MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium kluyveri DSM 555 chromosome

Total Repeats: 307

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009706	TTAAAT	2	12	8945	8956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009706	TTTAAC	2	12	29875	29886	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_009706	CAACTA	2	12	43392	43403	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009706	TATAAA	2	12	43723	43734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009706	TTTTAA	2	12	46589	46600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009706	TAATCT	2	12	50479	50490	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_009706	AATTTT	2	12	78091	78102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009706	TTAATT	2	12	87655	87666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009706	TTATTT	2	12	101812	101823	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009706	TATATG	2	12	105074	105085	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009706	GTATTA	2	12	134780	134791	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009706	AACAAT	2	12	151897	151908	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_009706	ATTTTA	2	12	152120	152131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009706	ATATAA	2	12	155376	155387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009706	GACATT	2	12	173808	173819	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_009706	AATTAA	2	12	191291	191302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009706	TTTAAT	2	12	194609	194620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009706	ATATAA	2	12	264751	264762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009706	AATAGT	2	12	267581	267592	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009706	AACTAA	2	12	291036	291047	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_009706	ATTTCT	2	12	292264	292275	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_009706	TATGAA	2	12	292449	292460	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009706	TATTTT	2	12	298599	298610	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009706	AAAACT	2	12	299437	299448	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_009706	AGATGG	2	12	299521	299532	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009706	CGTCTT	2	12	301933	301944	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009706	ACAATG	2	12	325512	325523	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_009706	ATTTAA	2	12	331451	331462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009706	CAAAAA	2	12	348022	348033	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_009706	TATATT	2	12	374456	374467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009706	GAAAAT	2	12	380727	380738	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009706	CTATGT	2	12	384481	384492	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_009706	TCTGAT	2	12	384505	384516	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_009706	AATGAA	2	12	386298	386309	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009706	AATATA	2	12	394342	394353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009706	AATATA	2	12	400642	400653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009706	TTATAT	2	12	405401	405412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009706	TTAATT	2	12	413322	413333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009706	ATATAA	2	12	425810	425821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009706	TAATTT	2	12	437209	437220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009706	AAATTT	2	12	442825	442836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009706	TCTATA	2	12	450915	450926	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_009706	AGCAAA	2	12	454085	454096	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_009706	CAAAAT	2	12	454155	454166	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_009706	AGTAAA	2	12	462970	462981	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009706	ATAAAG	2	12	463569	463580	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009706	CATTAG	2	12	463654	463665	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009706	ACCTCC	2	12	466332	466343	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_009706	ATGATA	2	12	467300	467311	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009706	TAAATA	2	12	475220	475231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009706	TGTTAT	2	12	479755	479766	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009706	TGTAAT	2	12	506040	506051	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009706	AATATT	2	12	510504	510515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009706	ATTATA	2	12	518808	518819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009706	ATTTTT	2	12	527308	527319	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009706	AAAGGC	2	12	527535	527546	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_009706	TACAGG	2	12	546599	546610	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_009706	ATGATA	2	12	546894	546905	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009706	ATATTT	2	12	548971	548982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009706	TACTAG	2	12	553581	553592	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_009706	GCAATT	2	12	553848	553859	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_009706	TGTGTT	2	12	557375	557386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009706	TTTAAA	2	12	557628	557639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009706	TTATAA	2	12	557871	557882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009706	AAATAC	2	12	558454	558465	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009706	TAATAC	2	12	564800	564811	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_009706	TCGTTT	2	12	574178	574189	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_009706	TTAATT	2	12	603685	603696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009706	AAAAAT	2	12	603736	603747	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009706	ATATTA	2	12	619696	619707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009706	TTATAA	2	12	640994	641005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009706	TAATTA	2	12	658250	658261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009706	GACTAT	2	12	677050	677061	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_009706	ATAGTA	2	12	686330	686341	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009706	ATTTTA	2	12	691752	691763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009706	TGTATT	2	12	728009	728020	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009706	ATGTGA	2	12	734965	734976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009706	AAATGT	2	12	747430	747441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009706	ATTTAT	2	12	796590	796601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009706	ATTTAA	2	12	797884	797895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009706	ATTTTA	2	12	824831	824842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009706	TAAAAA	2	12	857495	857506	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009706	TATGGA	2	12	860426	860437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009706	ATTTTT	2	12	874417	874428	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009706	TAATAT	2	12	886632	886643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009706	ACTATG	2	12	910982	910993	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_009706	AATAAA	2	12	931591	931602	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009706	AATATA	2	12	943586	943597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009706	TAAATT	2	12	954373	954384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009706	ATTTAA	2	12	955063	955074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009706	TAAAAA	2	12	982335	982346	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009706	GTTTTT	2	12	1014107	1014118	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009706	TAATTT	2	12	1024814	1024825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009706	AACAAA	2	12	1033881	1033892	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_009706	TATTTT	2	12	1045466	1045477	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009706	AATGTA	2	12	1069410	1069421	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009706	TGCAAA	2	12	1070808	1070819	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_009706	AGTTAT	2	12	1073311	1073322	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009706	AAAATT	2	12	1087555	1087566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009706	AAATAT	2	12	1092195	1092206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009706	AACTTA	2	12	1101120	1101131	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_009706	ATTGAT	2	12	1120762	1120773	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009706	ATAAAA	2	12	1159048	1159059	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009706	AAGTTT	2	12	1170625	1170636	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009706	AATATA	2	12	1176984	1176995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009706	AATTAA	2	12	1185812	1185823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009706	ATAGGC	2	12	1215877	1215888	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_009706	ATATGT	2	12	1236759	1236770	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009706	GAATTT	2	12	1252558	1252569	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009706	TAAAAA	2	12	1260501	1260512	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009706	TTTTTA	2	12	1328862	1328873	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009706	TAAAAA	2	12	1342225	1342236	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009706	TGTTAA	2	12	1362706	1362717	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009706	TTTAAA	2	12	1362833	1362844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009706	GTATAT	2	12	1365134	1365145	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009706	TTTTAT	2	12	1373889	1373900	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009706	ATGAAT	2	12	1375536	1375547	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009706	AAAATA	2	12	1378619	1378630	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009706	TTAATT	2	12	1385378	1385389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009706	TTTAAA	2	12	1434137	1434148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009706	AAAGTA	2	12	1434178	1434189	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009706	GTTATT	2	12	1448035	1448046	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009706	AAAAAC	2	12	1483073	1483084	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_009706	ATTTAA	2	12	1493693	1493704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009706	TCTATA	2	12	1521411	1521422	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_009706	GATAGA	2	12	1524140	1524151	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009706	ATAAAT	2	12	1525391	1525402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009706	AATAAA	2	12	1544480	1544491	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009706	ATGAGG	2	12	1552530	1552541	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009706	TATTTT	2	12	1554530	1554541	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009706	AAAGTA	2	12	1605291	1605302	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009706	ATTTTT	2	12	1611939	1611950	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009706	TTTTAG	2	12	1613732	1613743	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009706	ATTTTT	2	12	1618244	1618255	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009706	TTTATA	2	12	1619750	1619761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_009706	AAATTT	2	12	1721682	1721693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_009706	TGTTAT	2	12	1788355	1788366	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.