MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanoregula boonei 6A8 chromosome

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009712	TAAAAA	2	12	190	201	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009712	AACCGG	2	12	8415	8426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009712	AGGGGG	2	12	26624	26635	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009712	ATCACC	2	12	92155	92166	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009712	CTGCCC	2	12	128343	128354	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_009712	CCGGCC	2	12	142666	142677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_009712	TGCCGG	2	12	168057	168068	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009712	CTCTTT	2	12	197595	197606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009712	ACAAAA	2	12	259254	259265	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009712	CCGGAC	2	12	267094	267105	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009712	TTTGTT	2	12	271613	271624	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009712	TGCCGG	2	12	294710	294721	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009712	CCCCTG	2	12	303702	303713	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_009712	TTTTTA	2	12	368730	368741	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009712	GCCCCT	2	12	384945	384956	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_009712	CCTCAA	2	12	424048	424059	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009712	AAAACA	2	12	479402	479413	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009712	GGTAAC	2	12	490099	490110	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_009712	TCTCCG	2	12	549067	549078	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009712	TTACAC	2	12	688232	688243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009712	GCTCCC	2	12	699701	699712	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_009712	ATGAAA	2	12	709790	709801	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009712	CACAAC	2	12	710032	710043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009712	TCCATA	2	12	717816	717827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009712	GTTGCG	2	12	756837	756848	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_009712	GGGGAG	2	12	768295	768306	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009712	TGAAAC	2	12	805497	805508	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_009712	TGATCG	2	12	830926	830937	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_009712	CCTGCA	2	12	847705	847716	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009712	TCCGGG	2	12	847815	847826	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009712	ATTTTT	2	12	856855	856866	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009712	GTATAT	2	12	859364	859375	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009712	TGGAAG	2	12	899642	899653	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009712	ATCGTT	2	12	931538	931549	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_009712	AAAAAT	2	12	962760	962771	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009712	TCCCCG	2	12	970873	970884	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_009712	ATCCCG	2	12	975060	975071	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009712	GATTGA	2	12	1062878	1062889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009712	ACCCCC	2	12	1077422	1077433	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
40	NC_009712	TACCGA	2	12	1096520	1096531	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009712	TTTTCC	2	12	1138077	1138088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009712	GAGGGG	2	12	1187078	1187089	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009712	GATCTG	2	12	1191250	1191261	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_009712	GCCCAT	2	12	1197168	1197179	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009712	GTGAAA	2	12	1278706	1278717	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009712	GCCTGA	2	12	1279951	1279962	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009712	GGGGGA	2	12	1315564	1315575	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009712	ACCGCG	2	12	1324621	1324632	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009712	TATCCT	2	12	1376920	1376931	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009712	AGGGAA	2	12	1391364	1391375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009712	ATTTTT	2	12	1529957	1529968	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009712	GCACCA	2	12	1566357	1566368	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009712	CTCATC	2	12	1603203	1603214	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009712	TCTTTT	2	12	1612041	1612052	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_009712	GATAGG	2	12	1620831	1620842	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009712	GGGGTA	2	12	1671322	1671333	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009712	TCATCG	2	12	1703837	1703848	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009712	CAGGAT	2	12	1730171	1730182	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_009712	GTCCGG	2	12	1755720	1755731	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009712	TGTACC	2	12	1760806	1760817	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009712	GTCCAC	2	12	1786009	1786020	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009712	GAAAAA	2	12	1790891	1790902	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009712	CCCCGG	2	12	1804367	1804378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_009712	ATATCC	2	12	1858680	1858691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009712	ATGGGG	2	12	1862050	1862061	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009712	CCGATC	2	12	1931436	1931447	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009712	TGCCGG	2	12	1935756	1935767	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009712	CTGCTC	2	12	1993695	1993706	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009712	ATGCAG	2	12	2022167	2022178	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_009712	CCGGAT	2	12	2087627	2087638	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009712	TAATTA	2	12	2124938	2124949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009712	GTGAAA	2	12	2155589	2155600	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009712	CCTGAT	2	12	2252542	2252553	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009712	TTTTTG	2	12	2253941	2253952	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009712	CTTTTT	2	12	2339838	2339849	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_009712	GGGAAC	2	12	2356596	2356607	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_009712	ACCCCC	2	12	2367783	2367794	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
78	NC_009712	GGGGCG	2	12	2396928	2396939	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_009712	TTTTCT	2	12	2471134	2471145	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_009712	AATCCA	2	12	2486244	2486255	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009712	GTGACG	2	12	2512727	2512738	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_009712	TGATTC	2	12	2542906	2542917	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.