MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 plasmid_59kb

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009704	CCTCT	2	10	560	569	0 %	40 %	0 %	60 %	153930590
2	NC_009704	CTCTT	2	10	2261	2270	0 %	60 %	0 %	40 %	153930621
3	NC_009704	ACGAA	2	10	2957	2966	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009704	GTTAA	2	10	5175	5184	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009704	TGTAT	2	10	5374	5383	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009704	ATCTT	2	10	5641	5650	20 %	60 %	0 %	20 %	153930626
7	NC_009704	AAAAG	2	10	6202	6211	80 %	0 %	20 %	0 %	153930606
8	NC_009704	AAGAT	2	10	6252	6261	60 %	20 %	20 %	0 %	153930606
9	NC_009704	AACAA	2	10	7166	7175	80 %	0 %	0 %	20 %	153930587
10	NC_009704	TTGCT	2	10	7191	7200	0 %	60 %	20 %	20 %	153930587
11	NC_009704	ATTTC	2	10	8081	8090	20 %	60 %	0 %	20 %	153930569
12	NC_009704	AATGG	2	10	9523	9532	40 %	20 %	40 %	0 %	153930569
13	NC_009704	AATTG	2	10	9954	9963	40 %	40 %	20 %	0 %	153930569
14	NC_009704	TCAAG	2	10	11943	11952	40 %	20 %	20 %	20 %	153930568
15	NC_009704	TTGTT	2	10	12114	12123	0 %	80 %	20 %	0 %	153930617
16	NC_009704	ATTAA	2	10	18440	18449	60 %	40 %	0 %	0 %	153930563
17	NC_009704	AAGGA	2	10	20165	20174	60 %	0 %	40 %	0 %	153930575
18	NC_009704	AGATA	2	10	20509	20518	60 %	20 %	20 %	0 %	153930575
19	NC_009704	GTTAC	2	10	21215	21224	20 %	40 %	20 %	20 %	153930575
20	NC_009704	GAAAT	2	10	22524	22533	60 %	20 %	20 %	0 %	153930625
21	NC_009704	TGATT	2	10	22966	22975	20 %	60 %	20 %	0 %	153930625
22	NC_009704	GGTAC	2	10	24704	24713	20 %	20 %	40 %	20 %	153930579
23	NC_009704	GAAAA	2	10	24989	24998	80 %	0 %	20 %	0 %	153930579
24	NC_009704	TACCG	2	10	26088	26097	20 %	20 %	20 %	40 %	153930572
25	NC_009704	TTAAA	2	10	27652	27661	60 %	40 %	0 %	0 %	153930570
26	NC_009704	AGAGC	2	10	28422	28431	40 %	0 %	40 %	20 %	153930604
27	NC_009704	AAGTT	2	10	28456	28465	40 %	40 %	20 %	0 %	153930604
28	NC_009704	GGGAA	2	10	31056	31065	40 %	0 %	60 %	0 %	153930567
29	NC_009704	TGCTT	2	10	32137	32146	0 %	60 %	20 %	20 %	153930594
30	NC_009704	CTGCT	2	10	34005	34014	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_009704	ATTTT	2	10	36669	36678	20 %	80 %	0 %	0 %	153930614
32	NC_009704	TTGCA	2	10	40464	40473	20 %	40 %	20 %	20 %	153930580
33	NC_009704	GTTCC	2	10	40631	40640	0 %	40 %	20 %	40 %	153930580
34	NC_009704	ACTTT	2	10	40876	40885	20 %	60 %	0 %	20 %	153930580
35	NC_009704	TGTCC	2	10	41986	41995	0 %	40 %	20 %	40 %	153930580
36	NC_009704	CTTGT	2	10	42333	42342	0 %	60 %	20 %	20 %	153930580
37	NC_009704	ATTTT	2	10	43784	43793	20 %	80 %	0 %	0 %	153930584
38	NC_009704	ATTTG	2	10	48048	48057	20 %	60 %	20 %	0 %	153930611
39	NC_009704	CACTT	2	10	48102	48111	20 %	40 %	0 %	40 %	153930611
40	NC_009704	ATGTA	2	10	49623	49632	40 %	40 %	20 %	0 %	153930611
41	NC_009704	GAAAT	2	10	49793	49802	60 %	20 %	20 %	0 %	153930611
42	NC_009704	TCATC	2	10	51187	51196	20 %	40 %	0 %	40 %	153930593
43	NC_009704	GTACT	2	10	52917	52926	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.