MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 plasmid_59kb

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009704	CTTT	2	8	677	684	0 %	75 %	0 %	25 %	153930590
2	NC_009704	AGTG	2	8	808	815	25 %	25 %	50 %	0 %	153930590
3	NC_009704	TATT	2	8	919	926	25 %	75 %	0 %	0 %	153930590
4	NC_009704	CATC	2	8	944	951	25 %	25 %	0 %	50 %	153930590
5	NC_009704	CATT	2	8	2181	2188	25 %	50 %	0 %	25 %	153930621
6	NC_009704	TCTT	2	8	4298	4305	0 %	75 %	0 %	25 %	153930566
7	NC_009704	GTTG	2	8	4495	4502	0 %	50 %	50 %	0 %	153930566
8	NC_009704	ACAA	2	8	6068	6075	75 %	0 %	0 %	25 %	153930606
9	NC_009704	TCTT	2	8	6340	6347	0 %	75 %	0 %	25 %	153930606
10	NC_009704	ATGG	2	8	7570	7577	25 %	25 %	50 %	0 %	153930599
11	NC_009704	CTTT	2	8	7649	7656	0 %	75 %	0 %	25 %	153930599
12	NC_009704	ATCA	2	8	8093	8100	50 %	25 %	0 %	25 %	153930569
13	NC_009704	CTGG	2	8	8121	8128	0 %	25 %	50 %	25 %	153930569
14	NC_009704	GTTG	2	8	8517	8524	0 %	50 %	50 %	0 %	153930569
15	NC_009704	TTTA	2	8	9822	9829	25 %	75 %	0 %	0 %	153930569
16	NC_009704	AGAA	2	8	10379	10386	75 %	0 %	25 %	0 %	153930573
17	NC_009704	AAAG	2	8	10724	10731	75 %	0 %	25 %	0 %	153930573
18	NC_009704	CAAC	2	8	10990	10997	50 %	0 %	0 %	50 %	153930573
19	NC_009704	TTCA	2	8	11579	11586	25 %	50 %	0 %	25 %	153930568
20	NC_009704	AAGC	2	8	12245	12252	50 %	0 %	25 %	25 %	153930617
21	NC_009704	TATC	2	8	12397	12404	25 %	50 %	0 %	25 %	153930617
22	NC_009704	AGGA	2	8	12422	12429	50 %	0 %	50 %	0 %	153930617
23	NC_009704	TCCA	2	8	12464	12471	25 %	25 %	0 %	50 %	153930612
24	NC_009704	GTCA	2	8	13408	13415	25 %	25 %	25 %	25 %	153930612
25	NC_009704	GCAA	2	8	14254	14261	50 %	0 %	25 %	25 %	153930607
26	NC_009704	CAAT	2	8	14431	14438	50 %	25 %	0 %	25 %	153930607
27	NC_009704	GTTG	2	8	15313	15320	0 %	50 %	50 %	0 %	153930596
28	NC_009704	GGCT	2	8	15383	15390	0 %	25 %	50 %	25 %	153930596
29	NC_009704	CAAG	2	8	15466	15473	50 %	0 %	25 %	25 %	153930596
30	NC_009704	GGTA	2	8	15481	15488	25 %	25 %	50 %	0 %	153930596
31	NC_009704	CTTC	2	8	15603	15610	0 %	50 %	0 %	50 %	153930596
32	NC_009704	GAAT	2	8	16065	16072	50 %	25 %	25 %	0 %	153930596
33	NC_009704	TGAT	2	8	16167	16174	25 %	50 %	25 %	0 %	153930596
34	NC_009704	ATGA	2	8	16539	16546	50 %	25 %	25 %	0 %	153930585
35	NC_009704	GCTT	2	8	16829	16836	0 %	50 %	25 %	25 %	153930585
36	NC_009704	TAAT	2	8	16862	16869	50 %	50 %	0 %	0 %	153930585
37	NC_009704	TAGA	2	8	17048	17055	50 %	25 %	25 %	0 %	153930622
38	NC_009704	ATTT	2	8	17153	17160	25 %	75 %	0 %	0 %	153930622
39	NC_009704	ATAC	2	8	17182	17189	50 %	25 %	0 %	25 %	153930622
40	NC_009704	TTTA	2	8	17364	17371	25 %	75 %	0 %	0 %	153930622
41	NC_009704	ATTA	2	8	17415	17422	50 %	50 %	0 %	0 %	153930622
42	NC_009704	TGGA	2	8	17827	17834	25 %	25 %	50 %	0 %	153930571
43	NC_009704	TTAT	2	8	18353	18360	25 %	75 %	0 %	0 %	153930571
44	NC_009704	CCAA	2	8	18812	18819	50 %	0 %	0 %	50 %	153930563
45	NC_009704	TTTA	2	8	19399	19406	25 %	75 %	0 %	0 %	153930563
46	NC_009704	ATTG	2	8	19454	19461	25 %	50 %	25 %	0 %	153930563
47	NC_009704	AAAC	2	8	19703	19710	75 %	0 %	0 %	25 %	153930563
48	NC_009704	TAAA	2	8	19884	19891	75 %	25 %	0 %	0 %	153930563
49	NC_009704	AGAC	2	8	20312	20319	50 %	0 %	25 %	25 %	153930575
50	NC_009704	TTAT	2	8	20741	20748	25 %	75 %	0 %	0 %	153930575
51	NC_009704	TTTA	2	8	20766	20773	25 %	75 %	0 %	0 %	153930575
52	NC_009704	AGAA	2	8	20831	20838	75 %	0 %	25 %	0 %	153930575
53	NC_009704	TGAG	2	8	21192	21199	25 %	25 %	50 %	0 %	153930575
54	NC_009704	TTAT	2	8	21462	21469	25 %	75 %	0 %	0 %	153930575
55	NC_009704	CTAT	2	8	21516	21523	25 %	50 %	0 %	25 %	153930597
56	NC_009704	TTAA	2	8	22037	22044	50 %	50 %	0 %	0 %	153930625
57	NC_009704	TCCA	2	8	22108	22115	25 %	25 %	0 %	50 %	153930625
58	NC_009704	CCTG	2	8	22995	23002	0 %	25 %	25 %	50 %	153930625
59	NC_009704	TATT	2	8	23122	23129	25 %	75 %	0 %	0 %	153930625
60	NC_009704	CTTT	2	8	23832	23839	0 %	75 %	0 %	25 %	153930581
61	NC_009704	TGCT	2	8	23855	23862	0 %	50 %	25 %	25 %	153930581
62	NC_009704	TTTA	2	8	23897	23904	25 %	75 %	0 %	0 %	153930581
63	NC_009704	GTTT	2	8	23979	23986	0 %	75 %	25 %	0 %	153930581
64	NC_009704	TCAT	2	8	24008	24015	25 %	50 %	0 %	25 %	153930581
65	NC_009704	GAAA	2	8	24390	24397	75 %	0 %	25 %	0 %	153930581
66	NC_009704	AAAG	2	8	24528	24535	75 %	0 %	25 %	0 %	153930579
67	NC_009704	GCAA	2	8	25123	25130	50 %	0 %	25 %	25 %	153930595
68	NC_009704	GAAT	2	8	25218	25225	50 %	25 %	25 %	0 %	153930595
69	NC_009704	GAAT	2	8	25314	25321	50 %	25 %	25 %	0 %	153930595
70	NC_009704	CATT	2	8	25688	25695	25 %	50 %	0 %	25 %	153930595
71	NC_009704	ATCA	2	8	25960	25967	50 %	25 %	0 %	25 %	153930595
72	NC_009704	AATC	2	8	26888	26895	50 %	25 %	0 %	25 %	153930572
73	NC_009704	CAGG	2	8	27115	27122	25 %	0 %	50 %	25 %	153930572
74	NC_009704	GAAA	2	8	27564	27571	75 %	0 %	25 %	0 %	153930570
75	NC_009704	TGTT	2	8	27834	27841	0 %	75 %	25 %	0 %	153930570
76	NC_009704	ACAG	2	8	28246	28253	50 %	0 %	25 %	25 %	153930618
77	NC_009704	CCGT	2	8	28291	28298	0 %	25 %	25 %	50 %	153930618
78	NC_009704	TATC	2	8	29104	29111	25 %	50 %	0 %	25 %	153930583
79	NC_009704	AAAT	2	8	29593	29600	75 %	25 %	0 %	0 %	153930609
80	NC_009704	TTAT	2	8	29703	29710	25 %	75 %	0 %	0 %	153930609
81	NC_009704	AACA	2	8	29940	29947	75 %	0 %	0 %	25 %	153930609
82	NC_009704	AGAA	2	8	30157	30164	75 %	0 %	25 %	0 %	153930602
83	NC_009704	AAAG	2	8	30209	30216	75 %	0 %	25 %	0 %	153930602
84	NC_009704	AGTA	2	8	30929	30936	50 %	25 %	25 %	0 %	153930567
85	NC_009704	TGGT	2	8	31002	31009	0 %	50 %	50 %	0 %	153930567
86	NC_009704	ATTG	2	8	32824	32831	25 %	50 %	25 %	0 %	153930601
87	NC_009704	GCCA	2	8	32863	32870	25 %	0 %	25 %	50 %	153930601
88	NC_009704	ATGT	2	8	33543	33550	25 %	50 %	25 %	0 %	153930623
89	NC_009704	TGGC	2	8	34506	34513	0 %	25 %	50 %	25 %	153930586
90	NC_009704	AGTC	2	8	35311	35318	25 %	25 %	25 %	25 %	153930565
91	NC_009704	ATTC	2	8	35656	35663	25 %	50 %	0 %	25 %	153930600
92	NC_009704	TGAA	2	8	36068	36075	50 %	25 %	25 %	0 %	153930614
93	NC_009704	ATGA	2	8	36179	36186	50 %	25 %	25 %	0 %	153930614
94	NC_009704	AATA	2	8	36521	36528	75 %	25 %	0 %	0 %	153930614
95	NC_009704	TAAA	2	8	37101	37108	75 %	25 %	0 %	0 %	153930603
96	NC_009704	ATTT	2	8	37113	37120	25 %	75 %	0 %	0 %	153930603
97	NC_009704	CTTT	2	8	37977	37984	0 %	75 %	0 %	25 %	153930610
98	NC_009704	TGAT	2	8	38024	38031	25 %	50 %	25 %	0 %	153930610
99	NC_009704	TGAT	2	8	38060	38067	25 %	50 %	25 %	0 %	153930610
100	NC_009704	TGAG	2	8	39687	39694	25 %	25 %	50 %	0 %	153930589
101	NC_009704	CTTT	2	8	41158	41165	0 %	75 %	0 %	25 %	153930580
102	NC_009704	TGCT	2	8	41900	41907	0 %	50 %	25 %	25 %	153930580
103	NC_009704	CTGT	2	8	42073	42080	0 %	50 %	25 %	25 %	153930580
104	NC_009704	TGGC	2	8	42288	42295	0 %	25 %	50 %	25 %	153930580
105	NC_009704	GCTT	2	8	42415	42422	0 %	50 %	25 %	25 %	153930580
106	NC_009704	TGTT	2	8	42635	42642	0 %	75 %	25 %	0 %	153930580
107	NC_009704	CTCA	2	8	42691	42698	25 %	25 %	0 %	50 %	153930582
108	NC_009704	GTTT	2	8	42844	42851	0 %	75 %	25 %	0 %	153930582
109	NC_009704	AATA	2	8	43149	43156	75 %	25 %	0 %	0 %	153930584
110	NC_009704	TAAT	2	8	43238	43245	50 %	50 %	0 %	0 %	153930584
111	NC_009704	CACT	2	8	43754	43761	25 %	25 %	0 %	50 %	153930584
112	NC_009704	TAGT	2	8	43916	43923	25 %	50 %	25 %	0 %	153930584
113	NC_009704	ATTT	2	8	43982	43989	25 %	75 %	0 %	0 %	153930584
114	NC_009704	TCCC	2	8	44260	44267	0 %	25 %	0 %	75 %	153930584
115	NC_009704	AATA	2	8	44880	44887	75 %	25 %	0 %	0 %	153930584
116	NC_009704	GTCA	2	8	45035	45042	25 %	25 %	25 %	25 %	153930620
117	NC_009704	ATAA	2	8	45401	45408	75 %	25 %	0 %	0 %	153930620
118	NC_009704	TCTT	2	8	45656	45663	0 %	75 %	0 %	25 %	153930564
119	NC_009704	CAGT	2	8	45693	45700	25 %	25 %	25 %	25 %	153930564
120	NC_009704	TTGG	2	8	46230	46237	0 %	50 %	50 %	0 %	153930564
121	NC_009704	AGAT	2	8	46339	46346	50 %	25 %	25 %	0 %	153930564
122	NC_009704	TCCA	2	8	46466	46473	25 %	25 %	0 %	50 %	153930564
123	NC_009704	CAAT	2	8	46644	46651	50 %	25 %	0 %	25 %	153930564
124	NC_009704	GTAA	2	8	46903	46910	50 %	25 %	25 %	0 %	153930564
125	NC_009704	TTGA	2	8	47224	47231	25 %	50 %	25 %	0 %	153930564
126	NC_009704	ACTT	2	8	47334	47341	25 %	50 %	0 %	25 %	153930564
127	NC_009704	ATTT	2	8	47732	47739	25 %	75 %	0 %	0 %	153930611
128	NC_009704	GATA	2	8	48593	48600	50 %	25 %	25 %	0 %	153930611
129	NC_009704	ATCT	2	8	48852	48859	25 %	50 %	0 %	25 %	153930611
130	NC_009704	GCTT	2	8	49317	49324	0 %	50 %	25 %	25 %	153930611
131	NC_009704	CTTT	2	8	49529	49536	0 %	75 %	0 %	25 %	153930611
132	NC_009704	CCTA	2	8	50191	50198	25 %	25 %	0 %	50 %	153930576
133	NC_009704	AGCC	3	12	50455	50466	25 %	0 %	25 %	50 %	153930588
134	NC_009704	AGAT	2	8	50519	50526	50 %	25 %	25 %	0 %	153930588
135	NC_009704	TAGG	2	8	50801	50808	25 %	25 %	50 %	0 %	153930578
136	NC_009704	CAAA	2	8	50972	50979	75 %	0 %	0 %	25 %	153930578
137	NC_009704	TAGT	2	8	51433	51440	25 %	50 %	25 %	0 %	153930593
138	NC_009704	AATT	2	8	51478	51485	50 %	50 %	0 %	0 %	153930593
139	NC_009704	TATC	2	8	51781	51788	25 %	50 %	0 %	25 %	153930593
140	NC_009704	AGTT	2	8	51820	51827	25 %	50 %	25 %	0 %	153930593
141	NC_009704	GCTT	2	8	52184	52191	0 %	50 %	25 %	25 %	153930592
142	NC_009704	CTAT	2	8	52224	52231	25 %	50 %	0 %	25 %	153930592
143	NC_009704	ACCT	2	8	53826	53833	25 %	25 %	0 %	50 %	153930574
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.