MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 plasmid_59kb

Total Repeats: 728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009704	CGA	2	6	57	62	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009704	AGG	2	6	120	125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009704	TTA	2	6	160	165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009704	CCT	2	6	255	260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_009704	CAG	2	6	459	464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009704	ACA	2	6	733	738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930590
7	NC_009704	AAC	2	6	771	776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930590
8	NC_009704	CTT	3	9	870	878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930590
9	NC_009704	TAA	2	6	927	932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930590
10	NC_009704	AAG	2	6	967	972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930590
11	NC_009704	AAC	2	6	1038	1043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930590
12	NC_009704	AAT	2	6	1046	1051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930590
13	NC_009704	CTT	2	6	1252	1257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930590
14	NC_009704	ACT	2	6	1384	1389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930590
15	NC_009704	CAG	2	6	1394	1399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930590
16	NC_009704	GTT	2	6	1584	1589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009704	TGA	2	6	1704	1709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009704	AAC	2	6	1795	1800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009704	CAT	2	6	1901	1906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930598
20	NC_009704	AAC	2	6	1948	1953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930598
21	NC_009704	GTC	2	6	1985	1990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930598
22	NC_009704	TAG	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930598
23	NC_009704	TGC	2	6	2040	2045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930598
24	NC_009704	TTC	2	6	2065	2070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930598
25	NC_009704	CCT	2	6	2111	2116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	153930598
26	NC_009704	AGG	2	6	2141	2146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930621
27	NC_009704	CTT	2	6	2291	2296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930621
28	NC_009704	TCC	2	6	2423	2428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_009704	ACT	2	6	2458	2463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009704	ATA	2	6	2581	2586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009704	AAT	2	6	2625	2630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009704	CAG	2	6	2927	2932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009704	ATG	2	6	3006	3011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009704	CCG	2	6	3028	3033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_009704	CCG	2	6	3097	3102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_009704	CTT	2	6	3199	3204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009704	GTT	2	6	3301	3306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009704	ATT	2	6	3447	3452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930608
39	NC_009704	GCT	2	6	3478	3483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930608
40	NC_009704	GCT	2	6	3487	3492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930608
41	NC_009704	TGT	2	6	3585	3590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930608
42	NC_009704	GCT	2	6	3786	3791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009704	CAA	2	6	4116	4121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930566
44	NC_009704	GAA	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930566
45	NC_009704	TTC	2	6	4426	4431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930566
46	NC_009704	TCA	2	6	4544	4549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930566
47	NC_009704	TTC	2	6	4630	4635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930566
48	NC_009704	GCA	2	6	4646	4651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930566
49	NC_009704	ATC	2	6	4705	4710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930566
50	NC_009704	CAA	2	6	4868	4873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009704	CAG	3	9	4976	4984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009704	ATT	2	6	5041	5046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009704	TTC	2	6	5050	5055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009704	GCT	2	6	5304	5309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009704	GAA	2	6	5547	5552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009704	TTC	2	6	5662	5667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930626
57	NC_009704	AGA	2	6	5675	5680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930626
58	NC_009704	GAG	2	6	5885	5890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930626
59	NC_009704	ATC	2	6	5932	5937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930626
60	NC_009704	GTT	2	6	6083	6088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930606
61	NC_009704	CAT	2	6	6157	6162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930606
62	NC_009704	GAA	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930606
63	NC_009704	TCA	2	6	6234	6239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930606
64	NC_009704	CCG	2	6	6264	6269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153930606
65	NC_009704	AGT	2	6	6475	6480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930606
66	NC_009704	TGG	2	6	6622	6627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153930606
67	NC_009704	TCA	2	6	6705	6710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930606
68	NC_009704	TCT	2	6	6865	6870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930606
69	NC_009704	AGG	2	6	6895	6900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930606
70	NC_009704	AGC	2	6	6901	6906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930606
71	NC_009704	ATA	2	6	7019	7024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930606
72	NC_009704	CGC	2	6	7052	7057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153930606
73	NC_009704	GTT	2	6	7067	7072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930606
74	NC_009704	GAG	2	6	7119	7124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930606
75	NC_009704	GGA	2	6	7244	7249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930587
76	NC_009704	TGA	2	6	7261	7266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930587
77	NC_009704	TAG	2	6	7332	7337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930587
78	NC_009704	CTT	2	6	7417	7422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930587
79	NC_009704	GGC	2	6	7444	7449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153930587
80	NC_009704	GCC	2	6	7612	7617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153930599
81	NC_009704	TGC	2	6	7629	7634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930599
82	NC_009704	TAT	2	6	7762	7767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930599
83	NC_009704	TGT	2	6	7975	7980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930569
84	NC_009704	TGA	2	6	8041	8046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930569
85	NC_009704	TCG	2	6	8149	8154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930569
86	NC_009704	TGA	2	6	8218	8223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930569
87	NC_009704	CGT	2	6	8228	8233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930569
88	NC_009704	ATA	2	6	8321	8326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930569
89	NC_009704	TGA	3	9	8338	8346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930569
90	NC_009704	TCA	2	6	8377	8382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930569
91	NC_009704	TCA	2	6	8435	8440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930569
92	NC_009704	ATT	2	6	8543	8548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930569
93	NC_009704	TAT	2	6	8556	8561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930569
94	NC_009704	TGG	2	6	8596	8601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153930569
95	NC_009704	GTT	2	6	8621	8626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930569
96	NC_009704	CAG	2	6	8898	8903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930569
97	NC_009704	TAC	2	6	8942	8947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930569
98	NC_009704	CAT	2	6	8956	8961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930569
99	NC_009704	TGC	2	6	9451	9456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930569
100	NC_009704	ATG	2	6	9459	9464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930569
101	NC_009704	AAC	2	6	9565	9570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930569
102	NC_009704	GCT	2	6	9572	9577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930569
103	NC_009704	ATT	2	6	9649	9654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930569
104	NC_009704	TTC	2	6	9816	9821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930569
105	NC_009704	AGA	2	6	10075	10080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930569
106	NC_009704	ATC	2	6	10133	10138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930569
107	NC_009704	TAC	2	6	10163	10168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930569
108	NC_009704	TGC	2	6	10258	10263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930569
109	NC_009704	GCA	2	6	10352	10357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930569
110	NC_009704	CGT	2	6	10438	10443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930573
111	NC_009704	AGG	2	6	10536	10541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930573
112	NC_009704	AAT	2	6	10542	10547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930573
113	NC_009704	CAG	2	6	10670	10675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930573
114	NC_009704	CAA	2	6	10775	10780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930573
115	NC_009704	AAG	2	6	10811	10816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930573
116	NC_009704	ATT	2	6	10876	10881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930573
117	NC_009704	GGA	2	6	10908	10913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930573
118	NC_009704	ATG	2	6	10957	10962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930573
119	NC_009704	GAT	2	6	10999	11004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930573
120	NC_009704	TGA	2	6	11162	11167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930568
121	NC_009704	GCG	2	6	11280	11285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153930568
122	NC_009704	TTC	2	6	11344	11349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930568
123	NC_009704	TTG	2	6	11419	11424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930568
124	NC_009704	GTC	2	6	11508	11513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930568
125	NC_009704	TTC	2	6	11549	11554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930568
126	NC_009704	GCA	2	6	11616	11621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930568
127	NC_009704	AGA	2	6	11644	11649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930568
128	NC_009704	ATA	2	6	11653	11658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930568
129	NC_009704	ATT	2	6	11766	11771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930568
130	NC_009704	GTC	2	6	11777	11782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930568
131	NC_009704	GTT	2	6	11817	11822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930568
132	NC_009704	TAG	2	6	11896	11901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930568
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163	NC_009704	ATT	2	6	14139	14144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930607
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254	NC_009704	GAA	2	6	20671	20676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930575
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256	NC_009704	TCA	2	6	20928	20933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930575
257	NC_009704	TTC	2	6	21046	21051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930575
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382	NC_009704	TCT	2	6	30757	30762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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499	NC_009704	ATA	2	6	41206	41211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930580
500	NC_009704	TCA	3	9	41221	41229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930580

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