MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum F str. Langeland plasmid pCLI

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009700	TATTT	2	10	38	47	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009700	TATGA	2	10	1110	1119	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009700	TATAA	2	10	1675	1684	60 %	40 %	0 %	0 %	153941569
4	NC_009700	ATTAA	2	10	3129	3138	60 %	40 %	0 %	0 %	153941565
5	NC_009700	ATAAA	2	10	4071	4080	80 %	20 %	0 %	0 %	153941556
6	NC_009700	ATATA	2	10	5170	5179	60 %	40 %	0 %	0 %	153941558
7	NC_009700	ATAAA	2	10	5474	5483	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009700	AATTA	2	10	5500	5509	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009700	CTATA	2	10	5770	5779	40 %	40 %	0 %	20 %	153941548
10	NC_009700	ATTTC	2	10	5916	5925	20 %	60 %	0 %	20 %	153941548
11	NC_009700	TAATA	2	10	7103	7112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009700	CCTTT	2	10	7131	7140	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009700	ATAAA	2	10	7302	7311	80 %	20 %	0 %	0 %	153941551
14	NC_009700	AAAAC	2	10	7423	7432	80 %	0 %	0 %	20 %	153941551
15	NC_009700	GATAA	2	10	7685	7694	60 %	20 %	20 %	0 %	153941551
16	NC_009700	AAAAT	2	10	7862	7871	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009700	TGAAT	2	10	8186	8195	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009700	TAAAT	2	10	8297	8306	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009700	ATTTA	2	10	10293	10302	40 %	60 %	0 %	0 %	153941570
20	NC_009700	TTTTA	2	10	10575	10584	20 %	80 %	0 %	0 %	153941570
21	NC_009700	ATTAC	2	10	10681	10690	40 %	40 %	0 %	20 %	153941570
22	NC_009700	TTTTA	2	10	11254	11263	20 %	80 %	0 %	0 %	153941562
23	NC_009700	TTATT	2	10	11334	11343	20 %	80 %	0 %	0 %	153941562
24	NC_009700	AATTT	2	10	12225	12234	40 %	60 %	0 %	0 %	153941562
25	NC_009700	ATTAA	2	10	12615	12624	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009700	TTTTA	2	10	12677	12686	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009700	TTTTC	2	10	12968	12977	0 %	80 %	0 %	20 %	153941555
28	NC_009700	ATATT	2	10	13448	13457	40 %	60 %	0 %	0 %	153941555
29	NC_009700	CATAC	2	10	13791	13800	40 %	20 %	0 %	40 %	153941564
30	NC_009700	TAAGG	2	10	13956	13965	40 %	20 %	40 %	0 %	153941564
31	NC_009700	TTTTA	2	10	14324	14333	20 %	80 %	0 %	0 %	153941564
32	NC_009700	TTTCA	2	10	15113	15122	20 %	60 %	0 %	20 %	153941564
33	NC_009700	TATAT	2	10	15724	15733	40 %	60 %	0 %	0 %	153941567
34	NC_009700	TAAAA	2	10	16803	16812	80 %	20 %	0 %	0 %	153941567

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.