MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter curvus 525.92 chromosome

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009715	ATGACG	2	12	31256	31267	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009715	AAATAA	2	12	54767	54778	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009715	AGCAAA	2	12	58968	58979	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009715	CACGCT	2	12	69352	69363	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009715	AAATTT	2	12	74953	74964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009715	TTTATT	2	12	81222	81233	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009715	TTGAGC	2	12	83480	83491	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_009715	TTCGTG	2	12	83929	83940	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_009715	AATTTT	2	12	86132	86143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009715	CTTTTA	2	12	120904	120915	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009715	ATAAAA	2	12	126194	126205	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009715	CCGGCA	2	12	131781	131792	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009715	AAGAGC	2	12	131936	131947	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_009715	TTTAAA	2	12	183430	183441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009715	TGCGGT	2	12	191642	191653	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_009715	TAAATT	2	12	201771	201782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009715	CAAAAA	2	12	233321	233332	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009715	TGAAAA	2	12	249941	249952	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009715	AATTTA	2	12	256161	256172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009715	AAATTT	2	12	323603	323614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009715	AATTTA	2	12	332965	332976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009715	TATGAT	2	12	357662	357673	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009715	GATTTA	2	12	364661	364672	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009715	AAATTT	2	12	376326	376337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009715	GGTATA	2	12	378039	378050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009715	TTTGGC	2	12	378624	378635	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_009715	AATTTA	2	12	396975	396986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009715	AGGATA	2	12	492055	492066	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009715	AATAAA	2	12	573041	573052	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009715	TGTAAA	2	12	606546	606557	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009715	TTCTCT	2	12	629771	629782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009715	AAATTT	2	12	631669	631680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009715	CTGGTG	2	12	631684	631695	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_009715	TTTAAA	2	12	633792	633803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009715	ATTTAA	2	12	634257	634268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009715	TTTAAA	2	12	644251	644262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009715	AAAGAT	2	12	685487	685498	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009715	CGGCTG	2	12	745354	745365	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009715	CGATGA	2	12	747013	747024	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_009715	GCGAGT	2	12	755017	755028	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_009715	TAAAAT	2	12	764100	764111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009715	TTTAAG	2	12	775714	775725	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009715	ATTTAA	2	12	797966	797977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009715	TTGTAG	2	12	801299	801310	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009715	TTGTAG	2	12	807059	807070	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009715	ATTTAA	2	12	828293	828304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009715	GGTATC	2	12	866730	866741	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009715	AATTTA	2	12	912292	912303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009715	CTGAAA	2	12	915571	915582	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_009715	TTTATT	2	12	917819	917830	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009715	AGCGCA	2	12	981860	981871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009715	TCGGGC	2	12	982368	982379	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009715	TACTTT	2	12	991606	991617	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_009715	AAGCCA	2	12	1001579	1001590	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009715	CAAAGC	2	12	1003788	1003799	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009715	AAAATA	2	12	1011921	1011932	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009715	TATAAA	2	12	1012326	1012337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009715	TCGTTT	2	12	1020683	1020694	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_009715	CTCTAT	2	12	1020919	1020930	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009715	GAATTT	2	12	1047187	1047198	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009715	ATCGCG	2	12	1074098	1074109	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009715	TCGAGA	2	12	1074534	1074545	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_009715	AACAAA	2	12	1192435	1192446	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_009715	CTATAA	2	12	1220759	1220770	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_009715	CAAAAT	2	12	1245819	1245830	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009715	GCCTTT	2	12	1245876	1245887	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009715	GATCTC	2	12	1286964	1286975	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009715	TGCTTT	2	12	1294109	1294120	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_009715	GATCTT	2	12	1297016	1297027	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_009715	TTTTGG	2	12	1339281	1339292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009715	ATTTTA	2	12	1402200	1402211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009715	AGGCAA	2	12	1426329	1426340	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_009715	TGATTT	2	12	1477985	1477996	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009715	TCGTTA	2	12	1490649	1490660	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_009715	GTCCGC	2	12	1509392	1509403	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009715	TGTCCG	2	12	1509640	1509651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009715	ATTTTG	2	12	1610359	1610370	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009715	TTTTTC	2	12	1612857	1612868	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_009715	CGCTCA	2	12	1661599	1661610	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009715	GATTTT	2	12	1666525	1666536	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009715	CGGAAA	2	12	1680225	1680236	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_009715	ACCGCC	2	12	1712651	1712662	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_009715	AAATTT	2	12	1718408	1718419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009715	TAAATT	2	12	1718454	1718465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009715	TTAAAA	2	12	1719068	1719079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009715	ATTTTT	2	12	1726600	1726611	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009715	TTGGGC	2	12	1748540	1748551	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_009715	TAAAAA	2	12	1751931	1751942	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009715	CCTTGC	2	12	1759695	1759706	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009715	GATAAG	2	12	1790686	1790697	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009715	ATGCCC	2	12	1819167	1819178	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009715	TTTTAG	2	12	1933398	1933409	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009715	TTTGAT	2	12	1938238	1938249	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009715	GAAATA	2	12	1941763	1941774	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.