MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97 chromosome

Total Repeats: 989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009707	AAACGA	2	12	42	53	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	153951168
2	NC_009707	TGCAAA	2	12	1689	1700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	153952198
3	NC_009707	TTTAGT	2	12	2047	2058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153952198
4	NC_009707	TAAGTG	2	12	2471	2482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952198
5	NC_009707	AAGCTA	2	12	3666	3677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	153951349
6	NC_009707	AAGTGA	2	12	3811	3822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153951349
7	NC_009707	TCACAT	2	12	5415	5426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153952107
8	NC_009707	TGGATT	2	12	6411	6422	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	153952107
9	NC_009707	ATGCTA	2	12	9893	9904	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	153951980
10	NC_009707	ATTTAA	2	12	10697	10708	50 %	50 %	0 %	0 %	153951980
11	NC_009707	ATGGGT	2	12	19350	19361	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	153952083
12	NC_009707	TTCATT	2	12	20372	20383	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	153951860
13	NC_009707	AAGAAA	2	12	21586	21597	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153950993
14	NC_009707	AAGATA	2	12	22505	22516	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153950977
15	NC_009707	AGCAAA	2	12	23288	23299	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	153950977
16	NC_009707	TTTTCT	2	12	23795	23806	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	153951761
17	NC_009707	TGAAGT	2	12	26688	26699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153951098
18	NC_009707	TTTTCA	2	12	28100	28111	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	153952071
19	NC_009707	TTTTAT	2	12	28309	28320	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	153952071
20	NC_009707	TTATGC	2	12	29371	29382	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	153951291
21	NC_009707	CTTTAA	2	12	31618	31629	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	153952334
22	NC_009707	ATGTGT	2	12	32432	32443	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	153951390
23	NC_009707	CGCCAT	2	12	35810	35821	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	153951536
24	NC_009707	ATGGAT	2	12	36298	36309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952383
25	NC_009707	GAAATT	2	12	36507	36518	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153952383
26	NC_009707	TTTTAT	2	12	42030	42041	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	153951062
27	NC_009707	CTACAG	2	12	48926	48937	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	153951153
28	NC_009707	TTGATT	2	12	52724	52735	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153951784
29	NC_009707	CCTATG	2	12	54758	54769	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	153952211
30	NC_009707	TATTTT	2	12	55482	55493	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	153952211
31	NC_009707	AAAACA	2	12	56263	56274	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	153951558
32	NC_009707	ATGAAA	2	12	59122	59133	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153952213
33	NC_009707	TAAGCT	2	12	59654	59665	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	153952213
34	NC_009707	AGTTTT	2	12	61836	61847	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153952411
35	NC_009707	CAAAAT	2	12	65970	65981	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	153951142
36	NC_009707	TAGCAG	2	12	66237	66248	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	153952103
37	NC_009707	TAATTT	2	12	68682	68693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153951498
38	NC_009707	ATTTTA	2	12	68934	68945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153951498
39	NC_009707	AAATAT	2	12	69291	69302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153951498
40	NC_009707	CCTCCA	2	12	73696	73707	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	153951989
41	NC_009707	AGTATA	2	12	74641	74652	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153952498
42	NC_009707	ACGCAC	2	12	77729	77740	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	153951920
43	NC_009707	TAGCTT	2	12	78399	78410	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	153951200
44	NC_009707	TTCATT	2	12	80758	80769	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	153951589
45	NC_009707	CATCTT	2	12	82505	82516	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	153952395
46	NC_009707	TCTTTA	2	12	84812	84823	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	153952082
47	NC_009707	TTTAAA	2	12	84925	84936	50 %	50 %	0 %	0 %	153952082
48	NC_009707	CTAGCT	2	12	85357	85368	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	153951329
49	NC_009707	GAATGA	2	12	85611	85622	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153951329
50	NC_009707	TAAATT	2	12	88147	88158	50 %	50 %	0 %	0 %	153951058
51	NC_009707	AAAAGC	2	12	91132	91143	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	153952662
52	NC_009707	TTTTTG	2	12	93344	93355	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	153951159
53	NC_009707	GAATTT	2	12	93664	93675	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153951686
54	NC_009707	AACTCA	2	12	94179	94190	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	153951686
55	NC_009707	CTTTTT	2	12	94644	94655	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	153951686
56	NC_009707	CTTTAA	2	12	95959	95970	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	153950972
57	NC_009707	TGTAAC	2	12	99130	99141	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	153952003
58	NC_009707	CAGGAA	2	12	99838	99849	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	153951706
59	NC_009707	CAGGCT	2	12	104079	104090	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	153952518
60	NC_009707	AAGCTA	2	12	104134	104145	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	153952518
61	NC_009707	TTAATG	2	12	104971	104982	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153951573
62	NC_009707	GCAAGC	2	12	105051	105062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153951573
63	NC_009707	AACTTA	2	12	107114	107125	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	153952548
64	NC_009707	TTAGAA	2	12	109425	109436	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153950956
65	NC_009707	TGGCTG	2	12	110263	110274	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	153952401
66	NC_009707	GGTTTG	2	12	117489	117500	0 %	50 %	50 %	0 %	153951408
67	NC_009707	AAAATA	2	12	119300	119311	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153952317
68	NC_009707	AATAGT	2	12	120253	120264	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153951205
69	NC_009707	ATTTTG	2	12	120837	120848	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153952154
70	NC_009707	GAAAAA	2	12	121744	121755	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153950982
71	NC_009707	GTTGTG	2	12	122591	122602	0 %	50 %	50 %	0 %	153951916
72	NC_009707	TGGCGG	3	18	122637	122654	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	153951916
73	NC_009707	TTTGAT	2	12	124202	124213	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153952345
74	NC_009707	CTTTAG	2	12	124388	124399	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	153951034
75	NC_009707	AAGCTA	2	12	129757	129768	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	153951370
76	NC_009707	TTCTTT	2	12	137707	137718	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	153951002
77	NC_009707	GGGCTT	2	12	138385	138396	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	153950961
78	NC_009707	AAAGAT	2	12	141458	141469	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153951460
79	NC_009707	AAAGAA	2	12	143634	143645	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153951208
80	NC_009707	TTTCTA	2	12	143942	143953	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	153951208
81	NC_009707	GAAAAA	2	12	146329	146340	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153952308
82	NC_009707	ACCTTT	2	12	149585	149596	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	153951881
83	NC_009707	ATTTTT	2	12	151408	151419	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	153951883
84	NC_009707	TAAGGA	2	12	154520	154531	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153952354
85	NC_009707	TTTTAC	2	12	156535	156546	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	153951779
86	NC_009707	CTGCTC	2	12	158411	158422	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	153951904
87	NC_009707	ATTTTC	2	12	159333	159344	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	153952461
88	NC_009707	TTAGAT	2	12	160634	160645	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153951240
89	NC_009707	AGAATA	2	12	161275	161286	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153951240
90	NC_009707	CAAAAC	2	12	162369	162380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153951021
91	NC_009707	ATAAAA	2	12	162438	162449	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153951021
92	NC_009707	TTTTGC	2	12	162994	163005	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	153952242
93	NC_009707	GATAAA	2	12	163342	163353	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153952242
94	NC_009707	AGCTAT	2	12	164049	164060	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	153951044
95	NC_009707	TCAAAT	2	12	166074	166085	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	153952089
96	NC_009707	AAATAA	2	12	168843	168854	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153951107
97	NC_009707	ATTTTC	2	12	170915	170926	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	153952562
98	NC_009707	GGCTGT	2	12	172240	172251	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	153951398
99	NC_009707	TATAAA	2	12	173652	173663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153951468
100	NC_009707	AAAAGC	2	12	175150	175161	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	153952007
101	NC_009707	AACAAG	2	12	175942	175953	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	153950951
102	NC_009707	ATTCTA	2	12	178662	178673	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	153951263
103	NC_009707	GCTATT	2	12	178889	178900	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	153951263
104	NC_009707	TTGCAG	2	12	180236	180247	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	153951504
105	NC_009707	AACATA	2	12	180584	180595	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	153951504
106	NC_009707	GCAAAG	2	12	183792	183803	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	153950958
107	NC_009707	AAAACC	2	12	184022	184033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153951970
108	NC_009707	CAAGGA	2	12	186392	186403	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	153952653
109	NC_009707	TAGGAT	2	12	187952	187963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153951420
110	NC_009707	AATGAA	2	12	190795	190806	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153951633
111	NC_009707	AAGTGC	2	12	192000	192011	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	153951633
112	NC_009707	CCTAAT	2	12	192019	192030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153951633
113	NC_009707	CTTACT	2	12	193620	193631	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	153951971
114	NC_009707	AATTAA	2	12	194998	195009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153951019
115	NC_009707	AAATTC	2	12	195712	195723	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	153952070
116	NC_009707	TTTTAG	2	12	202800	202811	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153950997
117	NC_009707	AAAGAA	2	12	202939	202950	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153951486
118	NC_009707	TTTGAT	2	12	209239	209250	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153951917
119	NC_009707	TAAAAT	2	12	210461	210472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952612
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