MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 plasmid_59kb

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009704	ACGATG	2	12	6779	6790	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	153930606
2	NC_009704	CTTAAC	2	12	8278	8289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930569
3	NC_009704	CTTATT	2	12	10745	10756	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	153930573
4	NC_009704	TGTCGG	2	12	11930	11941	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	153930568
5	NC_009704	TGATGG	2	12	16096	16107	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	153930596
6	NC_009704	AACCAA	2	12	17243	17254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930622
7	NC_009704	TCTGAT	2	12	24174	24185	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	153930581
8	NC_009704	TTTAGT	2	12	25392	25403	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153930595
9	NC_009704	AGAATT	2	12	27518	27529	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153930570
10	NC_009704	TTTATT	2	12	27934	27945	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	153930618
11	NC_009704	CTAATT	2	12	29553	29564	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	153930609
12	NC_009704	CATTAT	2	12	32691	32702	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	153930594
13	NC_009704	AAGTGA	2	12	36037	36048	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153930614
14	NC_009704	TTATTT	2	12	38078	38089	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	153930610
15	NC_009704	ACCATC	2	12	43323	43334	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	153930584
16	NC_009704	TATCAA	2	12	43598	43609	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	153930584
17	NC_009704	TGATAT	2	12	49904	49915	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153930611
18	NC_009704	GACAAC	2	12	51109	51120	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	153930578
19	NC_009704	TGAAAT	2	12	52165	52176	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153930592
20	NC_009704	GATTTT	2	12	55706	55717	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153930577
21	NC_009704	ATCCTC	2	12	55933	55944	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	153930577

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.