MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter hominis ATCC BAA-381

Total Repeats: 180

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009714	TTTTTA	2	12	8579	8590	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009714	TTTTGT	2	12	25976	25987	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009714	AATTTT	2	12	31378	31389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009714	ATTTTT	2	12	31521	31532	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009714	TAAAAA	2	12	31629	31640	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009714	ATTTTA	2	12	34387	34398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009714	AAATTT	2	12	37593	37604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009714	GAAAAA	2	12	42938	42949	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009714	TAAAAT	2	12	50882	50893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009714	TGAAAA	2	12	53662	53673	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009714	CAATAA	2	12	58479	58490	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_009714	TAAAGA	2	12	63867	63878	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009714	TAGTTT	2	12	65232	65243	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009714	TATAAA	2	12	65256	65267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009714	AAATTA	2	12	73866	73877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009714	ATTAAG	2	12	74957	74968	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009714	GCAAAG	2	12	98888	98899	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009714	AAGTTT	2	12	118848	118859	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009714	TAAATT	2	12	118933	118944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009714	CTTTTT	2	12	119399	119410	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_009714	AAAAGA	2	12	119924	119935	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009714	AGAAAA	3	18	120548	120565	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009714	GATAAA	2	12	120812	120823	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009714	AAAAAT	3	18	129867	129884	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009714	TGATGT	2	12	132167	132178	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009714	AAATTT	2	12	207033	207044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009714	ATTTTA	2	12	207131	207142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009714	AAATAT	2	12	280378	280389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009714	AATTTA	2	12	284324	284335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009714	ATGGAC	2	12	295606	295617	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_009714	CCTTTG	2	12	300894	300905	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009714	AAATTT	2	12	307786	307797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009714	TTTTTG	2	12	307853	307864	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009714	AATTAA	2	12	307873	307884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009714	ATTTAA	2	12	329549	329560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009714	CAATAA	2	12	332939	332950	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_009714	ATTAAT	2	12	333570	333581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009714	ACTATA	2	12	350035	350046	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_009714	TTTAAG	2	12	350112	350123	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009714	TTTAAA	2	12	363747	363758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009714	AAATTT	2	12	375381	375392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009714	GCAAGA	2	12	383646	383657	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_009714	TTAAAG	2	12	389277	389288	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009714	ATTTTT	2	12	391294	391305	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009714	AAATAA	2	12	397034	397045	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009714	AAATTT	2	12	400074	400085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009714	TGCAAT	2	12	410731	410742	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009714	AAATTA	2	12	412991	413002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009714	GTAGTG	2	12	414283	414294	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009714	ATTTAA	2	12	415123	415134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009714	CAATAA	2	12	419729	419740	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_009714	TTAATA	2	12	420063	420074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009714	AGATAA	2	12	422530	422541	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009714	ATTTAT	2	12	438327	438338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009714	ATTTAA	2	12	455938	455949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009714	ATAACT	2	12	457798	457809	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_009714	TTTTAA	2	12	516989	517000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009714	AAAAAT	2	12	520162	520173	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009714	CAAATT	2	12	538239	538250	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_009714	AAATTT	2	12	538301	538312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009714	TATTGT	2	12	541340	541351	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009714	CAAATT	2	12	547759	547770	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_009714	AAATTC	2	12	549940	549951	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_009714	TAAATT	2	12	550020	550031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009714	TTGTAT	2	12	572466	572477	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009714	TAAAAG	2	12	576049	576060	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009714	TCCATT	2	12	578512	578523	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009714	TTCATA	2	12	578595	578606	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_009714	TATTAA	2	12	579767	579778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009714	TAAAAA	2	12	592050	592061	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009714	TTTTTA	2	12	592647	592658	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009714	TTTTTA	2	12	611729	611740	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009714	AAGAAA	2	12	622136	622147	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009714	AAATGA	2	12	647989	648000	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009714	ATAAAA	2	12	648073	648084	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009714	TTTAAA	2	12	648518	648529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009714	ATTTTA	2	12	666277	666288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009714	GATTTT	2	12	686542	686553	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009714	TTAAAA	2	12	726618	726629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009714	TCTTTT	2	12	730103	730114	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_009714	AAATTT	2	12	730499	730510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009714	GCTTTT	2	12	730946	730957	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_009714	AGTAAA	2	12	734751	734762	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009714	AAATTT	2	12	734893	734904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009714	AAATTT	2	12	755160	755171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009714	AATTAA	2	12	755291	755302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009714	AAATTT	2	12	763975	763986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009714	ATTTTT	2	12	764159	764170	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009714	TCTTGC	2	12	764665	764676	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009714	AAATTT	2	12	819938	819949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009714	ATTTTT	2	12	850879	850890	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009714	TAAAAA	2	12	851101	851112	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009714	TATTTT	2	12	851123	851134	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009714	ATAAAA	2	12	876182	876193	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009714	TAAAAA	2	12	927803	927814	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009714	AAATTT	2	12	933358	933369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009714	AATTTT	2	12	942857	942868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009714	CTTGCG	2	12	962740	962751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009714	TTTCGT	2	12	963253	963264	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_009714	TACCTT	2	12	982533	982544	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009714	AATTAA	2	12	997042	997053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009714	TGTATC	2	12	1020059	1020070	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_009714	TTTACC	2	12	1029382	1029393	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009714	GCTCAA	2	12	1030848	1030859	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009714	ATTTAT	2	12	1031343	1031354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009714	TATTTT	2	12	1035083	1035094	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009714	TCTTTA	2	12	1083484	1083495	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_009714	ATCTAT	2	12	1091127	1091138	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_009714	CTGTAA	2	12	1091225	1091236	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_009714	TTATCT	2	12	1091844	1091855	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_009714	AAAATT	2	12	1096926	1096937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009714	CAAAAT	2	12	1100211	1100222	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_009714	TTAAAC	2	12	1103915	1103926	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_009714	TAAAAA	2	12	1110862	1110873	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009714	AAATTT	2	12	1120104	1120115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009714	TTTCAT	2	12	1120359	1120370	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_009714	CAAATT	2	12	1127255	1127266	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_009714	AAATTC	2	12	1130193	1130204	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_009714	AATTTA	2	12	1137194	1137205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009714	AAAATA	2	12	1142675	1142686	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009714	TAAAAT	2	12	1151089	1151100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009714	TTTTTG	2	12	1178955	1178966	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009714	AAAAAC	2	12	1187222	1187233	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_009714	AATAAA	2	12	1192014	1192025	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009714	AAATAA	2	12	1265911	1265922	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009714	ATTTCT	2	12	1266170	1266181	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_009714	TTGTTT	2	12	1266182	1266193	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009714	ATTTTT	2	12	1266269	1266280	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009714	AATTTT	2	12	1270785	1270796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009714	ATTAAA	2	12	1275464	1275475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009714	TAAAAT	2	12	1277984	1277995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009714	TACAAA	2	12	1295611	1295622	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_009714	AACAAA	2	12	1296730	1296741	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.