572	0 %	0 %	40 %	60 %	154243768
83	NC_009717	TGCCA	2	10	121557	121566	20 %	20 %	20 %	40 %	154243773
84	NC_009717	AGCGA	2	10	123881	123890	40 %	0 %	40 %	20 %	154243775
85	NC_009717	TCGCC	2	10	124409	124418	0 %	20 %	20 %	60 %	154243776
86	NC_009717	TGTCC	2	10	124920	124929	0 %	40 %	20 %	40 %	154243777
87	NC_009717	GCGCC	2	10	125363	125372	0 %	0 %	40 %	60 %	154243777
88	NC_009717	GCCGC	2	10	126644	126653	0 %	0 %	40 %	60 %	154243777
89	NC_009717	CCGCC	2	10	128607	128616	0 %	0 %	20 %	80 %	154243781
90	NC_009717	TGCCG	2	10	128796	128805	0 %	20 %	40 %	40 %	154243781
91	NC_009717	GCGTG	2	10	128999	129008	0 %	20 %	60 %	20 %	154243781
92	NC_009717	CAGAG	2	10	131559	131568	40 %	0 %	40 %	20 %	154243782
93	NC_009717	AGGCG	2	10	131764	131773	20 %	0 %	60 %	20 %	154243782
94	NC_009717	CGGCG	2	10	131923	131932	0 %	0 %	60 %	40 %	154243782
95	NC_009717	ACGAC	2	10	133173	133182	40 %	0 %	20 %	40 %	154243782
96	NC_009717	CGGCG	2	10	133693	133702	0 %	0 %	60 %	40 %	154243782
97	NC_009717	CAAGG	2	10	134214	134223	40 %	0 %	40 %	20 %	154243783
98	NC_009717	GCCTT	2	10	136768	136777	0 %	40 %	20 %	40 %	154243784
99	NC_009717	CGGCC	2	10	137402	137411	0 %	0 %	40 %	60 %	154243784
100	NC_009717	CGCGG	2	10	138500	138509	0 %	0 %	60 %	40 %	154243785
101	NC_009717	ATCGG	2	10	139577	139586	20 %	20 %	40 %	20 %	154243787
102	NC_009717	GGCGG	2	10	140129	140138	0 %	0 %	80 %	20 %	154243787
103	NC_009717	GCACC	2	10	140304	140313	20 %	0 %	20 %	60 %	154243788
104	NC_009717	GAGGC	2	10	143588	143597	20 %	0 %	60 %	20 %	154243789
105	NC_009717	CAAGC	2	10	144749	144758	40 %	0 %	20 %	40 %	154243790
106	NC_009717	ACGAA	2	10	144795	144804	60 %	0 %	20 %	20 %	154243790
107	NC_009717	GAGCT	2	10	148360	148369	20 %	20 %	40 %	20 %	154243794
108	NC_009717	TCGGC	2	10	148980	148989	0 %	20 %	40 %	40 %	154243794
109	NC_009717	GTTTC	2	10	150083	150092	0 %	60 %	20 %	20 %	154243795
110	NC_009717	GCCCG	2	10	153338	153347	0 %	0 %	40 %	60 %	154243796
111	NC_009717	GCTGA	2	10	157589	157598	20 %	20 %	40 %	20 %	154243800
112	NC_009717	CGCCT	2	10	158399	158408	0 %	20 %	20 %	60 %	154243800
113	NC_009717	CGGCG	2	10	158578	158587	0 %	0 %	60 %	40 %	154243800
114	NC_009717	GCCGC	2	10	159298	159307	0 %	0 %	40 %	60 %	154243801
115	NC_009717	CCGGT	2	10	159948	159957	0 %	20 %	40 %	40 %	154243801
116	NC_009717	GCGCG	2	10	163484	163493	0 %	0 %	60 %	40 %	154243805
117	NC_009717	CCGAC	2	10	166267	166276	20 %	0 %	20 %	60 %	154243809
118	NC_009717	CTGTC	2	10	169894	169903	0 %	40 %	20 %	40 %	154243814
119	NC_009717	GCGCC	2	10	170700	170709	0 %	0 %	40 %	60 %	154243815
120	NC_009717	CGGGC	2	10	172082	172091	0 %	0 %	60 %	40 %	154243816
121	NC_009717	CAATT	2	10	174338	174347	40 %	40 %	0 %	20 %	154243817
122	NC_009717	GCGCG	2	10	175951	175960	0 %	0 %	60 %	40 %	154243820
123	NC_009717	GGCAC	2	10	179516	179525	20 %	0 %	40 %	40 %	154243824
124	NC_009717	CGCGG	2	10	181362	181371	0 %	0 %	60 %	40 %	154243825
125	NC_009717	TCGCC	2	10	181387	181396	0 %	20 %	20 %	60 %	154243825
126	NC_009717	CGGCC	2	10	181851	181860	0 %	0 %	40 %	60 %	154243826
127	NC_009717	GGCCC	2	10	181905	181914	0 %	0 %	40 %	60 %	154243826
128	NC_009717	CCGGC	2	10	183174	183183	0 %	0 %	40 %	60 %	154243828
129	NC_009717	GGGCG	2	10	184937	184946	0 %	0 %	80 %	20 %	154243829
130	NC_009717	CGATG	2	10	186430	186439	20 %	20 %	40 %	20 %	154243831
131	NC_009717	GACCG	2	10	192733	192742	20 %	0 %	40 %	40 %	154243836
132	NC_009717	GATCA	2	10	193372	193381	40 %	20 %	20 %	20 %	154243836
133	NC_009717	AGGCA	2	10	194455	194464	40 %	0 %	40 %	20 %	154243836
134	NC_009717	ACGAG	2	10	195574	195583	40 %	0 %	40 %	20 %	154243837
135	NC_009717	CTTGC	2	10	197116	197125	0 %	40 %	20 %	40 %	154243839
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.