MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 plasmid_59kb

Total Repeats: 624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009704	ACA	2	6	733	738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930590
2	NC_009704	AAC	2	6	771	776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930590
3	NC_009704	CTT	3	9	870	878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930590
4	NC_009704	TAA	2	6	927	932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930590
5	NC_009704	AAG	2	6	967	972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930590
6	NC_009704	AAC	2	6	1038	1043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930590
7	NC_009704	AAT	2	6	1046	1051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930590
8	NC_009704	CTT	2	6	1252	1257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930590
9	NC_009704	ACT	2	6	1384	1389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930590
10	NC_009704	CAG	2	6	1394	1399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930590
11	NC_009704	CAT	2	6	1901	1906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930598
12	NC_009704	AAC	2	6	1948	1953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930598
13	NC_009704	GTC	2	6	1985	1990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930598
14	NC_009704	TAG	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930598
15	NC_009704	TGC	2	6	2040	2045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930598
16	NC_009704	TTC	2	6	2065	2070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930598
17	NC_009704	CCT	2	6	2111	2116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	153930598
18	NC_009704	AGG	2	6	2141	2146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930621
19	NC_009704	CTT	2	6	2291	2296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930621
20	NC_009704	ATT	2	6	3447	3452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930608
21	NC_009704	GCT	2	6	3478	3483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930608
22	NC_009704	GCT	2	6	3487	3492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930608
23	NC_009704	TGT	2	6	3585	3590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930608
24	NC_009704	CAA	2	6	4116	4121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930566
25	NC_009704	GAA	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930566
26	NC_009704	TTC	2	6	4426	4431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930566
27	NC_009704	TCA	2	6	4544	4549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930566
28	NC_009704	TTC	2	6	4630	4635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930566
29	NC_009704	GCA	2	6	4646	4651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930566
30	NC_009704	ATC	2	6	4705	4710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930566
31	NC_009704	TTC	2	6	5662	5667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930626
32	NC_009704	AGA	2	6	5675	5680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930626
33	NC_009704	GAG	2	6	5885	5890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930626
34	NC_009704	ATC	2	6	5932	5937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930626
35	NC_009704	GTT	2	6	6083	6088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930606
36	NC_009704	CAT	2	6	6157	6162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930606
37	NC_009704	GAA	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930606
38	NC_009704	TCA	2	6	6234	6239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930606
39	NC_009704	CCG	2	6	6264	6269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153930606
40	NC_009704	AGT	2	6	6475	6480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930606
41	NC_009704	TGG	2	6	6622	6627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153930606
42	NC_009704	TCA	2	6	6705	6710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930606
43	NC_009704	TCT	2	6	6865	6870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930606
44	NC_009704	AGG	2	6	6895	6900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930606
45	NC_009704	AGC	2	6	6901	6906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930606
46	NC_009704	ATA	2	6	7019	7024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930606
47	NC_009704	CGC	2	6	7052	7057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153930606
48	NC_009704	GTT	2	6	7067	7072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930606
49	NC_009704	GAG	2	6	7119	7124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930606
50	NC_009704	GGA	2	6	7244	7249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930587
51	NC_009704	TGA	2	6	7261	7266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930587
52	NC_009704	TAG	2	6	7332	7337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930587
53	NC_009704	CTT	2	6	7417	7422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930587
54	NC_009704	GGC	2	6	7444	7449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153930587
55	NC_009704	GCC	2	6	7612	7617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153930599
56	NC_009704	TGC	2	6	7629	7634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930599
57	NC_009704	TAT	2	6	7762	7767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930599
58	NC_009704	TGT	2	6	7975	7980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930569
59	NC_009704	TGA	2	6	8041	8046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930569
60	NC_009704	TCG	2	6	8149	8154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930569
61	NC_009704	TGA	2	6	8218	8223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930569
62	NC_009704	CGT	2	6	8228	8233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930569
63	NC_009704	ATA	2	6	8321	8326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930569
64	NC_009704	TGA	3	9	8338	8346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930569
65	NC_009704	TCA	2	6	8377	8382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930569
66	NC_009704	TCA	2	6	8435	8440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930569
67	NC_009704	ATT	2	6	8543	8548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930569
68	NC_009704	TAT	2	6	8556	8561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930569
69	NC_009704	TGG	2	6	8596	8601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153930569
70	NC_009704	GTT	2	6	8621	8626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930569
71	NC_009704	CAG	2	6	8898	8903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930569
72	NC_009704	TAC	2	6	8942	8947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930569
73	NC_009704	CAT	2	6	8956	8961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930569
74	NC_009704	TGC	2	6	9451	9456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930569
75	NC_009704	ATG	2	6	9459	9464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930569
76	NC_009704	AAC	2	6	9565	9570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930569
77	NC_009704	GCT	2	6	9572	9577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930569
78	NC_009704	ATT	2	6	9649	9654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930569
79	NC_009704	TTC	2	6	9816	9821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930569
80	NC_009704	AGA	2	6	10075	10080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930569
81	NC_009704	ATC	2	6	10133	10138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930569
82	NC_009704	TAC	2	6	10163	10168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930569
83	NC_009704	TGC	2	6	10258	10263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930569
84	NC_009704	GCA	2	6	10352	10357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930569
85	NC_009704	CGT	2	6	10438	10443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930573
86	NC_009704	AGG	2	6	10536	10541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930573
87	NC_009704	AAT	2	6	10542	10547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930573
88	NC_009704	CAG	2	6	10670	10675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930573
89	NC_009704	CAA	2	6	10775	10780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930573
90	NC_009704	AAG	2	6	10811	10816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930573
91	NC_009704	ATT	2	6	10876	10881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930573
92	NC_009704	GGA	2	6	10908	10913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930573
93	NC_009704	ATG	2	6	10957	10962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930573
94	NC_009704	GAT	2	6	10999	11004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930573
95	NC_009704	TGA	2	6	11162	11167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930568
96	NC_009704	GCG	2	6	11280	11285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153930568
97	NC_009704	TTC	2	6	11344	11349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930568
98	NC_009704	TTG	2	6	11419	11424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930568
99	NC_009704	GTC	2	6	11508	11513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930568
100	NC_009704	TTC	2	6	11549	11554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930568
101	NC_009704	GCA	2	6	11616	11621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930568
102	NC_009704	AGA	2	6	11644	11649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930568
103	NC_009704	ATA	2	6	11653	11658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930568
104	NC_009704	ATT	2	6	11766	11771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930568
105	NC_009704	GTC	2	6	11777	11782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930568
106	NC_009704	GTT	2	6	11817	11822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930568
107	NC_009704	TAG	2	6	11896	11901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930568
108	NC_009704	TTA	2	6	12008	12013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930617
109	NC_009704	TCG	2	6	12503	12508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930612
110	NC_009704	AAT	2	6	12513	12518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930612
111	NC_009704	ATT	2	6	12528	12533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930612
112	NC_009704	TAT	2	6	12563	12568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930612
113	NC_009704	CAA	2	6	12597	12602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930612
114	NC_009704	AGC	2	6	12642	12647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930612
115	NC_009704	ATA	2	6	12679	12684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930612
116	NC_009704	TAT	2	6	12689	12694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930612
117	NC_009704	CCA	2	6	12696	12701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153930612
118	NC_009704	CAA	2	6	12754	12759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930612
119	NC_009704	ACC	2	6	12797	12802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153930612
120	NC_009704	CCT	2	6	12807	12812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	153930612
121	NC_009704	TAA	2	6	12815	12820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930612
122	NC_009704	GCC	2	6	12826	12831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153930612
123	NC_009704	CAA	2	6	12882	12887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930612
124	NC_009704	GAA	2	6	12891	12896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930612
125	NC_009704	CTC	2	6	13213	13218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	153930612
126	NC_009704	GTT	2	6	13248	13253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930612
127	NC_009704	AAT	2	6	13298	13303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930612
128	NC_009704	GCA	2	6	13473	13478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930612
129	NC_009704	TAA	2	6	13526	13531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930612
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