MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanoregula boonei 6A8 chromosome

Total Repeats: 5864

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009712	TTTC	2	8	81	88	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009712	GTAC	2	8	295	302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009712	TTTA	2	8	375	382	25 %	75 %	0 %	0 %	154149550
4	NC_009712	CTCA	2	8	504	511	25 %	25 %	0 %	50 %	154149550
5	NC_009712	CGCC	2	8	1143	1150	0 %	0 %	25 %	75 %	154149550
6	NC_009712	ACAG	2	8	1252	1259	50 %	0 %	25 %	25 %	154149550
7	NC_009712	CCCA	2	8	1285	1292	25 %	0 %	0 %	75 %	154149550
8	NC_009712	CTCA	2	8	1411	1418	25 %	25 %	0 %	50 %	154149550
9	NC_009712	GATG	2	8	1644	1651	25 %	25 %	50 %	0 %	154149551
10	NC_009712	CCTT	2	8	2118	2125	0 %	50 %	0 %	50 %	154149551
11	NC_009712	ATTC	2	8	2126	2133	25 %	50 %	0 %	25 %	154149551
12	NC_009712	GGCC	2	8	3048	3055	0 %	0 %	50 %	50 %	154149552
13	NC_009712	GTTT	2	8	3601	3608	0 %	75 %	25 %	0 %	154149553
14	NC_009712	TACT	2	8	3875	3882	25 %	50 %	0 %	25 %	154149553
15	NC_009712	GGGT	2	8	4092	4099	0 %	25 %	75 %	0 %	154149553
16	NC_009712	CACC	2	8	4171	4178	25 %	0 %	0 %	75 %	154149553
17	NC_009712	CTGC	2	8	4544	4551	0 %	25 %	25 %	50 %	154149554
18	NC_009712	TCCC	2	8	4628	4635	0 %	25 %	0 %	75 %	154149555
19	NC_009712	ATGT	2	8	4863	4870	25 %	50 %	25 %	0 %	154149555
20	NC_009712	CTGG	2	8	5362	5369	0 %	25 %	50 %	25 %	154149556
21	NC_009712	GCCG	2	8	5534	5541	0 %	0 %	50 %	50 %	154149556
22	NC_009712	GATG	2	8	5731	5738	25 %	25 %	50 %	0 %	154149556
23	NC_009712	GCGG	2	8	6308	6315	0 %	0 %	75 %	25 %	154149557
24	NC_009712	CATT	2	8	7627	7634	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009712	TGGC	2	8	7883	7890	0 %	25 %	50 %	25 %	154149559
26	NC_009712	GGAA	2	8	7971	7978	50 %	0 %	50 %	0 %	154149559
27	NC_009712	CGGC	2	8	8904	8911	0 %	0 %	50 %	50 %	154149560
28	NC_009712	CCCG	2	8	8990	8997	0 %	0 %	25 %	75 %	154149560
29	NC_009712	AGCC	2	8	9306	9313	25 %	0 %	25 %	50 %	154149561
30	NC_009712	TGCG	2	8	9850	9857	0 %	25 %	50 %	25 %	154149561
31	NC_009712	GGGA	2	8	10200	10207	25 %	0 %	75 %	0 %	154149562
32	NC_009712	GGAT	2	8	11616	11623	25 %	25 %	50 %	0 %	154149564
33	NC_009712	AGGA	2	8	12028	12035	50 %	0 %	50 %	0 %	154149565
34	NC_009712	AGGC	2	8	12060	12067	25 %	0 %	50 %	25 %	154149565
35	NC_009712	GAGG	2	8	12429	12436	25 %	0 %	75 %	0 %	154149565
36	NC_009712	CCAT	2	8	14197	14204	25 %	25 %	0 %	50 %	154149568
37	NC_009712	CTGA	2	8	14794	14801	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009712	CTGT	2	8	15145	15152	0 %	50 %	25 %	25 %	154149570
39	NC_009712	GAAC	2	8	15673	15680	50 %	0 %	25 %	25 %	154149571
40	NC_009712	GGGC	2	8	15985	15992	0 %	0 %	75 %	25 %	154149571
41	NC_009712	GGGC	2	8	16592	16599	0 %	0 %	75 %	25 %	154149571
42	NC_009712	TGCA	2	8	17079	17086	25 %	25 %	25 %	25 %	154149571
43	NC_009712	TATC	2	8	17319	17326	25 %	50 %	0 %	25 %	154149571
44	NC_009712	CGAG	2	8	18020	18027	25 %	0 %	50 %	25 %	154149572
45	NC_009712	TGCC	2	8	18386	18393	0 %	25 %	25 %	50 %	154149572
46	NC_009712	GACC	2	8	18923	18930	25 %	0 %	25 %	50 %	154149572
47	NC_009712	CCGG	2	8	18992	18999	0 %	0 %	50 %	50 %	154149572
48	NC_009712	CATC	2	8	19178	19185	25 %	25 %	0 %	50 %	154149572
49	NC_009712	CGGC	2	8	19366	19373	0 %	0 %	50 %	50 %	154149572
50	NC_009712	CACC	2	8	19916	19923	25 %	0 %	0 %	75 %	154149572
51	NC_009712	GGCC	2	8	20492	20499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009712	ATGG	2	8	21977	21984	25 %	25 %	50 %	0 %	154149573
53	NC_009712	GGCC	2	8	22157	22164	0 %	0 %	50 %	50 %	154149573
54	NC_009712	GCAC	2	8	22323	22330	25 %	0 %	25 %	50 %	154149573
55	NC_009712	CGAT	2	8	22902	22909	25 %	25 %	25 %	25 %	154149574
56	NC_009712	TGCC	2	8	23405	23412	0 %	25 %	25 %	50 %	154149575
57	NC_009712	CGGG	2	8	23590	23597	0 %	0 %	75 %	25 %	154149575
58	NC_009712	TCGA	2	8	24977	24984	25 %	25 %	25 %	25 %	154149577
59	NC_009712	TCGA	2	8	25232	25239	25 %	25 %	25 %	25 %	154149577
60	NC_009712	CCCG	2	8	25320	25327	0 %	0 %	25 %	75 %	154149578
61	NC_009712	ATGG	2	8	27577	27584	25 %	25 %	50 %	0 %	154149581
62	NC_009712	CTGT	2	8	28216	28223	0 %	50 %	25 %	25 %	154149582
63	NC_009712	CTGC	2	8	28292	28299	0 %	25 %	25 %	50 %	154149582
64	NC_009712	ATTC	2	8	28356	28363	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009712	CCTC	2	8	28973	28980	0 %	25 %	0 %	75 %	154149583
66	NC_009712	ACCG	2	8	28984	28991	25 %	0 %	25 %	50 %	154149583
67	NC_009712	GCCG	2	8	31775	31782	0 %	0 %	50 %	50 %	154149584
68	NC_009712	GTCA	2	8	32142	32149	25 %	25 %	25 %	25 %	154149584
69	NC_009712	GGCC	2	8	32917	32924	0 %	0 %	50 %	50 %	154149585
70	NC_009712	CCAG	2	8	33519	33526	25 %	0 %	25 %	50 %	154149586
71	NC_009712	GTGG	2	8	33919	33926	0 %	25 %	75 %	0 %	154149586
72	NC_009712	AAAG	2	8	34057	34064	75 %	0 %	25 %	0 %	154149586
73	NC_009712	CTGC	2	8	34114	34121	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009712	GGCC	2	8	34177	34184	0 %	0 %	50 %	50 %	154149587
75	NC_009712	CCGG	2	8	34227	34234	0 %	0 %	50 %	50 %	154149587
76	NC_009712	CAGG	2	8	34418	34425	25 %	0 %	50 %	25 %	154149587
77	NC_009712	TGCC	2	8	35310	35317	0 %	25 %	25 %	50 %	154149588
78	NC_009712	TCCG	2	8	36259	36266	0 %	25 %	25 %	50 %	154149589
79	NC_009712	CCGG	2	8	36521	36528	0 %	0 %	50 %	50 %	154149589
80	NC_009712	AAGG	2	8	36601	36608	50 %	0 %	50 %	0 %	154149589
81	NC_009712	CCCT	2	8	36799	36806	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_009712	GCCG	2	8	37700	37707	0 %	0 %	50 %	50 %	154149591
83	NC_009712	ATCG	2	8	38265	38272	25 %	25 %	25 %	25 %	154149592
84	NC_009712	TGTT	2	8	38411	38418	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009712	CGGG	2	8	38797	38804	0 %	0 %	75 %	25 %	154149593
86	NC_009712	CTGC	2	8	39093	39100	0 %	25 %	25 %	50 %	154149593
87	NC_009712	GTTC	2	8	39823	39830	0 %	50 %	25 %	25 %	154149594
88	NC_009712	CGCT	2	8	41133	41140	0 %	25 %	25 %	50 %	154149594
89	NC_009712	CCCG	2	8	41142	41149	0 %	0 %	25 %	75 %	154149594
90	NC_009712	CCCG	2	8	41161	41168	0 %	0 %	25 %	75 %	154149594
91	NC_009712	CGGA	2	8	41460	41467	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009712	GGAA	2	8	41741	41748	50 %	0 %	50 %	0 %	154149595
93	NC_009712	CCCT	2	8	42879	42886	0 %	25 %	0 %	75 %	154149597
94	NC_009712	CAGC	2	8	42984	42991	25 %	0 %	25 %	50 %	154149597
95	NC_009712	GGCC	2	8	43951	43958	0 %	0 %	50 %	50 %	154149598
96	NC_009712	GATA	2	8	44388	44395	50 %	25 %	25 %	0 %	154149599
97	NC_009712	GGAG	2	8	45681	45688	25 %	0 %	75 %	0 %	154149600
98	NC_009712	GCGG	2	8	46107	46114	0 %	0 %	75 %	25 %	154149600
99	NC_009712	CGGC	2	8	47016	47023	0 %	0 %	50 %	50 %	154149602
100	NC_009712	CAGC	2	8	47110	47117	25 %	0 %	25 %	50 %	154149602
101	NC_009712	GGCG	2	8	47194	47201	0 %	0 %	75 %	25 %	154149602
102	NC_009712	CCGG	2	8	47399	47406	0 %	0 %	50 %	50 %	154149602
103	NC_009712	GCCT	2	8	47564	47571	0 %	25 %	25 %	50 %	154149602
104	NC_009712	GGTG	2	8	47958	47965	0 %	25 %	75 %	0 %	154149603
105	NC_009712	GATT	2	8	48818	48825	25 %	50 %	25 %	0 %	154149604
106	NC_009712	AGGG	2	8	48956	48963	25 %	0 %	75 %	0 %	154149605
107	NC_009712	ATCT	2	8	50358	50365	25 %	50 %	0 %	25 %	154149606
108	NC_009712	CATC	2	8	51442	51449	25 %	25 %	0 %	50 %	154149606
109	NC_009712	GAAA	2	8	51837	51844	75 %	0 %	25 %	0 %	154149607
110	NC_009712	CATC	2	8	52043	52050	25 %	25 %	0 %	50 %	154149607
111	NC_009712	CATG	2	8	52073	52080	25 %	25 %	25 %	25 %	154149607
112	NC_009712	GCTC	2	8	52195	52202	0 %	25 %	25 %	50 %	154149607
113	NC_009712	GAGC	2	8	52262	52269	25 %	0 %	50 %	25 %	154149607
114	NC_009712	ATCG	2	8	52605	52612	25 %	25 %	25 %	25 %	154149608
115	NC_009712	CTCC	2	8	52682	52689	0 %	25 %	0 %	75 %	154149608
116	NC_009712	CGGG	2	8	53402	53409	0 %	0 %	75 %	25 %	154149608
117	NC_009712	AGCA	2	8	55593	55600	50 %	0 %	25 %	25 %	154149610
118	NC_009712	TTCA	2	8	55636	55643	25 %	50 %	0 %	25 %	154149610
119	NC_009712	GATG	2	8	55758	55765	25 %	25 %	50 %	0 %	154149611
120	NC_009712	CTGC	2	8	56164	56171	0 %	25 %	25 %	50 %	154149611
121	NC_009712	CCAC	2	8	56670	56677	25 %	0 %	0 %	75 %	154149612
122	NC_009712	CCGG	2	8	56893	56900	0 %	0 %	50 %	50 %	154149612
123	NC_009712	GCAG	2	8	57150	57157	25 %	0 %	50 %	25 %	154149612
124	NC_009712	GTGG	2	8	57361	57368	0 %	25 %	75 %	0 %	154149612
125	NC_009712	CGAT	2	8	57752	57759	25 %	25 %	25 %	25 %	154149612
126	NC_009712	TTTC	2	8	58124	58131	0 %	75 %	0 %	25 %	154149613
127	NC_009712	CCGT	2	8	58239	58246	0 %	25 %	25 %	50 %	154149613
128	NC_009712	ACGG	2	8	58436	58443	25 %	0 %	50 %	25 %	154149613
129	NC_009712	CAGC	2	8	58846	58853	25 %	0 %	25 %	50 %	154149613
130	NC_009712	AGAA	2	8	59024	59031	75 %	0 %	25 %	0 %	154149613
131	NC_009712	ATTC	2	8	59678	59685	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009712	ATCC	2	8	59774	59781	25 %	25 %	0 %	50 %	154149615
133	NC_009712	TAAT	2	8	61664	61671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009712	CTGC	2	8	62154	62161	0 %	25 %	25 %	50 %	154149616
135	NC_009712	GGCA	2	8	62178	62185	25 %	0 %	50 %	25 %	154149616
136	NC_009712	CCAT	2	8	62364	62371	25 %	25 %	0 %	50 %	154149616
137	NC_009712	GCAA	2	8	62651	62658	50 %	0 %	25 %	25 %	154149616
138	NC_009712	AGGA	2	8	62859	62866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009712	CGAT	2	8	63756	63763	25 %	25 %	25 %	25 %	154149617
140	NC_009712	CGGT	2	8	64334	64341	0 %	25 %	50 %	25 %	154149618
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142	NC_009712	AGGC	2	8	64569	64576	25 %	0 %	50 %	25 %	154149619
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