MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanoregula boonei 6A8 chromosome

Total Repeats: 1560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009712	GATCT	2	10	1432	1441	20 %	40 %	20 %	20 %	154149550
2	NC_009712	GATGA	2	10	2413	2422	40 %	20 %	40 %	0 %	154149552
3	NC_009712	CTCCG	2	10	2980	2989	0 %	20 %	20 %	60 %	154149552
4	NC_009712	CGGCC	2	10	3805	3814	0 %	0 %	40 %	60 %	154149553
5	NC_009712	CAGTC	2	10	4363	4372	20 %	20 %	20 %	40 %	154149553
6	NC_009712	CCCGG	2	10	5815	5824	0 %	0 %	40 %	60 %	154149556
7	NC_009712	TTATT	2	10	6096	6105	20 %	80 %	0 %	0 %	154149556
8	NC_009712	GCGAT	2	10	6960	6969	20 %	20 %	40 %	20 %	154149557
9	NC_009712	GGGCC	2	10	7854	7863	0 %	0 %	60 %	40 %	154149559
10	NC_009712	TGCGG	2	10	8303	8312	0 %	20 %	60 %	20 %	154149559
11	NC_009712	GCCAC	2	10	10663	10672	20 %	0 %	20 %	60 %	154149563
12	NC_009712	GGGTA	2	10	14761	14770	20 %	20 %	60 %	0 %	154149568
13	NC_009712	TCCCG	2	10	15787	15796	0 %	20 %	20 %	60 %	154149571
14	NC_009712	GTCCA	2	10	15905	15914	20 %	20 %	20 %	40 %	154149571
15	NC_009712	CGATG	2	10	16549	16558	20 %	20 %	40 %	20 %	154149571
16	NC_009712	GGCAG	2	10	16689	16698	20 %	0 %	60 %	20 %	154149571
17	NC_009712	GCCGT	2	10	18817	18826	0 %	20 %	40 %	40 %	154149572
18	NC_009712	GAACC	2	10	18856	18865	40 %	0 %	20 %	40 %	154149572
19	NC_009712	ACTGC	2	10	19762	19771	20 %	20 %	20 %	40 %	154149572
20	NC_009712	TGGTG	2	10	20675	20684	0 %	40 %	60 %	0 %	154149573
21	NC_009712	TACCT	2	10	21261	21270	20 %	40 %	0 %	40 %	154149573
22	NC_009712	CATCG	2	10	21557	21566	20 %	20 %	20 %	40 %	154149573
23	NC_009712	GCCCG	2	10	23676	23685	0 %	0 %	40 %	60 %	154149575
24	NC_009712	AAAGA	2	10	25466	25475	80 %	0 %	20 %	0 %	154149578
25	NC_009712	CATTG	2	10	25981	25990	20 %	40 %	20 %	20 %	154149579
26	NC_009712	GGGCA	2	10	29287	29296	20 %	0 %	60 %	20 %	154149583
27	NC_009712	GGCCC	2	10	29496	29505	0 %	0 %	40 %	60 %	154149583
28	NC_009712	ATGTG	2	10	30530	30539	20 %	40 %	40 %	0 %	154149583
29	NC_009712	ACGGA	2	10	30729	30738	40 %	0 %	40 %	20 %	154149583
30	NC_009712	ATCAT	2	10	31285	31294	40 %	40 %	0 %	20 %	154149584
31	NC_009712	TCGGT	2	10	33382	33391	0 %	40 %	40 %	20 %	154149586
32	NC_009712	CCGGG	2	10	34936	34945	0 %	0 %	60 %	40 %	154149587
33	NC_009712	TGCCG	2	10	37807	37816	0 %	20 %	40 %	40 %	154149592
34	NC_009712	ACCTG	2	10	38372	38381	20 %	20 %	20 %	40 %	154149592
35	NC_009712	CATCC	2	10	43526	43535	20 %	20 %	0 %	60 %	154149598
36	NC_009712	TCCCG	2	10	43683	43692	0 %	20 %	20 %	60 %	154149598
37	NC_009712	GGACA	2	10	44527	44536	40 %	0 %	40 %	20 %	154149599
38	NC_009712	ATAAA	2	10	46247	46256	80 %	20 %	0 %	0 %	154149600
39	NC_009712	GAGCG	2	10	50633	50642	20 %	0 %	60 %	20 %	154149606
40	NC_009712	GCCCG	2	10	52284	52293	0 %	0 %	40 %	60 %	154149607
41	NC_009712	GCTCG	2	10	57252	57261	0 %	20 %	40 %	40 %	154149612
42	NC_009712	GACGG	2	10	58292	58301	20 %	0 %	60 %	20 %	154149613
43	NC_009712	CCCGG	2	10	58519	58528	0 %	0 %	40 %	60 %	154149613
44	NC_009712	CCGAT	2	10	60481	60490	20 %	20 %	20 %	40 %	154149615
45	NC_009712	TCCCG	2	10	60936	60945	0 %	20 %	20 %	60 %	154149615
46	NC_009712	TTGCC	2	10	61048	61057	0 %	40 %	20 %	40 %	154149615
47	NC_009712	CGTGC	2	10	62279	62288	0 %	20 %	40 %	40 %	154149616
48	NC_009712	CCCCG	2	10	63232	63241	0 %	0 %	20 %	80 %	154149617
49	NC_009712	GGCCA	2	10	63785	63794	20 %	0 %	40 %	40 %	154149617
50	NC_009712	TCGTG	2	10	65714	65723	0 %	40 %	40 %	20 %	154149620
51	NC_009712	GGGGA	2	10	66279	66288	20 %	0 %	80 %	0 %	154149620
52	NC_009712	GGCCC	2	10	67264	67273	0 %	0 %	40 %	60 %	154149622
53	NC_009712	GCCGG	2	10	68868	68877	0 %	0 %	60 %	40 %	154149624
54	NC_009712	GTCCT	2	10	69033	69042	0 %	40 %	20 %	40 %	154149624
55	NC_009712	ACCTG	2	10	72670	72679	20 %	20 %	20 %	40 %	154149630
56	NC_009712	TACGG	2	10	74630	74639	20 %	20 %	40 %	20 %	154149632
57	NC_009712	GCCTG	2	10	76166	76175	0 %	20 %	40 %	40 %	154149633
58	NC_009712	CCGGT	2	10	79432	79441	0 %	20 %	40 %	40 %	154149635
59	NC_009712	CGCCC	2	10	79605	79614	0 %	0 %	20 %	80 %	154149635
60	NC_009712	GCAGG	2	10	79979	79988	20 %	0 %	60 %	20 %	154149636
61	NC_009712	ACTGC	2	10	80075	80084	20 %	20 %	20 %	40 %	154149636
62	NC_009712	GGCGA	2	10	80380	80389	20 %	0 %	60 %	20 %	154149636
63	NC_009712	GCGGA	2	10	80511	80520	20 %	0 %	60 %	20 %	154149636
64	NC_009712	GGCCG	2	10	81151	81160	0 %	0 %	60 %	40 %	154149636
65	NC_009712	CCGGC	2	10	81791	81800	0 %	0 %	40 %	60 %	154149637
66	NC_009712	CGTCC	2	10	81815	81824	0 %	20 %	20 %	60 %	154149637
67	NC_009712	CCTGC	2	10	82585	82594	0 %	20 %	20 %	60 %	154149638
68	NC_009712	GGCCG	2	10	83052	83061	0 %	0 %	60 %	40 %	154149639
69	NC_009712	CGGAA	2	10	84188	84197	40 %	0 %	40 %	20 %	154149641
70	NC_009712	GCGGG	2	10	88201	88210	0 %	0 %	80 %	20 %	154149647
71	NC_009712	ATGCC	2	10	89492	89501	20 %	20 %	20 %	40 %	154149649
72	NC_009712	CCGGG	2	10	89760	89769	0 %	0 %	60 %	40 %	154149649
73	NC_009712	GATCG	2	10	90030	90039	20 %	20 %	40 %	20 %	154149649
74	NC_009712	GCGCT	2	10	96460	96469	0 %	20 %	40 %	40 %	154149654
75	NC_009712	CTGCT	2	10	99378	99387	0 %	40 %	20 %	40 %	154149657
76	NC_009712	GCCCG	2	10	100046	100055	0 %	0 %	40 %	60 %	154149657
77	NC_009712	AACCG	2	10	101527	101536	40 %	0 %	20 %	40 %	154149659
78	NC_009712	CGGCT	2	10	101957	101966	0 %	20 %	40 %	40 %	154149660
79	NC_009712	CCGGG	2	10	102028	102037	0 %	0 %	60 %	40 %	154149660
80	NC_009712	CGGGC	2	10	102264	102273	0 %	0 %	60 %	40 %	154149660
81	NC_009712	GGGAC	2	10	103704	103713	20 %	0 %	60 %	20 %	154149662
82	NC_009712	TCTGC	2	10	107362	107371	0 %	40 %	20 %	40 %	154149666
83	NC_009712	GCGGA	2	10	110155	110164	20 %	0 %	60 %	20 %	154149669
84	NC_009712	AAGGT	2	10	110476	110485	40 %	20 %	40 %	0 %	154149669
85	NC_009712	GGGCG	2	10	111294	111303	0 %	0 %	80 %	20 %	154149671
86	NC_009712	CCTGG	2	10	112796	112805	0 %	20 %	40 %	40 %	154149672
87	NC_009712	GCTCC	2	10	117140	117149	0 %	20 %	20 %	60 %	154149675
88	NC_009712	CCGGC	2	10	118202	118211	0 %	0 %	40 %	60 %	154149675
89	NC_009712	CAGCT	2	10	121740	121749	20 %	20 %	20 %	40 %	154149676
90	NC_009712	CCGTT	2	10	121870	121879	0 %	40 %	20 %	40 %	154149676
91	NC_009712	CGGTG	2	10	122096	122105	0 %	20 %	60 %	20 %	154149676
92	NC_009712	ATGAT	2	10	122626	122635	40 %	40 %	20 %	0 %	154149676
93	NC_009712	CCGGT	2	10	126590	126599	0 %	20 %	40 %	40 %	154149681
94	NC_009712	AACTC	2	10	126751	126760	40 %	20 %	0 %	40 %	154149682
95	NC_009712	GGTCC	2	10	129236	129245	0 %	20 %	40 %	40 %	154149684
96	NC_009712	GATCC	2	10	129802	129811	20 %	20 %	20 %	40 %	154149685
97	NC_009712	GCCGA	2	10	130692	130701	20 %	0 %	40 %	40 %	154149686
98	NC_009712	GATCC	2	10	137500	137509	20 %	20 %	20 %	40 %	154149692
99	NC_009712	GCATG	2	10	139986	139995	20 %	20 %	40 %	20 %	154149693
100	NC_009712	TCCCT	2	10	142773	142782	0 %	40 %	0 %	60 %	154149696
101	NC_009712	AAGGC	2	10	143189	143198	40 %	0 %	40 %	20 %	154149696
102	NC_009712	CTCTT	2	10	143902	143911	0 %	60 %	0 %	40 %	154149697
103	NC_009712	CACAT	2	10	144405	144414	40 %	20 %	0 %	40 %	154149698
104	NC_009712	GTCCT	2	10	145833	145842	0 %	40 %	20 %	40 %	154149699
105	NC_009712	GTACC	2	10	146131	146140	20 %	20 %	20 %	40 %	154149699
106	NC_009712	TGGGA	2	10	146229	146238	20 %	20 %	60 %	0 %	154149699
107	NC_009712	CGTTT	2	10	146325	146334	0 %	60 %	20 %	20 %	154149699
108	NC_009712	CATCG	2	10	151917	151926	20 %	20 %	20 %	40 %	154149704
109	NC_009712	TGGTC	2	10	153408	153417	0 %	40 %	40 %	20 %	154149706
110	NC_009712	GGTGC	2	10	154446	154455	0 %	20 %	60 %	20 %	154149707
111	NC_009712	ATACT	2	10	156072	156081	40 %	40 %	0 %	20 %	154149709
112	NC_009712	GCAGA	2	10	157708	157717	40 %	0 %	40 %	20 %	154149709
113	NC_009712	GAAGG	2	10	157855	157864	40 %	0 %	60 %	0 %	154149709
114	NC_009712	CTCCC	2	10	162302	162311	0 %	20 %	0 %	80 %	154149713
115	NC_009712	GCCAC	2	10	163634	163643	20 %	0 %	20 %	60 %	154149714
116	NC_009712	AGGAG	2	10	165051	165060	40 %	0 %	60 %	0 %	154149715
117	NC_009712	CCGGC	2	10	165888	165897	0 %	0 %	40 %	60 %	154149716
118	NC_009712	CGGGT	2	10	166279	166288	0 %	20 %	60 %	20 %	154149716
119	NC_009712	GAAAG	2	10	168424	168433	60 %	0 %	40 %	0 %	154149718
120	NC_009712	GCCCG	2	10	169102	169111	0 %	0 %	40 %	60 %	154149719
121	NC_009712	CCGGC	2	10	169670	169679	0 %	0 %	40 %	60 %	154149719
122	NC_009712	AAATC	2	10	173982	173991	60 %	20 %	0 %	20 %	154149725
123	NC_009712	GGTCG	2	10	175117	175126	0 %	20 %	60 %	20 %	154149726
124	NC_009712	CGGTC	2	10	176120	176129	0 %	20 %	40 %	40 %	154149727
125	NC_009712	CGGGC	2	10	176369	176378	0 %	0 %	60 %	40 %	154149727
126	NC_009712	GCCGG	2	10	176413	176422	0 %	0 %	60 %	40 %	154149727
127	NC_009712	CGCGG	2	10	177789	177798	0 %	0 %	60 %	40 %	154149729
128	NC_009712	TTTTC	2	10	178925	178934	0 %	80 %	0 %	20 %	154149731
129	NC_009712	GATCA	2	10	178953	178962	40 %	20 %	20 %	20 %	154149731
130	NC_009712	CATTG	2	10	179818	179827	20 %	40 %	20 %	20 %	154149732
131	NC_009712	GGCCG	2	10	183644	183653	0 %	0 %	60 %	40 %	154149741
132	NC_009712	GTCCG	2	10	184552	184561	0 %	20 %	40 %	40 %	154149741
133	NC_009712	CCGGT	2	10	184823	184832	0 %	20 %	40 %	40 %	154149741
134	NC_009712	CCCGG	2	10	185241	185250	0 %	0 %	40 %	60 %	154149741
135	NC_009712	GCACC	2	10	186038	186047	20 %	0 %	20 %	60 %	154149742
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140	NC_009712	GCATC	2	10	195992	196001	20 %	20 %	20 %	40 %	154149752
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