MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter hominis ATCC BAA-381

Total Repeats: 410

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009714	TATTT	2	10	9250	9259	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009714	TAATT	2	10	9272	9281	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009714	TAAAA	2	10	14837	14846	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009714	ATAAA	2	10	14851	14860	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009714	ATTTA	2	10	34407	34416	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009714	AAATT	2	10	40764	40773	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009714	TAAAA	2	10	40980	40989	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009714	ACATA	2	10	41636	41645	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009714	AACTT	2	10	41746	41755	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009714	ATTTC	2	10	45331	45340	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009714	CAAAG	2	10	51642	51651	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009714	TCAAT	2	10	51824	51833	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009714	ATTTT	2	10	53545	53554	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009714	TAAAA	2	10	53758	53767	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009714	ATTTA	2	10	55213	55222	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009714	CCGTA	2	10	57161	57170	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009714	CTTAT	2	10	58438	58447	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009714	ATTTT	2	10	66033	66042	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009714	ATTTT	2	10	71889	71898	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009714	CAATT	2	10	71948	71957	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009714	AAGTA	2	10	72453	72462	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009714	GGTAA	2	10	72510	72519	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009714	TCGTG	2	10	73306	73315	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009714	AATAA	2	10	74044	74053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009714	TAAAT	3	15	74969	74983	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009714	TAGCG	2	10	75024	75033	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009714	TTTTA	2	10	91398	91407	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009714	ATTTT	2	10	101374	101383	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009714	ATTTT	2	10	109725	109734	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009714	AAATT	2	10	113300	113309	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009714	AAATT	2	10	113329	113338	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009714	AGTTT	2	10	119141	119150	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009714	AAAAT	2	10	120669	120678	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009714	AAGAA	2	10	120760	120769	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009714	AAGAA	2	10	125956	125965	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009714	AAAAT	2	10	126830	126839	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009714	ATAAA	2	10	128171	128180	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009714	TATAT	2	10	131842	131851	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009714	TTTAT	2	10	133372	133381	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009714	ATTAA	2	10	133382	133391	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009714	ATAAA	2	10	136673	136682	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009714	ATTTT	2	10	176299	176308	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009714	TTAAA	2	10	176395	176404	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009714	TCTTA	2	10	182179	182188	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_009714	TGAAA	2	10	182251	182260	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009714	TTTCA	2	10	185905	185914	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009714	AATTT	2	10	186359	186368	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009714	ATTTA	2	10	187813	187822	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009714	ATTTT	2	10	188822	188831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009714	GGCGC	2	10	206093	206102	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_009714	TAAAA	2	10	206313	206322	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009714	TATAA	2	10	206577	206586	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009714	TAAAA	2	10	206847	206856	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009714	AAAAT	2	10	211723	211732	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009714	GTTTA	2	10	227789	227798	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009714	AATCA	2	10	234628	234637	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_009714	TGCTT	2	10	234674	234683	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_009714	TCAAA	2	10	234710	234719	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009714	AAAAG	2	10	241021	241030	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009714	TAATT	2	10	242433	242442	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009714	TTTTG	2	10	259208	259217	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009714	AAATT	2	10	272956	272965	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009714	TGAAA	2	10	280158	280167	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009714	AAATT	2	10	284235	284244	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009714	TTAAA	2	10	293455	293464	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009714	AGGAA	2	10	296423	296432	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009714	AAAGA	2	10	296556	296565	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009714	TCTTT	2	10	305528	305537	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009714	TTTAA	2	10	305566	305575	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009714	TTTTA	2	10	308022	308031	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009714	AATTT	2	10	312592	312601	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009714	ATGTT	2	10	312650	312659	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009714	TTGTT	2	10	322069	322078	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009714	AATCT	2	10	322111	322120	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_009714	ATATA	2	10	322161	322170	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009714	TGTTT	2	10	325630	325639	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009714	ATATT	2	10	329563	329572	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009714	ATTTA	2	10	329673	329682	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009714	CCGTA	2	10	331621	331630	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_009714	CTTAT	2	10	332898	332907	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009714	AAAAT	2	10	333482	333491	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009714	TATTT	2	10	333496	333505	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009714	ATTTT	2	10	334469	334478	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009714	AAATT	2	10	339117	339126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009714	TCAAA	2	10	342989	342998	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_009714	TAAAA	2	10	346939	346948	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009714	TAAAA	2	10	348795	348804	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009714	ATTTT	2	10	354055	354064	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009714	GAAAT	2	10	355204	355213	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009714	ATGTT	2	10	355259	355268	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009714	TTTAA	2	10	355397	355406	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009714	TAATT	2	10	356024	356033	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009714	ATTTT	2	10	373216	373225	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009714	TTTAA	2	10	374101	374110	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009714	AAATT	2	10	397143	397152	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009714	TAAAA	2	10	399673	399682	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009714	TAAAA	3	15	407808	407822	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009714	TAAAA	2	10	407974	407983	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009714	AAATT	2	10	407989	407998	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009714	TTAAA	2	10	408066	408075	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009714	CTTGC	2	10	410871	410880	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_009714	AAATA	2	10	410881	410890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009714	ATTTT	2	10	411014	411023	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009714	CAATT	2	10	411073	411082	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_009714	AAGTA	2	10	411578	411587	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009714	GGTAA	2	10	411635	411644	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009714	TCGTG	2	10	412431	412440	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_009714	AATAA	2	10	413169	413178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009714	AAGAA	2	10	414153	414162	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009714	AAGTC	2	10	414297	414306	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_009714	ATAAA	2	10	414805	414814	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009714	TAAAT	2	10	415202	415211	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009714	AATTT	2	10	416374	416383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009714	ATTTA	2	10	416463	416472	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009714	CCGTA	2	10	418411	418420	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_009714	CTTAT	2	10	419688	419697	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009714	TACAA	2	10	438286	438295	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_009714	AATAA	2	10	456178	456187	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009714	TAAAT	2	10	456705	456714	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009714	TATTT	2	10	467431	467440	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009714	TATAA	2	10	475644	475653	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009714	TATTT	2	10	475750	475759	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009714	TAAAA	2	10	499445	499454	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009714	ATTTA	2	10	502576	502585	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009714	TTATT	2	10	502606	502615	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009714	TAAAA	2	10	510607	510616	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009714	TAAAA	3	15	510665	510679	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009714	TATAA	2	10	526995	527004	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009714	ATTTT	2	10	527005	527014	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009714	AATAA	2	10	536320	536329	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009714	AATAC	2	10	536511	536520	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_009714	ATATG	2	10	536571	536580	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009714	TACGA	2	10	538271	538280	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_009714	AAAAT	2	10	554222	554231	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009714	TTTTA	2	10	554746	554755	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009714	AAATA	2	10	554959	554968	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009714	ATAAA	2	10	565034	565043	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009714	TTATT	2	10	570052	570061	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009714	GTGAT	2	10	570078	570087	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009714	ATCAA	2	10	571297	571306	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_009714	CTTTT	2	10	579911	579920	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_009714	TTAAA	2	10	592236	592245	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009714	TTAAA	2	10	607146	607155	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009714	AAAAT	2	10	616834	616843	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009714	AAATT	2	10	622349	622358	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009714	ACATT	2	10	622487	622496	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_009714	TTGAT	2	10	623002	623011	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009714	TTTAA	2	10	643092	643101	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009714	AATAA	2	10	643194	643203	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.